Субгеномная мРНК

Субгеномная мРНК ' s существенно меньшие участки исходного Записал матричной нити .

3 'на 5' ДНК или РНК [ править ]

Во время транскрипции исходная цепь шаблона обычно читается от 3 ' до 5' конца от начала до конца. Субгеномные мРНК создаются, когда транскрипция начинается с 3 'конца цепи матрицы (или 5' вновь синтезируемой матрицы) и начинает копироваться к 5 'концу цепи матрицы, прежде чем "прыгнуть" до конца. шаблона и копирование последних нуклеотидов 5 'конца шаблона (завершение 3' хвоста для вновь созданной цепи).

В результате, переведенная нить будет иметь 5'-конец в разной степени с исходным шаблоном (в зависимости от того, через какую часть шаблона перепрыгнула транскрипция) и аналогичный 3'-конец шаблона. ^[1]

5 'на 3' (положительный смысл) вирусной РНК [ править ]

Положительно-смысловая (от 5 'до 3') вирусная РНК, которая может быть непосредственно транслирована в желаемые вирусные белки, подвергается процессу, аналогичному описанному в пунктах 3-5 '. Части вирусной РНК могут быть пропущены во время трансляции.

Результат [ править ]

В результате из одной и той же цепи мРНК может быть создано множество различных белков со сходными 5'-концами (в разной степени) и одинаковыми 3'-концами. Или различные белки могут быть созданы с помощью вирусной РНК с положительным смыслом.

5'-сечение вновь созданной нити совпадает с секцией эталонной нити, и этот участок эталонной нити называется «вложенным набором». ^[2]

3 '5' GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATACGTTATTTCTGCGCGGAAAAAAAAA - Исходный шаблон Strand 5 '3' GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATAC --------------- AAAAAAAAA | GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCAC -------------------------- AAAAAAAAA | = Субгеномная мРНК. GCCGCCCCGTAT ---------------------------------------- AAAAAAAAA |  GCCGCCCCGTAT = Nested Set - указывает прыжки.

Примеры [ править ]

Этот сложный метод транскрипции обычно ограничивается вирусами , особенно вирусами одноцепочечной РНК с положительным смыслом или вирусами класса IV, использующими систему классификации Балтимора , например вирусами отряда Nidovirales .

Он в основном используется для сжатия большего количества генетической информации в меньший объем генетического материала. ^[3]

Литература [ править ]

↑ Wu B, White KA (декабрь 2007 г.). «Разделение репликации РНК вируса от транскрипции через полимеразу: функциональные и эволюционные идеи» . Журнал EMBO . 26 (24): 5120–30. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7601931 . PMC 2140117 . PMID 18034156 .
^ Le, TM; Вонг, HH; Тай, ФП; Клык, S; Keng, CT; Tan, YJ; Лю, Д.X. (август 2007 г.). «Экспрессия, посттрансляционная модификация и биохимическая характеристика белков, кодируемых субгеномной мРНК8 коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома» . FEBS Дж . 274 (16): 4211–22. DOI : 10.1111 / j.1742-4658.2007.05947.x . PMID 17645546 .
↑ Xu W, White KA (февраль 2008 г.). «Субгеномная транскрипция мРНК в aureusvirus: подавление транскрипции и эволюция регуляторных элементов РНК». Вирусология . 371 (2): 430–8. DOI : 10.1016 / j.virol.2007.09.035 . PMID 17988704 .

[pmid18034156-1] Wu B, White KA (декабрь 2007 г.). «Разделение репликации РНК вируса от транскрипции через полимеразу: функциональные и эволюционные идеи» . Журнал EMBO . 26 (24): 5120–30. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7601931 . PMC 2140117 . PMID 18034156 .

[2] Le, TM; Вонг, HH; Тай, ФП; Клык, S; Keng, CT; Tan, YJ; Лю, Д.X. (август 2007 г.). «Экспрессия, посттрансляционная модификация и биохимическая характеристика белков, кодируемых субгеномной мРНК8 коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома» . FEBS Дж . 274 (16): 4211–22. DOI : 10.1111 / j.1742-4658.2007.05947.x . PMID 17645546 .

[pmid17988704-3] Xu W, White KA (февраль 2008 г.). «Субгеномная транскрипция мРНК в aureusvirus: подавление транскрипции и эволюция регуляторных элементов РНК». Вирусология . 371 (2): 430–8. DOI : 10.1016 / j.virol.2007.09.035 . PMID 17988704 .

[1]