Депендопарвовирус | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство : | Моноднавирия |
Королевство: | Shotokuvirae |
Тип: | Cossaviricota |
Класс: | Quintoviricetes |
Порядок: | Piccovirales |
Семья: | Parvoviridae |
Подсемейство: | Parvovirinae |
Род: | Депендопарвовирус |
Разновидность | |
См. Текст |
Dependoparvovirus (ранее Dependovirus или адено-ассоциированные вирусы группы ) является род в подсемейство Parvovirinae от вируса семьи Parvoviridae ; [1] [2] они относятся к группе II вирусов по классификации Балтимора . Некоторые dependoparvoviruses также известны как аденосателлитные вирусыпотому что они не могут повторить продуктивно в своей клетке - хозяине без клетки будучи коинфицирован с помощью вируса - помощника , таких как аденовирус , в герпесвирусах , или вирус коровьей оспы.
Существует одиннадцать признанных видов: [3]
Депендопарвовирусы имеют форму икосаэдра , размер 22 нм [4] состоит из 60 клиновидных белков (число триангуляции = 1). В каждом капсомере присутствуют три белка (VP1, VP2 и VP3). Каждый капсид состоит из белков 5 VP1, 5 VP2 и 50 VP3. У капсида нет конверта. [5]
Геном представляет собой одну молекулу одноцепочечной ДНК длиной 4,7 килобаз. У него всего две открытые рамки для чтения. 3'-открытая рамка считывания представляет собой структурный белок капсида, cap, который может быть сплайсирован с образованием двух РНК, одна для белка вириона 1 (VP1), а другая, в конечном итоге, дает VP2 и VP3. Второй ген, rep, может быть сплайсирован на четыре разных неструктурных регуляторных белка, которые все помогают в репликации генома. Эти белки названы Rep 78, Rep68, Rep 52 и Rep 40 в зависимости от их молекулярной массы. [4]
Из-за инвертированных концевых повторов (ITR) на каждом конце генома формируется Т-образная вторичная структура . Комплементарные области оставляют 3'- гидроксильную группу одноцепочечной для начала репликации. Эта 3'-гидроксильная группа используется в качестве праймера для синтеза ведущей цепи . Создаются как положительные, так и отрицательные смысловые цепи ДНК. Двухцепочечные промежуточные соединения образуются на протяжении всей репликации; это означает, что две нити, положительное и отрицательное, будут совпадать. [4] [5]
Эти вирусы способны размножаться у всех позвоночных. Они ограничены только вирусом, которым они должны заразиться, также известным как вирус-помощник. Эти вспомогательные вирусы необходимы для репликации зависимого парвовируса. Распространенным вирусом-помощником у людей является аденовирус . [ необходима цитата ]
Депендопарвовирус недостаточно заразен, чтобы вызвать иммунный ответ ; это делает его хорошим вирусом для использования в качестве инструмента генной терапии. Генная терапия - это возможное лечение множества расстройств и заболеваний, имеющих генетическое происхождение. В настоящее время разрабатываются вирусные векторы для переноса генов в клетки человека. Поскольку этот вирус не стимулирует иммунный ответ, его можно эффективно использовать несколько раз без нейтрализации перед инфекцией [ необходима цитата ] . Еще одна причина, по которой эти вирусы являются надежными векторами, - это известная точка вставки генома. Этот вирус всегда вставляет его содержимое в том же месте на хромосоме 19. [ править] Эта предсказуемость может снизить вероятность внедрения в важную область, которая может нарушить нормальную функцию генов или повысить риск развития рака. [6]
В настоящее время одной из проблем, связанных с использованием этого вируса в качестве терапевтического средства, является тот факт, что геном довольно мал. Если в геноме менее 5 килобайт, количество генетического материала, которое может поместиться в капсид, ограничено. В настоящее время ведется работа по увеличению объема информации, которую может доставить этот вектор. Это может быть достигнуто с помощью ITR, обнаруженных как на 5 ', так и на 3' конце генома. Поскольку ITR имеют одну и ту же последовательность, они оставляют незащищенными комплементарные нити, если их удалить. Комплементарные цепи могут подвергаться рекомбинации и объединять два встроенных фрагмента размером 5 т.п.н. [7]
Викискладе есть медиафайлы по теме Dependovirus . |