Депендопарвовирус


Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Dependoparvovirus (ранее Dependovirus или адено-ассоциированные вирусы группы ) является род в подсемейство Parvovirinae от вируса семьи Parvoviridae ; [1] [2] они относятся к группе II вирусов по классификации Балтимора . Некоторые dependoparvoviruses также известны как аденосателлитные вирусыпотому что они не могут повторить продуктивно в своей клетке - хозяине без клетки будучи коинфицирован с помощью вируса - помощника , таких как аденовирус , в герпесвирусах , или вирус коровьей оспы.

Разновидность

Существует одиннадцать признанных видов: [3]

Вирусология

Схематический рисунок вирусной частицы Dependoparvovirus ( поперечный разрез и вид сбоку)

Депендопарвовирусы имеют форму икосаэдра , размер 22 нм [4] состоит из 60 клиновидных белков (число триангуляции = 1). В каждом капсомере присутствуют три белка (VP1, VP2 и VP3). Каждый капсид состоит из белков 5 VP1, 5 VP2 и 50 VP3. У капсида нет конверта. [5]

Геном представляет собой одну молекулу одноцепочечной ДНК длиной 4,7 килобаз. У него всего две открытые рамки для чтения. 3'-открытая рамка считывания представляет собой структурный белок капсида, cap, который может быть сплайсирован с образованием двух РНК, одна для белка вириона 1 (VP1), а другая, в конечном итоге, дает VP2 и VP3. Второй ген, rep, может быть сплайсирован на четыре разных неструктурных регуляторных белка, которые все помогают в репликации генома. Эти белки названы Rep 78, Rep68, Rep 52 и Rep 40 в зависимости от их молекулярной массы. [4]

Из-за инвертированных концевых повторов (ITR) на каждом конце генома формируется Т-образная вторичная структура . Комплементарные области оставляют 3'- гидроксильную группу одноцепочечной для начала репликации. Эта 3'-гидроксильная группа используется в качестве праймера для синтеза ведущей цепи . Создаются как положительные, так и отрицательные смысловые цепи ДНК. Двухцепочечные промежуточные соединения образуются на протяжении всей репликации; это означает, что две нити, положительное и отрицательное, будут совпадать. [4] [5]

Диапазон хостов

Эти вирусы способны размножаться у всех позвоночных. Они ограничены только вирусом, которым они должны заразиться, также известным как вирус-помощник. Эти вспомогательные вирусы необходимы для репликации зависимого парвовируса. Распространенным вирусом-помощником у людей является аденовирус . [ необходима цитата ]

Генная терапия

Депендопарвовирус недостаточно заразен, чтобы вызвать иммунный ответ ; это делает его хорошим вирусом для использования в качестве инструмента генной терапии. Генная терапия - это возможное лечение множества расстройств и заболеваний, имеющих генетическое происхождение. В настоящее время разрабатываются вирусные векторы для переноса генов в клетки человека. Поскольку этот вирус не стимулирует иммунный ответ, его можно эффективно использовать несколько раз без нейтрализации перед инфекцией [ необходима цитата ] . Еще одна причина, по которой эти вирусы являются надежными векторами, - это известная точка вставки генома. Этот вирус всегда вставляет его содержимое в том же месте на хромосоме 19. [ править] Эта предсказуемость может снизить вероятность внедрения в важную область, которая может нарушить нормальную функцию генов или повысить риск развития рака. [6]

В настоящее время одной из проблем, связанных с использованием этого вируса в качестве терапевтического средства, является тот факт, что геном довольно мал. Если в геноме менее 5 килобайт, количество генетического материала, которое может поместиться в капсид, ограничено. В настоящее время ведется работа по увеличению объема информации, которую может доставить этот вектор. Это может быть достигнуто с помощью ITR, обнаруженных как на 5 ', так и на 3' конце генома. Поскольку ITR имеют одну и ту же последовательность, они оставляют незащищенными комплементарные нити, если их удалить. Комплементарные цепи могут подвергаться рекомбинации и объединять два встроенных фрагмента размером 5 т.п.н. [7]

использованная литература

  1. ^ Котмор, SF; Agbandje-McKenna, M; Канути, М; Chiorini, JA; Эйс-Хубингер, А; Хьюз, Дж; Mietzsch, M; Modha, S; Ольястро, М; Пензес, JJ; Пинтель, диджей; Цю, Дж; Содерлунд-Венермо, М; Tattersall, P; Tijssen, P; и Консорциум отчетов ICTV (2019). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Parvoviridae" . Журнал общей вирусологии . 100 (3): 367–368. DOI : 10,1099 / jgv.0.001212 . PMC  6537627 . PMID  30672729 .
  2. ^ «ICTV 10-й отчет (2018)» .
  3. ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2020» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 . Дата обращения 10 мая 2021 .
  4. ^ a b c Gonçalves, M (2005). «Аденоассоциированный вирус: от дефектного вируса к эффективному вектору» . Журнал вирусологии . 2 (1): 43–60. DOI : 10.1186 / 1743-422X-2-43 . PMC 1131931 . PMID 15877812 .  
  5. ^ a b Управление ICTVdB (2006). Бюхен-Осмонд, К. (ред.). «ICTVdB - Универсальная база данных вирусов, версия 4: Dependovirus» . Колумбийский университет, Нью-Йорк, США . Проверено 4 мая 2009 года .
  6. ^ Excoffon, K; и другие. (2009). «Направленная эволюция аденоассоциированного вируса в инфекционный респираторный вирус» . Труды Национальной академии наук . 106 (10): 3865–3870. Bibcode : 2009PNAS..106.3865E . DOI : 10.1073 / pnas.0813365106 . PMC 2646629 . PMID 19237554 .  
  7. ^ Ghosh, A .; Yue, Y .; Лай, Ю. и Дуань, Д. (2008). «Система гибридных векторов расширяет возможности упаковки адено-ассоциированных вирусных векторов трансген-независимым образом» (PDF) . Молекулярная терапия . 16 (1): 124–130. DOI : 10.1038 / sj.mt.6300322 . PMID 17984978 .  

внешние ссылки

  • ViralZone : Dependoparvovirus
Источник « https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Dependoparvovirus&oldid=1040845727 »