МнРНК U5 - это малая ядерная РНК (мяРНК), которая участвует в сплайсинге РНК в качестве компонента сплайсосомы . Он образует U5 snRNP ( небольшой ядерный рибонуклеопротеидных ) путем связывания с несколькими белками , включая Prp8 - самый большой и самый консервативный белок в сплайсосома, Brr2 - в геликазу , необходимый для активации сплайсосомы, Snu114 и 7 Sm белков. [1] U5 snRNA образует коаксиально уложенную серию спиралей, которые выступают в активный сайт сплайсосомы. [2] [3] Петля 1, которая закрывает эту серию спиралей, образует 4-5 пар оснований с 5'-экзоном во время двух химических реакций сплайсинга.[4] [5] Это взаимодействие, по-видимому, особенно важно на втором этапе сплайсинга, лигирования экзонов. [6]
Сплайсосомная РНК U5 | |
---|---|
Идентификаторы | |
Символ | U5 |
Рфам | RF00020 |
Прочие данные | |
Тип РНК | Джин ; мяРНК ; сращивание |
Домен (ы) | Эукариоты |
ИДТИ | GO: 0000351 GO: 0000353 GO: 0005682 GO: 0046540 |
ТАК | ТАК: 0000395 |
Структуры PDB | PDBe |
Рекомендации
- ^ Stevens SW, Барт I, Ge Г, Мур RE, Young MK, Lee TD, Абельсон J (ноябрь 2001). «Биохимический и генетический анализ малых ядерных рибонуклеопротеидов U5, U6 и U4 / U6 x U5 из Saccharomyces cerevisiae» . РНК . 7 (11): 1543–53. PMC 1370197 . PMID 11720284 .
- ^ Nguyen TH, Galej WP, Bai XC, Savva CG, Newman AJ, Scheres SH, Nagai K (июль 2015 г.). «Архитектура сплайсосомного три-мяРНП U4 / U6.U5» . Природа . 523 (7558): 47–52. Bibcode : 2015Natur.523 ... 47N . DOI : 10,1038 / природа14548 . PMC 4536768 . PMID 26106855 .
- ^ Ян Ц., Ханг Дж., Ван Р., Хуанг М., Вонг С.К., Ши И (сентябрь 2015 г.). «Структура сплайсосомы дрожжей при разрешении 3,6 ангстрем». Наука . 349 (6253): 1182–91. Bibcode : 2015Sci ... 349.1182Y . DOI : 10.1126 / science.aac7629 . PMID 26292707 . S2CID 22194712 .
- ^ Ньюман А.Дж., Норман С. (февраль 1992 г.). «МнРНК U5 взаимодействует с последовательностями экзонов в 5'- и 3'-сайтах сплайсинга». Cell . 68 (4): 743–54. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (92) 90149-7 . PMID 1739979 . S2CID 3328508 .
- ^ Sontheimer EJ, Steitz JA (декабрь 1993 г.). «Малые ядерные РНК U5 и U6 как компоненты активного центра сплайсосомы». Наука . 262 (5142): 1989–96. Bibcode : 1993Sci ... 262.1989S . DOI : 10.1126 / science.8266094 . PMID 8266094 .
- ^ O'Keefe RT, Norman C, Newman AJ (август 1996). «Инвариантная последовательность петли 1 мяРНК U5 незаменима на первом каталитическом этапе сплайсинга пре-мРНК в дрожжах». Cell . 86 (4): 679–89. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (00) 80140-3 . PMID 8752221 . S2CID 17484887 .
дальнейшее чтение
- Zwieb C (январь 1997 г.). «База данных уРНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (1): 102–3. DOI : 10.1093 / NAR / 25.1.102 . PMC 146409 . PMID 9016512 .
- Томас Дж., Леа К., Цукер-Априсон Э, Блюменталь Т. (май 1990 г.). «Сплайсосомные мяРНК Caenorhabditis elegans» . Исследования нуклеиновых кислот . 18 (9): 2633–42. DOI : 10.1093 / NAR / 18.9.2633 . PMC 330746 . PMID 2339054 .
Внешние ссылки
- Страница для сплайсосомной РНК U5 в Rfam