Выше по потоку открытая рамка считывания ( uORF ) представляет собой открытую рамку считывания (ORF) , в пределах нетранслируемой области 5' (5'UTR) в качестве мРНК . uORFs могут регулировать экспрессию эукариотических генов . [1] [2] Трансляция uORF обычно подавляет нижележащую экспрессию первичной ORF. Однако в некоторых генах, таких как дрожжевой GCN4, трансляция специфических uORF может увеличивать трансляцию основной ORF. [3] У бактерий пКОРС называются лидерными пептидами и первоначально были обнаружены на основании их влияния на регуляцию генов, участвующих в синтезе или транспортеаминокислоты .
Приблизительно 50% генов человека содержат uORF в своем 5'UTR, и когда они присутствуют, они вызывают снижение экспрессии белка. [4] Человеческие пептиды, полученные из транслированных uORFs, могут быть обнаружены из клеточного материала с помощью масс-спектрометра . [5]
См. Также [ править ]
Ссылки [ править ]
- Перейти ↑ Vilela C, McCarthy JE (август 2003 г.). «Регулирование экспрессии генов грибов с помощью коротких открытых рамок считывания в 5'-нетранслируемой области мРНК» . Молекулярная микробиология . 49 (4): 859–67. DOI : 10.1046 / j.1365-2958.2003.03622.x . PMID 12890013 .
- Перейти ↑ Lovett PS, Rogers EJ (июнь 1996). «Регулирование рибосом с помощью растущего пептида» . Микробиологические обзоры . 60 (2): 366–85. DOI : 10.1128 / MMBR.60.2.366-385.1996 . PMC 239448 . PMID 8801438 .
- ^ Хиннебуш, Алан Г. (1997-08-29). «Трансляционная регуляция дрожжевого GCN4: ОКНО ФАКТОРОВ, КОНТРОЛИРУЮЩИХ СВЯЗЬ ИНИЦИАТОР-тРНК С РИБОСОМОМ *» . Журнал биологической химии . 272 (35): 21661–21664. DOI : 10.1074 / jbc.272.35.21661 . ISSN 0021-9258 . PMID 9268289 .
- ^ Кальво SE, Pagliarini DJ, Mootha В.К. (май 2009). «Открытые рамки считывания, расположенные выше по течению, вызывают повсеместное снижение экспрессии белков и являются полиморфными среди людей» (PDF) . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . Труды Национальной академии наук. 106 (18): 7507–12. Bibcode : 2009PNAS..106.7507C . DOI : 10.1073 / pnas.0810916106 . PMC 2669787 . PMID 19372376 .
- ^ Slavoff SA, Mitchell AJ, Schwaid AG, Cabili М.Н., Ма J, Левин JZ, Karger А.Д., Будник Б.А., Rinn JL, Сагателян A (январь 2013). «Пептидомическое открытие пептидов, кодируемых короткой открытой рамкой считывания, в клетках человека» . Природа Химическая биология . 9 (1): 59–64. DOI : 10.1038 / nchembio.1120 . PMC 3625679 . PMID 23160002 .
