3EBB , 3HU1 , 3HU2 , 3HU3 , 3QC8 , 3QQ7 , 3QQ8 , 3qc8 , 3QQ7 , 3QQ8 , 3QWZ , 3TIW , 4KDI , 4KDL, 4KLN, 4KO8 , 4COD , 4P0A , 5C19 , 3CF2 , 3CF1 , 5FTK , 5C18 , 3CF3 , 5FTJ , 5FTM , 5FTL , 5FTN , 5С1Б , 5С1А, 5DYI , 5DYG
Валозин-содержащий белок ( VCP ) или АТФаза переходного эндоплазматического ретикулума ( TER АТФаза ), также известная как p97 у млекопитающих и CDC48 у S. cerevisiae , представляет собой фермент , который у человека кодируется геном VCP . [5] [6] [7] TER-АТФаза представляет собой фермент АТФазы , присутствующий во всех эукариотах и архебактериях . Его основная функция заключается в отделении белковых молекул от крупных клеточных структур, таких как белковые комплексы, мембраны органелл и хроматин., и, таким образом, облегчают деградацию высвобождаемых полипептидов протеасомой , состоящей из нескольких субъединиц протеазы .
p97/ CDC48 является членом семейства АТФаз AAA+ (расширенное семейство АТФаз, связанных с различными клеточными активностями). Ферменты этого семейства обнаружены у всех видов от бактерий до человека. Многие из них являются важными шаперонами , которые регулируют сворачивание или разворачивание белков-субстратов. p97/CDC48 представляет собой ААА+-АТФазу II типа, что означает, что она содержит два тандемных АТФазных домена (названных D1 и D2 соответственно) ( рис. 1 ).
Два домена АТФазы соединены коротким полипептидным линкером. Домен, предшествующий домену D1 ( N-концевой домен), и короткий карбоксиконцевой хвост участвуют во взаимодействии с кофакторами. [8] N-домен соединен с доменом D1 коротким линкером N-D1.
Большинство известных субстратов p97/CDC48 модифицированы цепями убиквитина и расщепляются протеасомой 26S . Соответственно, многие коферменты и адаптеры p97/CDC48 имеют домены, которые могут распознавать убиквитин. [9] Стало очевидным, что взаимодействия между убиквитином и кофакторами p97/CDC48 имеют решающее значение для многих предполагаемых функций, хотя точная роль этих взаимодействий еще предстоит выяснить.
CDC48 был обнаружен при генетическом скрининге генов, участвующих в регуляции клеточного цикла у почкующихся дрожжей . [10] Скрининг идентифицировал несколько аллелей Cdc48 , которые влияют на рост клеток при недопустимых температурах. Поиск гомолога CDC48 (валозина) у млекопитающих выявил предшественник белка массой 97 кДа, названный «валозин-содержащим белком (VCP)» или p97, а также показал, что он был создан только как артефакт очистки, а не во время физиологической обработки. [11] Даже без доказательств того, что валозин является физиологическим продуктом, номенклатура VCP продолжает использоваться в литературе.