Иван Афанасьевич Прончищев (ум. в 1687) — окольничий, посол, воевода в Казани, стольник царя Алексея Михайловича.
Весной 1658 года участвовал в переговорах со шведскими послами у реки Плюссы, относительно вечного мира, а в конце этого года — в заключении перемирия между Россией и Швецией. В 1661 году снова проходили мирные переговоры со шведским королём Карлом XI, которые закончились Кардисским мирным договором, подписанным со стороны России боярином, князем Иваном Семёновичем Прозоровским и Иваном Афанасьевичем Прончищевым. Осенью того же года он пожалован в думные дворяне и назначен послом в Швецию, куда снова ездил в 1662 и 1663 годах.
В 1678 году уже в чине окольничего и с титулом наместника Чебоксарского, он участвовал в переговорах с польскими послами в Москве. В 1681 году был отправлен на посольский съезд в Швецию «великим и полномочным послом»: в дворянах при нём находились его сын, стольник Михаил Иванович и ещё четыре Прончищевых, состоявших с ним в дальнем родстве. В промежутках между посольской службой и заключением договоров, он нёс придворную службу, участвовал в Смоленском походе и руководил различными приказами.
В 1648 году, на следующий день свадьбы царя Алексея Михайловича с Марией Ильиничной Милославской, Прончищев был в числе стольников, ставивших кушанья перед боярами, сидевшими в кривом столе. В 1650—1652 годах он сопровождал царя в его богомольных и загородных походах.
В 1653 году находился в числе лиц, отправленных в Нижний Новгород на встречу грузинской царицы Елены Леоновны и её сына царевича Николая Давидовича, а по дороге обратно должен был стоять у царевича «на ухабе», в 1654 году ездил к грузинской царице «со столом» от царя.
В 1656 году он — рында при приёме послов немецкого императора Фердинанда. В 1660 году, во время обеда, данного по случаю отпуска грузинского царевича Николая Давидовича, подавал кушанья царю Алексею. В 1664 году Прончищев был приставом у английского посла графа Карлейля и участвовал в «ответе» с ним, а во время торжественного обеда в Грановитой палате, вместе с Никитой Ивановичем Шереметевым, был посажен на одной скамье с графом Карлейлем.