28S рибосомная РНК
28S рибосомная РНК представляет собой структурную рибосомную РНК (рРНК) для большой субъединицы (LSU) эукариотических цитоплазматических рибосом и, таким образом, является одним из основных компонентов всех эукариотических клеток. Он имеет размер 25S у растений и 28S у млекопитающих, отсюда и псевдоним 25S–28S рРНК . [1]
В сочетании с 5,8S рРНК на 5'-стороне это эукариотический ядерный гомолог прокариотической 23S и митохондриальной 16S рибосомных РНК. [2] [3] [4]
Гены, кодирующие 28S рРНК, называются 28S рДНК. Сравнение последовательностей этих генов иногда используется в молекулярном анализе для построения филогенетических деревьев , например, у простейших , [5] грибов , [6] насекомых , [7] паукообразных , [8] тихоходок , [9] и позвоночных . [10] [11]
Некоторые эукариоты расщепляют 28S рРНК на две части, прежде чем собрать обе в рибосому, явление, называемое «скрытым разрывом». [12]
В нескольких базах данных представлены выравнивания и аннотации последовательностей рРНК LSU для сравнительных целей:
