Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Аэропирум перникс
Научная классификация
Домен:
Архей
Тип:
Crenarchaeota
Учебный класс:
Термопротеи
Заказ:
Desulfurococcales
Семья:
Desulfurococcaceae
Род:
Aeropyrum
Разновидность:
А. перникс
Биномиальное имя
Аэропирум перникс
Sako et al. 1996 г.

Aeropyrum pernix - это вид архей- экстремофилов в архее типа Crenarchaeota . Он является обязательно термофильных видов. Первые экземпляры были выделены из донных отложений в море у берегов Японии .

Открытие [ править ]

Aeropyrum pernix была первой обнаруженной строго аэробной гипертермофильной архей . Первоначально он был изолирован от нагретых морских отложений и выходящей воды, собранной в 1996 году из сольфатарного источника на острове Кодакара-дзима в Кюсю , Япония . [1]

Структура генома [ править ]

Его полный геном был секвенирован в 1999 году, его размер составляет 1669 килобаз, при этом обнаружено 2694 возможных гена . [2] Были обнаружены все гены цикла TCA, за исключением гена α-кетоглутаратдегидрогеназы . На его месте были идентифицированы гены, кодирующие две субъединицы 2-оксокислоты: ферредоксин оксидоредуктаза.

Свойства [ править ]

Клетки Aeropyrum pernix имеют сферическую форму и примерно 1 мкм в диаметре. Оболочка, окружающая клетки Aeropyrum, имеет ширину около 25 нм. Организмы растут при температуре от 70 до 100 ° C (оптимум от 90 до 95 ° C), при pH от 5 до 9 (оптимум, pH 7) и при солености от 1,8 до 7% (оптимум, соленость 3,5%). Рост организмов не обнаруживается при 68 или 102 ° C. При солености ниже 1,5% клетки лизируются за счет низкого осмотического шока. Клетки организмов чувствительны к хлорамфениколу и нечувствительны к ампициллину, ванкомицину и циклосерину. Хорошо растет на белковых веществах, время удвоения в этих условиях составляет около 200 минут. [1]

Ссылки [ править ]

  1. ^ а б Сако Й., Номура Н., Учида А. и др. (1996). «Aeropyrum pernix gen. Nov., Sp. Nov., Новая аэробная гипертермофильная архея, растущая при температурах до 100 ° C» (PDF) . Int. J. Syst. Бактериол . 46 (4): 1070–7. DOI : 10.1099 / 00207713-46-4-1070 . PMID  8863437 . Архивировано из оригинального (PDF) 2 декабря 2008 года . Проверено 23 ноября 2007 .
  2. ^ Каварабаяси Y, Хино Y, Хорикава Х и др. (1999). «Полная последовательность генома аэробного гипертермофильного кренархея, Aeropyrum pernix K1» (PDF) . ДНК Res . 6 (2): 83–101, 145–52. DOI : 10.1093 / dnares / 6.2.83 . PMID 10382966 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Бхуия, Мохаммад Вадуд; Сурьяди, Джимми; Чжоу, Жоли; Браун, Бернард Эндрю, II (5 августа 2013 г.). «Структура многофункционального белка Aeropyrum pernix L7Ae и понимание его чрезвычайной термостабильности» . Acta Crystallographica Раздел F . 69 (Pt 9): 979–988. DOI : 10.1107 / S1744309113021799 . PMC  3758144 . PMID  23989144 .
  • Дайфуку, Такаши; Ёсида, Такаши; Такаюки, Китамура; Кавайчи, Сатоши; Иноуэ, Такахиро; Номура, Кейго; Йошида, Юи; Куно, Сотаро; Сако, Ёсихико (19 июля 2013 г.). «Вариации связанных с вирусом элементов в синтетических геномах гипертермофильных Archaeon Aeropyrum» . Прил. Environ. Microbiol . 79 (19): 5891–8. DOI : 10,1128 / AEM.01089-13 . PMC  3811351 . PMID  23872576 .
  • Ли, Пён Чхон; Mijts, Benjamin N .; Петри, Ральф; Уоттс, Кевин Т .; Шмидт-Даннерт, Клаудиа (16 июня 2004 г.). «Изменение специфичности продукта фарнезилгеранилдифосфатсинтазы (Fgs) Aeropyrum pernix путем направленной эволюции» . Разработка и отбор протеиновой инженерии . 17 (11): 771–777. DOI : 10,1093 / белок / gzh089 . PMID  15548566 .
  • Ота, Ажда; Гмайнер, Деян; Sentijurc, Marjeta; Ульрих, Наташа Поклар (13 апреля 2012 г.). «Влияние pH среды роста Aeropyrum на структурные свойства и текучесть археосом» . Археи . 2012 : 9. дои : 10,1155 / 2012/285152 . PMC  3384975 . PMID  22778670 .
  • Сакураба, Харухико; Сатура, Такенори; Кавакам, Рюши; Ким, Кван; Кара, Юске; Йонеда, Казунари; Осима, Тосихиса (16 апреля 2012 г.). «Кристаллическая структура новой связанной с красителем L-пролиндегидрогеназы из гипертермофильных архей Aeropyrum Pernix» . Журнал биологической химии . 287 (24): 20070–20080. DOI : 10.1074 / jbc.M111.319038 . PMC  3370190 . PMID  22511758 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Типовой штамм Aeropyrum pernix в Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию
  • Геном KEGG: Aeropyrum pernix