Семейство альдо / кеторедуктазы | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ленточная диаграмма альдозоредуктазы человека в комплексе с НАДФ + , цитратом и IDD594, низкомолекулярным ингибитором . Из PDB : 1us0 . | |||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||
Символ | Aldo_ket_red | ||||||||||
Pfam | PF00248 | ||||||||||
ИнтерПро | IPR001395 | ||||||||||
PROSITE | PDOC00061 | ||||||||||
SCOP2 | 1ads / SCOPe / SUPFAM | ||||||||||
CDD | cd06660 | ||||||||||
|
Семейство альдокеторедуктазы - это семейство белков, которые подразделяются на 16 категорий; они включают ряд родственных мономерных НАДФН- зависимых оксидоредуктаз , таких как альдегидредуктаза , альдозоредуктаза , простагландин F-синтаза , ксилозоредуктаза , ро-кристаллин и многие другие. [1]
Структура [ править ]
Все они обладают схожей структурой с бета-альфа-бета складкой, характерной для белков, связывающих нуклеотиды . [2] Складка включает параллельный бета-8 / альфа-8-ствол, который содержит новый мотив связывания НАДФ. Сайт связывания расположен в большом глубоком эллиптическом кармане на С- конце бета-листа , субстрат связан в протяженной конформации. Гидрофобная природа кармана отдает предпочтение ароматическим и неполярным субстратам по сравнению с высокополярными. [3]
Связывание кофермента НАДФН вызывает массивные конформационные изменения, переориентируя петлю, эффективно блокируя кофермент на месте. Это связывание больше похоже на FAD-, чем на NAD (P)-связывающие оксидоредуктазы. [4]
Примеры [ править ]
Некоторые белки этого семейства содержат регуляторный домен бета-цепи калиевого канала ; сообщается, что они обладают оксидоредуктазной активностью. [5]
См. Также [ править ]
- AKR1
- Стероидогенный фермент
Ссылки [ править ]
- ^ Bohren К.М., Баллок B, Вермут B, Gabbay KH (июнь 1989). «Суперсемейство альдокеторедуктаз. КДНК и выведенные аминокислотные последовательности альдегидных и альдозоредуктаз человека». J. Biol. Chem . 264 (16): 9547–51. PMID 2498333 .
- ^ Шад SZ, ранний SL, Williams TR, Kézdy FJ, Heinrikson RL, Гримий CE, Даутите CC (март 1990). «Анализ последовательности альдозоредуктазы хрусталика крупного рогатого скота». J. Biol. Chem . 265 (7): 3628–35. PMID 2105951 .
- ^ Вильсон Д. К., Bohren К.М., Gabbay KH, Quiocho FA (июль 1992). «Маловероятный сайт сахарного субстрата в структуре 1.65 A человеческого холофермента альдозоредуктазы, вовлеченный в диабетические осложнения». Наука . 257 (5066): 81–4. DOI : 10.1126 / science.1621098 . PMID 1621098 .
- ^ Borhani DW, Хартер TM, Петраш JM (декабрь 1992). «Кристаллическая структура бинарного комплекса альдозредуктазы.НАДФН». J. Biol. Chem . 267 (34): 24841–7. DOI : 10,2210 / pdb1abn / PDB . PMID 1447221 .
- ↑ Gulbis JM, Zhou M, Mann S, MacKinnon R (июль 2000 г.). «Структура цитоплазматической бета-субъединицы-T1 сборки потенциал-зависимых каналов K +». Наука . 289 (5476): 123–7. Bibcode : 2000Sci ... 289..123G . DOI : 10.1126 / science.289.5476.123 . PMID 10884227 .