Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Armatimonadetes является филюм из грам-отрицательных бактерий .

История [ править ]

Armatimonadetes был первоначально описан исключительно на основе последовательностей клонов гена 16S рРНК окружающей среды и был временно назван кандидатным типом OP10. Однако в 2011 году бактериальный штамм, принадлежащий к этому типу, был выделен из водного растения в Японии. Вид был назван Armatimonas rosea и был первым представителем своего типа, рода и вида. [1]

Члены [ править ]

Armatimonas rosea , аэробная хемогетеротрофная бактерия, штамм YO-36T, была выделена из ризоплана водного растения (тростник, Phragmites australis ), обитающего в пресноводном озере в Японии. [1]

Chthonomonas calidirosea , аэробная, сахаролитическая , облигатно термофильная, подвижная, неспорообразующая бактерия, штамм T49 (T), была выделена из геотермально нагретой почвы в Hell's Gate, Тикитере, Новая Зеландия. [2]

Филогения [ править ]

В настоящее время принятая таксономия основана на Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) [3] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) [4], а филогения основана на выпуске 123 LTP на основе 16S рРНК от The All -Проект «Живое дерево видов» . [5]

Таксономия [ править ]

  • Класс Fimbriimonadia Im et al. 2012 г.
  • Класс Armatimonadia Tamaki et al. 2011 г.
  • Класс Chthonomonadetes Lee et al. 2011 г.
    • Заказать Chthonomonadales Lee et al. 2011 г.
      • Семейство Chthonomonadaceae Lee et al. 2011 г.
        • Род Chthonomonas Lee et al. 2011 г.
          • Виды Chthonomonas calidirosea Lee et al. 2011 г.

Заметки [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ а б Тамаки, Хидеюки; Танака, Ясухиро; Мацудзава, Хироаки; Мурамацу, Мидзухо; Мэн, Сиань-Инь; Ханада, Сатоши; Мори, Казухиро; Камагата, Йоичи (2010). «Armatimonas rosea gen. Nov., Sp. Nov., Грамотрицательная, аэробная, хемогетеротрофная бактерия нового бактериального типа Armatimonadetes phyl. Nov., Официально названная кандидатным типом OP10» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 61 (Pt 6): 1442–7. DOI : 10.1099 / ijs.0.025643-0 . PMID  20622056 .
  2. ^ Ли, Кевин CY; Данфилд, Питер Ф .; Morgan, Xochitl C .; Кроу, Мишель А .; Houghton, Karen M .; Высоцкий Михаил; Райан, Джейсон LJ; Лагутин, Кирилл; и другие. (2010). «Chthonomonas calidirosea gen. Nov., Sp. Nov., Аэробный пигментированный термофильный микроорганизм нового класса бактерий Chthonomonadetes classis. Nov. Недавно описанного типа Armatimonadetes, первоначально обозначенного как подразделение-кандидат OP10» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 61 (Pt 10): 2482–90. DOI : 10.1099 / ijs.0.027235-0 . PMID 21097641 . 
  3. ^ JP Euzéby. «Арматимонадеты» . Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). Архивировано из оригинала на 2011-06-13 . Проверено 20 марта 2016 .
  4. ^ Сэйерс; и другие. «Арматимонадеты» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 марта 2016 .
  5. ^ Проект "Живое дерево всех видов" . «Выпуск 123 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF) . Silva Полная база данных рибосомных РНК . Проверено 20 марта 2014 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Страница для Арматимонадетов на LPSN