Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

LifeDomainKingdomPhylumClassOrderFamilyGenusSpecies
Иерархия восьми основных таксономических рангов биологической классификации . Царство содержит один или несколько типов. Промежуточные второстепенные рейтинги не показаны.

В биологии, филюм ( / е л əm / ; множественное число : фил ) является уровень классификации или таксономического ранга ниже царства и выше класса . Традиционно в ботанике термин « разделение » использовался вместо филума, хотя Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений принимает эти термины как эквивалентные. [1] [2] [3] В зависимости от определений животный мир Animaliaили Metazoa содержит приблизительно 35 типов; царство растений Plantae насчитывает около 14, а царство грибов Fungi - около 8 типов. Текущие исследования в области филогенетики раскрывают взаимосвязь между типами, которые содержатся в более крупных кладах , таких как Ecdysozoa и Embryophyta .

Общее описание [ править ]

Термин «тип» был введен в 1866 г. Эрнстом Геккелем из греческого слова « филон» ( φῦλον , «раса, род»), связанного с филоном ( φυλή , «племя, род»). [4] [5] Геккель отмечал, что виды постоянно эволюционировали в новые виды, которые, казалось, сохраняли мало согласованных между собой черт и, следовательно, несколько черт, которые отличали их как группу («замкнутое единство»). "Wohl aber ist eine solche reale und vollkommen abgeschlossene Einheit die Summe Aller Species, welche aus einer und derselben gemeinschaftlichen Stammform allmählig sich entwickelt haben, wie z. B. alle Wirbelthiere. Diese Summe nennen wir." что переводится как: Однако, возможно, такое реальное и полностью самодостаточное единство является совокупностью всех видов, которые постепенно эволюционировали из одной и той же общей исходной формы, как, например, все позвоночные. Мы называем эту совокупность [a] Stamm [т. Е. Раса] ( Филон ). В систематике растений , август W. Eichler (1883) Объявления растений в пять групп , названных подразделений, термин , который остается в использовании сегодня для групп растений, водорослей и грибов. [1] [6] Определения зоологической филы изменились от своих истоков в шести Линнея классов и четырех embranchements от Жоржа Кювье .[7]

Неформально типы можно рассматривать как группы организмов, основанные на общей специализации строения тела . [8] По сути, тип может быть определен двумя способами: как группа организмов с определенной степенью морфологического сходства или сходства в развитии ( фенетическое определение) или как группа организмов с определенной степенью эволюционного родства ( филогенетическое определение). [9] Попытка определить уровень иерархии Линнея без ссылки на (эволюционную) родственность неудовлетворительна, но фенетическое определение полезно при решении вопросов морфологического характера, например, насколько успешными были различные планы тела. [цитата необходима ]

Определение, основанное на генетическом родстве [ править ]

Наиболее важной объективной мерой в приведенных выше определениях является «определенная степень», которая определяет, насколько разные организмы должны быть членами разных типов. Минимальное требование состоит в том, чтобы все организмы в типе были явно более тесно связаны друг с другом, чем с любой другой группой. [9] Даже это проблематично, потому что требование зависит от знания взаимоотношений организмов: по мере того, как становится доступным больше данных, особенно из молекулярных исследований, мы можем лучше определять отношения между группами. Таким образом, типы могут быть объединены или разделены, если станет очевидно, связаны они друг с другом или нет. Например, бородатые червибыли описаны как новый тип (Pogonophora) в середине 20-го века, но молекулярная работа почти полвека спустя обнаружила, что они представляют собой группу кольчатых червей , поэтому эти типы были объединены (бородатые черви теперь представляют собой семейство кольчатых червей ) . [10] С другой стороны, весьма паразитарные филюмы мезозои были разделены на две филы ( ортонектида и Rhombozoa ) , когда она была обнаружена ортонектида, вероятно , вторичноротый и Rhombozoa первичноротого . [11]

Эта изменчивость типов привела к тому, что некоторые биологи призвали отказаться от концепции типа в пользу кладистики - метода, при котором группы помещаются на «генеалогическое древо» без какого-либо формального ранжирования размера группы. [9]

Определение на основе плана тела [ править ]

Определение типа, основанное на плане тела, было предложено палеонтологами Грэмом Баддом и Сереном Йенсеном (как это сделал Геккель столетием ранее). Это определение было предложено потому, что вымершие организмы сложнее всего классифицировать: они могут быть ответвлениями, которые отклонились от линии типа до того, как были приобретены все признаки, определяющие современный тип. По определению Бадда и Дженсена тип определяется набором символов, общих для всех его живых представителей.

Такой подход порождает некоторые небольшие проблемы - например, наследственные признаки, общие для большинства членов филума, могли быть потеряны некоторыми членами. Кроме того, это определение основано на произвольном моменте времени: настоящем. Однако, поскольку он основан на символах, его легко применить к летописи окаменелостей. Более серьезная проблема заключается в том, что он основан на субъективном решении о том, какие группы организмов следует рассматривать как типы.

Этот подход полезен, поскольку он позволяет легко классифицировать вымершие организмы как « стеблевые группы » по типу, с которым они имеют наибольшее сходство, основываясь только на таксономически важных сходствах. [9] Однако доказать, что окаменелость принадлежит к группе короны типа, сложно, поскольку она должна отображать характер, уникальный для подмножества группы короны. [9] Кроме того, организмы в группе ствола типа могут обладать «планом тела» этого типа без всех характеристик, необходимых для того, чтобы попасть в него. Это ослабляет представление о том, что каждый тип представляет собой отдельный план тела. [12]

На классификацию, использующую это определение, может сильно повлиять вероятность выживания редких групп, что может сделать тип намного более разнообразным, чем он был бы в противном случае. [13]

Известный тип [ править ]

Животные [ править ]

Общие числа являются приблизительными; цифры разных авторов сильно различаются, не в последнюю очередь потому, что некоторые из них основаны на описанных видах [14], некоторые - на экстраполяциях на количество неописанных видов. Например, описано около 25 000–27 000 видов нематод, в то время как опубликованные оценки общего числа видов нематод включают 10 000–20 000 видов; 500 000; 10 миллионов; и 100 миллионов. [15]

Растения [ править ]

Царство Plantae определяется разными биологами по-разному (см. Текущие определения Plantae ). Все определения включают живые эмбриофиты (наземные растения), к которым можно добавить два подразделения зеленых водорослей, Chlorophyta и Charophyta , чтобы сформировать кладу Viridiplantae . В приведенном ниже таблице следует влиятельной (хотя спорной) системе Cavalier-Smith в «приравнивании Plantae» с архепластидой , [19] представляет группу , содержащую и Зелёные Растения водорослевого Rhodophyta и глаукофитовые водоросли подразделения.

Определение и классификация растений на уровне подразделения также различаются от источника к источнику и постепенно меняются в последние годы. Таким образом, некоторые источники помещают хвощи в подразделение Arthrophyta, а папоротники в подразделение Pteridophyta [20], в то время как другие помещают их обоих в подразделение Pteridophyta, как показано ниже. Подразделение Pinophyta может использоваться для всех голосеменных растений (т. Е. Включая саговники, гинкго и гнетофиты) [21] или только для хвойных растений, как показано ниже.

С момента первой публикации системы APG в 1998 г., в которой предложена классификация покрытосеменных растений до уровня порядков , многие источники предпочли рассматривать ранги выше, чем порядки, как неформальные клады. Там, где были предоставлены формальные ранги, традиционные подразделения, перечисленные ниже, были сокращены до гораздо более низкого уровня, например, подклассы . [22]

Грибы [ править ]

Тип Microsporidia обычно входит в состав королевства Fungi, хотя его точные отношения остаются неясными [41], и Международное общество протистологов считает его простейшим [42] (см. Protista , ниже). Молекулярный анализ Zygomycota показал, что он полифилетичен (его представители не имеют прямого предка) [43], что многие биологи считают нежелательным. Соответственно, есть предложение об упразднении филума Zygomycota. Его члены будут разделены между типом Glomeromycota и четырьмя новыми подтипами incertae sedis (неопределенное местонахождение ): Entomophthoromycotina , Kickxellomycotina., Mucoromycotina и Zoopagomycotina . [41]

Протиста [ править ]

Королевство Protista (или Protoctista) входит в традиционной модели пяти- или шести-королевство, где он может быть определен как содержащий все эукариоты , которые не являются растения, животные или грибы. [16] : 120 Протиста - это полифилетический таксон [44], который для современных биологов менее приемлем, чем в прошлом. Были сделаны предложения разделить его между несколькими новыми царствами, такими как Protozoa и Chromista в системе Кавальера-Смита . [45]

Таксономия протистов долгое время была нестабильной, [46] с различными подходами и определениями, что привело к появлению множества конкурирующих схем классификации. Фил перечисленный здесь используется для Chromista и простейших в Каталоге жизни , [47] заимствован из системы , используемой Международное общество Protistologists. [42]

Каталог жизни включает Rhodophyta и Glaucophyta в царстве Plantae [47], но в других системах эти типы считаются частью Protista. [48]

Бактерии [ править ]

В настоящее время существует 29 типов, принятых в Списке имен прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) [49]

  1. Ацидобактерии , фенотипически разнообразные и в основном некультивируемые
  2. Актинобактерии , грамположительные виды с высоким содержанием G + C
  3. Aquificae , всего 14 теплолюбивых родов, глубокое ветвление
  4. Арматимонадеты
  5. Bacteroidetes
  6. Caldiserica , бывший кандидат подразделения OP5, Caldisericum exile является единственным представителем
  7. Хламидии , всего 6 родов
  8. Chlorobi , всего 7 родов, зеленые серные бактерии
  9. Chloroflexi , зеленые несернистые бактерии
  10. Chrysiogentes , всего 3 рода ( Chrysiogenes arsenatis , Desulfurispira natronophila , Desulfurispirillum alkaliphilum )
  11. Цианобактерии , также известные как сине-зеленые водоросли.
  12. Deferribacteres
  13. Deinococcus-Thermus , Deinococcus radiodurans и Thermus aquaticus являются «общеизвестными» видами этого типа.
  14. Диктиогломи
  15. Elusimicrobia , ранее кандидат в подразделение Thermite Group 1
  16. Фибробактерии
  17. Firmicutes , грамположительные виды с низким содержанием G + C, такие как спорообразующие бациллы (аэробные) и клостридии (анаэробные)
  18. Фузобактерии
  19. Гемматимонадетес
  20. Lentisphaerae , ранее клады VadinBE97
  21. Нитроспира
  22. Планктомицеты
  23. Протеобактерии , наиболее известные типы, содержащие такие виды, как Escherichia coli или Pseudomonas aeruginosa.
  24. Спирохеты , виды включают Borrelia burgdorferi , вызывающую болезнь Лайма.
  25. Synergistetes
  26. Tenericutes , альтернативно класс Mollicutes в типе Firmicutes (известный род: Mycoplasma )
  27. Термодесульфобактерии
  28. Термотоги , глубокое ветвление
  29. Веррукомикробия

Археи [ править ]

В настоящее время существует пять типов, принятых в Списке имен прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). [49]

  1. Crenarchaeota , второй по распространенности тип архей
  2. Euryarchaeota , наиболее распространенный тип архей
  3. Корархеота
  4. Наноархеи , сверхмалые симбиоты, единичные известные виды
  5. Таумархеота

См. Также [ править ]

  • Кладистика
  • Филогенетика
  • Систематика
  • Таксономия

Заметки [ править ]

  1. ^ Парафилетический

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b McNeill, J .; и др., ред. (2012). Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений (Мельбурнский кодекс), принятый Восемнадцатым Международным ботаническим конгрессом в Мельбурне, Австралия, июль 2011 г. (электронное издание). Международная ассоциация систематики растений . Дата обращения 14 мая 2017 .
  2. ^ «Науки о жизни» . Новый словарь культурной грамотности американского наследия (третье изд.). Компания Houghton Mifflin. 2005 . Проверено 4 октября 2008 года . Типы в царстве растений часто называют подразделениями.
  3. Берг, Линда Р. (2 марта 2007 г.). Вводная ботаника: растения, люди и окружающая среда (2-е изд.). Cengage Learning. п. 15. ISBN 9780534466695. Проверено 23 июля 2012 года .
  4. Перейти ↑ Valentine 2004 , p. 8.
  5. ^ Геккель, Эрнст (1866). Generelle Morphologie der Organismen [ Общая морфология организмов ] (на немецком языке). т. 1. Берлин (Германия): Г. Реймер. стр.  28 -29.
  6. ^ Найк, В. Н. (1984). Таксономия покрытосеменных растений . Тата МакГроу-Хилл. п. 27. ISBN 9780074517888.
  7. Перейти ↑ Collins AG, Valentine JW (2001). «Определение типа: эволюционные пути к плану тела многоклеточных животных». Evol. Dev. 3 : 432-442.
  8. ^ Валентин, Джеймс У. (2004). О происхождении Phyla . Чикаго: Издательство Чикагского университета. п. 7. ISBN 978-0-226-84548-7. Классификации организмов в иерархических системах использовались в семнадцатом и восемнадцатом веках. Обычно организмы группировались в соответствии с их морфологическим сходством, которое воспринималось первыми исследователями, а затем эти группы группировались в соответствии с их сходством и так далее, чтобы сформировать иерархию.
  9. ^ a b c d e Budd, GE; Дженсен, С. (май 2000 г.). «Критическая переоценка летописи окаменелостей билатерального типа» . Биологические обзоры . 75 (2): 253–295. DOI : 10.1111 / j.1469-185X.1999.tb00046.x . PMID 10881389 . S2CID 39772232 .  
  10. ^ Раус GW (2001). "Кладистический анализ Siboglinidae Caullery, 1914 (Polychaeta, Annelida): ранее типы Pogonophora и Vestimentifera" . Зоологический журнал Линнеевского общества . 132 (1): 55–80. DOI : 10.1006 / zjls.2000.0263 .
  11. ^ Павловски Дж, Монтойя-Бургос СО, Fahrni ДФ, Wüest Дж, Zaninetti л (октябрь 1996 г.). «Происхождение Mesozoa на основании последовательностей гена 18S рРНК» . Мол. Биол. Evol . 13 (8): 1128–32. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.molbev.a025675 . PMID 8865666 . 
  12. ^ Бадд, GE (сентябрь 1998 г.). «Эволюция плана тела членистоногих в кембрии на примере аномалокаридных мышц». Летая . 31 (3): 197–210. DOI : 10.1111 / j.1502-3931.1998.tb00508.x .
  13. ^ Бриггс, ДЭГ ; Форти, РА (2005). «Замечательная борьба: систематика, стволовые группы и филогенетический сигнал кембрийского излучения». Палеобиология . 31 (2 (Suppl)): 94–112. DOI : 10,1666 / 0094-8373 (2005) 031 [0094: WSSSGA] 2.0.CO; 2 .
  14. ^ Б с д е е г ч я J K L Чжан, Zhi-Цян (30 августа 2013 г. ). «Биоразнообразие животных: обновление классификации и разнообразия в 2013 году. В: Zhang, Z.-Q. (Ed.) Animal Biodiversity: Outline of High-level Classification and Survey of Taxonomic Richness (Addenda 2013)» . Zootaxa . 3703 (1): 5. DOI : 10.11646 / zootaxa.3703.1.3 .
  15. ^ Фелдер, Дэррил Л .; Кэмп, Дэвид К. (2009). Происхождение, воды и биота Мексиканского залива: биоразнообразие . Издательство Техасского университета A&M. п. 1111. ISBN 978-1-60344-269-5.
  16. ^ Б с д е е г ч я J к л м п о р Q R сек т у V ш х у г аа аЬ ас объявлением ае аф аг ах аи а ^ ак ал ам Маргулис, Линн; Чепмен, Майкл Дж. (2009). Королевства и Домены (4-е исправленное изд.). Лондон: Academic Press. ISBN 9780123736215.
  17. ^ Фельдкамп, S. (2002) Современная биология . Холт, Райнхарт и Уинстон, США. (стр.725)
  18. ^ Кэннон, JT; Веллутини, Британская Колумбия; Smith, J .; Ронквист, Ф .; Jondelius, U .; Хейнол, А. (4 февраля 2016 г.). «Xenacoelomorpha - родственная группа Nephrozoa» . Природа . 530 (7588): 89–93. Bibcode : 2016Natur.530 ... 89C . DOI : 10,1038 / природа16520 . PMID 26842059 . S2CID 205247296 .  
  19. ^ a b Кавальер-Смит, Томас (22 июня 2004 г.). «Всего шесть царств жизни» . Труды: Биологические науки . 271 (1545): 1251–1262. DOI : 10.1098 / rspb.2004.2705 . PMC 1691724 . PMID 15306349 .  
  20. ^ Mauseth 2012 , стр. 514, 517.
  21. ^ a b c Кронквист, А .; А. Тахтаджан; В. Циммерманн (апрель 1966 г.). «О высших таксонах Embryobionta». Таксон . 15 (4): 129–134. DOI : 10.2307 / 1217531 . JSTOR 1217531 . 
  22. Перейти ↑ Chase, Mark W. & Reveal, James L. (октябрь 2009 г.), «Филогенетическая классификация наземных растений, сопровождающих APG III», Ботанический журнал Линнеевского общества , 161 (2): 122–127, DOI : 10,1111 /j.1095-8339.2009.01002.x
  23. ^ a b c Маузет, Джеймс Д. (2012). Ботаника: Введение в биологию растений (5-е изд.). Садбери, Массачусетс: Джонс и Бартлетт Обучение. ISBN 978-1-4496-6580-7.п. 489
  24. ^ Mauseth 2012 , стр. 540.
  25. ^ Mauseth 2012 , стр. 542.
  26. ^ Mauseth 2012 , стр. 543.
  27. ^ Mauseth 2012 , стр. 509.
  28. ^ Crandall-Stotler, Барбара; Стотлер, Раймонд Э. (2000). «Морфология и классификация Marchantiophyta». В А. Джонатане Шоу; Бернар Гоффине (ред.). Биология мохообразных . Кембридж: Издательство Кембриджского университета. п. 21. ISBN 978-0-521-66097-6.
  29. ^ Mauseth 2012 , стр. 535.
  30. ^ Wyatt, Т., Wosten, Х., Dijksterhuis, J. (2013). «Достижения в прикладной микробиологии, глава 2 - Споры грибов для распространения в пространстве и времени». Успехи прикладной микробиологии . 85 : 43–91. DOI : 10.1016 / B978-0-12-407672-3.00002-2 . PMID 23942148 . CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  31. ^ "Классификации грибов | Безграничная биология" . course.lumenlearning.com . Дата обращения 5 мая 2019 .
  32. ^ а б «Архейская генетика | Безграничная микробиология» . course.lumenlearning.com .
  33. ^ Холт, Джек R .; Иудика, Карлос А. (1 октября 2016 г.). «Blastocladiomycota» . Разнообразие жизни . Саскуэханна университет . Проверено 29 декабря +2016 .
  34. ^ Холт, Джек R .; Иудика, Карлос А. (9 января 2014 г.). «Chytridiomycota» . Разнообразие жизни . Саскуэханна университет . Проверено 29 декабря +2016 .
  35. ^ "Chytridiomycota | тип грибов" . Британская энциклопедия . Дата обращения 5 мая 2019 .
  36. ^ McConnaughey, М (2014). Физико-химические свойства грибов . DOI : 10.1016 / B978-0-12-801238-3.05231-4 . ISBN 9780128012383.
  37. ^ Тейлор, Крингс и Тейлор, Томас, Майкл и Эдит (2015). «Ископаемые грибы, глава 4 - Chytridiomycota». Ископаемые грибы : 41–67. DOI : 10.1016 / b978-0-12-387731-4.00004-9 .
  38. ^ Холт, Джек R .; Иудика, Карлос А. (12 марта 2013 г.). «Микроспоридии» . Разнообразие жизни . Саскуэханна университет . Проверено 29 декабря +2016 .
  39. ^ Холт, Джек R .; Иудика, Карлос А. (23 апреля 2013 г.). «Neocallimastigomycota» . Разнообразие жизни . Саскуэханна университет . Проверено 29 декабря +2016 .
  40. ^ а б «Виды грибов» . BiologyWise . Дата обращения 5 мая 2019 .
  41. ^ а б Хиббетт Д.С., Биндер М., Бишофф Дж. Ф., Блэквелл М., Кэннон П. Ф., Эрикссон О. Э. и др. (Май 2007 г.). «Филогенетическая классификация грибов более высокого уровня» (PDF) . Микологические исследования . 111 (Pt 5): 509–47. CiteSeerX 10.1.1.626.9582 . DOI : 10.1016 / j.mycres.2007.03.004 . PMID 17572334 . Архивировано из оригинального (PDF) 26 марта 2009 года.   
  42. ^ a b Руджеро, Майкл А .; Гордон, Деннис П .; Оррелл, Томас М .; и другие. (29 апреля 2015 г.). «Классификация всех живых организмов высшего уровня» . PLOS ONE . 10 (6): e0119248. Bibcode : 2015PLoSO..1019248R . DOI : 10.1371 / journal.pone.0119248 . PMC 4418965 . PMID 25923521 .  
  43. ^ Белый, Мерлин М .; Джеймс, Тимоти Й .; О'Доннелл, Керри; и другие. (Ноябрь – декабрь 2006 г.). «Филогения Zygomycota на основе данных о последовательности ядерных рибосом». Mycologia . 98 (6): 872–884. DOI : 10.1080 / 15572536.2006.11832617 . PMID 17486964 . S2CID 218589354 .  
  44. Хаген, Джоэл Б. (январь 2012 г.). «Пять королевств, более или менее: Роберт Уиттакер и широкая классификация организмов» . Биология . 62 (1): 67–74. DOI : 10.1525 / bio.2012.62.1.11 .
  45. ^ Блэквелл, Уилл Н .; Пауэлл, Марта Дж. (Июнь 1999 г.). «Согласование королевств с кодексами номенклатуры: необходимо ли это?» . Систематическая биология . 48 (2): 406–412. DOI : 10.1080 / 106351599260382 . PMID 12066717 . 
  46. Дэвис, РА (19 марта 2012 г.). "Царство ПРОТИСТА" . Колледж горы Святого Иосифа . Проверено 28 декабря +2016 .
  47. ^ a b «Таксономическое дерево» . Каталог жизни . 23 декабря 2016 . Проверено 28 декабря +2016 .
  48. Корлисс, Джон О. (1984). «Королевство Протиста и его 45 Фила». Биосистемы . 17 (2): 87–176. DOI : 10.1016 / 0303-2647 (84) 90003-0 . PMID 6395918 . 
  49. ^ а б Дж. П. Эйзеби. «Список прокариотических имен, стоящих в номенклатуре: Phyla» . Проверено 28 декабря +2016 .[ постоянная мертвая ссылка ]

Внешние ссылки [ править ]

  • Типы "настоящие"? Действительно ли существует четко определенное «количество типов животных» в летописи окаменелостей?
  • Основные типы животных