Это хорошая статья. Для получения дополнительной информации нажмите здесь.
Страница защищена ожидающими изменениями
Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено из биологической классификации )
Перейти к навигации Перейти к поиску
Чтобы узнать о других значениях, см. Таксономия (значения) .
«Научная классификация» перенаправляется сюда. Для использования в других целях, см Научная классификация (значения) .
Эта статья о биологии. О практике набивки и оседлания животных см. Таксидермия .

Часть серии по
Эволюционная биология
Зяблики Дарвина, автор Gould.jpg
Зябликов Дарвина по Джон Гулд
Ключевые темы
Процессы и результаты
Естественная история
История эволюционной теории
  • Обзор
  • эпоха Возрождения
  • До Дарвина
  • Дарвин
  • Происхождение видов
  • До синтеза
  • Современный синтез
  • Молекулярная эволюция
  • Эво-дево
  • Текущее исследование
  • История видообразования
  • История палеонтологии ( хронология )
Поля и приложения
  • Приложения эволюции
  • Биосоциальная криминология
  • Экологическая генетика
  • Эволюционная эстетика
  • Эволюционная антропология
  • Эволюционные вычисления
  • Эволюционная экология
  • Эволюционная экономика
  • Эволюционная эпистемология
  • Эволюционная этика
  • Эволюционная теория игр
  • Эволюционная лингвистика
  • Эволюционная медицина
  • Эволюционная нейробиология
  • Эволюционная физиология
  • Эволюционная психология
  • Экспериментальная эволюция
  • Филогенетика
  • Палеонтология
  • Селекция
  • Видообразовательные эксперименты
  • Социобиология
  • Систематика
  • Универсальный дарвинизм
Социальные последствия
  • Эволюция как факт и теория
  • Социальные эффекты
  • Споры о сотворении и эволюции
  • Возражения против эволюции
  • Уровень поддержки
  •  Портал эволюционной биологии
  • Категория Категория
  • похожие темы
  • v
  • т
  • е

В биологии , систематики (от Древнегреческих τάξις ( такси )  «расположение», и -νομία ( -nomia )  « метод ») является научным исследованием имен, определение ( ограничивающим ) и классификации групп биологических организмов на основе общих характеристик. Организмы сгруппированы в таксоны (единственное число: таксон), и этим группам присваивается таксономический ранг. ; группы данного ранга можно агрегировать, чтобы сформировать более инклюзивную группу более высокого ранга, создавая таким образом таксономическую иерархию. Основные ранги в современном использовании - это домен , царство , тип (в ботанике иногда вместо типа используется разделение), класс , порядок , семейство , род и вид . Шведский ботаник Карл Линней считается основателем нынешней системы таксономии, поскольку он разработал ранжированную систему, известную как таксономия Линнея, для категоризации организмов и биноминальная номенклатура для наименования организмов.

С развитием теории, данных и аналитических технологий биологической систематики система Линнея превратилась в систему современной биологической классификации, предназначенной для отражения эволюционных отношений между организмами, как живыми, так и вымершими.

Определение [ править ]

Точное определение таксономии варьируется от источника к источнику, но суть дисциплины остается: концепция, наименование и классификация групп организмов. [1] В качестве ориентира ниже представлены недавние определения таксономии:

  1. Теория и практика группирования особей в виды, объединения видов в более крупные группы и присвоения этим группам названий, таким образом производя классификацию. [2]
  2. Область науки (и главный компонент систематики ), которая включает описание, идентификацию, номенклатуру и классификацию [3]
  3. Наука классификации, в биологии расположение организмов в классификации [4]
  4. «Наука о классификации применительно к живым организмам, включая изучение способов образования видов и т. Д.» [5]
  5. «Анализ характеристик организма с целью классификации» [6]
  6. « Систематика изучает филогению, чтобы предоставить образец, который можно перевести в классификацию и названия более обширной области таксономии» (внесено в список желательных, но необычных определений) [7]

Разнообразные определения либо помещают таксономию как подобласть систематики (определение 2), либо инвертируют эту связь (определение 6), либо, кажется, считают эти два термина синонимичными. Существуют некоторые разногласия относительно того , считается ли биологическая номенклатура частью таксономии (определения 1 и 2) или частью систематики вне таксономии. [8] Например, определение 6 сочетается со следующим определением систематики, которое выводит номенклатуру за пределы таксономии: [6]

  • Систематика : «Изучение идентификации, таксономии и номенклатуры организмов, включая классификацию живых существ с учетом их естественных взаимоотношений, а также изучение изменчивости и эволюции таксонов».

Целый набор терминов, включая таксономию, систематическую биологию , систематику, биосистематику , научную классификацию, биологическую классификацию и филогенетику , временами имел перекрывающиеся значения - иногда одинаковые, иногда немного разные, но всегда связанные и пересекающиеся. [1] [9] Здесь используется самое широкое значение слова «таксономия». Сам термин был введен в 1813 году де Кандолем в его « Теории élémentaire de la botanique» . [10]

Монография и таксономическая редакция [ править ]

Таксономическая ревизия или таксономическое обзор представляет собой новый анализ образцов вариации в конкретном таксоне . Этот анализ может быть выполнен на основе любой комбинации различных доступных типов признаков, таких как морфологические, анатомические, палинологические, биохимические и генетические. монографияили полная редакция - это пересмотр, который является исчерпывающим для таксона в отношении информации, предоставленной в определенное время и для всего мира. Другие (частичные) версии могут быть ограничены в том смысле, что они могут использовать только некоторые из доступных наборов символов или иметь ограниченный пространственный диапазон. Пересмотр приводит к подтверждению или новому пониманию взаимосвязей между субтаксонами в рамках изучаемого таксона, что может привести к изменению классификации этих субтаксов, идентификации новых субтаксов или слиянию предыдущих субтаксов. [11]

Таксономия альфа и бета [ править ]

Не путать с альфа-разнообразием .

Термин « альфа-таксономия » в основном используется сегодня для обозначения дисциплины поиска, описания и наименования таксонов , особенно видов. [12] В более ранней литературе этот термин имел другое значение, относящееся к морфологической таксономии и результатам исследований конца XIX века. [13]

Уильям Бертрам Туррилл ввел термин «альфа-таксономия» в серии статей, опубликованных в 1935 и 1937 годах, в которых он обсуждал философию и возможные будущие направления таксономии. [14]

... среди систематиков растет желание рассматривать свои проблемы с более широких точек зрения, исследовать возможности более тесного сотрудничества со своими цитологическими, экологическими и генетическими коллегами и признать, что некоторый пересмотр или расширение, возможно, радикального характера, их целей и методов, может быть желательным ... Turrill (1935) предположил, что, принимая старую бесценную таксономию, основанную на структуре и удобно обозначенную как "альфа", можно увидеть далекую таксономию, основанную на как можно более широкую основу морфологических и физиологических фактов, и такую, в которой «найдется место для всех данных наблюдений и экспериментов, относящихся, даже если косвенно, к конституции, подразделению, происхождению и поведению видов и других таксономических групп». Идеалы могут,можно сказать, никогда полностью не реализовать. Однако они обладают огромной ценностью действовать как постоянные стимуляторы, и если у нас есть какой-то, даже нечеткий, идеал таксономии «омега», мы можем немного продвинуться вниз по греческому алфавиту. Некоторые из нас радуют себя, думая, что сейчас мы нащупываем таксономию «бета».[14]

Таким образом, Туррилл явно исключает из альфа-таксономии различные области исследования, которые он включает в таксономию в целом, такие как экология, физиология, генетика и цитология. Далее он исключает филогенетическую реконструкцию из альфа-таксономии (стр. 365–366).

Более поздние авторы использовали этот термин в другом смысле, чтобы обозначить определение границ видов (не подвидов или таксонов других рангов), используя любые доступные исследовательские методы, включая сложные вычислительные или лабораторные методы. [15] [12] Таким образом, Эрнст Майр в 1968 году определил « бета-таксономию » как классификацию рангов выше видов. [16]

Понимание биологического значения изменчивости и эволюционного происхождения групп родственных видов еще более важно для второго этапа таксономической деятельности, разделения видов на группы родственников («таксонов») и их расположения в иерархии высшие категории. Эту деятельность обозначает термин «классификация»; ее также называют «бета-таксономией».

Микротаксономия и макротаксономия [ править ]

Основная статья: Проблема видов

То, как следует определять виды в определенной группе организмов, порождает практические и теоретические проблемы, которые называются проблемой видов . Научная работа по определению видов называется микротаксономией. [17] [18] [12] В более широком смысле, макротаксономия - это изучение групп в подроде более высоких таксономических рангов и выше. [12]

История [ править ]

В то время как некоторые описания таксономической истории пытаются датировать таксономию древними цивилизациями, по-настоящему научная попытка классификации организмов не предпринималась до 18 века. Ранние работы были в основном описательными и касались растений, которые были полезны в сельском хозяйстве или медицине. В этом научном мышлении есть несколько этапов. Ранняя таксономия была основана на произвольных критериях, так называемых «искусственных системах», включая систему половой классификации растений Линнея (конечно, классификация животных Линнеем была названа «Systema Naturae» («Система природы»), подразумевая, что он, по крайней мере, считал, что это больше, чем «искусственная система»). Позднее появились системы, основанные на более полном рассмотрении характеристик таксонов, получившие название «естественные системы ", напримерде Жюсьё (1789 г.), де Кандоль (1813 г.) и Бентам и Хукер (1862–1863 гг.). Эти классификации описаны эмпирические закономерности и были предварительно эволюционными мышления. Публикация книги Чарльза Дарвина « О происхождении видов» (1859 г.) привела к новому объяснению классификации, основанной на эволюционных отношениях. Это была концепция филетических систем с 1883 года. Типичным примером этого подхода являются подходы Эйхлера (1883) и Энглера (1886–1892). Появление кладистской методологии в 1970-х годах привело к классификации, основанной на единственном критерии монофилии , поддерживаемой наличиемсинапоморфии . С тех пор доказательная база была расширена данными молекулярной генетики, которые по большей части дополняют традиционную морфологию . [19] [ необходима страница ] [20] [ необходима страница ] [21] [ требуется страница ]

Pre-Linnaean [ править ]

Ранние систематики [ править ]

Имена и классификация нашего окружения, вероятно, имели место с тех пор, пока человечество могло общаться. Всегда было важно знать названия ядовитых и съедобных растений и животных, чтобы передать эту информацию другим членам семьи или группы. Иллюстрации лекарственных растений появляются на египетских настенных росписях ок. 1500 г. до н.э., что указывает на понимание использования различных видов и наличие базовой систематики. [22]

Древние времена [ править ]

Дополнительная информация: биология Аристотеля § Классификация
Описание редких животных (写生 珍禽 图) художника династии Сун Хуан Цюань (903–965)

Организмы впервые были классифицированы Аристотелем ( Греция , 384–322 гг. До н.э.) во время его пребывания на острове Лесбос . [23] [24] [25] Он классифицировал существа по их частям или, говоря современным языком, по признакам , таким как живорождение, наличие четырех ног, откладывание яиц, наличие крови или теплоту тела. [26] Он разделил все живое на две группы: растения и животных. [24] Некоторые из его групп животных, такие как Anhaima (животные без крови, переводятся как беспозвоночные ) и Enhaima (животные с кровью, примерно позвоночные), а также такие группы, как акулы и китообразные , все еще широко используются сегодня. [27] Его ученик Теофраст (Греция, 370–285 гг. До н.э.) продолжил эту традицию, упомянув около 500 растений и их использование в своей Historia Plantarum . Опять же, некоторые группы растений, все еще известные в настоящее время, можно проследить до Теофраста, такие как Cornus , Crocus и Narcissus . [24]

Средневековый [ править ]

Таксономия в средних веках была в значительной степени на основе аристотелевской системы , [26] с дополнениями относительно философский и экзистенциального порядка существ. Это включало такие концепции, как Великая цепь бытия в западной схоластической традиции [26], опять же, в конечном счете, унаследованные от Аристотеля. Аристотелевская система не классифицирует растения или грибы из-за отсутствия микроскопа в то время [25], поскольку его идеи основывались на организации всего мира в едином континууме согласно scala naturae (естественная лестница). [24] Это также принималось во внимание в Великой цепи бытия.[24] Успехи были достигнуты такими учеными, как Прокопий , Тимофей Газский , Деметриос Пепагомен и Фома Аквинский . Средневековые мыслители использовали абстрактные философские и логические классификации, более подходящие для абстрактной философии, чем для прагматической систематики. [24]

Ренессанс и Раннее Новое время [ править ]

В эпоху Возрождения , Эпохи Разума и Просвещения категоризация организмов стала более распространенной [24], а таксономические работы стали достаточно амбициозными, чтобы заменить древние тексты. Иногда это приписывают разработке сложных оптических линз, которые позволили изучать морфологию организмов гораздо более подробно. Одним из первых авторов, воспользовавшихся этим технологическим скачком, был итальянский врач Андреа Чезальпино (1519–1603), которого называли «первым систематиком». [28] Его magnum opus De Plantis вышел в 1583 году и описал более 1500 видов растений. [29] [30]Два больших семейства растений, которые он впервые обнаружил, используются и сегодня: сложноцветные и брассовые . [31] Затем в 17 веке Джон Рей ( Англия , 1627–1705) написал много важных таксономических работ. [25] Возможно, его величайшим достижением был Methodus Plantarum Nova (1682 г.) [32], в котором он опубликовал подробную информацию о более чем 18 000 видов растений. В то время его классификации были, пожалуй, самыми сложными, из когда-либо созданных любым систематиком, поскольку он основывал свои таксоны на множестве комбинированных признаков. Следующие важные таксономические работы были выполнены Джозефом Питтоном де Турнефором (Франция, 1656–1708 гг.). [33]Его работа 1700 года, Institutiones Rei Herbariae , включала более 9000 видов из 698 родов, что напрямую повлияло на Линнея, поскольку это был текст, который он использовал в молодости. [22]

Линнеевская эпоха [ править ]

Основная статья: линнеевская таксономия
Титульный лист Systema Naturae , Лейден, 1735 г.

Шведский ботаник Карл Линней (1707–1778) [26] открыл новую эру таксономии. С его основных работами Systema Naturae 1 - е изданием в 1735 году, [34] Виды Plantarum в 1753, [35] и Systema Naturae 10 - го издание , [36] он произвел революцию в современной таксономии. В его работах реализована стандартизированная биномиальная система именования видов животных и растений [37].который оказался изящным решением хаотичной и неорганизованной таксономической литературы. Он не только ввел стандарт класса, порядка, рода и вида, но также дал возможность идентифицировать растения и животных из своей книги, используя меньшие части цветка. [37] Таким образом, родилась система Линнея , которая до сих пор используется в основном так же, как и в 18 веке. [37] В настоящее время систематики растений и животных рассматривают работу Линнея как «отправную точку» для правильных названий (в 1753 и 1758 годах соответственно). [38] Имена, опубликованные до этих дат, называются «предлиннеевскими» и не считаются действительными (за исключением пауков, опубликованных в Svenska Spindlar [39]). Даже таксономические названия, опубликованные самим Линнеем до этих дат, считаются предлиннеевскими. [22]

Современная система классификации [ править ]

Основные статьи: эволюционная таксономия и филогенетическая номенклатура
Эволюция позвоночных на уровне класса, ширина веретена указывает количество семейств. Диаграммы шпинделя типичны для эволюционной систематики.
То же соотношение, выраженное в кладограмме, типичной для кладистики.

Структура групп, вложенных в группы, была определена классификацией растений и животных Линнеем, и эти закономерности начали представлять в виде дендрограмм царств животных и растений ближе к концу 18 века, задолго до того, как была опубликована книга «Происхождение видов ». . [25] Образец «Природной системы» не влечет за собой порождающий процесс, такой как эволюция, но, возможно, подразумевает его, вдохновляя ранних мыслителей-трансмутационистов. Среди ранних работ, исследующих идею трансмутации видов, были « Зоономия» Эразма Дарвина 1796 года и « Зоологическая философия» Жана-Батиста Ламарка 1809 года.[12] Идея была популяризирована в англоязычном мире благодаря спекулятивным, но широко читаемым « Остаткам естественной истории сотворения» , анонимно опубликованным Робертом Чемберсом в 1844 году. [40]

С теорией Дарвина быстро возникло общее признание того, что классификация должна отражать дарвиновский принцип общего происхождения . [41] Представления о древе жизни стали популярными в научных работах, включая известные группы окаменелостей. Одной из первых современных групп, связанных с ископаемыми предками, были птицы . [42] Используя недавно обнаруженные окаменелости археоптерикса и гесперорниса , Томас Генри Хаксли заявил, что они произошли от динозавров, группы, официально названной Ричардом Оуэном в 1842 году. [43] [44]Полученное в результате описание динозавров, «породивших» птиц или являющихся «предками» птиц, является важнейшим признаком эволюционного таксономического мышления. По мере того как в конце 19 - начале 20 веков обнаруживалось все больше и больше групп окаменелостей, палеонтологи пытались понять историю животных на протяжении веков, связывая известные группы. [45] Благодаря современному эволюционному синтезу начала 1940-х гг. Возникло по существу современное понимание эволюции основных групп. Поскольку эволюционная таксономия основана на таксономических рангах Линнея, в современном использовании эти два термина в значительной степени взаимозаменяемы. [46]

Кладистический метод возник с 1960 годом . [41] В 1958 году Джулиан Хаксли использовал термин клад. [12] Позже, в 1960 году, Каин и Харрисон ввели термин кладистический. [12] Важной особенностью является организация таксонов в иерархическом эволюционном дереве с желанием, чтобы все названные таксоны были монофилетическими. [41] Таксон называется монофилетическим, если он включает всех потомков предковой формы. [47] [48] Группы, из которых удалены дочерние группы, называются парафилетическими , [47] в то время как группы, представляющие более одной ветви от древа жизни, называютсяполифилетический . [47] [48] Монофилетические группы распознаются и диагностируются на основе синапоморфий , общих производных состояний характера. [49]

Кладистические классификации совместимы с традиционной линнеевской таксономией и кодексами зоологической и ботанической номенклатуры. [50] Была предложена альтернативная система номенклатуры, Международный кодекс филогенетической номенклатуры или PhyloCode , целью которой является регулирование формального наименования клад . [51] [52] Линнеевские ранги будут необязательными в соответствии с Филокодом , который предназначен для сосуществования с текущими ранговыми кодами. [52] Еще неизвестно, примет ли систематическое сообщество Филокод или отвергнет его в пользу нынешних систем номенклатуры, которые использовались (и изменялись по мере необходимости) более 250 лет.

Королевства и владения [ править ]

Базовая схема современной классификации. Можно использовать многие другие уровни; домен, высший уровень в жизни, является новым и спорным.
Основная статья: Королевство (биология)

Задолго до Линнея растения и животные считались отдельными царствами. [53] Линней использовал это как высший ранг, разделив физический мир на растительное, животное и минеральное царства. По мере того, как достижения в области микроскопии сделали возможной классификацию микроорганизмов, число царств увеличилось, причем системы из пяти и шести царств были наиболее распространенными.

Домены - относительно новая группа. Во- первых , предложенный в 1977 году, Карл Вёзе «сек система три домена не был общепринятым , пока позже. [54] Одной из основных характеристик метода трех доменов является разделение архей и бактерий , ранее сгруппированных в единое царство бактерий (царство, также иногда называемое Монера ), [53] с эукариотами для всех организмов, клетки которых содержат ядро. . [55] Небольшое количество ученых включает шестое царство, Археи, но не принимает метод домена. [53]

Томас Кавалье-Смит , который много писал о классификации простейших , недавно предположил, что Neomura , клад, объединяющий архей и эукарии , произошла от бактерий, точнее, от актинобактерий . В своей классификации 2004 года он рассматривал археобактерии как часть царства бактерий, то есть полностью отверг трехдоменную систему. [56] Стефан Лукета в 2012 году предложил систему из пяти «доминионов», добавив Prionobiota (бесклеточную и без нуклеиновой кислоты) и Virusobiota (бесклеточную, но с нуклеиновой кислотой) к традиционным трем доменам. [57]

Линней
1735 [58]		Геккель
1866 г. [59]		Чаттон
1925 [60]		Коупленд
1938 [61]		Уиттакер
1969 [62]		Woese et al.
1990 [63]		Кавальер-Смит
1998 [56]		Кавальер-Смит
2015 [64]
2 королевства3 королевства2 империи4 королевства5 королевств3 домена2 империи, 6 королевств2 империи, 7 королевств
(не лечится)ПротистаПрокариотаMoneraMoneraБактерииБактерииБактерии
АрхеиАрхеи
ЭукариотыПротоктистаПротистаЭукарияПростейшиеПростейшие
ChromistaChromista
VegetabiliaPlantaePlantaePlantaePlantaePlantae
ГрибыГрибыГрибы
AnimaliaAnimaliaAnimaliaAnimaliaAnimaliaAnimalia
Основная статья: Царство (биология) § Резюме

Последние всеобъемлющие классификации [ править ]

Существуют частичные классификации для многих отдельных групп организмов, которые пересматриваются и заменяются по мере появления новой информации; однако исчерпывающие опубликованные исследования большей части или всей жизни встречаются реже; недавние примеры - это Adl et al., 2012 и 2019, [65] [66], который охватывает эукариот только с акцентом на протистов, и Ruggiero et al., 2015, [67], охватывающий как эукариот, так и прокариот до ранга Порядок, хотя оба исключают ископаемых представителей. [67] Отдельный сборник (Ruggiero, 2014) [68] охватывает существующие таксоны до ранга семейства. Другие методы лечения, основанные на базах данных, включают Энциклопедию жизни ,Глобальный информационный фонд по биоразнообразию , база данных таксономии NCBI , Временный регистр морских и неморских родов , Открытое древо жизни и Каталог жизни . Database Палеобиология является ресурсом для ископаемых.

Заявление [ править ]

Биологическая таксономия - это раздел биологии , который обычно практикуют биологи, известные как «систематики», хотя энтузиасты- натуралисты также часто участвуют в публикации новых таксонов. [69] Поскольку таксономия направлена ​​на описание и организацию жизни , работа, проводимая систематиками, имеет важное значение для изучения биоразнообразия и, как следствие, области природоохранной биологии . [70] [71]

Классификация организмов [ править ]

Основная статья: Таксономический ранг

Биологическая классификация - важнейший компонент таксономического процесса. В результате он информирует пользователя о предполагаемых родственниках таксона. Биологическая классификация использует таксономические ряды, в том числе среди других (в порядке от наиболее до наименее включительно включительно): Домен , Великобритания , Филюм , Класс , Заказ , Семья , Род , виды и штамма . [72] [примечание 1]

Таксономические описания [ править ]

См. Также: Описание вида.
Типовой образец для Nepenthes smilesii , тропического растения-кувшина.

«Определение» таксона инкапсулируется его описанием или диагнозом, либо обоими вместе взятыми. Не существует установленных правил, регулирующих определение таксонов, но присвоение названий и публикация новых таксонов регулируется набором правил. [8] В зоологии , то номенклатура для наиболее часто используемых рангов ( надсемейство к подвиду ), регулируется Международного кодекса зоологической номенклатуры ( МКЗН Code ). [73] В области фикологии , микологии и ботаники наименование таксонов регулируетсяМеждународный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений ( ICN ). [74]

Первоначальное описание таксона включает пять основных требований: [75]

  1. Таксону необходимо дать название, основанное на 26 буквах латинского алфавита ( бином для новых видов или одночлен для других рангов).
  2. Имя должно быть уникальным (т.е. не омонимом ).
  3. Описание должно быть основано как минимум на одном образце номенклатурного типа .
  4. Он должен включать утверждения о соответствующих атрибутах либо для описания (определения) таксона, либо для дифференциации его от других таксонов (диагноз, Кодекс ICZN , статья 13.1.1, ICN , статья 38). Оба кода намеренно отделяют определение содержания таксона (его границы ) от определения его названия.
  5. Эти первые четыре требования должны быть опубликованы в работе, доступной в большом количестве идентичных копий, в качестве постоянной научной записи.

Тем не менее, часто намного больше информации включена, как географический диапазон таксона, экологические примечания, химия, поведение и т.д. Как исследователи прибывают на их таксонах меняется: в зависимости от имеющихся данных и ресурсов, методы варьируются от простых количественного или качественного сравнения поразительных особенностей, чтобы разработать компьютерный анализ больших объемов данных последовательностей ДНК . [76]

Цитата автора [ править ]

Основные статьи: цитирование авторов (ботаника) и цитирование авторов (зоология)

После научного названия может стоять «авторитет». [77] Авторитет - это имя ученого или ученых, которые первыми официально опубликовали это имя. [77] Например, в 1758 году Линней дал азиатскому слону научное имя Elephas maximus , поэтому это имя иногда пишут как « Elephas maximus Linnaeus, 1758». [78] Имена авторов часто сокращаются: обычно используется аббревиатура L. от Linnaeus . Фактически в ботанике существует регламентированный список стандартных сокращений (см. Список ботаников по аббревиатуре автора ). [79] Система назначения полномочий немного отличается междуботаника и зоология . [8] Однако стандартно, что если род вида был изменен с момента первоначального описания, оригинальное авторитетное название помещается в круглые скобки. [80]

Фенетика [ править ]

Основная статья: Фенетика

В фенетике, также известной как таксиметрия или числовая таксономия, организмы классифицируются на основе общего сходства, независимо от их филогении или эволюционных отношений. [12] Результатом является мера эволюционного «расстояния» между таксонами. Фенетические методы стали относительно редкими в наше время, в значительной степени вытесненными кладистическими анализами, поскольку фенетические методы не различают общие предковые (или плезиоморфные ) признаки от новых общих (или апоморфных) признаков. [81] Однако некоторые фенетические методы, такие как соединение соседей , нашли свое применение в кладистике как разумное приближение филогении, когда более продвинутые методы (такие как байесовский вывод ) являются слишком дорогостоящими в вычислительном отношении.[82]

Базы данных [ править ]

Основная статья: Таксономическая база данных

Современная таксономия использует технологии баз данных для поиска и каталогизации классификаций и их документации. [83] Хотя общепринятой базы данных нет, существуют всеобъемлющие базы данных, такие как « Каталог жизни» , в котором делается попытка перечислить все задокументированные виды. [84] По состоянию на апрель 2016 года в каталоге было перечислено 1,64 миллиона видов для всех королевств, что означает охват более трех четвертей предполагаемых видов, известных современной науке. [85]

См. Также [ править ]

  • Автоматическая идентификация видов
  • Бактериальная систематика
  • Кладограмма
  • Кластерный анализ
  • Консорциум штрих-кода жизни
  • Консорциум европейских таксономических учреждений
  • Дендрограмма
  • Генотипы
  • Глоссарий научного нейминга
  • Идентификация (биология)
  • Incertae sedis
  • Открытое Древо Жизни
  • Фенограмма
  • Теория множеств
  • Таксономия (общая)
  • Классификация вирусов

Примечания [ править ]

  1. ^ Эту систему ранжирования можно запомнить по мнемонике «Играют ли короли в шахматы на изящном стекле?»

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b Wilkins, JS (5 февраля 2011 г.). «Что такое систематика и что такое таксономия?» . Архивировано 27 августа 2016 года . Дата обращения 21 августа 2016 .
  2. ^ Джадд, WS; Кэмпбелл, CS; Келлог, EA; Стивенс, П.Ф .; Донохью, MJ (2007). «Таксономия». Систематика растений: филогенетический подход (3-е изд.). Сандерленд: Sinauer Associates.
  3. ^ Симпсон, Майкл Г. (2010). «Глава 1 Систематика растений: обзор». Систематика растений (2-е изд.). Академическая пресса. ISBN 978-0-12-374380-0.
  4. ^ Кирк, PM, Cannon, PF, Minter, DW, Stalpers, JA eds. (2008) «Таксономия». В словаре грибов , 10-е издание. CABI, Нидерланды.
  5. ^ Уокер, PMB, изд. (1988). Словарь Вордсворта по науке и технике . WR Chambers Ltd. и Cambridge University Press.
  6. ^ а б Лоуренс, Э. (2005). Биологический словарь Хендерсона . Пирсон / Прентис Холл. ISBN 978-0-13-127384-9.
  7. ^ Уиллер, Квентин Д. (2004). «Таксономическая сортировка и бедность филогении». В HCJ Godfray & S. Knapp (ред.). Таксономия двадцать первого века . Философские труды Королевского общества . 359 . С. 571–583. DOI : 10.1098 / rstb.2003.1452 . PMC 1693342 . PMID 15253345 .  
  8. ^ a b c «Номенклатура, названия и таксономия» . Межгорный гербарий - УрГУ . 2005. Архивировано из оригинального 23 ноября 2016 года.
  9. Перейти ↑ Small, Ernest (1989). «Систематика биологической систематики (или таксономия таксономии)». Таксон . 38 (3): 335–356. DOI : 10.2307 / 1222265 . JSTOR 1222265 . 
  10. ^ Сингх, Гурчаран (2004). Систематика растений: комплексный подход . Научные издательства. п. 20. ISBN 978-1-57808-351-0 - через Google Книги.
  11. ^ Макстед, Найджел (1992). «К определению методологии таксономической ревизии». Таксон . 41 (4): 653–660. DOI : 10.2307 / 1222391 . JSTOR 1222391 . 
  12. ^ a b c d e f g h «Таксономия: значение, уровни, периоды и роль» . Обсуждение биологии . 27 мая 2016. Архивировано 5 апреля 2017 года.[ ненадежный источник? ]
  13. ^ Rosselló-Мор, Рамон; Аманн, Рудольф (1 января 2001 г.). «Видовая концепция прокариот» . Обзоры микробиологии FEMS . 25 (1): 39–67. DOI : 10.1111 / j.1574-6976.2001.tb00571.x . ISSN 1574-6976 . PMID 11152940 .  
  14. ^ a b Turrill, WB (1938). «Расширение таксономии с особым вниманием к сперматофитам». Биологические обзоры . 13 (4): 342–373. DOI : 10.1111 / j.1469-185X.1938.tb00522.x . S2CID 84905335 . 
  15. ^ Steyskal, GC (1965). «Трендовые кривые скорости описания видов в зоологии». Наука . 149 (3686): 880–882. Bibcode : 1965Sci ... 149..880S . DOI : 10.1126 / science.149.3686.880 . PMID 17737388 . S2CID 36277653 .  
  16. ^ Майр, Эрнст (9 февраля 1968 г.), «Роль систематики в биологии: изучение всех аспектов разнообразия жизни - одна из наиболее важных задач в биологии», Science , 159 (3815): 595–599, Bibcode : 1968Sci ... 159..595M , DOI : 10.1126 / science.159.3815.595 , PMID 4886900 
  17. Перейти ↑ Mayr, Ernst (1982). «Глава 6: Микротаксономия, наука о видах» . Рост биологической мысли: разнообразие, эволюция и наследование . Belknap Press издательства Гарвардского университета. ISBN 978-0-674-36446-2.
  18. ^ «Результат вашего запроса» . www.biological-concepts.com . Архивировано 5 апреля 2017 года.
  19. Перейти ↑ Datta 1988 .
  20. ^ Stace 1989 .
  21. ^ Stuessy 2009 .
  22. ^ a b c Манктелоу, М. (2010) История таксономии. Архивировано 29 мая 2015 г. в Wayback Machine . Лекция кафедры систематической биологии Уппсальского университета.
  23. ^ Майр, Э. (1982) Рост биологической мысли . Белкнап П. из Гарвардского университета, Кембридж (Массачусетс)
  24. ^ a b c d e f g "Палеос: Таксономия" . palaeos.com . Архивировано из оригинала на 31 марта 2017 года.
  25. ^ а б в г «систематика | биология» . Британская энциклопедия . Архивировано 5 апреля 2017 года.
  26. ^ a b c d "Биология 101, Глава 20" . www.cbs.dtu.dk . 23 марта 1998 года. Архивировано 28 июня 2017 года.
  27. ^ Леруа, Armand Мари (2014). Лагуна: как Аристотель изобрел науку . Блумсбери. С. 384–395. ISBN 978-1-4088-3622-4.
  28. ^ "Андреа Чезальпино | Итальянский врач, философ и ботаник" . Британская энциклопедия . Архивировано 5 апреля 2017 года.
  29. ^ Чезальпино, Андреа; Марескотти, Джорджо (1583). De plantis libri XVI . Флоренция: Apud Georgium Marescottum - через Интернет-архив.
  30. ^ "Андреа Чезальпино | Итальянский врач, философ и ботаник" . Британская энциклопедия . Архивировано 5 апреля 2017 года.
  31. ^ Хайме, Prohens (2010). International Edition Vegetables I: Asteraceae, Brassicaceae, Chenopodicaceae и Cucurbitaceae (Справочник по селекции растений) . ISBN 978-1-4419-2474-2.
  32. ^ Джон, Рэй (1682). "Methodus plantarum nova" . impensis Хенрици Фэйторн и Джоаннис Керси, рекламное объявление Роф Кометерио Д. Паули. Архивировано 29 сентября 2017 года. Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
  33. ^ "Джозеф Питтон де Турнефор | Французский ботаник и врач" . Британская энциклопедия . Архивировано 5 апреля 2017 года.
  34. ^ Linnaeus, C. (1735) Systema naturae, sive regna tria naturae systematice proposita по классам, ординам, родам и видам . Хаак, Лейден
  35. ^ Linnaeus, C. (1753) Виды Plantarum . Стокгольм, Швеция.
  36. ^ Линней, К. (1758) Systema naturae, sive regna tria naturae systematice proposita по классам, порядкам, родам и видам , 10-е издание. Хаак, Лейден
  37. ^ a b c «Таксономия - Линнеевская система | биология» . Британская энциклопедия . Архивировано 5 апреля 2017 года.
  38. Перейти ↑ Donk, MA (декабрь 1957 г.). «Типизация и последующие отправные точки» (PDF) . Таксон . 6 (9): 245–256. DOI : 10.2307 / 1217493 . JSTOR 1217493 . Архивировано 18 мая 2015 года (PDF) из оригинала.  
  39. ^ Карл, Клерк; Карл, Бергквист; Эрик, Борг; Л., Готтман; Ларс, Сальвиус (1757). «Свенский шпиндель» . Литерис Лаур. Salvii. Архивировано 1 декабря 2017 года. Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
  40. ^ Secord, Джеймс А. (2000). Викторианская сенсация: экстраординарная публикация, получение и тайное авторство пережитков естественной истории сотворения мира . Издательство Чикагского университета . ISBN 978-0-226-74410-0. Архивировано из оригинального 16 мая 2008 года.
  41. ^ a b c «Таксономия - Классификация со времен Линнея | биология» . Британская энциклопедия . Архивировано 5 апреля 2017 года.
  42. ^ «Ископаемые останки самых ранних современных птиц в мире могут помочь нам понять исчезновение динозавров» . Архивировано 5 апреля 2017 года.[ нужен лучший источник ]
  43. ^ Хаксли, TH (1876): Лекции по эволюции. Нью-Йорк Трибьюн . Дополнительный. нет. 36. In Collected Essays IV: pp. 46–138. Исходный текст с рисунками. Архивировано 28 июня 2011 г. в Wayback Machine.
  44. ^ "Томас Генри Хаксли | Британский биолог" . Британская энциклопедия . Архивировано 6 февраля 2018 года.
  45. ^ Rudwick, MJS (1985). Значение окаменелостей: эпизоды в истории палеонтологии . Издательство Чикагского университета. п. 24. ISBN 978-0-226-73103-2.
  46. ^ Paterlini Марта (сентябрь 2007). «Должен быть порядок. Наследие Линнея в век молекулярной биологии» . EMBO Reports . 8 (9): 814–816. DOI : 10.1038 / sj.embor.7401061 . PMC 1973966 . PMID 17767191 .  
  47. ^ a b c Тейлор, Майк. «Что означают такие термины, как монофилетический, парафилетический и полифилетический?» . www.miketaylor.org.uk . Архивировано 1 августа 2010 года.
  48. ^ a b «Полифилетический против монофилетического» . ncse.com . Архивировано 5 апреля 2017 года.
  49. ^ Брауэр, Эндрю В.З. и Рэндалл Т. Шу. 2021. Биологическая систематика: принципы и приложения (3-е изд.) Cornell University Press, Итака, Нью-Йорк.
  50. ^ Schuh, Рэндалл Т. "Линнеевская система и ее 250-летнее существование". Ботанический обзор 69, вып. 1 (2003): 59.
  51. ^ Queiroz, Филип Д. Cantino, Кевин де. «Филокод» . www.ohio.edu . Архивировано 10 мая 2016 года.
  52. ^ a b "Филокод: концепция, история и преимущества | Таксономия" . Обсуждение биологии . 12 июля 2016 года. Архивировано 5 апреля 2017 года.[ ненадежный источник? ]
  53. ^ a b c «Царственная классификация живых организмов» . Обсуждение биологии . 2 декабря 2014. Архивировано 5 апреля 2017 года.[ ненадежный источник? ]
  54. ^ "Карл Вёзе | Институт геномной биологии Карла Р. Вёза" . www.igb.Illinois.edu . Архивировано из оригинального 28 апреля 2017 года.
  55. ^ Крафт, Джоэл и Донахью, Майкл Дж. (Ред.) (2004). Сборка Древа Жизни . Оксфорд, Англия: Издательство Оксфордского университета. ISBN 0-19-517234-5 . стр.45, 78, 555 
  56. ^ a b Кавальер-Смит, Т. (1998). «Пересмотренная система жизни шести царств» . Биологические обзоры . 73 (03): 203–66. DOI : 10.1111 / j.1469-185X.1998.tb00030.x . PMID 9809012 . 
  57. ^ Luketa, S. (2012). «Новые взгляды на мегаклассификацию жизни» (PDF) . Протистология . 7 (4): 218–237. Архивировано 2 апреля 2015 года (PDF) .
  58. Перейти ↑ Linnaeus, C. (1735). Systemae Naturae, sive regna tria naturae, систематика предложений по классам, порядкам, родам и видам .
  59. Перейти ↑ Haeckel, E. (1866). Generelle Morphologie der Organismen . Реймер, Берлин.
  60. ^ Chatton, Э. (1925). " Pansporella perplexa . Рефлексии о биологии и филогении простейших". Annales des Sciences Naturelles - Zoologie et Biologie Animale . 10-VII: 1–84.
  61. ^ Коупленд, Х. (1938). «Царства организмов». Ежеквартальный обзор биологии . 13 : 383–420. DOI : 10.1086 / 394568 .
  62. ↑ Whittaker, RH (январь 1969). «Новые представления о царствах организмов». Наука . 163 (3863): 150–60. Bibcode : 1969Sci ... 163..150W . DOI : 10.1126 / science.163.3863.150 . PMID 5762760 . 
  63. ^ Woese, C .; Kandler, O .; Уилис, М. (1990). «К естественной системе организмов: предложение о доменах архей, бактерий и эукариев» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (12): 4576–9. Bibcode : 1990PNAS ... 87.4576W . DOI : 10.1073 / pnas.87.12.4576 . PMC 54159 . PMID 2112744 .  
  64. ^ Ruggiero, Майкл А .; Гордон, Деннис П .; Оррелл, Томас М .; Байи, Николас; Бургуэн, Тьерри; Бруска, Ричард С .; Кавальер-Смит, Томас; Guiry, Michael D .; Кирк, Пол М .; Туэзен, Эрик В. (2015). «Классификация всех живых организмов более высокого уровня» . PLOS ONE . 10 (4): e0119248. Bibcode : 2015PLoSO..1019248R . DOI : 10.1371 / journal.pone.0119248 . PMC 4418965 . PMID 25923521 .  
  65. ^ Адл, СМ; Симпсон, AGB; Переулок, СЕ; Lukeš, J .; Бас, D .; Баузер, СС; и другие. (Декабрь 2015 г.). «Уточненная классификация эукариот» . Журнал эукариотической микробиологии . 59 (5): 429–493. DOI : 10.1111 / j.1550-7408.2012.00644.x . PMC 3483872 . PMID 23020233 .  
  66. ^ Адл, СМ; Бас, D .; Переулок, СЕ; Lukeš, J .; Schoch, CL; Смирнов, А .; и другие. (2019). «Изменения в классификации, номенклатуре и разнообразии эукариот» . Журнал эукариотической микробиологии . 66 (1): 4–119. DOI : 10.1111 / jeu.12691 . PMC 6492006 . PMID 30257078 .  
  67. ^ а б Руджеро, Массачусетс; Гордон, Д.П .; Оррелл, TM; Байи, Н .; Bourgoin, T .; Бруска, RC; и другие. (2015). «Классификация всех живых организмов более высокого уровня» . PLOS ONE . 10 (4): e0119248. Bibcode : 2015PLoSO..1019248R . DOI : 10.1371 / journal.pone.0119248 . PMC 4418965 . PMID 25923521 .  
  68. Перейти ↑ Ruggiero, Michael A. (2014). Семейства всех живых организмов, Версия 2.0.а.15, (26.04.14). Эксперт Солюшнс Интернешнл, ООО, Рестон, Вирджиния. 420 стр. Включенные данные доступны для загрузки по адресу https://www.gbif.org/dataset/8067e0a2-a26d-4831-8a1e-21b9118a299c (doi: 10.15468 / tfp6yv)
  69. ^ «Несколько плохих ученых угрожают свергнуть таксономию» . Смитсоновский институт . Проверено 24 февраля 2019 .
  70. ^ "Что такое таксономия?" . Лондон: Музей естественной истории. Архивировано из оригинала на 1 октября 2013 года . Проверено 23 декабря 2017 года .
  71. ^ Макнили, Джеффри А. (2002). «Роль таксономии в сохранении биоразнообразия» (PDF) . J. Nat. Консерв . 10 (3): 145–153. DOI : 10.1078 / 1617-1381-00015 . S2CID 16953722 . Архивировано (PDF) из оригинала 24 декабря 2017 года через Semantic Scholar.  
  72. ^ «Мнемоническая таксономия / биология: Порядок класса типа Kingdom ...» Архивировано 6 июня 2017 года.
  73. ^ "Код ICZN" . www.animalbase.uni-goettingen.de .
  74. ^ "Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений" . Международная ассоциация таксономии растений . Архивировано 11 января 2013 года.
  75. ^ "Как я могу описать новые виды?" . Международная комиссия по зоологической номенклатуре . Архивировано из оригинала на 6 марта 2012 года . Дата обращения 21 мая 2020 .
  76. ^ «Таксономия - Оценка таксономических знаков» . Encyclopdia Britannica . Архивировано 22 апреля 2019 года.
  77. ^ a b «Совет редакции: научные названия видов | AJE | Эксперты американских журналов» . www.aje.com . Архивировано 9 апреля 2017 года.
  78. ^ «Карол Линней: Классификация, таксономия и вклад в биологию - Видео и стенограмма урока | Study.com» . Study.com . Архивировано 9 апреля 2017 года.
  79. ^ Biocyclopedia.com. «Биологическая классификация» . www.biocyclopedia.com . Архивировано 14 мая 2017 года.
  80. ^ «Зоологическая номенклатура: основное руководство для авторов, не относящихся к систематике» . Annelida.net . Архивировано 16 марта 2017 года.
  81. ^ «Классификация» . Государственный университет Северной Каролины . Архивировано 14 апреля 2017 года . Проверено 27 апреля 2017 года .
  82. ^ Макдональд, Дэвид (осень 2008 г.). «Глоссарий молекулярных маркеров» . Университет Вайоминга . Архивировано 10 июня 2007 года.
  83. ^ Вуд, Дилан; Король, Маргарет; Лэндис, Дрю; Кортни, Уильям; Ван, Рунтан; Келли, Росс; Тернер, Джессика А .; Калхун, Винс Д. (26 августа 2014 г.). «Использование современных технологий веб-приложений для создания интуитивно понятных и эффективных инструментов визуализации и обмена данными» . Границы нейроинформатики . 8 : 71. DOI : 10,3389 / fninf.2014.00071 . ISSN 1662-5196 . PMC 4144441 . PMID 25206330 .   
  84. ^ «О - Список растений» . www.theplantlist.org .
  85. ^ «О Каталоге Жизни: Годовой Контрольный список 2016» . Каталог жизни . Интегрированная система таксономической информации (ITIS). Архивировано 15 мая 2016 года . Дата обращения 22 мая 2016 .

Библиография [ править ]

  • Стэйс, Клайв А. (1989) [1980]. Таксономия и биосистематика растений (2-е изд.). Кембридж: Издательство Кембриджского университета . ISBN 978-0-521-42785-2. Проверено 19 апреля 2015 года .
  • Датта, Субхаш Чандра (1988). Систематическая ботаника (4-е изд.). Нью-Дели: New Age International. ISBN 978-81-224-0013-7. Проверено 25 января 2015 года .
  • Стюесси, Тод Ф. (2009). Таксономия растений: систематическая оценка сравнительных данных . Издательство Колумбийского университета. ISBN 978-0-231-14712-5. Проверено 6 февраля 2014 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Что такое таксономия? в Музее естественной истории в Лондоне
  • Таксономия в NCBI Национальный центр информации по биотехнологии
  • Таксономия в UniProt the Universal Protein Resource
  • ITIS - интегрированная система таксономической информации
  • CETaF Консорциум европейских таксономических зал
  • Каталог свободных видов Wikispecies
  • Биологическая классификация.