Кристофер Бойс Бердж - профессор биологии и биологической инженерии Массачусетского технологического института .
Крис Бердж | |
---|---|
Родившийся | Кристофер Бойс Бердж 26 мая 1968 г. [1] |
Альма-матер | Стэндфордский Университет |
Известен | GENSCAN [2] [3] |
Награды | Премия Овертона [4] Премия им. Сирла [5] |
Научная карьера | |
Учреждения | Массачусетский Институт Технологий |
Тезис | Идентификация генов в геномной ДНК человека (1997) |
Докторант | Сэмюэл Карлин [6] |
Веб-сайт | гены |
Образование
Бердж получил степень бакалавра наук в Стэнфордском университете в 1990 году и продолжил обучение в аспирантуре по вычислительной биологии в Стэнфордском университете, получив докторскую степень [7] в 1997 году [1] под руководством Сэмюэля Карлина . [2] [3] Во время своего пребывания в Стэнфорде он отвечал за разработку алгоритмов для GENSCAN, используемых в прогнозировании генов, например, при первоначальном анализе проекта « Геном человека» . [8] Его докторская диссертация была озаглавлена « Идентификация генов в геномной ДНК человека» .
Исследовать
С 1997 по 1999 год Бердж работал постдоком в лаборатории Филиппа Аллена Шарпа , работая в области сплайсинга РНК и молекулярной эволюции . [9] Бердж присоединился к Массачусетскому технологическому институту в 1999 году в качестве научного сотрудника по биоинформатике . Он стал доцентом в 2002 году, адъюнкт-профессором в 2004 году, занял должность в 2006 году и получил звание профессора в 2010 году. Он является ассоциированным членом Института Броуда с 2004 года. [1] Его текущие исследовательские интересы включают геномику , РНК. сплайсинг и регуляция микроРНК [10] . [11] [12] [13] [14]
Бердж также работал в редакционных советах академических журналов RNA , PLOS Computational Biology , BMC Bioinformatics и BMC Genomics . [1]
Награды
В 2001 году он был удостоен премии Овертона [4] в области вычислительной биологии Международного общества вычислительной биологии . В 2003 году он был награжден премией Searle Scholar Award за исследования в области вычислительной биологии экспрессии генов . [5] В 2007 году он был награжден премией Научно-исследовательского института Шеринг-Плау (теперь известной как премия ASBMB Young Investigator Award) Американского общества биохимии и молекулярной биологии за выдающийся вклад в исследования биохимии и молекулярной биологии. [15]
Рекомендации
- ^ a b c d http://genes.mit.edu/burgelab/CBurgeCV.pdf Архивировано 17 августа 2011 г. в Wayback Machine Резюме Кристофера Берджа
- ^ a b Бердж, Кристофер ; Карлин, Самуэль (1997). «Прогнозирование полных структур генов в геномной ДНК человека» (PDF) . Журнал молекулярной биологии . 268 (1): 78–94. DOI : 10.1006 / jmbi.1997.0951 . PMID 9149143 . Архивировано из оригинального (PDF) 20 июня 2015 года.
- ^ а б Бердж, К .; Карлин, С. (1998). «Поиск генов в геномной ДНК». Текущее мнение в структурной биологии . 8 (3): 346–354. DOI : 10.1016 / S0959-440X (98) 80069-9 . PMID 9666331 .
- ^ а б «Приз Овертона» . www.iscb.org . Проверено 23 мая 2021 года .
- ^ а б "Программа стипендиатов Сирла: Кристофер Бердж (2003)" . Архивировано из оригинала на 5 сентября 2015 года . Проверено 10 августа 2015 года .
- ↑ Кристофер Бердж в проекте « Математическая генеалогия»
- ^ Бердж, Кристофер Бойс (2012). Идентификация генов в геномной ДНК человека (кандидатская диссертация). Стэндфордский Университет. ProQuest 304386368 .
- ^ Lander, ES ; Linton, M .; Birren, B .; Nusbaum, C .; Zody, C .; Болдуин, Дж .; Девон, К .; Dewar, K .; Дойл, М .; Fitzhugh, W .; Funke, R .; Gage, D .; Harris, K .; Heaford, A .; Howland, J .; Kann, L .; Lehoczky, J .; Levine, R .; McEwan, P .; McKernan, K .; Meldrim, J .; Месиров, JP; Миранда, С .; Моррис, В .; Naylor, J .; Raymond, C .; Rosetti, M .; Santos, R .; Шеридан, А .; и другие. (Февраль 2001 г.). «Первоначальное секвенирование и анализ генома человека» (PDF) . Природа . 409 (6822): 860–921. Bibcode : 2001Natur.409..860L . DOI : 10.1038 / 35057062 . ISSN 0028-0836 . PMID 11237011 .
- ^ Burge, C .; Padgett, R .; Шарп, П. (1998). «Эволюционные судьбы и происхождение интронов типа U12». Молекулярная клетка . 2 (6): 773–785. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80292-0 . PMID 9885565 .
- ^ Родс, МВт; Рейнхарт, Б. Дж.; Lim, LP; Бердж, CB; Бартель, Б .; Бартель, Д.П. (2002). «Прогнозирование мишеней микроРНК растений». Cell . 110 (4): 513–520. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (02) 00863-2 . PMID 12202040 .
- ^ Публикации Кристофера Бурже в индексируется Scopus библиографической базы данных. (требуется подписка)
- ^ Http://www.biomedexperts.com/Profile.bme/172484/Christopher_B_Burge архивации 2012-03-21 в Вайбак машины профиля Chris Бурже в BiomedExperts
- ^ Льюис, ВР; Бердж, CB; Бартель, Д.П. (2005). «Консервативное спаривание семян, часто фланкированное аденозинами, указывает на то, что тысячи генов человека являются мишенями для микроРНК». Cell . 120 (1): 15–20. DOI : 10.1016 / j.cell.2004.12.035 . PMID 15652477 .
- ^ Льюис, ВР; Shih, IH; Джонс-Роудс, штат Массачусетс; Бартель, Д.П .; Бердж, CB (2003). «Прогнозирование мишеней микроРНК млекопитающих». Cell . 115 (7): 787–98. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (03) 01018-3 . PMID 14697198 .
- ^ «Премия ASBMB для молодых исследователей, ранее являющаяся премией научно-исследовательского института ASBMB Schering-Plough» . Проверено 10 августа 2015 года .