Перейти к навигации Перейти к поиску
Разработчики) | BlueTractorSoftware Ltd |
---|---|
Операционная система | Mac OS X, Windows, Linux |
Платформа | Ява |
Тип | Биоинформатика |
Лицензия | коммерческий |
Веб-сайт | bluetractorsoftware.co.uk |
DNADynamo - это коммерческий пакет программного обеспечения для анализа последовательностей ДНК, производимый Blue Tractor Software Ltd [1] , работающий в Microsoft Windows , Mac OS X и Linux [2]. Он используется молекулярными биологами [3] для анализа последовательностей ДНК и белков. Бесплатная демоверсия доступна на сайте разработчиков программного обеспечения.
Особенности [ править ]
DNADynamo - это универсальный пакет для анализа последовательностей ДНК и белков, который может выполнять большинство функций, требуемых стандартной исследовательской лабораторией молекулярной биологии.
- Просмотр, редактирование и аннотирование последовательностей ДНК и белков
- Сборка Contig и редактирование хроматограммы, включая сравнение с эталонной последовательностью для выявления мутаций
- Выравнивание глобальной последовательности с помощью ClustalW и MUSCLE и редактирование.
- Выделите и перетащите редактирование выравнивания последовательности для ручного выравнивания ДНК по сравнению с белком
- Анализ сайтов с ограничениями - для просмотра сайтов с ограничениями в таблицах, а также на линейных и круговых картах.
- Субклонирование инструмент для сборки конструкций с использованием Сайты рестрикции или Gibson сборки ,
- Моделирование геля агарозы.
- Поиск в базе данных в Интернете - поиск в общедоступных базах данных в NCBI, таких как Genbank и UniProt .
- Онлайн- поиск BLAST .
- Анализ белков, включая оценку молекулярной массы, коэффициента экстинкции и pI.
- Дизайн праймера для ПЦР , включая интерфейс с Primer3
- Просмотр трехмерной структуры через интерфейс Jmol
История [ править ]
DNADynamo разрабатывается с 2004 года BlueTractorSoftware Ltd, компанией по разработке программного обеспечения, базирующейся в Северном Уэльсе, Великобритания [4]