Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

DNADynamo - это коммерческий пакет программного обеспечения для анализа последовательностей ДНК, производимый Blue Tractor Software Ltd [1] , работающий в Microsoft Windows , Mac OS X и Linux [2]. Он используется молекулярными биологами [3] для анализа последовательностей ДНК и белков. Бесплатная демоверсия доступна на сайте разработчиков программного обеспечения.

Особенности [ править ]

DNADynamo - это универсальный пакет для анализа последовательностей ДНК и белков, который может выполнять большинство функций, требуемых стандартной исследовательской лабораторией молекулярной биологии.

  • Просмотр, редактирование и аннотирование последовательностей ДНК и белков
  • Сборка Contig и редактирование хроматограммы, включая сравнение с эталонной последовательностью для выявления мутаций
  • Выравнивание глобальной последовательности с помощью ClustalW и MUSCLE и редактирование.
  • Выделите и перетащите редактирование выравнивания последовательности для ручного выравнивания ДНК по сравнению с белком
  • Анализ сайтов с ограничениями - для просмотра сайтов с ограничениями в таблицах, а также на линейных и круговых картах.
  • Субклонирование инструмент для сборки конструкций с использованием Сайты рестрикции или Gibson сборки ,
  • Моделирование геля агарозы.
  • Поиск в базе данных в Интернете - поиск в общедоступных базах данных в NCBI, таких как Genbank и UniProt .
  • Онлайн- поиск BLAST .
  • Анализ белков, включая оценку молекулярной массы, коэффициента экстинкции и pI.
  • Дизайн праймера для ПЦР , включая интерфейс с Primer3
  • Просмотр трехмерной структуры через интерфейс Jmol

История [ править ]

DNADynamo разрабатывается с 2004 года BlueTractorSoftware Ltd, компанией по разработке программного обеспечения, базирующейся в Северном Уэльсе, Великобритания [4]

Ссылки [ править ]

Внешние ссылки [ править ]