| Белок инициатора хромосомной репликации dnaA | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||
| Организм | |||||||
| Символ | DnaA | ||||||
| Entrez | 948217 | ||||||
| RefSeq (Prot) | NP_418157.1 | ||||||
| UniProt | P03004 | ||||||
| Прочие данные | |||||||
| Хромосома | геном: 3.88 - 3.88 Мб | ||||||
| |||||||
| Bac_DnaA_C | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура dnaa domainiv в комплексе с dnaabox dna | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Bac_DnaA_C | ||||||||
| Pfam | PF08299 | ||||||||
| Клан пфам | CL0123 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR013159 | ||||||||
| SCOP2 | 1j1v / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| Bac_DnaA | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 структура amppcp-связанной ДНК из aquifex aeolicus | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Bac_DnaA | ||||||||
| Pfam | PF00308 | ||||||||
| Клан пфам | CL0023 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR013317 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00771 | ||||||||
| SCOP2 | 1j1v / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
DnaA - это белок, который активирует репликацию ДНК у бактерий . [1] Это фактор инициации репликации, который способствует раскручиванию ДНК на oriC . [1] Начало фазы инициации репликации ДНК определяется концентрацией DnaA. [1] DnaA накапливается во время роста, а затем запускает репликацию. [1] Репликация начинается с активного связывания DnaA с 9-мерными (9- bp ) повторами выше oriC . [1] Связывание DnaA приводит к разделению цепей в 13-мерных повторах. [1]Это связывание заставляет ДНК образовывать петлю в процессе подготовки к расплавлению под действием геликазы DnaB . [1]
Функция [ править ]
Активная форма DnaA связана с АТФ . [1] Сразу после разделения клетки уровень активной ДНК в клетке низкий. [1] Хотя для активной формы DnaA требуется АТФ, образование комплекса oriC / DnaA и последующее раскручивание ДНК не требует гидролиза АТФ . [2]
Oric сайт в E.coli , имеет три Т богатых 13 пар оснований областей ( Dues ) , после четырех областей 9 п.н. с TTAT последовательности ( C или A) CA (C или A). [3] Около 10 молекул DnaA связываются с участками длиной 9 пар оснований, которые охватывают белки, заставляя ДНК в области, богатой AT, раскручиваться. В oriC имеется 8 сайтов связывания DnaA , с которыми DnaA связывается с дифференциальной аффинностью. Когда репликация ДНК вот-вот начнется, DnaA занимает все сайты связывания с высокой и низкой аффинностью. Область, богатая денатурированными AT, позволяет рекрутировать DnaB (геликаза ), который комплексуется с DnaC (загрузчик геликазы). DnaC помогает геликазе связываться и правильно размещать оцДНК в области 13 пар оснований; это достигается путем гидролиза АТФ , после которого высвобождается DnaC. Одноцепочечные связывающие белки (SSB) стабилизируют отдельные цепи ДНК, чтобы поддерживать репликационный пузырь . DnaB - это геликаза 5 '→ 3', поэтому она перемещается по отстающей нити . Он связывается с DnaG ( примазой ), образуя единственный праймер для ведущей цепи и добавляя РНК.праймеры на отстающую прядь. Взаимодействие между DnaG и DnaB необходимо для контроля долготы фрагментов Окадзаки на отстающей цепи. После этого ДНК-полимераза III может начать репликацию ДНК .
DnaA состоит из четырех доменов: первый - это N-конец, который связан с регуляторными белками, второй - это спиральный линкерный участок, третий домен - это AAA +-регион, который связывается с АТФ, и четвертый домен - C-концевой. Область связывания ДНК. [4] DnaA содержит две консервативные области: первая расположена в центральной части белка и соответствует АТФ-связывающему домену, вторая расположена в C-концевой половине и участвует в связывании ДНК. [5]
Синтез [ править ]
DnaA может связывать свой собственный промоутер . Когда DnaA связывается со своим собственным промотором, она блокирует связывание РНК-полимеразы с промотором и ингибирует инициацию транскрипции . Таким образом, DnaA может регулировать свое собственное выражение. [6] [7] Этот процесс называется саморегулированием .
См. Также [ править ]
- Комплекс распознавания происхождения
Ссылки [ править ]
- ^ Б с д е е г ч я Foster JB, Слончевским J (2009). Микробиология: развивающаяся наука . Нью-Йорк: WW Norton & Co. ISBN 978-0-393-97857-5.
- ^ Леонард AC, Grimwade JE (декабрь 2010 г.). «Регулируя сборку комплекса DnaA: пора восполнить пробелы» . Curr. Opin. Microbiol . 13 (6): 766–72. DOI : 10.1016 / j.mib.2010.10.001 . PMC 3005629 . PMID 21035377 .
- ^ Fuller RS, Funnell BE, Корнберг A (октябрь 1984). «Белковый комплекс dnaA с ориджином хромосомной репликации E. coli ( oriC ) и другими участками ДНК». Cell . 38 (3): 889–900. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (84) 90284-8 . PMID 6091903 . S2CID 23316215 .
- ^ Costa A, Hood IV, Бергер JM (2013-01-01). «Механизмы инициации репликации клеточной ДНК» . Ежегодный обзор биохимии . 82 : 25–54. DOI : 10.1146 / annurev-biochem-052610-094414 . PMC 4696014 . PMID 23746253 .
- ↑ Roth A, Messer W (май 1995 г.). «ДНК-связывающий домен белка-инициатора DnaA» . EMBO J . 14 (9): 2106–11. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07202.x . PMC 398312 . PMID 7744016 .
- ^ Хансен ФГ, Atlung Т (2018-02-28). «Сказка о ДНК» . Границы микробиологии . 9 : 319. DOI : 10,3389 / fmicb.2018.00319 . PMC 5835720 . PMID 29541066 .
- Перейти ↑ Speck C, Weigel C, Messer W (ноябрь 1999 г.). «Белок ATP- и ADP-dnaA, молекулярный переключатель в регуляции генов» . Журнал EMBO . 18 (21): 6169–76. DOI : 10.1093 / emboj / 18.21.6169 . PMC 1171680 . PMID 10545126 .
Дальнейшее чтение [ править ]
- Pratt CA, Voet D, Voet JG (2012). Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне . Нью-Йорк: Вили. ISBN 978-0-470-54784-7.
- Кокс М, Нельсон Д.Р. (2008). Принципы биохимии Ленингера . WH Freeman & Co. (Sd). ISBN 978-1-4292-2416-1.
- Шолефилд Дж, Эррингтон Дж, Мюррей Х (2012). «Soj / ParA останавливает репликацию ДНК, ингибируя образование спирали белка-инициатора DnaA» . Журнал EMBO . 31 (6): 1542–1555. DOI : 10.1038 / emboj.2012.6 . PMC 3321191 . PMID 22286949 .
Внешние ссылки [ править ]
- DnaA + белок, + бактерии в Национальных медицинских предметных рубриках США (MeSH)
