Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
FlexGen BV
ПромышленностьБиотехнологии
Основан2004 г.
Штаб-квартира
Лейден
,
Нидерланды
Обслуживаемая площадь
Мировой
ТоварыFlexArrayer, пользовательские олигопулы FleXelect
УслугиИндивидуальный синтез олигопула
Интернет сайтhttp://www.flexgen.nl

FlexGen - биотехнологическая компания, базирующаяся в Лейдене, Нидерланды. FlexGen был дочерним предприятием Медицинского центра Лейденского университета и компании Dutch Space (часть EADS ) и обладал собственными технологиями для лазерного синтеза олигонуклеотидов и других биомолекул на месте. 21 декабря 2015 года компания Flexgen Bv в Лейдене (Зюйд-Голландия) была признана банкротом судом в Гелдерланд Источник .

Продукты [ править ]

FleXelect [ править ]

Олигопулы FleXelect состоят из пользовательских олигонуклеотидов в растворе и могут использоваться для целевого обогащения в растворе перед секвенированием ДНК следующего поколения . Целевое обогащение или гибридная селекция в растворе - это метод геномной селекции во все большем числе приложений [1] [2], таких как;

  1. Анализ интересующих нестандартных геномных областей (например, конкретных генов, нескольких вариантов и / или полных путей).
  2. Анализ хромосомной транслокации
  3. Проверка однонуклеотидного полиморфизма или SNP (обычно после исследований всего генома или всего экзома)
  4. Другие приложения для исследований и диагностики (например, синтетическая биология )

Примером недавнего применения является тестирование генов риска рака груди BRCA1 и BRCA2 [3]

FlexArrayer [ править ]

FlexArrayer - это собственный инструмент для синтеза олигонуклеотидов. FlexArrayer обеспечивает высокопроизводительный синтез олигопул FleXelect для целевого обогащения в растворе, а также для производства индивидуальных микрочипов. FlexArrayer также применим для повторной последовательности на основе массива. [4]

FlexArrayer обеспечивает синтез микрочипов и олигопул, обычно используемых:

  1. Центры геномики и средства секвенирования
  2. Институты здоровья и безопасности и микробиологические лаборатории
  3. Новаторы в области технологий в следующих областях: химия поверхности, PNA ( пептидная нуклеиновая кислота ), siRNA ( малая интерферирующая РНК ) и др.

Технология [ править ]

Производство микрочипов и олигопул FleXelect осуществляется с помощью FlexArrayer (см. Изображение) с использованием запатентованной технологии. FlexArrayer синтезирует специальные наборы зондов на субстрате на основе технологии снятия защиты с олигонуклеотидов;

  1. Перед первым этапом синтеза олигонуклеотидов вся поверхность ДНК-микрочипа покрывается фотолабильными группами.
  2. Эти точки, в которых должно произойти первое добавление нуклеотидов, индивидуально активируются лазером.
  3. Раствор нуклеотидов промывают поверхность микрочипа, и нуклеотиды химически связываются с активированными пятнами.
  4. Все нуклеотиды содержат фотолабильную группу, которая, в свою очередь, может быть активирована. Выполняется столько раундов фотоактивации и добавления нуклеотидов, сколько требуется для синтеза олигонуклеотидов желаемой длины.
  5. Это повторяется до 60 раз, пока не будут синтезированы требуемые последовательности (до 100 000). Таким образом, максимальная длина любого олигонуклеотида, продуцируемого на этой платформе, составляет 60 мкм.
  6. Теперь микроматрица готова к использованию, в качестве альтернативы олигонуклеотиды можно отщепить для получения олигопул FleXelect.
FlexArrayer , инструмент для синтеза олигонуклеотидов.

Ссылки [ править ]

  1. ^ Маманова, Л .; Коффи, Эй Джей; Скотт, CE; Козарева, И .; Тернер, EH; Кумар, А .; Howard, E .; Shendure, J .; Тернер, ди-джей (2010). «Стратегии целевого обогащения для секвенирования следующего поколения». Природные методы . 7 (2): 111–118. DOI : 10.1038 / nmeth.1419 . PMID  20111037 .Маманова, Л .; Коффи, Эй Джей; Скотт, CE; Козарева, И .; Тернер, EH; Кумар, А .; Howard, E .; Shendure, J .; Тернер, ди-джей (2010). «Стратегии целевого обогащения для секвенирования следующего поколения» . Природные методы . 7 (6): 479. DOI : 10.1038 / nmeth0610-479c .
  2. ^ Tewhey, R .; Nakano, M .; Ван, X .; Pabón-Peña, C .; Новак, Б .; Giuffre, A .; Линия.; Happe, S .; Робертс, Д. Н.; Лепруст, EM; Topol, EJ; Harismendy, O .; Фрейзер, К.А. (2009). «Обогащение целей секвенирования из генома человека путем гибридизации раствора» . Геномная биология . 10 (10): R116. DOI : 10.1186 / ГБ-2009-10-10-r116 . PMC 2784331 . PMID 19835619 .  
  3. ^ Две европейские лаборатории обращаются к секвенированию нового поколения для тестирования BRCA1 / 2, INsequence, 26 октября 2010 г.
  4. ^ SM Carr et al., ДНК «Повторное секвенирование» с помощью микроматрицы, 2008. Comp Biochem Physiol D, Genomics & Proteomics 3,1-11 (ссылка)

Внешние ссылки [ править ]

  • Веб-сайт бывшей компании FlexGen на WayBack Machine