Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Фузобактерии
«Fusobacterium novum» в жидкой культуре
Fusobacterium novum в жидкой культуре
Научная классификация е
Домен:Бактерии
Тип:Фузобактерии
Garrity & Holt 2012
Учебный класс:Фузобактерии
Staley & Whitman, 2012 г.
Заказ:Фузобактерии
Staley & Whitman, 2012 г.
Семьи и роды [1]

Фузобактерии - это облигатно-анаэробные неспорообразующие грамотрицательные палочки . Со времени первых сообщений в конце девятнадцатого века этим организмам применялись разные названия, иногда одно и то же название применялось к разным видам. Совсем недавно произошли не только изменения в номенклатуре , но и попытки провести различие между видами, которые считаются либо патогенными, либо комменсальными, либо и тем, и другим. Из-за их асахаролитическиххарактера и общей нехватки положительных результатов рутинных биохимических тестов, лабораторная идентификация фузобактерий была затруднена. Однако применение новых молекулярно-биологических методов к таксономии позволило установить ряд новых видов вместе с подвидом Fusobacterium necrophorum и F. nucleatum и предоставить новые методы идентификации. Участие фузобактерий в широком спектре инфекций человека, вызывающих некроз тканей и сепсис, было признано давно, а в последнее время сообщалось об их значении во внутриамниотических инфекциях, преждевременных родах и тропических язвах.

Начиная с первых сообщений о фузобактериях в конце девятнадцатого века, разнообразие названий видов привело к некоторой путанице в пределах родов Fusobacterium и Leptotrichia . Однако новые методы исследования привели к лучшему пониманию таксономии с описанием нескольких новых видов фузобактерий. Среди новых описанных видов - F. ulcerans из тропических язв и несколько видов из полости рта. Возможно также подвидение важных видов F. necrophorum и F. nucleatum . Вероятно, что в будущем систематика фузобактерий получит дальнейшее развитие. [2]

Филогения [ править ]

В настоящее время принятая таксономия основана на Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LSPN) [3] [4], а филогения основана на выпуске 123 LTP на основе 16S рРНК, разработанном The All-Species Living Tree Project . [5]

 
Лептотрихиевые
Стрептобациллы
 

S. hongkongensis Woo et al. 2014 г.

 
 
 

S. moniliformis Levaditi et al. 1925 г.

 
 

Sneathia sanguinegens Collins et al. 2002 (тип sp.)

 
 
 
 
 

Sebaldella termitidis (Sebald 1962) Коллинз и Шах 1986

 
Лептотрихия
 

L. goodfellowii Eribe et al. 2004 г.

 
 
 

L. hofstadii Eribe et al. 2004 г.

 
 
 

L. buccalis (Robin 1853) Trevisan 1879 (тип sp.)

 
 
 

L. wadei Eribe et al. 2004 г.

 
 
 

L. shahii Eribe et al. 2004 г.

 
 
 

L. hongkongensis Woo et al. 2011 г.

 
 

L. trevisanii Tee et al. 2002 г.

 
 
 
 
 
 
 
 
 
TITE '' '' 'Жирный текст' '' ''
 

Psychrilyobacter atlanticus Zhao et al. 2009 г.

 
 
 
 

Ilyobacter tartaricus Schink 1985 г.

 
 
 
 

Ilyobacter polytropus Stieb and Schink 1985 (тип sp.)

 
 

Propionigenium maris Janssen and Liesack 1996 исправляют. Watson et al. 2000 г.

 
 
 
 

Ilyobacter Insetus Brune et al. 2002 г.

 
 

Propionigenium modestum Schink, Pfennig 1983 (тип sp.)

 
 
 
 
 
Цетобактерии
 

C. ceti Foster et al. 1996 г. (тип sp.)

 
 

C. somerae Finegold et al. 2003 г.

 
 
Фузобактерии
 

F. perfoetens ( Tissier 1905) Мур и Холдеман 1973

 
 
 
 

F. necrogenes (Weinberg et al. 1937) Moore and Holdeman 1970

 
 
 

F. mortiferum (Harris 1901) Мур и Холдеман 1970

 
 

Clostridium rectum (Heller, 1922), Holdeman and Moore, 1972 г.

 
 
 
 
 
 

F. ulcerans Adriaans and Shah 1988 г.

 
 

F. varium (Eggerth and Gagnon 1933) Мур и Холдеман 1969

 
 
 
 
 

F. gonidiaformans (Tunnicliff and Jackson 1925) Мур и Холдеман 1970

 
 
 

F. equinum Dorsch et al. 2001 г.

 
F. necrophorum
 

F. n. Funduliforme (бывший Hallé 1898) Shinjo et al. 1991 г.

 
 

F. n. necrophorum (Flügge 1886) Shinjo et al. 1991 г.

 
 
 
 
 
 

F. russii (Hauduroy et al., 1937) Мур, Холдман, 1970 г.

 
 
 

F. nucleatum polymorphum (ex Knorr 1922), Dzink et al. 1990 г.

 
 
 

F. periodonticum Slots et al. 1984

 
 
 
 

F. canifelinum Conrads et al. 2004 г.

 
 
 

F. nucleatum fusiforme (ex Veillon and Zuber 1898) Gharbia and Shah 1992

 
 

F. nucleatum vincentii Dzink et al. 1990 г.

 
 
 
 
 

F. nucleatum nucleatum (Knorr, 1922), Dzink et al. 1990 г. (тип sp.)

 
 
 

F. simiae Slots and Potts 1982 г.

 
 
 

F. nucleatum animalis Gharbia and Shah 1992 г.

 
 

Filifactor alocis (Cato et al. 1985) Jalava and Eerola 1999 г.

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Примечание 1: виды, не использованные в проекте « Живое дерево всех видов»

  • Лептотрихиевые
    • Caviibacter abscessus Eisenberg et al. 2016 г.
    • Oceanivirga salmonicida Eisenberg et al. 2016 г.
    • Streptobacillus felis Eisenberg et al. 2015 г.
    • Streptobacillus notomytis Eisenberg et al. 2015 г.
    • Streptobacillus ratti Eisenberg et al. 2015 г.
    • Sneathia amnionii ♠ Harwich et al. 2012 г.
  • Фузобактерии
    • Ilyobacter delafieldii Janssen and Harfoot 1991 г.
    • Ilyobacter psychrophilus ♠ Qoura & Андраникян 2005a
    • Fusobacterium naviforme (Jungano 1909) Мур и Холдеман 1970
    • Fusobacterium plautii corrig. Сеген 1928
    • Fusobacterium polysaccharolyticum van Gylswyk 1981
    • Fusobacterium prausnitzii (Hauduroy et al., 1937), Moore & Holdeman, 1970 г.
    • Fusobacterium sulci Cato et al. 1985 г.

Примечание 2:
♠ Штамм, обнаруженный в Национальном центре биотехнологической информации (NCBI), но не внесенный в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN

Появляются новые доказательства того, что эти бактерии могут вызывать рак толстой кишки у человека или быть связаны с ним. В 2011 году исследователи сообщили о наличии фузобактерий в ткани рака толстой кишки (Genome Res 2012; 22: 292), а новое многоцентровое исследование предоставило доказательства того, что некоторые случаи, особенно правосторонние, могут быть вызваны инфекцией фузобактериями (1).

1. Bullman S et al. Science 2017 15 декабря; 358: 1443.

См. Также [ править ]

  • Веретенообразный

Ссылки [ править ]

  1. ^ «Фузобактерии» . Таксономия NCBI . Bethesda, MD: Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 3 января 2019 .
  2. ^ Беннетт, KW; Элей, А. (1 октября 1993 г.). «Фузобактерии: новая систематика и родственные болезни» . Журнал медицинской микробиологии . 39 (4): 246–254. DOI : 10.1099 / 00222615-39-4-246 . PMID 8411084 . [ постоянная мертвая ссылка ]
  3. ^ JP Euzéby. «Фузобактерии» . Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) . Проверено 20 марта 2016 .
  4. ^ Сэйерс; и другие. «Фузобактерии» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 марта 2016 .
  5. ^ См. Проект «Живое дерево всех видов» [1] . Данные извлечены из «релиза 123 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF) . Silva Полная база данных рибосомных РНК . Проверено 20 марта 2016 .