Genome @ home был проектом распределенных вычислений, которым руководил Стефан Ларсон из Стэнфордского университета , и дочерним проектом Folding @ home . Его целью был дизайн белка и его применение, что имело значение во многих областях, включая медицину . Genome @ home находится в ведении Pande Lab в Стэнфордском университете , некоммерческой организации, занимающейся научными исследованиями и образованием. [1]
Функция [ править ]
Следуя проекту « Геном человека» , ученым необходимо было знать биологические и медицинские последствия полученного богатства генетической информации. Genome @ home использовала лишнюю вычислительную мощность на персональных компьютерах для виртуального конструирования генов , соответствующих существующим белкам , хотя также может создавать новые белки, которые не были обнаружены в природе. [2] Этот процесс требует больших вычислительных ресурсов, поэтому распределенные вычисления являются жизнеспособным вариантом. Исследователи могут использовать результаты проекта, чтобы лучше понять эволюцию природных геномов и белков, а также их функции. Этот проект нашел применение в медицинской терапии., новые фармацевтические препараты и присвоение функций вновь секвенированным генам. [2]
Genome @ home непосредственно изучала геномы и белки, виртуально создавая новые последовательности для существующих трехмерных белковых структур, которые другие ученые получали с помощью рентгеновской кристаллографии или методов ЯМР . Понимая взаимосвязь между последовательностями и конкретными белковыми структурами, лаборатория Панде занялась современными проблемами структурной биологии , генетики и медицины . [1]
В частности, проект Genome @ home помог понять, почему тысячи различных аминокислотных последовательностей все образуют одни и те же структуры, и помог в области протеомики и структурной геномики , предсказав функции недавно открытых генов и белков. Это также имело значение в медицинской терапии , создавая и виртуально создавая новые версии существующих белков. [1] Программное обеспечение Genome @ home было разработано для однопроцессорных систем. Он начинается с большого набора потенциальных последовательностей и многократно просматривает и уточняет эти последовательности, пока не будет найдена хорошо продуманная последовательность. Затем он отправляет эту последовательность на сервер и повторяет процесс. [1]
Заключение [ править ]
По финансовым причинам проект был официально завершен 8 марта 2004 г., хотя данные собирались до 15 апреля. После его завершения пользователей попросили вместо этого сделать пожертвование в Folding @ home . [1] [3]
Результаты [ править ]
В нем собрана большая база данных последовательностей белков, которая в течение многих лет будет использоваться в важных научных целях лабораторией Панде и другими учеными по всему миру. [1] [3]
На сайте Genome @ home появилось четыре рецензируемых научных публикации . [4]
См. Также [ править ]
- Список распределенных вычислительных проектов
Ссылки [ править ]
- ^ Б с д е е Панде лаборатории. "Genome @ home FAQ" . Стэнфордский университет . Архивировано из оригинального (FAQ) 27.07.2011 . Проверено 5 сентября 2011 . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
- ^ a b Лаборатория Панде. "Что такое Genome @ home?" . Стэнфордский университет . Архивировано 4 декабря 2011 года . Проверено 30 ноября 2011 . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
- ^ a b «Обновления Genome @ home» . 2004-03-04. Архивировано 21 сентября 2012 года . Проверено 30 ноября 2011 . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
- ^ Pande lab. "Genome @ home Научные результаты" . Стэнфордский университет . Архивировано 4 декабря 2011 года . Проверено 30 ноября 2011 . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
