Хлорофлекси (класс)

Chloroflexia являются одним из шести классов бактерий в филюме Chloroflexi , известный как нитчатые зеленые бактерий без серы . Они используют свет для получения энергии и названы в честь своего зеленого пигмента, который обычно содержится в фотосинтетических телах, называемых хлоросомами .

Хлорофлексия обычно носит нитчатый характер и может перемещаться через бактериальное скольжение . Они факультативно аэробны , но не производят кислород в процессе производства энергии из света или фототрофии . Кроме того, у хлорофлексии другой метод фототрофии ( фотогетеротрофии ), чем у настоящих фотосинтезирующих бактерий .

Этимология [ править ]

Название «Chloroflexi» является неолатиновым множественным числом от «Chloroflexus», которое является названием первого описанного рода. Существительное представляет собой сочетание греческого хлорос (χλωρός) ^[1], означающего «зеленовато-желтый», и латинского flexus (от flecto ) ^[2], означающего «изогнутый», что означает «зеленый изгиб». ^[3] Название не связано с хлором, элементом, подтвержденным в 1810 году сэром Хамфри Дэви и названным в честь его бледно-зеленого цвета.

Таксономия и молекулярные сигнатуры [ править ]

Класс Chloroflexia - это группа глубоко разветвленных фотосинтезирующих бактерий (за исключением видов Herpetosiphon и Kallotenue ), которые в настоящее время состоят из трех отрядов: Chloroflexales , Herpetosiphonales и Kallotenuales . ^{[4] [5] [6] [7] [8]} Каждый из Herpetosiphonales и Kallotenuales состоит из одного рода в рамках своего собственного семейства, Herpetosiphonaceae ( Herpetosiphon ) и Kallotenuaceae ( Kallotenue ), соответственно, тогда как Chloroflexales более филогенетически разнообразны.^{[4] [5] [7]}

Микроскопические отличительные характеристики [ править ]

Члены филума Chloroflexi являются монодермами и окрашивают в основном грамотрицательные, тогда как большинство видов бактерий являются дидермантами и окрашивают грамотрицательные , за исключением грамположительных Firmicutes (низкий уровень GC грамположительных), актинобактерий (высокий GC, грамположительные) и Группа Deinococcus-Thermus (грамположительные, дидерманы с густым пептидогликаном). ^{[9] [10] [11]}

Генетические отличительные характеристики [ править ]

Сравнительный геномный анализ недавно уточнил таксономию класса Chloroflexia , разделив Chloroflexales на подотряд Chloroflexineae, состоящий из семейств Oscillachloridaceae и Chloroflexaceae , и подотряд Roseiflexineae, содержащий семейство Roseiflexaceae . ^[4] Пересмотренная таксономия была основана на идентификации ряда консервативных сигнатурных инделей (CSI), которые служат в качестве высоконадежных молекулярных маркеров общего происхождения. ^{[12] [13] [14] [15]}

Физиологические отличительные характеристики [ править ]

Дополнительным подтверждением разделения Chloroflexales на два подотряда являются наблюдаемые различия в физиологических характеристиках, где каждый подотряд характеризуется различными профилями каротиноидов , хинонов и жирных кислот , которые постоянно отсутствуют в другом подотряде. ^{[4] [16] [17]}

Помимо разграничения таксономических рангов, CSI могут играть роль в уникальных характеристиках членов клады: в частности, вставка из четырех аминокислот в белке пируват флаводоксин / ферредоксин оксидоредуктазу, белке, который играет важную роль в фотосинтезирующих организмах. , был обнаружен исключительно среди всех представителей рода Chloroflexus и, как полагают, играет важную функциональную роль. ^{[18] [19]}

Дополнительная работа была проделана с использованием CSI для разграничения филогенетического положения Chloroflexia относительно соседних фотосинтетических групп, таких как Cyanobacteria. ^[20]

Виды Chloroflexia образуют отдельную линию с видами Chlorobi , их ближайшими филогенетическими родственниками. Было обнаружено, что CSI является общим для членов как Chloroflexia, так и Chlorobi , что было интерпретировано как результат горизонтального переноса генов между двумя родственниками. ^[21]

Таксономия [ править ]

В настоящее время принята следующая таксономия: ^{[4] [5] [22]}

• Заказать Chloroflexales
  • Подотряд Chloroflexineae
    • Семейство Chloroflexaceae Trüper 1976 исправлено. Gupta et al. 2013
      • Род Chloroflexus Pierson and Castenholz 1974 г.
        • C. aggregans Hanada et al. 1995 г.
        • C. aurantiacus Пирсон и Кастенхольц 1974 г.
    • Семейство Oscillochloridaceae Keppen 2000 исправить. Gupta et al. 2013
      • Род Oscillochloris Горленко и Пивоварова 1989 исправил. Keppen et al. 2000 г.
        • О. Хрисея Горленко и Пивоварова 1989
        • O. trichoides (ex Szafer) Горленко и Коротков 1989 исправляют. Keppen et al. 2000 г.
      • Род Chloronema Dubinina and Gorlenko 1975 г.
        • Chloronema giganteum Дубинина и Горленко 1975 г.
  • Подотряд Roseiflexineae
    • Семейство Roseiflexaceae Gupta et al. 2013
      • Род Roseiflexus Hanada et al. 2002 г.
        • Roseiflexus castenholzii Hanada et al. 2002 г.
      • Род Heliothrix Pierson et al. 1986 г.
        • Heliothrix oregonensis Pierson et al. 1986 г.
• Орден " Герпетосифоналес "
  • Семья " Herpetosiphonaceae "
    • Род Herpetosiphon Holt and Lewin 1968 г.
      • H. aurantiacus Холт и Левин, 1968 г.
      • H. geysericola (Copeland 1936) Левин 1970

Кроме того, «Kouleothrix aurantiaca» и «Dehalobium chlorocoercia» не были полностью описаны.

Ссылки [ править ]

Дальнейшее чтение [ править ]

• Гаррити GM, Холт JG (2001). "Phylum BVI. Chloroflexi phy. Nov" . В Бун, Д. Р., Кастенхольц, Р. В. (ред.). Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии . Руководство Берджи по систематической бактериологии. 1 (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag. п. 169 . ISBN 978-0-387-98771-2.

Внешние ссылки [ править ]

• Ссылки PubMed на Chloroflexi
• Ссылки PubMed Central для Chloroflexi
• Ссылки Google Scholar для Chloroflexi

Внешние ссылки [ править ]

В Wikispecies есть информация, относящаяся к Chloroflexi (класс) .