Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Относительно других типов см. Бактериальные типы . Для класса см. Chloroflexi (класс) .

Хлорофлекси
Научная классификация
Домен:
Бактерии
(без рейтинга):
Террабактерии
Тип:
Хлорофлекси

(Гаррити и Холт, 2002 г.) Гугенгольц и Стакебрандт, 2004 г.
Классы
Синонимы
  • «Хлоробактерии» Кавальер-Смит, 1992 г.
  • Chloroflexaeota Oren et al. 2015 г.
  • Thermomicrobaeota Oren et al. 2015 г.

Chloroflexi или Chlorobacteria являются филюмом из бактерий , содержащих изолят с разнообразием фенотипов, включая член , которые являются аэробными термофилами , которые используют кислород и хорошо растут при высоких температурах; аноксигенные фототрофы , использующие свет для фотосинтеза ( зеленые несернистые бактерии ); и анаэробные галоидоэпиляторы , в которых в качестве акцепторов электронов используются галогенированные органические вещества (такие как токсичные хлорированные этены и полихлорированные бифенилы ).

Большинство бактерий, с точки зрения разнообразия, являются diderms и пятна грамотрицательные , заметные исключения , являющиеся Firmicutes ( низкий G + C грам-положительные результаты ), Actinobacteria (High-G + C грам-положительные) и Deinococcus-Thermus группу (грамотрицательных положительные дидермы с толстым пептидогликаном) Напротив, представители филума Chloroflexi являются монодермами , но окрашивают в основном грамотрицательные. [1]

История [ править ]

Смотрите также: Бактериальная таксономия и Бактериальные типы

Название таксона было создано в 2001 году в томе 1 Руководства по систематической бактериологии Берджи и представляет собой латинское множественное число от имени Chloroflexus , названия типового рода филума, что является общепринятой практикой . [2]

В 1987 году Карл Вёзе , считающийся предшественником революции в молекулярной филогении, разделил Eubacteria на 11 подразделов на основе последовательностей 16S рибосомной РНК (SSU) и сгруппировал роды Chloroflexus , Herpetosiphon и Thermomicrobium в «зеленые несернистые бактерии и их родственники». , [3] [4], который был временно переименован в «Chloroflexi» в первом томе Руководства Берджи по систематической бактериологии. [5]

Chloroflexi - это тип с глубоким ветвлением (см. Бактериальный тип ), поэтому в первом томе Руководства Берджи по систематической бактериологии было рассмотрено включение одного класса с таким же названием - класса Chloroflexi. [5] Однако с 2001 года новые классы были созданы благодаря недавно обнаруженным видам, и тип Chloroflexi теперь разделен следующим образом: [6]

  • Chloroflexi Gupta et al. 2012 г.
  • Thermomicrobia Hugenholtz & Stackebrandt, 2004 г.
  • "Dehalococcoidetes" Hugenholtz & Stackebrandt, 2004 г.
  • Anaerolineae Yamada et al., 2006
  • Caldilineae Yamada et al., 2006
  • Ktedonobacteria Cavaletti et al., 2007 исправлено. Ябе и др., 2010 г.

« Dehalococcoidetes » - это название-заполнитель, данное Hugenholtz & Stackebrandt, 2004, [7] после « Dehalococcoides ethenogenes », вида, частично описанного в 1997 году. [8] Первым полностью описанным видом был Dehalogenimonas lykanthroporepellens , Moe et al. 2009, [9], но в описании этого вида класс не был объявлен официальным, а также не были указаны семейства или порядки, поскольку эти два вида имеют только 90% идентичности 16S рибосомной РНК , что означает, что они могут относиться к разным семействам или даже отрядам. [9]

Недавний филогенетический анализ Chloroflexi обнаружил очень слабую поддержку группировки различных классов, которые в настоящее время являются частью этого типа. [10] Шесть классов, составляющих филум, не всегда образовывали хорошо поддерживаемую кладу в филогенетических деревьях, основанных на конкатенированных последовательностях для больших наборов данных белков, и не было идентифицировано никаких консервативных инделей сигнатур, которые были бы уникально общими для всего типа. [10] Однако было обнаружено, что классы Chloroflexi и Thermomicrobia последовательно группируются как обычными филогенетическими методами, так и с помощью идентификации общих консервативных сигнатурных инделей в 50S рибосомном белке L19 и ферменте UDP-глюкозо-4-эпимераза. [10]Было высказано предположение, что тип Chloroflexi sensu stricto должен включать только классы Chloroflexi и Thermomicrobia, а четыре других класса («Dehalococcoidetes», Anaerolineae, Caldilineae и Ktedonobacteria) могут представлять один или несколько независимых типов ветвлений по соседству с Chloroflexi. [10]

Филогения [ править ]

В настоящее время принятая таксономия основана на Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) [11] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI). [12] Филогения основана на выпуске 132 LTP на основе 16S рРНК, разработанном All-Species Living Tree Project [13]

 
 
 
 

Thermoflexus hugenholtzii Dodsworth et al. 2014 г.

 
 
Dehalococcoidaceae
 

Dehalococcoides Löffler et al. 2013

 
Дегалогенимонас
 

D. lykanthroporepellens Moe et al. 2009 г. (тип sp.)

 
 
 

D. alkenigignens Bowman et al. 2013

 
 

D. formicexedens Key et al. 2017 г.

 
 
 
 
 
 
 
Caldilineaceae
 

Litorilinea aerophila Kale et al. 2013

 
Caldilinea
 

C. aerophila Sekiguchi et al. 2003 г. (тип sp.)

 
 

C. tarbellica Grégoire et al. 2011 г.

 
 
 
 
Ardenticatenaceae

Ardenticatena maritima Kawaichi et al. 2013

 
Анаэролиновые
 

Thermomarinilinea lacunifontana Nunoura et al. 2013

 
 
Анаеролина
 

A. thermolimosa Yamada et al. 2006 [14]

 
 

A. thermophila Sekiguchi et al. 2003 [15] (тип sp.)

 
 
 
 

Flexilinea flocculi Sun et al. 2015 г.

 
 
 

Ornatilinea apprima Podosokorskaya et al. 2013

 
 
 

Levilinea saccharolytica Yamada et al. 2006 [14]

 
 
 
 

Bellilinea caldifistulae Yamada et al. 2007 г.

 
 

Pelolinea submarina Imachi et al. 2014 г.

 
 
 
 

Leptolinea tardivitalis Yamada et al. 2006 [14]

 
 

Longilinea arvoryzae Yamada et al. 2007 [16]

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Ктедонобактерии
Термогемматиспора
 

T. foliorum Yabe et al. 2011 г.

 
 
 

T. carboxidivorans King & King 2014 г.

 
 

T. onikobensis Yabe et al. 2011 г. (тип sp.)

 
 
 
Ктедонобактерии
Ktedonobacteraceae
 

Dictyobacter aurantiacus Yabe et al. 2017 г.

 
 

Ktedonobacter racemifer corrig. Кавалетти и др. 2007 г.

 
 
Термоспоротрикс
 

T. hazakensis Yabe et al. 2010 г.

 
 

T. narukonensis Yabe , Sakai & Yokota, 2016 г.

 
 
 
 
Термомикробия
Sphaerobacteraceae
 

Nitrolancea hollandica Sorokin et al. 2014 г.

 
 

Sphaerobacter thermophilus Demharter et al. 1989 г.

 
 
Thermomicrobiaceae
Терморудис
 

T. peleae King & King 2014 г.

 
 

T. Pharmacophila Houghton et al. 2015 г.

 
 
Термомикробий
 

T. carboxidum King & King 2014 г.

 
 

T. roseum Jackson et al. 1973

 
 
 
 
 
Хлорофлексия
Герпетосифон
 

H. aurantiacus Holt & Lewin 1968 г.

 
 

H. geysericola Lewin 1970 г.

 
 
 
Kallotenuaceae

Kallotenue papyrolyticum Cole et al. 2013

 
Хлорофлексалес
Roseiflexaceae

Roseiflexus castenholzii Hanada et al. 2002 г.

 
Хлорофлексус
 

C. aurantiacus Pierson & Castenholz 1974 г.

 
 
 

C. aggregans Hanada et al. 1995 г.

 
 

C. islandicus Gaisin et al. 2017 г.

 
 
 
 
 
 
 
 

Примечания:
♠ Штаммы, обнаруженные в Национальном центре биотехнологической информации (NCBI), но не перечисленные в Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LSPN).
♪ Прокариоты, у которых чистые (аксенические) культуры не изолированы или доступны; т.е. они не культивируются или не могут поддерживаться в культуре более чем на несколько последовательных пассажей.

Таксономия [ править ]

Род " Candidatus Chlorothrix " Klappenbach & Pierson 2004 [17]

  • Вид " Candidatus Chlorothrix halophila " Klappenbach & Pierson 2004

Класс Thermoflexia Dodsworth et al. 2014 г.

  • Заказать Thermoflexales Dodsworth et al. 2014 г.
    • Семейство Thermoflexaceae Dodsworth et al. 2014 г.
      • Род Thermoflexus Dodsworth et al. 2014 г.
        • Виды Thermoflexus hugenholtzii Dodsworth et al. 2014 г.

Класс Dehalococcoidia Löffler et al. 2013 ["Dehalococcoidetes" Hugenholtz & Stackebrandt 2004 ]

  • Отряд Dehalococcoidales Löffler et al. 2013
    • Семейство Dehalococcoidaceae Löffler et al. 2013
      • Род Dehalococcoides Löffler et al. 2013 [" Dehalococcoides " Maymo-Gatell et al. 1997 ]
        • Виды Dehalococcoides mccartyi Löffler et al. 2013 [" Dehalococcoides ethenogenes " Maymo-Gatell et al. 1997 ]
      • Род Dehalogenimonas Moe et al. 2009 г.
        • Виды D. alkenigignens Bowmann et al. 2013
        • Виды D. formicexedens Key et al. 2017 г.
        • Виды D. lykanthroporepellens Moe et al. 2009 г. (тип sp.)

Класс Anaerolineae Yamada et al. 2006 г.

  • Заказать Anaerolineales Yamada et al. 2006 г.
    • Семейство Anaerolineaceae Yamada et al. 2006 г.
      • Род " Thermanaerothrix " ♠ Gregoire et al. 2011 [18]
        • Вид " Thermanaerothrix daxensis " ♠ Gregoire et al. 2011 г.
      • Род « Brevefilum » ♠ McIlroy et al. 2017 г.
        • Виды " Brevefilum fermentans " ♠ McIlroy et al. 2017 г.
      • Род Candidatus Roseilinea ♠ Thiel et al. 2016 г.
        • Вид Candidatus Roseilinea gracile ♠ Thiel et al. 2016 г.
      • Род Thermomarinilinea Nunoura и др. 2013
        • Виды Thermomarinilinea lacunifontana Nunoura et al. 2013
      • Род Anaerolinea Sekiguchi et al. 2003 исправление. Ямада и др. 2006 г.
        • Виды A. thermolimosa Yamada et al. 2006 [14]
        • Виды A. thermophila Sekiguchi et al. 2003 [15] (тип sp.)
      • Род Bellilinea Yamada et al. 2007 [16]
        • Виды Bellilinea caldifistulae Yamada et al. 2007 [16]
      • Род Flexilinea Sun et al. 2015 г.
        • Виды Flexilinea flocculi Sun et al. 2015 г.
      • Род Levilinea Yamada et al. 2006 [14]
        • Виды Levilinea saccharolytica Yamada et al. 2006 г.
      • Род Leptolinea Yamada et al. 2006 [14]
        • Виды Leptolinea tardivitalis Yamada et al. 2006 г.
      • Род Longilinea Yamada et al. 2007 [16]
        • Виды Longilinea arvoryzae Yamada et al. 2007 г.
      • Род Ornatilinea Podosokorskaya et al. 2013
        • Виды Ornatilinea apprima Podosokorskaya et al. 2013
      • Род Pelolinea Imachi et al. 2014 г.
        • Виды Pelolinea submarina Imachi et al. 2014 г.

Класс Ardenticatenia Kawaichi et al. 2013

  • Отряд Ardenticatenales Kawaichi et al. 2013
    • Семейство Ardenticatenaceae Kawaichi et al. 2013
      • Род Candidatus Promineofilum ♠ McIlroy et al. 2016 г.
        • Вид Candidatus Promineofilum breve ♠ McIlroy et al. 2016 г.
      • Род Ardenticatena Kawaichi et al. 2013
        • Вид Ardenticatena maritima Kawaichi et al. 2013

Класс Caldilineae Yamada et al. 2006 г.

  • Отряд Caldilineales Yamada et al. 2006 г.
    • Семейство Caldilineaceae Yamada et al. 2006 г.
      • Род Litorilinea Kale et al. 2013
        • Виды Litorilinea aerophila Kale et al. 2013
      • Род Caldilinea Sekiguchi et al. 2003 г.
        • Виды C. aerophila Sekiguchi et al. 2003 [15] (тип sp.)
        • Виды C. tarbellica Grégoire et al. 2011 [19]

Класс Ktedonobacteria Cavaletti et al. 2007 исправление. Yabe et al. 2010 [«Ktedobacteria» (так в оригинале) Cavaletti et al. 2006 ]

  • Заказать Thermogemmatisporales Yabe et al. 2011 г.
    • Семейство Thermogemmatisporaceae Yabe et al. 2011 г.
      • Род Thermogemmatispora Yabe et al. 2011 [20]
        • Виды T. foliorum Yabe et al. 2011 [20]
        • Вид T. carboxidivorans King & King 2014 г.
        • Виды T. onikobensis Yabe et al. 2011 [20] (тип sp.)
  • Отряд Ktedonobacterales Cavaletti et al. 2007 [«Ktedobacterales» (так в оригинале) Cavaletti et al. 2006 ]
    • Семейство Ktedonobacteriaceae Cavaletti et al. 2007 [«Ktedobacteraceae» (так в оригинале) Cavaletti et al. 2006 ]
      • Род Dictyobacter Yabe et al. 2017 г.
        • Виды Dictyobacter aurantiacus Yabe et al. 2017 г.
      • Род Ktedonobacter corrig. Кавалетти и др. 2007 [« Ktedobacter » (так в оригинале ) Cavaletti et al. 2006 ]
        • Виды Ktedonobacter racemifer corrig. Кавалетти и др. 2007 [21] [" Ktedobacter (sic) racemifer " Cavaletti et al. 2006 ]
    • Семейство Thermosporotrichaceae Yabe et al. 2010 г.
      • Род Thermosporothrix Yabe et al. 2010 [22]
        • Виды T. hazakensis Yabe et al. 2010 г.
        • Виды T. narukonensis Yabe , Sakai & Yokota, 2016 г.

Класс Thermomicrobia Гаррити и Холт 2002 исправляют. Гугенгольц и Стакебрандт 2004 г.

  • Род " Thermobaculum " ♠ Botero et al. 2004 [23]
    • Вид " Thermobaculum terrenum " ♠ Botero et al. 2004 г.
  • Отряд Sphaerobacterales Stackebrandt et al. 1997 г.
    • Семейство Sphaerobacteraceae Stackebrandt et al. 1997 г.
      • Род Nitrolancea Sorokin et al. 2014 [« Нитроланцетус » Сорокин и др. 2012 ]
        • Виды Nitrolancea hollandica Sorokin et al. 2014 [« Nitrolancetus hollandicus » Сорокин и др. 2012 ]
      • Род Sphaerobacter Demharter et al. 1989 г.
        • Виды Sphaerobacter thermophilus Demharter et al. 1989 [24]
  • Заказать Thermomicrobiales Garrity and Holt 2002
    • Семейство Thermomicrobiaceae Garrity and Holt, 2002 г.
      • Род Thermorudis King & King 2014
        • Виды T. Pharmacophila Houghton et al. 2015 г.
        • Виды T. peleae King & King 2014 г.
      • Род Thermomicrobium Jackson et al. 1973 [25]
        • Виды T. carboxidum King & King 2014 г.
        • Виды T. roseum Jackson et al. 1973

Класс Chloroflexia Gupta et al. 2013

  • Заказать Kallotenuales Cole et al. 2013
    • Семейство Kallotenuaceae Cole et al. 2013
      • Род Kallotenue Cole et al. 2013
        • Виды Kallotenue papyrolyticum Cole et al. 2013
  • Отряд Herpetosiphonales Gupta et al. 2013 ["Herpetosiphonales" Castenholz 2001 ]
    • Семейство Herpetosiphonaceae Gupta et al. 2013 ["Herpetosiphonaceae" Castenholz 2001 ]
      • Род Herpetosiphon Holt & Lewin 1968.
        • Виды H. aurantiacus Holt & Lewin 1968 [26] [" Herpetosiphon giganteus "]
        • Виды H. geysericola Lewin 1970 [27] [28] [" Lewinella geysericola ", не " Phormidium geysericola " Copeland 1936 ; " Herpetosiphon geysericolus " (так в оригинале ) Левин 1970 ]
  • Заказать Chloroflexales Gupta et al. 2013
    • Род « Dehalobium » ♠ Wu et al. 2002 [29]
      • Вид " Dehalobium chlorocoercia " ♠ Wu et al. 2002 г.
    • Подотряд Roseiflexineae Gupta et al. 2013
      • Семейство Roseiflexaceae Gupta et al. 2013
        • Род " Kouleothrix " ♠ Kohno et al. 2002 г.
          • Вид " Kouleothrix aurantiaca " ♠ Kohno et al. 2002 г.
        • Род Heliothrix ♦ Pierson et al. 1986 г.
          • Виды Heliothrix oregonensis ♦ Pierson et al. 1986 [30]
        • Род Roseiflexus Hanada et al. 2002 г.
          • Виды Roseiflexus castenholzii Hanada et al. 2002 [31]
    • Подотряд Chloroflexineae Gupta et al. 2013
      • Семейство Chloroflexaceae Gupta et al. 2013
        • Род Candidatus Chloranaerofilum Thiel et al. 2016 г.
          • Виды Candidatus Chloranaerofilum corporosum Thiel et al. 2016 г.
        • Род Chloroflexus Pierson & Castenholz 1974
          • Виды C. aggregans Hanada et al. 1995 [32]
          • Виды C. aurantiacus Pierson & Castenholz 1974 [33] (тип sp.)
          • Виды C. islandicus Gaisin et al. 2017 г.
      • Семейство Oscillochloridaceae Gupta et al. 2013
        • Род Candidatus Chloroploca Gorlenko et al. 2014 г.
          • Виды Candidatus Chloroploca asiatica Gorlenko et al. 2014 г.
        • Род Chloronema ♪ Дубинина, Горленко 1975
          • Виды Chloronema giganteum ♪ Дубинина, Горленко 1975
        • Род Oscillochloris Gorlenko & Pivovarova 1989 исправил. Keppen et al. 2000 г.
          • Вид O. chrysea ♪ Горленко, Пивоварова 1989 (вид sp.)
          • Виды O. trichoides ♦ (ex Szafer) Горленко и Коротков 1989 исправлено. Keppen et al. 2000 [" Oscillatoria trichoides " (Szafer) Lauterborn 1915 ]

Этимология [ править ]

Название Chloroflexi - это неолатинский именительный падеж мужского рода множественного числа от Chloroflexus , которое является названием первого описанного рода. Существительное представляет собой комбинацию греческого прилагательного chloros, -a, on (χλωρός, -ά, -όν) , [34] означающего «зеленовато-желтый», и латинского пассивного причастия совершенного причастия flexus (от flecto ) мужского рода [35 ], что означает «изогнутый». [5] Этимология не связана с хлором , элементом, который был открыт в 1810 году сэром Хамфри Дэви и назван в честь его бледно-зеленого цвета. Другой тип с тем же корнем - Chlorobi , тогда как Cyanobacteriaимеет корень цианос ( κύανος ), что означает «сине-зеленый». [36]

В отличие от некоторых других типов, в названии родов Chloroflexi нет тематического корня, и на самом деле многие роды, начинающиеся с « Chloro- » или заканчивающиеся на «-хлорис», являются либо цианобактериями, либо хлоробактериями.

Ссылки [ править ]

  1. Перейти ↑ Sutcliffe, IC (2010). "Перспектива уровня филума на архитектуре оболочки бактериальной клетки". Тенденции в микробиологии . 18 (10): 464–470. DOI : 10.1016 / j.tim.2010.06.005 . PMID  20637628 .
  2. ^ Дон Дж. Бреннер; Ноэль Р. Криг; Джеймс Т. Стейли (26 июля 2005 г.) [1984 (Уильямс и Уилкинс)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Вступительные очерки . Руководство Берджи по систематической бактериологии. 2А (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 304. ISBN 978-0-387-24143-2. Британская библиотека № GBA561951.
  3. ↑ Холланд Л. (22 мая 1990 г.). «Везе, Карл в авангарде революции бактериальной эволюции». Ученый . 4 (10).
  4. ^ Вёзе, CR (1987). «Бактериальная эволюция» . Микробиологические обзоры . 51 (2): 221–271. DOI : 10.1128 / MMBR.51.2.221-271.1987 . PMC 373105 . PMID 2439888 .  
  5. ^ a b c Дон Дж. Бреннер; Ноэль Р. Криг; Джеймс Т. Стейли (26 июля 2005 г.) [1984 (Уильямс и Уилкинс)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Вступительные очерки . Руководство Берджи по систематической бактериологии. 2А (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 304. ISBN 978-0-387-24143-2. Британская библиотека № GBA561951.
  6. ^ Запись о классификации бактерий в LPSN ; Euzéby, JP (1997). «Список названий бактерий со статусом в номенклатуре: папка, доступная в Интернете» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 47 (2): 590–2. DOI : 10.1099 / 00207713-47-2-590 . PMID 9103655 . 
  7. ^ Hugenholtz, P .; Штакебрандт, Э. (2004). «Реклассификация Sphaerobacter thermophilus из подкласса Sphaerobacteridae в типе Actinobacteria в класс Thermomicrobia (измененное описание) в типе Chloroflexi (измененное описание)» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 54 (6): 2049–2051. DOI : 10.1099 / ijs.0.03028-0 . PMID 15545432 . 
  8. ^ Maymo-Gatell, X .; Chien, Y .; Gossett, JM; Зиндер, Ш. (1997). «Выделение бактерии, которая восстанавливает дехлорирование тетрахлорэтилена до этена». Наука . 276 (5318): 1568–1571. DOI : 10.1126 / science.276.5318.1568 . PMID 9171062 . 
  9. ^ а б Мо, ВМ; Ян, Дж .; Нобре, MF; Да Коста, MS; Рейни, Ф.А. (2009). «Dehalogenimonas lykanthroporepellens gen. Nov., sp. Nov., восстанавливающая дегалогенирующая бактерия, выделенная из грунтовых вод, загрязненных хлорированным растворителем» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 59 (11): 2692–2697. DOI : 10.1099 / ijs.0.011502-0 . PMID 19625421 . 
  10. ^ а б в г Гупта, РС; Chander, P .; Джордж, С. (2012). "Филогенетическая основа и молекулярные сигнатуры для класса Chloroflexi и его различных клад; предложение о разделении класса класса Chloroflexi. Ноябрь. В подотряд Chloroflexineae subord. Nov., состоящий из измененного семейства Oscillochloridaceae и семейства Chloroflexaceae fam. Nov., и подотряд Roseiflexineae subord. Nov., содержащий семейство Roseiflexaceae fam. Nov ". Антони ван Левенгук . 103 (1): 99–119. DOI : 10.1007 / s10482-012-9790-3 . PMID 22903492 . S2CID 17656551 .  
  11. ^ JP Euzéby. «Хлорофлекси» . Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) . Проверено 20 июля 2018 .
  12. ^ Сэйерс; и другие. «Хлорофлекси» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 марта 2014 .
  13. ^ «16S рРНК на основе LTP, выпуск 132 (полное дерево)» . Проект «Живое дерево всех видов» . Silva Полная база данных рибосомных РНК . Проверено 20 июля 2018 .
  14. ^ a b c d e е Ямада, Т .; Sekiguchi, Y .; Hanada, S .; Imachi, H .; Охаши, А .; Harada, H .; Камагата Ю. (2006). « Anaerolinea thermolimosa sp. Nov., Levilinea saccharolytica gen. Nov., Sp. Nov. И Leptolinea tardivitalis gen. Nov., Sp. Nov., Новые нитчатые анаэробы и описание новых классов Anaerolineae classis nov. И Caldilineae classis nov. .В бактериальном типе Chloroflexi » . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 56 (6): 1331–1340. DOI : 10.1099 / ijs.0.64169-0 . PMID 16738111 .
  15. ^ a b c Sekiguchi, Y .; Yamada, T .; Hanada, S .; Охаши, А .; Harada, H .; Камагата, Ю. (2003). « Anaerolinea thermophila gen. Nov., Sp. Nov. И Caldilinea aerophila gen. Nov., Sp. Nov., Новые нитчатые термофилы, которые представляют ранее некультивируемую линию доменных бактерий на уровне подтипа» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 53 (6): 1843–1851. DOI : 10.1099 / ijs.0.02699-0 . PMID 14657113 . 
  16. ^ a b c d Yamada, T .; Imachi, H .; Охаши, А .; Harada, H .; Hanada, S .; Kamagata, Y .; Секигучи, Ю. (2007). « Bellilinea caldifistulae gen. Nov., Sp. Nov. И Longilinea arvoryzae gen. Nov., Sp. Nov., Строго анаэробные нитчатые бактерии типа Chloroflexi, выделенные из консорциумов, разлагающих метаногенный пропионат» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 57 (10): 2299–2306. DOI : 10.1099 / ijs.0.65098-0 . PMID 17911301 . 
  17. ^ Клаппенбах, JA; Пирсон, Б.К. (2004). «Филогенетическая и физиологическая характеристика нитчатой ​​аноксигенной фотоавтотрофной бактерии ' Candidatus Chlorothrix halophila ' Gen. Nov., sp. Nov., выделенной из гиперсоленых микробных матов». Архив микробиологии . 181 (1): 17–25. DOI : 10.1007 / s00203-003-0615-7 . PMID 14655000 . S2CID 23854988 .  
  18. ^ Grégoire, P .; Фардо, ML; Joseph, M .; Guasco, S .; Hamaide, F .; Biasutti, S .; Michotey, VR; Bonin, P .; Оливье, Б. (2011). «Выделение и характеристика Thermanaerothrix daxensis gen. Nov., Sp. Nov., Термофильная анаэробная бактерия, относящаяся к типу« Chloroflexi », выделенная из глубокого горячего водоносного горизонта в бассейне Аквитании». Систематическая и прикладная микробиология . 34 (7): 494–497. DOI : 10.1016 / j.syapm.2011.02.004 . PMID 21621938 . 
  19. ^ Gregoire, P .; Bohli, M .; Cayol, J. -L .; Joseph, M .; Guasco, S .; Dubourg, K .; Cambar, J .; Михотей, В .; Bonin, P .; Фардо, М. -Л .; Оливье, Б. (2010). « Caldilinea tarbellica sp. Nov., Нитчатая термофильная анаэробная бактерия, выделенная из глубокого горячего водоносного горизонта в бассейне Аквитании» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 61 (6): 1436–1441. DOI : 10.1099 / ijs.0.025676-0 . PMID 20584812 . 
  20. ^ a b c Yabe, S .; Aiba, Y .; Sakai, Y .; Hazaka, M .; Йокота, А. (2010). « Thermogemmatispora onikobensis gen. Nov., Sp. Nov. И Thermogemmatispora foliorum sp. Nov., Выделенные из опавших листьев на геотермальных почвах, и описание сем. Thermogemmatisporaceae. Nov. и Thermogemmatisporales ord. Nov. В рамках класса Ktedonobacteria» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 61 (4): 903–910. DOI : 10.1099 / ijs.0.024877-0 . PMID 20495028 . 
  21. ^ Cavaletti, L .; Monciardini, P .; Bamonte, R .; Schumann, P .; Rohde, M .; Сосио, М .; Донадио, С. (2006). «Новая линия нитчатых, спорообразующих, грамположительных бактерий из почвы» . Прикладная и экологическая микробиология . 72 (6): 4360–4369. DOI : 10,1128 / AEM.00132-06 . PMC 1489649 . PMID 16751552 .  
  22. ^ Yabe, S .; Aiba, Y .; Sakai, Y .; Hazaka, M .; Йокота, А. (2009). « Thermosporothrix hazakensis gen. Nov., Sp. Nov., Выделенное из компоста, описание семейства Thermosporotrichaceae. Nov. В рамках класса Ktedonobacteria Cavaletti et al. 2007 и исправленное описание класса Ktedonobacteria» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 60 (8): 1794–1801. DOI : 10.1099 / ijs.0.018069-0 . PMID 19767365 . 
  23. ^ Ботеро, Л. М.; Браун, КБ; Brumefield, S .; Burr, M .; Кастенхольц, RW; Янг, М .; Макдермотт, TR (2004). " Thermobaculum terrenum gen. Nov., Sp. Nov .: нефототрофный грамположительный термофил, представляющий группу экологических клонов, родственных Chloroflexi (зеленые несернистые бактерии) и Thermomicrobia". Архив микробиологии . 181 (4): 269–277. DOI : 10.1007 / s00203-004-0647-7 . PMID 14745485 . S2CID 31431143 .  
  24. ^ Demharter, W .; Hensel, R .; Smida, J .; Штакебрандт, Э. (1989). " Sphaerobacter thermophilus gen. Nov., Sp. Nov. Глубоко укоренившийся член подразделения актиномицетов, выделенный из термофильно обработанного осадка сточных вод". Систематическая и прикладная микробиология . 11 (3): 261–266. DOI : 10.1016 / S0723-2020 (89) 80023-2 .
  25. ^ Джексон, TJ; Рамалей, РФ; Майншайн, WG (1973). «Thermomicrobium, новый род чрезвычайно термофильных бактерий» . Международный журнал систематической бактериологии . 23 : 28–36. DOI : 10.1099 / 00207713-23-1-28 .
  26. ^ Холт, JG; Левин, Р.А. (1968). «Herpetosiphon aurantiacus gen. Et sp. N., новый нитчатый скользящий организм» . Журнал бактериологии . 95 (6): 2407–2408. DOI : 10.1128 / JB.95.6.2407-2408.1968 . PMC 315177 . PMID 5669912 .  
  27. Перейти ↑ Copeland, JJ (1936). «Йеллоустонские термальные миксофисы». Летопись Нью-Йоркской академии наук . 36 (1): 4–223. Bibcode : 1936NYASA..36 .... 4C . DOI : 10.1111 / j.1749-6632.1936.tb56976.x . S2CID 128571314 . 
  28. Перейти ↑ Lewin, RA (1970). «Новые виды Herpetosiphon (Flexibacterales)». Канадский журнал микробиологии . 16 (6): 517–520. DOI : 10.1139 / m70-087 . PMID 5423287 . 
  29. ^ Ву, Q .; Ваттс, JEM; Сеятели, КР; Май, HD (2002). «Идентификация бактерии, которая специально катализирует восстановительное дехлорирование полихлорированных дифенилов с помощью двухфланцевых хлоринов» . Прикладная и экологическая микробиология . 68 (2): 807–812. DOI : 10,1128 / AEM.68.2.807-812.2002 . PMC 126686 . PMID 11823222 .  
  30. ^ Пирсон, Б.К .; Giovannoni, SJ; Шталь Д.А.; Кастенхольц, Р.В. (1985). "Heliothrix oregonensis, gen. Nov., sp. Nov., фототрофная нитевидная скользящая бактерия, содержащая бактериохлорофилл а". Архив микробиологии . 142 (2): 164–167. DOI : 10.1007 / BF00447061 . PMID 2412519 . S2CID 20173280 .  
  31. ^ Hanada, S .; Takaichi, S .; Мацуура, К .; Накамура, К. (2002). « Roseiflexus castenholzii gen. Nov., Sp. Nov., Термофильная, нитчатая фотосинтезирующая бактерия, у которой отсутствуют хлоросомы» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 52 (Pt 1): 187–193. DOI : 10.1099 / 00207713-52-1-187 . PMID 11837302 . 
  32. ^ Hanada, S .; Hiraishi, A .; Shimada, K .; Мацуура, К. (1995). " Chloroflexus aggregans sp. Nov., Нитчатая фототрофная бактерия, которая образует плотные клеточные агрегаты посредством активного скользящего движения" . Международный журнал систематической бактериологии . 45 (4): 676–681. DOI : 10.1099 / 00207713-45-4-676 . PMID 7547286 . 
  33. ^ Пирсон, Б.К .; Кастенхольц, Р.В. (1974). «Фототрофная скользящая нитчатая бактерия горячих источников, Chloroflexus aurantiacus, gen. And sp. Nov». Архив микробиологии . 100 (1): 5–24. DOI : 10.1007 / BF00446302 . PMID 4374148 . S2CID 25076525 .  
  34. ^ χλωρός . Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте " Персей"
  35. ↑ Льюис и Шорт ...
  36. ^ κύανος . Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте " Персей"