HLA-B (альфа) -β2MG со связанным пептидом | ||
главный комплекс гистосовместимости (человек), класс I, B39 | ||
Аллели | В * 3901, 3902, 3903,. . | |
Структура (см. HLA-B ) | ||
Общие данные | ||
Locus | чр.6 6п21.31 |
HLA-В39 (В39) является HLA - B серотипа . Серотип определяет наиболее распространенные генные продукты HLA-B * 39. [1]
B39 представляет собой расщепленный антиген из широкого антигена В16 и тип сестры B38 . B39 чаще всего встречается на западном побережье Тихого океана, в Японии, и наиболее часто встречается в новом мире. В Европе встречается в Скандинавии и на севере России.
Серотип [ править ]
В * 39 | B39 | B16 | B38 | Образец | |
аллель | % | % | % | размер (N) | |
* 3901 | 95 | 476 | |||
* 3902 | 87 | 96 | |||
* 3903 | 77 | 20 | |||
* 3905 | 82 | 245 | |||
* 3906 | 94 | 508 | |||
* 3908 | 48 | 57 | |||
* 3909 | 97 | 13 | |||
* 3910 | 82 | 127 | |||
* 3911 | 69 | 16 | |||
Ссылка аллелей на базу данных IMGT / HLA в EBI |
Серология наиболее распространенных аллелей B39, B * 3901 и B * 3906 хорошая, но некоторые продукты аллелей не обнаруживаются должным образом. Учитывая различное участие этих аллелей в диагностике заболеваний, необходимо типирование с высоким разрешением.
частота | ||
исх. | численность населения | (%) |
[3] | Венесуэла Перха Гора Бари | 23,9 |
Мексика Mixtec Oaxaca | 8,8 | |
США Аризона Пима | 7.3 | |
США Южный Техас, латиноамериканцы | 5,6 | |
Мексика Zaptotec Oaxaca | 4.5 | |
Нью-Мексико Канончито Навахо | 3,7 | |
Оман | 2,5 | |
PNG Ванигела | 2.3 | |
Тунис Тунис | 2.3 | |
Уроженцы Северной Америки | 1.9 | |
США испаноязычный | 1,7 | |
Бразилия Белу-Оризонти | 1.6 | |
Южная Дакота Лакота Сиу | 1.5 | |
Кубинский белый | 1.4 | |
Азорские острова С. Мария и С. Мигель | 1.3 | |
Австралия Новый Южный Уэльс | 1.1 | |
Финляндия | 1.1 | |
Северная Португалия | 1.1 | |
Центр Португалии | 1.0 | |
Испания Восточная Андалусия Gipsy | 1.0 | |
Бразилия Терена | 0,9 | |
Ирландия Северная | 0,9 | |
Азорские острова Терсейра | 0,8 | |
США Кавказская поп2 | 0,8 | |
Бразилия | 0,7 | |
США Филадельфия кавказцы | 0,7 | |
Индия Андхра-Прадеш Голла | 0,5 | |
Таиланд | 0,4 |
Аллели [ править ]
частота | ||
исх. | численность населения | (%) |
[3] | Тайвань Сайсиат | 54,9 |
[3] | Тайвань Цоу | 24,5 |
[3] | Южная Дакота Лакота Сиу | 22,5 |
[3] | Тайвань Тароко | 21,8 |
[3] | Тайвань Атаял | 19,8 |
[3] | PNG Ванигела | 16,7 |
[3] | Япония Айну Хоккайдо | 16.0 |
[3] | Тайваньский бунун | 14,9 |
[3] | Нью-Мексико Канончито Навахо | 14,6 |
[3] | Тайвань Тао | 13,3 |
[3] | Тайвань Рукай | 13,0 |
[3] | Тайвань Ами | 10.2 |
[3] | США Гавайи Окинава | 7,7 |
[3] | Папуа-Новая Гвинея Восера | 7.0 |
[3] | Папуа-Новая Гвинея Маданг | 6.4 |
[3] | Мексика Mixtec Oaxaca | 5.9 |
[3] | Тайвань Пуюма | 5.0 |
[3] | Тайвань Пайвань | 4.9 |
[3] | Новая Каледония | 4.8 |
[3] | Япония Центральная | 4.4 |
[3] | американское Самоа | 4.0 |
[3] | США уроженцы Северной Америки | 4.0 |
[3] | Тайваньская хакка | 3,6 |
[3] | Индиг. Австралийский полуостров Кейп-Йорк | 3.5 |
[3] | Япония (5) | 3.5 |
[3] | Филиппины Иватан | 3.0 |
[3] | Бразилия | 2,9 |
[3] | Китай Гуанси Маонан | 2,8 |
[3] | Грузия Тибилиси Грузины | 2,8 |
[3] | Китай Юньнань Ну | 2,6 |
[3] | Таиланд | 2,5 |
[3] | Азорские острова Терсейра | 2,4 |
[3] | Сингапурский китайский | 2,4 |
[3] | румынский | 2.3 |
[3] | Китай Юньнань Лису | 2.2 |
[3] | Индиг. Австралийский юендуму | 2.1 |
[3] | Китай Гуанчжоу | 2.0 |
[3] | Хорватия | 2.0 |
[3] | Юго-Восток Франции | 1.9 |
[3] | Грузия Сванети Сваны | 1.9 |
[3] | PNG плато Кариму | 1.9 |
[3] | Центральные острова Азорских островов | 1,8 |
[3] | Испания Восточная Андалусия | 1,8 |
[3] | Уганда Кампала | 1.6 |
[3] | Мексика Zaptotec Oaxaca | 1.5 |
[3] | Сингапур тайский | 1.5 |
[3] | Китай Гуанчжоу Хан | 1.4 |
[3] | Китай Цинхай Хуэй | 1.4 |
[3] | Республика Чехия | 1.4 |
[3] | Мадейра | 1.4 |
[3] | Индиг. Австралийка Кимберли | 1.3 |
[3] | Финляндия | 1.1 |
Болезнь [ править ]
B39 считается фактором артериита Такаясу и желчных камней в Мексике. [4] остеоартикулярной осложнения на бруцеллез , по всей видимости, связаны с В39. [5] Связь со спондилоартропатиями [6] [7] и псориатическим артритом [8] [9] наблюдалась в нескольких исследованиях. Псориатический артрит , по-видимому, связан с MICA- A9, которая тесно связана с HLA-B39. [10] [11] B39 также, по-видимому, участвует в варианте синдрома Фишера и синдрома Гийена-Барре . [12]
B39, по-видимому, защищает от кардиомиопатии при болезни Чаги, указывая на возможный фактор отбора в ее росте в Новом Свете. [13] Болезнь чаги вызывается трипаносомой, которую несет кровососущее насекомое, обитающее в тропических регионах, где выращивают пальмы.
Южная Калифорния теперь сообщает о случаях болезни чаги в результате переливания зараженной крови и, возможно, уже является средой обитания переносчика. [14]
При артериите Такаясу [ править ]
Артериит Такаясу, похоже, имеет связь с B39. [15] [16] Связь с B * 3902 увеличивает риск инфаркта легких , ишемической болезни сердца , аортальной регургитации , системной гипертензии , стеноза почечной артерии , цереброваскулярных заболеваний и нарушений зрения. [17] Было обнаружено, что B * 3906, распространенный у коренных жителей Мезоамерики, связан с тем же заболеванием. [18]
частота | ||
исх. | численность населения | (%) |
[3] | Мексика Mixe Oaxaca | 38,7 |
Мексика Zaptotec Oaxaca | 13,4 | |
Мексика Mixtec Oaxaca | 5.9 | |
Мексика Местис | 1.2 | |
Япония pop5 | 0,9 | |
Кубинский белый | 0,7 | |
Израиль Ашк. и Non Ashk. Евреи | 0,5 | |
Япония Центральная | 0,5 | |
Сенегал Ниохоло Манденка | 0,5 | |
В * 3903 | ||
---|---|---|
PNG Новая Британия Рабаул | 13,2 | |
Бразилия Терена | 11.2 | |
Аргентина Тоба Росарио | 5.2 | |
Бразилия | 0,7 | |
Финляндия | 0,6 | |
Кения Луо | 0,6 | |
Уроженцы Северной Америки | 0,5 | |
В * 3904 | ||
Аргентина Тоба Росарио | 1.2 | |
Грузия Сванети Сваны | 0,6 | |
Иордания Амман | 0,3 | |
Шицзячжуан Тяньцзянь Хан | 0,1 | |
Япония Центральная | 0,1 | |
румынский | 0,1 | |
В * 3905 | ||
Венесуэла Периха Юкпа | 36,1 | |
Мексика Zaptotec Oaxaca | 12,7 | |
Мексика Mixtec Oaxaca | 9,8 | |
Мексика Местис | 4.9 | |
Аризона Пима | 4.5 | |
Мексика Гвадалахара Местис | 2,4 | |
Аргентина Тоба Росарио | 2.3 | |
США испаноязычный | 2.1 | |
Мексика Mixe Oaxaca | 1.9 | |
Кубинский белый | 1.4 | |
Мексика Чихуахуа Тараумара | 1.1 | |
США уроженцы Северной Америки | 0,5 | |
Шицзячжуан Тяньцзянь Хан | 0,2 | |
В * 3907 | ||
Шицзячжуан Тяньцзянь Хан | 0,6 | |
Сингапур тайский | 0,5 | |
Китай Южный Хан | 0,2 | |
В * 3908 | ||
Мексика Zaptotec Oaxaca | 2.2 | |
Мексика Местис | 1.2 | |
Мексика Mixtec Oaxaca | 1.0 | |
Бразилия | 0,7 | |
США испаноязычный | 0,6 | |
В * 3909 | ||
Венесуэла Периха Юкпа | 34,9 | |
Таиланд pop3 | 3.1 | |
Бразилия Терена | 1,7 | |
Китай Южный Хан | 1.4 | |
Аргентина Тоба Росарио | 1.2 | |
Китай Цинхай Хуэй | 0,9 | |
В * 3910 | ||
Суданский | 2,5 | |
Сенегал Ниохоло Манденка | 2.1 | |
Южноафриканский Натал Зулу | 1.5 | |
Камерун Бети | 1.4 | |
Испания Восточная Андалусия | 1.2 | |
Кения Луо | 1.1 | |
Израильские арабские друзы | 1.0 | |
Кения Нанди | 1.0 | |
Гвинея-Бисау | 0,8 | |
Кения | 0,7 | |
Мали Бандиагара | 0,7 | |
Марокко Надор Металса Класс I | 0,7 | |
Камерун Бамилеке | 0,6 | |
Камерун Яунде | 0,5 | |
Израиль Ашк. и Non Ashk. Евреи | 0,5 | |
Саудовская Аравия Guraiat and Hail | 0,5 |
Ссылки [ править ]
- ^ Марш, SG; Альберт, ED; Бодмер, ВФ; Bontrop, RE; Dupont, B .; Эрлих, HA; Fernández-Viña, M .; Geraghty, DE; Holdsworth, R .; Херли, СК; Lau, M .; Ли, кВт; Мах, Б .; Maiers, M .; Mayr, WR; Мюллер, CR; Parham, P .; Петерсдорф, EW; Sasazuki, T .; Строминджер, JL; Svejgaard, A .; Терасаки, ИП; Tiercy, JM; Троусдейл, Дж. (2010). «Номенклатура факторов системы HLA, 2010» . Тканевые антигены . 75 (4): 291–455. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.2010.01466.x . PMC 2848993 . PMID 20356336 .
- ^ получено из IMGT / HLA
- ^ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am an ao ap aq ar as at au av aw топор ay az ba bb Миддлтон Д., Менчака Л., Руд Н., Комеровски Р. (2003). «База данных частот новых аллелей: http://www.allelefrequencies.net ». Тканевые антигены . 61 (5): 403–7. DOI : 10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x . PMID 12753660 . Внешняя ссылка в
|title=
( помощь ) - Перейти ↑ Méndez-Sánchez N, King-Martínez AC, Ramos MH, Pichardo-Bahena R, Uribe M (ноябрь 2004 г.). «Гены американских индейцев в популяции Мексики связаны с развитием желчнокаменной болезни». Являюсь. J. Gastroenterol . 99 (11): 2166–70. PMID 15554998 .
- ^ Браво MJ, Colmenero JDE D, Алонсо A, Кабальеро A (май 2003). «Аллель HLA-B * 39 придает предрасположенность к костно-суставным осложнениям при бруцеллезе человека». J. Rheumatol . 30 (5): 1051–3. PMID 12734905 .
- ^ Sobao Y, Цутий N, Такигучите М, Токунаг К (январь 1999 г.). «Перекрывающиеся пептид-связывающие специфичности HLA-B27 и B39: доказательства роли пептидного супермотива в патогенезе спондилоартропатий» . Ревматоидный артрит . 42 (1): 175–81. DOI : 10,1002 / 1529-0131 (199901) 42: 1 <175 :: АИД-ANR21> 3.0.CO; 2-7 . PMID 9920028 .
- ^ Альварес I, Лопес де Кастро JA (июль 2000 г.). «HLA-B27 и иммуногенетика спондилоартропатий». Curr Opin Rheumatol . 12 (4): 248–53. DOI : 10.1097 / 00002281-200007000-00003 . PMID 10910175 .
- ^ Истмонд CJ (май 1994). «Псориатический артрит. Генетика и антигены HLA». Клиническая ревматология Байера . 8 (2): 263–76. DOI : 10.1016 / S0950-3579 (94) 80018-9 . PMID 8076387 .
- ^ Gladman DD, Прощальный VT (июнь 1995). «Роль антигенов HLA как индикаторов прогрессирования болезни при псориатическом артрите. Многофакторная модель относительного риска» . Ревматоидный артрит . 38 (6): 845–50. DOI : 10.1002 / art.1780380619 . PMID 7779129 .
- ^ Bolognesi Е, Dalfonso S, Роландо В, Фасано МЕ, Pratico л, Momigliano-Richiardi Р (октябрь 2001 г.). «Аллели микросателлитов MICA и MICB в расширенных гаплотипах HLA». Евро. J. Immunogenet . 28 (5): 523–30. DOI : 10,1046 / j.0960-7420.2001.00250.x . PMID 11881819 .
- ↑ González S, Martínez-Borra J, López-Vázquez A, García-Fernández S, Torre-Alonso JC, López-Larrea C (май 2002). «MICA, а не MICB, TNFA или HLA-DRB1 связан с предрасположенностью к псориатическому артриту» . J. Rheumatol . 29 (5): 973–8. PMID 12022360 . Архивировано из оригинала на 2008-12-04 . Проверено 3 августа 2008 .
- ↑ Yuki N, Sato S, Tsuji S, Ogawa K, Miyatake T (июнь 1993 г.). «Лейкоцитарные антигены человека при синдроме Фишера». Аня. Neurol . 33 (6): 655–7. DOI : 10.1002 / ana.410330617 . PMID 8498847 .
- ^ Cruz-Роблес D, Reyes PA, Monteón-Падилья В.М., Ortiz-Мунис AR, Варгас-Аларкон G (январь 2004). «Гены MHC класса I и класса II у мексиканских пациентов с болезнью Шагаса». Гм. Иммунол . 65 (1): 60–5. DOI : 10.1016 / j.humimm.2003.10.008 . PMID 14700597 .
- ^ «Болезнь Шагаса представляет новую проблему для безопасности кровоснабжения» .
- ^ Кимура A, Китамура H, Дата Y, Numano F (август 1996). «Комплексный анализ генов HLA при артериите Такаясу в Японии». Int. J. Cardiol . 54 Дополнение: S61–9. DOI : 10.1016 / s0167-5273 (96) 88774-2 . PMID 9119528 .
- ^ Есида М, Кимура А, Кацураги К, Р Numano, Sasazuki Т (август 1993 г.). «Типирование ДНК гена HLA-B при артериите Такаясу». Тканевые антигены . 42 (2): 87–90. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.1993.tb02242.x . PMID 7903491 .
- ^ Китамура H, Kobayashi Y, Кимура A, Numano F (октябрь 1998). «Ассоциация клинических проявлений с аллелями HLA-B при артериите Такаясу». Int. J. Cardiol . 66 Дополнение 1: S121–6. DOI : 10.1016 / S0167-5273 (98) 00159-4 . PMID 9951811 .
- ^ Родригес-Рейна Т.С., Суньига-Рамос Дж., Сальгадо Н. и др. (Октябрь 1998 г.). «Последовательности интрона 2 и экзона 3 могут быть вовлечены в предрасположенность к развитию артериита Такаясу». Int. J. Cardiol . 66 Дополнение 1: S135–8, обсуждение S139. DOI : 10.1016 / S0167-5273 (98) 00161-2 . PMID 9951813 .