Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Гаплогруппа CT
Y-ДНК дерево.GIF
Возможное время происхожденияc. 70 000 лет назад, [1] ок. 100 000 лет назад [2] или около 101 000 лет назад [3]
Возможное место происхожденияАфрика , [4] [5] [6] [2], возможно, Северо-Восточная Африка [7]
ПредокГаплогруппа BT
ПотомкиГаплогруппа CF , Гаплогруппа DE
Определение мутацийP9.1, M168, M294, V9, V41, V54, V189 и V226

Гаплогруппа CT - это гаплогруппа Y-хромосомы человека , определяющая одну из основных отцовских линий человечества.

Мужчины, которые несут кладу CT, имеют Y-хромосомы с мутацией SNP M168, а также P9.1 и M294. Эти мутации присутствуют во всех современных человеческих мужских линиях, кроме A и B-M60 , которые встречаются почти исключительно в Африке .

Самый недавний общий предок по мужской линии (TMRCA) всех CT-мужчин, вероятно, предшествовал недавнему африканскому происхождению современных людей , миграции, в которой участвовали некоторые из его потомков. Поэтому считается, что он жил в Африке до предполагаемой миграции. [1] [5] [4] В соответствии с концепцией « Y-хромосомного Адама », данной отцовскому предку всех живых людей, CT-M168, следовательно, также упоминается в популярных источниках как линия «евразийского происхождения». Адам »или« Адам из Африки »; потому что, наряду со многими африканскими Y-линиями, от нее происходят все неафриканские Y-линии. [8] [7] [6]

Ни одного самца парагруппы CT * в современных популяциях никогда не обнаруживали. Это означает , что все мужчины , несущие эту гаплогруппу также определены как в одном из нескольких крупных отраслевых кладов . Все известные выжившие потомки CT находятся в одном из двух основных субкладов, CF и DE . В свою очередь, DE делится на преимущественно азиатскую гаплогруппу D-CTS3946 и преимущественно африканскую гаплогруппу E-M96 , тогда как CF делится на восточноазиатскую, индейскую и океаническую гаплогруппу C-M130 и гаплогруппу F-M89 , который преобладает в большинстве неафриканских популяций. [6]

Субклады [ править ]

Гаплогруппа CT (M168 / PF1416)
  • CF (P143 / PF2587, CTS3818 / M3690 / PF2668, CTS6376 / M3711 / PF2697)
    • C (M130 / Page51 / RPS4Y711, M216) Азия , Океания и Северная Америка
      • C1 F3393 / Z1426
        • C1a CTS11043
          • C1a1 ранее C1 (M8, M105, M131) Япония
          • C1a2 Очень низкая частота в Западной Евразии (включая Костенки 38 000 лет назад) и Северной Африке.
        • C1b
          • C1b1
            • C1b1a
              • C1b1a1 ранее C5 (M356) Южная Азия , Центральная Азия и Юго-Западная Азия
          • C1b2
            • C1b2a ранее C2 (M38) Индонезия , Новая Гвинея , Меланезия , Микронезия и Полинезия
            • C1b2b ранее C4 (M347) Коренные австралийцы
      • C2 ранее C3 (M217, P44) Встречается по всей Евразии и Северной Америке, но особенно среди монголов , казахов , тунгусов , палеосиберий и народов, говорящих на языке на-дене.
    • F (M89, M213) Встречается в Евразии , Океании и Америке.
      • F1 (P91, P104)
      • F2 (M427, M428)
      • F3 (P96)
      • F4 (M481)
    • GHIJK F1329 / M3658 / PF2622 / YSC0001299, CTS2254 / M3680 / PF2657, FGC2045 / Z12203 По всей Евразии ; также Америка ; на низком уровне / среди меньшинств в Африке и Океании
      • G M201, P257 В первую очередь Кавказ ; также на низком уровне / среди меньшинств в Европе, Северной Африке, Юго-Западной Азии и Центральной Азии
      • HIJK По всей Евразии; также Америка; на низком уровне / среди меньшинств в Африке и Океании
        • H M69, M370 Южная Азия , Центральная Азия и Юго-Западная Азия
        • IJK L15 / S137, L16 / S138 Евразия, Северная Африка, Океания, Северная и Южная Америка и Восточная Африка
        • IJ M429 / P125 Европа , Западная Азия , Северная Африка и Восточная Африка
          • Я M170, M258, P19, P38, P212, U179 Европа
          • J 12f2.1, M304 Европа , Западная Азия , Южная Азия , Северная Африка и Восточная Африка
        • K M9 Находится по всей Евразии ; также имеет большое значение в Северной и Южной Америке и Океании ; на более низких уровнях в Северной Африке и Восточной Африке
          • LT ( K1 ) L298 / P326
            • L M11, M20, M22, M61, M185, M295 Индийский субконтинент
            • T M70, M184 / USP9Y + 3178, M193, M272 (ранее K2) Юго-Западная Азия , Южная Азия , Северная Африка , Африканский Рог , бассейн Чада и Южная Европа
          • K2 M526 Евразия , Океания , Америка , некоторые коренные австралийцы и некоторые меньшинства в Африке
            • NO ( K2a ) M214 По сообщениям, обнаруживается в небольшом количестве самцов буи и японцев .
              • N M231 Восточная Европа , Северная Азия и Восточная Азия
              • O M175 Океания , Юго-Восточная Азия и Восточная Азия
            • K2b ранее MPS P331 Евразия, Америка, Океания и меньшинства в Африке
              • K2b1 ранее MS P397 / P399 Меланезийцы, микронезийцы, коренные австралийцы и полинезийцы.
                • M P256 Восточная Индонезия , Папуа-Новая Гвинея и Меланезия
                • S M230, P202, P204 (ранее K5) Восточная Индонезия , Папуа-Новая Гвинея и Меланезия
              • P ( K2b2 ) 92R7, M45, M74 / N12, P27.1 / P207 По всей Евразии , Америке и некоторым меньшинствам в Африке
                • Q M242 Америка и Евразия
                • R M207 / UTY2, M306 / S1 Европа, Ближний Восток, Южная Азия, бассейн Чада, Канарские острова
            • K2c P261 Низкие уровни на Бали
            • K2d P402 / P403 Низкие уровни в Java
            • K2e M147 Низкие уровни в Южной Азии
  • Гаплогруппа DE (M1 / YAP, M145 / P205, M203 / Page 36, P144, P153, P165, P167, P183) Азия, Африка, Южная и Восточная Европа; также на низких уровнях в Океании
    • Гаплогруппа D (M174) В основном жители Японии , Тибета и Андаманских островов ; также на низком уровне / среди меньшинств в Восточной Азии, Центральной Азии, Микронезии и Меланезии
      • Гаплогруппа D1 (CTS11577) В основном Тибет; меньшинства в Центральной Азии, Восточной Азии и Юго-Восточной Азии
        • Гаплогруппа D1a Z27276 Восточная и Центральная Азия
          • D1a1 (M15) (бывший D1) люди Цян ; также на низких уровнях по всей Восточной и Центральной Азии
          • Гаплогруппа D1a2 P99 (ex-D3) Тибет и Средняя Азия
        • Гаплогруппа D1b (бывшая D2) (M64.1 / Page 44.1, M55, M57, M179 / Page 31, M359.1 / P41.1, P37.1, P190, 12f2.2) В основном Япония; также на низком уровне / среди меньшинств в Корее, Китае, Микронезии и Меланезии
      • Гаплогруппа D2 L1366 (бывшая D1a) Филиппины
    • Гаплогруппа E (M40, M96) Африка, Ближний Восток, Южная и Восточная Европа
      • Гаплогруппа E1 (P147) На высоких уровнях по всей Африке; на более низких уровнях на Ближнем Востоке и в Европе
        • Гаплогруппа E1a (ранее E1) (M132) В первую очередь Африка
        • Гаплогруппа E1b (P177 / PF1939)
          • Гаплогруппа E1b1 (ранее E3) (P2, DYS391p)
            • Гаплогруппа E1b1a (V38)
            • Гаплогруппа E1b1a1 (ранее E3a) (M2) Западная Африка, Центральная Африка, Юго-Восточная Африка и Южная Африка
            • Гаплогруппа E1b1b (ранее E3b) (M215) Африканский Рог ( эфиопы , сомалийцы ), Северная Африка ( берберы , арабы [9] ), Ближний Восток, Европа (особенно районы около Средиземного моря)
      • Гаплогруппа E2 (M75) Восточная Африка

Источники [ править ]

  • ISOGG :
    • Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015
    • Y-ДНК Гаплогруппа C и ее субклады - 2015
    • Y-ДНК Гаплогруппа F и ее субклады - 2015

См. Также [ править ]

Генетика [ править ]

  • Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека
  • Гаплогруппы Y-хромосомы в популяциях мира
  • Гаплогруппы Y-ДНК по этнической группе
  • Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Восточной и Юго-Восточной Азии
  • Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Океании
Субклады Y-ДНК C
  • Мега-гаплогруппа CF
  • Мега-гаплогруппа CT
  • C-M130
  • C-M208
  • C-M210
  • C-M216
  • C-M217
  • C-M38
  • C-M8
  • C-M93
  • C-P33
  • C-P44

Ссылки [ править ]

  1. ^ а б Карафет и др. (2008) дают «70 000», цитируя «68 500 ± 6000 лет» из Хаммера и Зегуры (2002). Karafet TM, Mendez FL, Meilerman MB, Underhill PA, Zegura SL, Hammer MF (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–8. DOI : 10.1101 / gr.7172008 . PMC  2336805 . PMID  18385274 .. Раскол между CF и DE (который в отсутствие парагруппы CT * эквивалентен возрасту CT) датируется 70 000–75 000 лет назад в геноме Сибири верхнего палеолита, что свидетельствует о двойном происхождении коренных американцев , Nature 505, 87– 91 (2 января 2014 г.)
  2. ^ а б Камин М., Сааг Л., Винсенте М. и др. (Апрель 2015 г.). «Недавнее узкое место в разнообразии Y-хромосомы совпадает с глобальным изменением культуры» . Геномные исследования . 25 (4): 459–466. DOI : 10.1101 / gr.186684.114 . PMC 4381518 . PMID 25770088 .  
  3. ↑ Haber M, Jones AL, Connel BA, Asan, Arciero E, Huanming Y, Thomas MG, Xue Y, Tyler-Smith C (июнь 2019). "Редкая глубоко укоренившаяся африканская гаплогруппа Y-хромосомы D0 и ее последствия для распространения современного человека за пределы Африки" . Генетика . 212 (4): 1421–1428. DOI : 10.1534 / genetics.119.302368 . PMC 6707464 . PMID 31196864 .  
  4. ^ a b Андерхилл и Кивисилд; Кивисилд, Т (2007). «Использование структуры популяции Y-хромосомы и митохондриальной ДНК в отслеживании миграций человека» . Анну. Преподобный Жене . 41 (1): 539–64. DOI : 10.1146 / annurev.genet.41.110306.130407 . PMID 18076332 . S2CID 24904955 .  
  5. ^ a b Стоун, Линда; Пол Ф. Луркин; Луиджи Лука Кавалли-Сфорца (2007). «Путешествия, доисторические экспансии человека» . Гены, культура и эволюция человека . п. 187. ISBN. 978-1-4051-5089-7.
  6. ^ a b c Карафет; и другие. (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–8. DOI : 10.1101 / gr.7172008 . PMC 2336805 . PMID 18385274 .  
  7. ^ a b Дарвиновские детективы: раскрытие естественной истории генов и геномов , Норман А. Джонсон, 2007, ISBN 0-19-530675-9 , ISBN 978-0-19-530675-0  
  8. ^ Гены, культура и эволюция человека: синтез , Линда Стоун, Пол Ф. Луркин, 2007, ISBN 1-4051-5089-0 , стр. 187 
  9. ^ Перейра и др. (2010), Соединение генофондов к югу от Сахары и Западной Евразии: материнское и отцовское наследие кочевников туарегов из африканского Сахеля , Европейский журнал генетики человека (2010) 18, 915–923; DOI : 10.1038 / ejhg.2010.21
Филогенетическое дерево гаплогрупп ДНК Y-хромосомы человека [χ 1] [χ 2] Эта статья нуждается в обновлении . Обновите эту статью, чтобы отразить недавние события или новую доступную информацию. ( Февраль 2021 г. )
« Y-хромосомный Адам »
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я  J    LT  [χ 5]      K2  [χ 6]
L    Т   K2a  [χ 7]       K2b  [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313  [χ 10]    K2b1  [χ 11]П  [χ 12]
НЕТ  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
NOQр
Y-ДНК по населению Y-ДНК гаплогруппы исторических людей Сноски  ^ Ван печь М, Ван Geystelen А, Кайзер М, Decorte R, Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Мутация человека . 35 (2): 187–91. DOI : 10.1002 / humu.22468 . PMID 24166809 .  ^ Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015 . (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.) ^ Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4). ^ Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4. ^ Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1. ^ В период2002 по 2008 год, Гаплогруппа T-M184 был известен как «гаплогруппы К2». Это имя с тех пор было присвоено K-M526 , брату Haplogroup LT. ^ Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году. (Это последовало за публикацией: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL, et al. (2016) ». в мужской демографии человека выведен из последовательностей по всему миру 1244 Y-хромосома» . Nature Genetics . 48 (6): 593-9. DOI : 10.1038 / ng.3559 . ПМК 4884158 . PMID 27111036 .   В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a». ^ Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы. ^ Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «Гаплогруппа X» и «K2a» (но является родственным субкладом нынешнего K2a). ^ K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Poznik op. соч. ; YFull YTree v5.08 , 2017, «K-M2335» и; PhyloTree , 2017, «Подробная информация о маркерах Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.) ^ Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру. ^ Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2. ^ Гаплогруппа S, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1a. (Ранее название Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.) ^ Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее название Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)