Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено из гаплогруппы D (Y-ДНК) )
Перейти к навигации Перейти к поиску
Эта статья о гаплогруппе Y-ДНК человека. Для гаплогруппы мтДНК человека см. Гаплогруппа D (мтДНК) .
Гаплогруппа D-CTS3946
Возможное время происхождения83 000–64 700 лет назад (по оценкам, примерно 73 200 лет назад) [1]
Возможное место происхожденияАфрика [1]
ПредокDE
ПотомкиD-M174 (D1)
D-A5580.2 (D2, также известный как D0)
Определение мутацийCTS3946, CTS4030 / Z1605

Гаплогруппа D или D-CTS3946 - это гаплогруппа Y-хромосомы . И D-CTS3946, и линии E также демонстрируют однонуклеотидный полиморфизм M168, который присутствует во всех гаплогруппах Y-хромосомы, кроме A и B , а также полиморфизм уникального события YAP + , который является уникальным для гаплогруппы DE . Субклады гаплогруппы D-CTS3946 встречаются в основном в Восточной Азии , хотя они также регулярно с низкой частотой обнаруживаются в Центральной Азии и Юго-Восточной Азии , а также спорадически обнаруживаются в Западной Африке иЗападная Азия .

Обзор [ править ]

Предполагаемая миграция гаплогруппы D согласно Haber et al.

Гаплогруппа D ранее была названием линии передачи D D-M174 . Существуют различные предположения относительно происхождения гаплогруппы DE , родительской группы D, некоторые предполагают африканское [2], а другие азиатское происхождение. [3] Однако предполагается, что D-M174 имеет азиатское происхождение и встречается исключительно в Азии.

Однако исследование Haber et al. (2019) идентифицировали гаплогруппу, названную «D0», у трех нигерийцев. Гаплогруппа "D0" находится за пределами M174, но принадлежит к линии D, разделяет с ней 7 SNPs D-M174, которых нет у E, и было определено, что она рано отошла от ветви D (около разделения D / E). несколько возможностей, включая африканское происхождение и азиатское происхождение гаплогруппы, но отчасти из-за глубоко укоренившейся гаплогруппы «D0», а также недавно рассчитанного раннего времени расхождения для нее и ее родительской гаплогруппы, DE, заключают авторы в пользу африканского происхождения для D0 и DE, а также для общего предка (теперь известного как D-CTS3946 или "D") D0 и D-M174. Согласно Хаберу и др., D0 - это ветвь линии передачи DE рядом с разделением D / E, но на ветви D,расходились около 71000 лет назад. Авторы находят времена расхождения для DE *, E и D0, вероятно, в пределах периода примерно 76000-71000 лет назад, и вероятную дату выхода предков современных евразийцев из Африки (и последующей примеси неандертальцев) позже. , около 50 300–59 400 лет назад, что, по их мнению, также подтверждает африканское происхождение этих гаплогрупп.[1] Таким образом, предполагается, что D-CTS3946 распространился как внутри, так и за пределами Африки: одна ветвь расходится в D0 в Африке, а другая ветвь за пределами Африки в конечном итоге расходится в D-M174 (то есть с мутацией M174, позже возникшей из D -CTS3946, распространившийся на Азию). «D0» также был назван «D2», а бывший D (D-M174) теперь также был назван «D1» из-за этого открытия. [4] [5]

Три других образца D2 также были обнаружены (также в 2019 году) FTDNA: два в Аль-Ваджх на западном побережье Саудовской Аравии [4] [6] и еще один у россиянина, который проследил свое происхождение по отцовской линии до Сирии. [4] В 2020 году Майкл Сагер из FTDNA объявил, что другой образец был обнаружен у афроамериканца [7] [8] Образцы, обнаруженные у сирийского потомка и у афроамериканца, на сегодняшний день являются самыми базальными образцами D2. . [7] [4] [9] [8]Недавние данные (как также предложено Хабером и др.) Предполагают, что D2 является сильно дивергентной гаплогруппой, близкой к расщеплению DE, но на ветви D и не имеющей мутации M174, присущей другим известным линиям D (принадлежащим ее брату D- M174). [4]

Генетическое исследование Hallast et al. 2020 о древних и современных гаплогруппах с использованием филогенетического анализа последовательностей гаплогрупп C, D и FT, включая очень редкие глубоко укоренившиеся клоны (такие как D0 / D2, взятые Хабером и др. 2019), принимая «редкий глубоко укоренившийся D0. "во внимание, что начальный раскол внутри гаплогруппы CT(предок DE), вероятно, произошел в Африке, и что гаплогруппа D Y, а также C и FT покинули Африку в результате миграции из Африки около 70-50 000 лет назад с предками неафриканцев. Они утверждают, что эти линии затем быстро распространились по Евразии, позже диверсифицировались в Юго-Восточной Азии, а затем расширились на запад около 55-50 000 лет назад, заменив другие местные линии в Евразии. Они пришли к выводу, что гаплогруппа D (как D-M174) претерпела быстрое распространение в восточно-евразийских популяциях и состоит из 5 различных ветвей, которые сформировались около 45000 лет назад. Они обнаружили, что эти гаплогруппы в настоящее время наиболее разнообразны в Восточной Евразии (восточная / юго-восточная Азия). Было обнаружено, что тибето-бирманские популяции Восточной и Юго-Восточной Азии отличаются наибольшим разнообразием.[10]

Филогения субкладов [ править ]

ISOGG (версия: 14.151). [11]

  • DE (YAP)
    • D (CTS3946)
      • D1 (M174 / страница 30, IMS-JST021355)
        • D1a (CTS11577)　
          • D1a1 (F6251 / Z27276)
            • D1a1a (M15)
              • D1a1a1 (F849)
                • D1a1a1a (N1)
                  • D1a1a1a1 (Z27269) Япония , Китай , Тибет [12]
                    • D1a1a1a1a (PH4979)
                      • D1a1a1a1a1 (BY15119 / Z29428)
                • D1a1a1a2 (Z31591) Непал (Таманг), Казахстан, Китай (Йи)
              • D1a1a2 (F1070) Китай, Таиланд
            • D1a1b (P99)　Тибет , Монгол , Средняя Азия [12]
          • D1a2 (Z3660)
            • D1a2a (M64.1 / Page 44.1, M55) 　 Япония [12]
              • D1a2a1 (M116.1)
              • D1a2a2 (CTS131)
                • D1a2a2a (CTS220)
                • D1a2a2b (CTS68) Япония (остров Ребун)
            • D1a2b (Y34637)　Андаманские острова [13]
        • D1b (L1378) 　 Филиппины [14]
      • D2 (A5580.2) 　Нигерия , [1] афроамериканцы , Аль-Ваджх в Саудовской Аравии , [ необходима ссылка ] Сирия
Филогенетическое дерево гаплогрупп ДНК Y-хромосомы человека [χ 1] [χ 2] Эта статья нуждается в обновлении . Обновите эту статью, чтобы отразить недавние события или новую доступную информацию. ( Февраль 2021 г. )
« Y-хромосомный Адам »
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я  J    LT  [χ 5]      K2  [χ 6]
L    Т   K2a  [χ 7]       K2b  [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313  [χ 10]    K2b1  [χ 11]П  [χ 12]
НЕТ  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
NОQр
Y-ДНК по населению Y-ДНК гаплогруппы исторических людей Сноски  ^ Ван печь М, Ван Geystelen А, Кайзер М, Decorte R, Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Мутация человека . 35 (2): 187–91. DOI : 10.1002 / humu.22468 . PMID  24166809 . ^ Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015 . (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.) ^ Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4). ^ Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4. ^ Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1. ^ В период2002 по 2008 год, Гаплогруппа T-M184 был известен как «гаплогруппы К2». Это имя с тех пор было присвоено K-M526 , брату Haplogroup LT. ^ Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году. (Это последовало за публикацией: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL, et al. (2016) ». в мужской демографии человека выведен из последовательностей по всему миру 1244 Y-хромосома» . Nature Genetics . 48 (6): 593-9. DOI : 10.1038 / ng.3559 . ПМК 4884158 . PMID 27111036 .   В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a». ^ Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы. ^ Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешнего K2a). ^ K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Poznik op. соч. ; YFull YTree v5.08 , 2017, «K-M2335» и; PhyloTree , 2017, «Подробная информация о маркерах Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.) ^ Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру. ^ Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2. ^ Гаплогруппа S, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1a. (Ранее название Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.) ^ Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее название Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

Ссылки [ править ]

  1. ^ а б в г Габер М., Джонс А. Л., Коннелл Б. А., Арчиеро Э., Ян Х., Томас М. Г. и др. (Август 2019 г.). «Редкая африканская гаплогруппа Y-хромосомы D0 с глубокими корнями и ее последствия для распространения современного человека за пределы Африки» . Генетика . 212 (4): 1421–1428. DOI : 10.1534 / genetics.119.302368 . PMC 6707464 . PMID 31196864 .  
  2. ^ Андерхилл П., Kivisild T (2007). «Использование y-хромосомы и структуры популяций митохондриальной ДНК в отслеживании миграций человека». Ежегодный обзор генетики . 41 : 539–64. DOI : 10.1146 / annurev.genet.41.110306.130407 . PMID 18076332 . 
  3. Перейти ↑ Cabrera VM (2017). «Носители основных линий митохондриальной ДНК макрогаплогруппы L3 мигрировали обратно в Африку из Азии около 70 000 лет назад». bioRxiv 10.1101 / 233502 . 
  4. ^ a b c d e Эстес, Роберта (21.06.2019). "Захватывающие новые открытия гаплогруппы D ДНК Y!" . DNAeXplained - Генетическая генеалогия . Проверено 6 июля 2019 .
  5. ^ "Изображение" .
  6. ^ "Изображение" .
  7. ^ a b Сагер, Майкл (февраль 2020 г.). Древо человечества от FTDNA (Майк Сагер) .
  8. ^ a b Эстес, Роберта (10 декабря 2020 г.). «Новые открытия проливают свет на теорию за пределами Африки и за ее пределами» . DNAeXplained - Генетическая генеалогия .
  9. ^ "Изображение" .
  10. ^ Hallast Р, Agdzhoyan А, Балановский О, Сюэ У, Тайлер-Смит С (февраль 2021). «Юго-восточноазиатское происхождение современных неафриканских человеческих Y-хромосом» . Генетика человека . 140 (2): 299–307. DOI : 10.1007 / s00439-020-02204-9 . PMC 7864842 . PMID 32666166 .  
  11. ^ Y-ДНК Гаплогруппа D и ее субклады - 2019
  12. ^ a b c Hammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). «Двойное происхождение японцев: общая основа для Y-хромосом охотников-собирателей и фермеров». J. Hum. Genet. 51 (1): 47–58. DOI: 10.1007 / s10038-005-0322-0. PMID 16328082 . 
  13. ^ "D YTree" . www.yfull.com . Проверено 3 сентября 2019 .
  14. ^ Y-ДНК Гаплогруппа D и ее субклады - 2014