6.1 Филогенетическое дерево и карты распространения Y-ДНК гаплогруппы J
6.2 Другое
Истоки
Эта статья нуждается в дополнительных ссылках для проверки . Пожалуйста, помогите улучшить эту статью , добавив ссылки на надежные источники . Неисходный материал может быть оспорен и удален. Найдите источники: «Гаплогруппа J» Y-ДНК – новости · газеты · книги · ученый · JSTOR ( май 2014 г. ) ( узнайте, как и когда удалить это шаблонное сообщение )
Считается, что гаплогруппа J-M304 отделилась от гаплогруппы I-M170 примерно 43 000 лет назад в Западной Азии [1] , поскольку обе линии являются субкладами гаплогруппы IJ . Гаплогруппа IJ и гаплогруппа K происходят от гаплогруппы IJK , и только на этом уровне классификации гаплогруппа IJK объединяется с гаплогруппой G-M201 и гаплогруппой H как непосредственные потомки гаплогруппы F-M89 .. J-M304 определяется генетическим маркером M304 или эквивалентным маркером 12f2.1. Считается, что основные современные подгруппы J-M267 и J-M172, которые теперь включают между собой почти все потомки гаплогруппы, возникли очень рано, по крайней мере, 10 000 лет назад. Тем не менее, Y-хромосомы F-M89* и IJ-M429*, как сообщается, наблюдались на Иранском плато (Grugni et al. 2012).
С другой стороны, может показаться, что различные эпизоды перемещения населения повлияли на юго-восточную Европу, а роль Балкан как давнего коридора в Европу с Ближнего Востока показана филогенетическим объединением Hgs I. и J базальной мутацией M429. Это доказательство общего происхождения предполагает, что предки Hgs IJ-M429 *, вероятно, попали в Европу через балканский путь незадолго до LGM . Затем они впоследствии разделились на Hg J и Hg I на Ближнем Востоке и в Европе по типичной дизъюнктивной филогеографической схеме. Такой географический зал [ необходимо уточнение ] склонен сталкиваться с дополнительными последовательными потоками генов, включая поселенцев-садоводов. Более того, объединение гаплогрупп IJK создает эволюционную дистанцию от делегатов F–H, а также подтверждает вывод о том, что и IJ-M429, и KT-M9 возникли ближе к Ближнему Востоку, чем к Центральной или Восточной Азии. [ нужна ссылка ]
Гаплогруппа J также была обнаружена среди двух древних египетских мумий, раскопанных на археологических раскопках Абусир-эль-Мелек в Среднем Египте, которые датируются периодом между поздним Новым царством и римской эпохой . [3]
Распределение
Гаплогруппа J-M304 в наибольшей концентрации встречается на Аравийском полуострове . За пределами этого региона гаплогруппа J-M304 имеет значительное присутствие в других частях Ближнего Востока , а также в Северной Африке , на Африканском Роге и на Кавказе . Он также имеет умеренную распространенность в Южной Европе , особенно в центральной и южной Италии, на Мальте, в Греции и Албании. Субклад J-M410 в основном распространен в Анатолии , Греции и на юге Италии. Кроме того, J-M304 наблюдается в Центральной и Южной Азии , особенно в форме его субклада J-M172. J-12f2 и J-P19 также встречаются средиГереро (8%). [4]
Страна/регион
Выборка
Н
J-M267
J-M172
Всего Дж
Учиться
Алжир
Оран
102
22,5
4.9
27,4
Робино 2008ошибка harvnb: нет цели: CITEREFRobino2008 ( справка )
Албания
Тирана
30
20,0
Бош 2006ошибка harvnb: нет цели: CITEREFBosch2006 ( справка )
Албания
55
23,64
Батталья 2008ошибка harvnb: нет цели: CITEREFBattaglia2008 ( справка )
Босния
Сербы
81
9,9
Батталья 2008ошибка harvnb: нет цели: CITEREFBattaglia2008 ( справка )
Кавказ
чеченский
330
20,9
56,7
77,6
Балановский 2011ошибка harvnb: нет цели: CITEREFBalanovsky2011 ( помощь )
Кавказ
ингуш
143
2,8
88,8
91,6
Балановский 2011ошибка harvnb: нет цели: CITEREFBalanovsky2011 ( помощь )
Китай
уйгурский
50
0
34,0
34,0
Шоу 2010ошибка harvnb: нет цели: CITEREFShou2010 ( помощь )
Китай
узбекский
23
0
30,4
34,7
Шоу 2010ошибка harvnb: нет цели: CITEREFShou2010 ( помощь )
Китай
таджикский
31
0
16.1
16.1
Шоу 2010ошибка harvnb: нет цели: CITEREFShou2010 ( помощь )
Кипр
164
9,6
12,9
22,5
Эль-Сибай 2009 [5]ошибка harvnb: нет цели: CITEREFEl-Sibai2009 ( справка )
Египет
124
19,8
7.6
27,4
Эль-Сибай 2009 г.ошибка harvnb: нет цели: CITEREFEl-Sibai2009 ( справка )
Греция
Крит/Ираклион
104
1,9
44,2
46,1
Мартинес 2007ошибка harvnb: нет цели: CITEREFMartinez2007 ( справка )
Греция
Крит
143
3,5
35
38,5
Эль-Сибай 2009 г.ошибка harvnb: нет цели: CITEREFEl-Sibai2009 ( справка )
Греция
154
1,9
18.1
20
Эль-Сибай 2009 г.ошибка harvnb: нет цели: CITEREFEl-Sibai2009 ( справка )
Индия
Сунниты и североиндийские шииты
112
32
43,2
75,2
Эль-Сибай 2009 г.ошибка harvnb: нет цели: CITEREFEl-Sibai2009 ( справка )
Иран
92
3.2
25
28,2
Эль-Сибай 2009 г.ошибка harvnb: нет цели: CITEREFEl-Sibai2009 ( справка )
Ирак
арабы , арамеи , ассирийцы , мандеи
117
33.1
25.1
58,2
Эль-Сибай 2009 г.ошибка harvnb: нет цели: CITEREFEl-Sibai2009 ( справка )
Израиль
Акко (арабы)
101
39,2
18,6
57,8
Эль-Сибай 2009 г.ошибка harvnb: нет цели: CITEREFEl-Sibai2009 ( справка )
Италия
699
2
20
22
Капелли 2007 harvnb error: no target: CITEREFCapelli2007 (help)
Италия
Центральный Марке
59
5.1
35,6
40,7
Капелли 2007 harvnb error: no target: CITEREFCapelli2007 (help)
Италия
Западная Калабрия
57
3,5
35,1
38,6
Капелли 2007 harvnb error: no target: CITEREFCapelli2007 (help)
Италия
Сицилия
212
5.2
22,6
27,8
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Италия
Сардиния
81
4.9
9,9
14,8
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Иордания
273
35,5
14,6
50,1
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Косово
албанцы
114
16,67
Перичич 2005 harvnb error: no target: CITEREFPericic2005 (help)
Кувейт
42
33,3
9,5
42,8
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Ливан
951
17
29,4
46,4
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Мальта
90
7,8
21.1
28,9
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Марокко
316
1
0,2
1,2
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Марокко
Жители Италии
51
19,6
0
19,6
Онофри 2008 harvnb error: no target: CITEREFOnofri2008 (help)
Португалия
Португалия
303
4.3
6,9
11.2
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Катар
Катар
72
58,3
8.3
66,6
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Сербия
Белград
113
8
Перичич 2005 harvnb error: no target: CITEREFPericic2005 (help)
Сербия
179
5.6
Мирабал 2010 harvnb error: no target: CITEREFMirabal2010 (help)
Испания
Кадис
28
3,6
14.3
17,9
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Испания
Кантабрия
70
2,9
2,9
5,8
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Испания
Кастилия
21
0
9,5
9,5
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Испания
Кордова
27
0
14,7
14,7
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Испания
Галисия
19
5.3
0
5.3
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Испания
Уэльва
22
0
13,7
13,7
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Испания
Ибица
54
0
3,7
3,7
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Испания
Леон
60
1,7
5
6.7
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Испания
Малага
26
0
15,4
15,4
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Испания
Майорка
62
1,6
8
9,7
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Испания
Севилья
155
3.2
7,8
11
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Испания
Валенсия
31
2,7
5,5
8.2
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Сирия
арабы , арамеи , ассирийцы
554
33,6
20,8
54,4
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Тунис
62
0
8
8
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Тунис
52
34,6
3,8
38,4
Онофри 2008 harvnb error: no target: CITEREFOnofri2008 (help)
Тунис
Сус
220
25,9
8.2
34,1
Фадхлауи-Зид 2015 harvnb error: no target: CITEREFFadhlaoui-Zid2015 (help)
Тунис
Тунис
148
32,4
3.4
35,8
Арреди 2004 harvnb error: no target: CITEREFArredi2004 (help)
Турция
523
9.1
24,2
33,3
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
ОАЭ
164
34,7
10.3
45
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Йемен
62
72,5
9,6
82,1
Эль-Сибай 2009 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help)
Распределение субкладов
J-M304*
Парагруппа J-M304* [Phylogenetics 2] включает все J-M304, кроме J-M267, J-M172 и их субкладов. J-M304* редко встречается за пределами острова Сокотра, принадлежащего Йемену, где он встречается чрезвычайно часто - 71,4%. [6] Гаплогруппа J-M304* также была обнаружена с меньшей частотой в Омане ( Джакомо 2004 ) , евреях- ашкенази , [7] Саудовской Аравии ( Абу-Амеро 2009 ) , Греции ( Джакомо 2004 ) , Чехии ( Джакомо 2004 и Лука 2007 ), уйгуры [8] harv error: no target: CITEREFGiacomo2004 (help) harv error: no target: CITEREFAbu-Amero2009 (help) harv error: no target: CITEREFGiacomo2004 (help) harvnb error: no target: CITEREFGiacomo2004 (help) harvnb error: no target: CITEREFLuca2007 (help)и несколько тюркских народов . [9] ( Чинниоглу, 2004 г. и Варзари, 2006 г. ). harvnb error: no target: CITEREFCinnioglu2004 (help)
Однако YFull [1] и FTDNA [10] не смогли найти людей J* нигде в мире, хотя есть 2 человека J2-Y130506 и 1 человек J1 с Сокотры.
Ниже приводится сводка большинства исследований, в которых специально тестировались J-M267 и J-M172, показывая их распространение в Европе, Северной Африке, на Ближнем Востоке и в Центральной Азии.
J-M267
Основная статья: Гаплогруппа J-M267
Гаплогруппа J-M267 [филогенетика 3] , определяемая SNP M267, в наше время наиболее часто встречается на Аравийском полуострове: Йемен (до 76%), [11] Саудовская Аравия (до 64%) ( Alshamali 2009 ) , Катар (58 %), [12] и Дагестан (до 56%). [13] J-M267 в целом часто встречается среди арабских бедуинов (62%), [14] евреев- ашкенази (20%) ( Семино 2004 ) , Алжира (до 35%) ( Семино 2004 ) , Ирака (28%) ( Семино 2004). 2004 ) harv error: no target: CITEREFAlshamali2009 (help) harv error: no target: CITEREFSemino2004 (help) harv error: no target: CITEREFSemino2004 (help) harv error: no target: CITEREFSemino2004 (help), Тунис (до 31%), [15] Сирия (до 30%), Египет (до 20%) ( Луис, 2004 г. ) и Синайский полуостров . В какой-то степени частота гаплогруппы J-M267 рушится на границах арабо / семитоязычных территорий с преимущественно неарабо/семитскоязычными территориями, такими как Турция (9%), Иран (5%), индийские мусульмане-сунниты ( 2,3%) и шииты Северной Индии (11%) ( Eaaswarkhanth 2009 harv error: no target: CITEREFLuis2004 (help) harvnb error: no target: CITEREFEaaswarkhanth2009 (help)). Некоторые цифры выше, как правило, являются большими, полученными в некоторых исследованиях, в то время как меньшие цифры, полученные в других исследованиях, опущены. Это также очень часто встречается среди евреев , особенно линии Коэнов (46%) ( Хаммер 2009 ) . harv error: no target: CITEREFHammer2009 (help)
ISOGG заявляет, что J-M267 возник на Ближнем Востоке . Он встречается в некоторых частях Ближнего Востока , Анатолии и Северной Африки , с гораздо более редким распространением на южном средиземноморском фланге Европы и в Эфиопии .
Но не все исследования согласны с точкой происхождения. Был предложен Левант , но исследование 2010 года пришло к выводу, что гаплогруппа имеет более северное происхождение, возможно, из Анатолии .
Происхождение субклада J-P58, вероятно, связано с более северными популяциями, а затем распространяется на юг, на Аравийский полуостров . Высокая дисперсия Y-STR J-P58 в этнических группах в Турции , а также в северных регионах Сирии и Ирака подтверждает вывод о происхождении J-P58 в соседней восточной Анатолии . Более того, сетевой анализ гаплотипов J-P58 показывает, что некоторые популяции с низким разнообразием, такие как бедуины из Израиля , Катара , Судана и Объединенных Арабских Эмиратов, плотно сгруппированы рядом с высокочастотными гаплотипами. Это говорит о том, что эффект основателя при вспышке звезды проникает в Аравийскую пустыню ( Кьярони, 2010 ) . harv error: no target: CITEREFChiaroni2010 (help)
J-M172
Основная статья: Гаплогруппа J-M172
Гаплогруппа J-M172 [Филогенетика 4] обнаружена в самых высоких концентрациях на Кавказе и в Плодородном Полумесяце / Ираке и встречается по всему Средиземноморью (включая Итальянский , Балканский , Анатолийский и Пиренейский полуострова и Северную Африку ) ( Giacomo 2003 ) . harv error: no target: CITEREFGiacomo2003 (help)
Самая высокая зарегистрированная концентрация J-M172 составила 72% в Северо-Восточной Грузии ( Насидзе, 2004 ) . Другие высокие показатели включают ингушей 32% ( Насидзе, 2004 г. ) , киприотов 30-37% (Капелли, 2005 г.), ливанцев 30% (Уэллс и др., 2001 г.), ассирийцев , мандеев и арабских иракцев 29,7% ( Санчес и др., 2005 г.) . ссылка необходима ] , сирийцы и сирийцы 22,5%, курды 24-28 %, пуштуны 20-30%, [16] иранцы 23% ( harv error: no target: CITEREFNasidze2004 (help) harv error: no target: CITEREFNasidze2004 (help)Aburto 2006 ), евреи- ашкенази 24%, палестинские арабы 16,8-25%, евреи-сефарды 29% [17] и мусульмане-шииты Северной Индии 18%, чеченцы 26%, балкарцы 24%, ягнобцы 32%, армяне 21-24%, и азербайджанцы 24%-48%.
В Южной Азии было обнаружено, что J2-M172 значительно выше среди дравидийских каст (19%), чем среди индоевропейских каст (11%). J2-M172 и J-M410 встречаются у 21% среди дравидийских средних каст, за ними следуют высшие касты, 18,6%, и низшие касты, 14%. ( Sengupta 2006 ) [18] Субклады M172, такие как M67 и M92, не были обнаружены ни в индийских, ни в пакистанских образцах, что также может намекать на частичное общее происхождение ( Sengupta 2006 ) [18] harv error: no target: CITEREFSengupta2006 (help) harv error: no target: CITEREFSengupta2006 (help)
Согласно генетическому исследованию в Китае, проведенному Shou et al., J2-M172 с высокой частотой встречается среди уйгуров (17/50 = 34%) и узбеков (7/23 = 30,4%), с умеренной частотой среди памирцев (5/31). = 16,1%), и низкая частота среди югуров (2/32 = 6,3%) и монгуоров (1/50 = 2,0%). Авторы также обнаружили J-M304(xJ2-M172) с низкой частотой у русских (1/19 = 5,3%), узбеков (1/23 = 4,3%), сибэ (1/32 = 3,1%), дунсянов ( 1/35 = 2,9%), и казахи (1/41 = 2,4%) на Северо-Западе Китая . [19]
Филогенетика
В филогенетике Y-хромосомы субклады являются ветвями гаплогрупп. Эти субклады также определяются полиморфизмами одиночных нуклеотидов (SNP) или полиморфизмами уникальных событий (UEP).
Филогенетическая история
Основная статья: Таблица преобразования гаплогрупп Y-хромосомы
До 2002 года в академической литературе существовало как минимум семь систем именования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, целью которого было прежде всего своевременность. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знаменательного Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.
YCC 2002/2008 (сокращенно)
(α)
(β)
(γ)
(δ)
(ε)
(ζ)
(η)
YCC 2002 (от руки)
YCC 2005 (от руки)
YCC 2008 (от руки)
YCC 2010r (от руки)
ИСОГГ 2006
ИСОГГ 2007
ИСОГГ 2008
ИСОГГ 2009
ИСОГГ 2010
ИСОГГ 2011
ИСОГГ 2012
J-12f2a
9
VI
Мед
23
ЕС10
H4
Б
Дж*
Дж
Дж
Дж
-
-
-
-
-
-
Дж
J-M62
9
VI
Мед
23
ЕС10
H4
Б
J1
J1a
J1a
J1a
-
-
-
-
-
-
Частный
J-M172
9
VI
Мед
24
ЕС9
H4
Б
J2*
J2
J2
J2
-
-
-
-
-
-
J2
J-M47
9
VI
Мед
24
ЕС9
H4
Б
J2a
J2a
J2a1
J2a4a
-
-
-
-
-
-
J2a1a
J-M68
9
VI
Мед
24
ЕС9
H4
Б
J2b
J2b
J2a3
J2a4c
-
-
-
-
-
-
J2a1c
J-M137
9
VI
Мед
24
ЕС9
H4
Б
J2c
J2c
J2a4
J2a4h2a1
-
-
-
-
-
-
J2a1h2a1a
J-M158
9
VI
Мед
24
ЕС9
H4
Б
J2d
J2d
J2a5
J2a4h1
-
-
-
-
-
-
J2a1h1
J-M12
9
VI
Мед
24
ЕС9
H4
Б
J2e*
J2e
J2b
J2b
-
-
-
-
-
-
J2b
J-M102
9
VI
Мед
24
ЕС9
H4
Б
J2e1*
J2e1
J2b
J2b
-
-
-
-
-
-
J2b
J-M99
9
VI
Мед
24
ЕС9
H4
Б
J2e1a
J2e1a
J2b2a
J2b2a
-
-
-
-
-
-
Частный
J-M67
9
VI
Мед
24
ЕС9
H4
Б
J2f*
J2f
J2a2
J2a4b
-
-
-
-
-
-
J2a1b
J-M92
9
VI
Мед
24
ЕС9
H4
Б
J2f1
J2f1
J2a2a
J2a4b1
-
-
-
-
-
-
J2a1b1
J-M163
9
VI
Мед
24
ЕС9
H4
Б
J2f2
J2f2
J2a2b
J2a4b2
-
-
-
-
-
-
Частный
Научные публикации
В создании дерева YCC были представлены следующие исследовательские группы по их публикациям.
α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001 harvnb error: no target: CITEREFJobling_and_Tyler-Smith2000 (help) harvnb error: no target: CITEREFKaladjieva2001 (help)
β Андерхилл 2000 harvnb error: no target: CITEREFUnderhill2000 (help)
γ Молот 2001 harvnb error: no target: CITEREFHammer2001 (help)
δ Карафет 2001 harvnb error: no target: CITEREFKarafet2001 (help)
ε Семино 2000 harvnb error: no target: CITEREFSemino2000 (help)
ζ Вс 1999 г. harvnb error: no target: CITEREFSu1999 (help)
η Капелли 2001 harvnb error: no target: CITEREFCapelli2001 (help)
Филогенетические деревья
Для гаплогруппы J-M304 доступно несколько подтвержденных и предложенных филогенетических деревьев. Научно признанным является Консорциум Y-хромосом (YCC), опубликованный в Karafet 2008 и впоследствии обновленный. Черновик дерева, показывающий зарождающуюся науку, предоставлен Томасом Краном из Центра геномных исследований в Хьюстоне, штат Техас . Международное общество генетической генеалогии (ISOGG) также предоставляет любительское дерево.
Черновое дерево Центра геномных исследований
Это Томас Кран из Проекта предложенного дерева Центра геномных исследований для гаплогруппы J-P209 ( Krahn & FTDNA 2013 ) . Для краткости показаны только первые три уровня субкладов. harv error: no target: CITEREFKrahnFTDNA2013 (help)
Этот раздел нуждается в расширении . Вы можете помочь, дополнив его . ( январь 2013 г. )
Это официальное научное дерево, созданное Консорциумом Y-хромосом (YCC). Последнее крупное обновление было в 2008 году ( Karafet 2008 ) . Последующие обновления были ежеквартальными и раз в два года. Текущая версия является пересмотром обновления 2010 года. [20] harv error: no target: CITEREFKarafet2008 (help)
Смотрите также
Генетика
Генетическая история Ближнего Востока
Генетическая история Европы
Генетика и археогенетика Южной Азии
Таблица преобразования гаплогрупп Y-хромосомы
Генетическая генеалогия
Гаплогруппа
гаплотип
Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека
Молекулярная филогения
Парагрупп
Субклад
Y-хромосомный Аарон
Гаплогруппы Y-хромосомы в популяциях мира
Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Европы
Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Южной Азии
Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Восточной и Юго-Восточной Азии
Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Ближнего Востока
Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Северной Африки
Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Кавказа
Гаплогруппы Y-ДНК по этническим группам
J-субклады Y-ДНК
J-P58
J-M304
J-M172
J-M267
J2-L24
J2-L192
J2-L271
использованная литература
^ a b c d "JYTree" . Архивировано из оригинала 23 мая 2018 года . Проверено 8 апреля 2018 г.
^ a b Гаплогруппа J Y-ДНК . Архивировано 18 августа 2017 г. в Wayback Machine , ISOGG, 2015 г.
^ Шунеманн, Верена Дж.; и другие. (2017). «Геномы древних египетских мумий предполагают увеличение африканского происхождения к югу от Сахары в постримские периоды» . Связь с природой . 8 : 15694. Бибкод : 2017NatCo ...815694S . дои : 10.1038/ncomms15694 . ПВК 5459999 . PMID 28556824 .
^ Вуд, Элизабет Т .; и другие. (2005). «Контрастные модели вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: доказательства демографических процессов, обусловленных полом» (PDF) . Европейский журнал генетики человека . 13 (7): 867–876. doi : 10.1038/sj.ejhg.5201408 . PMID 15856073 . S2CID 20279122 . Архивировано (PDF) из оригинала 24 сентября 2016 г .. Проверено 24 сентября 2016 г.
↑ Эль-Сибай, 2009 г. , сообщил о результатах нескольких исследований: Ди Джакомо, 2003 г., Аль-Захери, 2003 г., Флорес, 2004 г., Чинниоглу, 2004 г. , Капелли, 2005 г., Гонсалвес, 2005 г., Заллуа, 2008 г., Каденас, 2008 г. harvnb error: no target: CITEREFEl-Sibai2009 (help) harvnb error: no target: CITEREFDi_Giacomo2003 (help) harvnb error: no target: CITEREFAl-Zahery2003 (help) harvnb error: no target: CITEREFFlores2004 (help) harvnb error: no target: CITEREFCinnioglu2004 (help) harvnb error: no target: CITEREFCapelli2005 (help) harvnb error: no target: CITEREFGoncalves2005 (help) harvnb error: no target: CITEREFZalloua2008 (help) harvnb error: no target: CITEREFCadenas2008 (help)
↑ Черны 2008 : J- 12f2 (xM267, M172) (45/63) Черны, Виктор; и другие. (2009). «За пределами Аравии - поселение на острове Сокотра, как показывает генетическое разнообразие митохондрий и Y-хромосомы» (PDF) . Американский журнал физической антропологии . 138 (4): 439–447. doi : 10.1002/ajpa.20960 . PMID 19012329 . Архивировано из оригинала (PDF) 6 октября 2016 года . Проверено 12 июня 2016 г. harvnb error: no target: CITEREFCerny2008 (help)
↑ Shen 2004 : Гаплогруппа J-M304 (xM267, M172) у евреев-ашкенази 1/20. harvnb error: no target: CITEREFShen2004 (help)
^ Чжун и др. (2011), Mol Biol Evol, 1 января 2011 г., том. 28 нет. 1 717-727 Архивировано 23 августа 2011 года в Wayback Machine , см. Таблицу [ постоянная мертвая ссылка ] .
↑ Юнусбаев 2006 : Статистика по объединенным этническим группам Дагестана, подробности см. В статье о Дагестане . даргинцы (91%), аварцы (67%), чамалины (67%), лезгины (58%), табасараны (49%), андийцы (37%), ассирийцы (29%), багвалины (21,4%) harvnb error: no target: CITEREFYunusbaev2006 (help)
^ "Архивная копия" . Архивировано из оригинала 12 февраля 2020 года . Проверено 28 сентября 2019 г. .CS1 maint: заархивированная копия как заголовок ( ссылка )
^ «Архивная копия» (PDF) . Архивировано (PDF) из оригинала 31 января 2017 г .. Проверено 11 мая 2020 г.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок ( ссылка )
^ б Сенгупта, С ; Животовский, Л.А.; Кинг, Р; и другие. (февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределения y-хромосомы с высоким разрешением в Индии идентифицируют как местную, так и экзогенную экспансию и обнаруживают незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии» . Являюсь. Дж. Хам. Жене . 78 (2): 202–21. дои : 10.1086/499411 . ПМС 1380230 . PMID 16400607 .
↑ Shou et al (2010), Распределение Y-хромосомы среди населения Северо-Западного Китая указывает на значительный вклад скотоводов из Центральной Азии и меньшее влияние жителей Западной Евразии . Архивировано 2 апреля 2015 г. в Wayback Machine , Journal of Human Genetics (2010) 55, 314– 322; doi:10.1038/jhg.2010.30; опубликовано в Интернете 23 апреля 2010 г., Таблица 2. Распределение гаплогрупп и разнообразие Y-хромосом в 14 северо-западных популяциях . Архивировано 14 января 2015 г. в Wayback Machine .
^ "Гаплодерево Y-ДНК" . Архивировано из оригинала 27 января 2013 года . Проверено 3 января 2013 г.Генеалогическое древо ДНК использует дерево Консорциума Y-хромосомы и размещает его на своем веб-сайте.
Процитированные работы
Журналы
Консорциум Y-хромосом "YCC" (2002 г.). «Номенклатурная система дерева бинарных гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 12 (2): 339–48. doi : 10.1101/gr.217602 . ПМС 155271 . PMID 11827954 .
Абу-Амеро, Халед К.; Хеллани, Али; Гонсалес, Ана М; Ларруга, Хосе М; Кабрера, Висенте М.; Андерхилл, Питер А (2009). «Разнообразие Y-хромосом Саудовской Аравии и его связь с близлежащими регионами» . Генетика БМК . 10 : 59. doi : 10.1186/1471-2156-10-59 . ПВК 2759955 . PMID 19772609 .
Альшамали, Фарида; Перейра, Луиза; Бадоул, Брюс; Полони, Эстелла С.; Куррат, Матиас (2009). «Структура местного населения на Аравийском полуострове, выявленная разнообразием Y-STR» . Наследственность человека . 68 (1): 45–54. дои : 10.1159/000210448 . PMID 19339785 .
Кьярони, Жак; Кинг, Рой Дж.; Майрес, Натали М; Хенн, Бренна М.; Дюкурно, Аксель; Митчелл, Майкл Дж.; Бетч, Жиль; Шейха, Исса; и другие. (2009). «Появление гаплогруппы J1e Y-хромосомы среди арабоязычного населения» . Европейский журнал генетики человека . 18 (3): 348–53. doi : 10.1038/ejhg.2009.166 . ПВК 2987219 . PMID 19826455 .
Кьярони, Жак; Кинг, Рой Дж.; Майрес, Натали М; Хенн, Бренна М.; Дюкурно, Аксель; Митчелл, Майкл Дж.; Бетч, Жиль; Шейха, Исса; и другие. (2010). «Появление гаплогруппы J1e Y-хромосомы среди арабоязычного населения» . Европейский журнал генетики человека . 18 (3): 348–53. doi : 10.1038/ejhg.2009.166 . ПВК 2987219 . PMID 19826455 .
Чинниоглу, Ченгиз; Кинг, Рой; Кивисильд, Тоомас; Калфоглу, Эрси; Атасой, Севиль; Каваллери, Джанпьеро Л.; Лилли, Анита С.; Роземан, Чарльз С.; и другие. (2004). «Раскопки слоев гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии». Генетика человека . 114 (2): 127–48. doi : 10.1007/s00439-003-1031-4 . PMID 14586639 . S2CID 10763736 .
Ди Джакомо, Ф.; Лука, Ф.; Анагноу, Н .; Чаварелла, Г.; Корбо, РМ; Креста, М.; Куччи, Ф.; Ди Стази, Л.; и другие. (2003). «В клинических моделях Y-хромосомного разнообразия человека в континентальной Италии и Греции преобладают эффекты дрейфа и основателя». Молекулярная филогенетика и эволюция . 28 (3): 387–95. doi : 10.1016/S1055-7903(03)00016-2 . PMID 12927125 .
Ди Джакомо, Ф.; Лука, Ф.; Попа, ЛО; Акар, Н.; Анагноу, Н .; Банико, Дж.; Брдичка, Р.; Барбуджани, Г.; и другие. (2004). «Y-хромосомная гаплогруппа J как признак постнеолитической колонизации Европы». Генетика человека . 115 (5): 357–71. doi : 10.1007/s00439-004-1168-9 . PMID 15322918 . S2CID 18482536 .
Хаммер, Майкл Ф .; Бехар, Дорон М .; Карафет, Татьяна М.; Мендес, Фернандо Л.; Холлмарк, Брайан; Эрез, Тамар; Животовский, Лев А .; Россет, Сахарон; Скорецкий, Карл (2009). «Расширенные гаплотипы Y-хромосомы разрешают множественные и уникальные линии еврейского духовенства» . Генетика человека . 126 (5): 707–17. doi : 10.1007/s00439-009-0727-5 . ПВК 2771134 . PMID 19669163 .
Джоблинг, Марк А .; Тайлер-Смит, Крис (2000). «Новое использование новых гаплотипов». Тенденции в генетике . 16 (8): 356–62. doi : 10.1016/S0168-9525(00)02057-6 . PMID 10904265 .
Карафет, ТМ; Мендес, Флорида; Мейлерман, МБ; Андерхилл, Пенсильвания; Зегура, С.Л.; Хаммер, М.Ф. (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–8. doi : 10.1101/gr.7172008 . ПВК 2336805 . PMID 18385274 .
Лука, Ф.; Ди Джакомо, Ф.; Бенинкаса, Т .; Попа, ЛО; Банико, Дж.; Крачмарова, А.; Маласпина, П.; Новеллетто, А .; Брдичка, Р. (2007). «Y-хромосомная вариация в Чешской Республике». Американский журнал физической антропологии . 132 (1): 132–139. doi : 10.1002/ajpa.20500 . hdl : 2108/35058 . PMID 17078035 .
Луис, Дж.; Роуолд, Д.; Регейро, М; Каейро, Б; Чинниоглу, К; Роземан, К; Андерхилл, П; Каваллисфорца, Л; Эррера, Р. (2004). «Левант против Африканского Рога: свидетельства двунаправленных коридоров миграции людей» . Американский журнал генетики человека . 74 (3): 532–44. дои : 10.1086/382286 . ПВК 1182266 . PMID 14973781 .
Мирабал С., Варлен Т., Гайден Т. и др. (июль 2010 г.). «Короткие тандемные повторы Y-хромосомы человека: рассказ об аккультурации и миграциях как механизмах распространения сельского хозяйства на Балканском полуострове». Американский журнал физической антропологии . 142 (3): 380–390. doi : 10.1002/ajpa.21235 . PMID 20091845 .
Насидзе, И.; Линг, EYS; Куинк, Д .; Дюпанлу, И.; Кордо, Р.; Рычков С.; Наумова О.; Жукова О.; и другие. (2004). «Митохондриальная ДНК и вариации Y-хромосомы на Кавказе» . Анналы генетики человека . 68 (3): 205–21. doi : 10.1046/j.1529-8817.2004.00092.x . PMID 15180701 . S2CID 27204150 .
Перичич М., Лаук Л.Б., Кларич И.М. и соавт. (октябрь 2005 г.). «Филогенетический анализ юго-восточной Европы с высоким разрешением прослеживает основные эпизоды потока отцовских генов среди славянских популяций» . Мол. биол. Эвол . 22 (10): 1964–75. doi : 10.1093/molbev/msi185 . PMID 15944443 .
Шен, Пейдун; Лави, Таль; Кивисильд, Тоомас; Чоу, Вивиан; Сенгун, Дениз; Гефель, Дов; Шпирер, Исаак; Вульф, Эйлон; и другие. (2004). «Реконструкция отцовства и матриродства самаритян и другого израильского населения по Y-хромосоме и вариации последовательности митохондриальной ДНК». Мутация человека . 24 (3): 248–60. doi : 10.1002/humu.20077 . PMID 15300852 . S2CID 1571356 .
Диссертация и диссертации
Варзари, Александр (2006). История населения Днестровско-Карпатского региона: данные инсерции Alu и полиморфизма Y-хромосомы (PDF) (Диссертация). Мюнхен, университет. OCLC 180859661 .
Блоги
Диенекес (2009). «Ближневосточные и к югу от Сахары родословные индийского мусульманского населения» .
Списки рассылки
Абурто, Альфред А. (2006). «Y-гаплогруппа J в Иране» (список рассылки). Архивировано из оригинала 13 октября 2012 года . Проверено 3 января 2013 г.
дальнейшее чтение
yJdb: гаплотипы базы данных Y-гаплогруппы J гаплогруппы J.
[1]
Субклады гаплогруппы J в Международном обществе генетической генеалогии
Небель и др. 2001 г., см. Модальные гаплотипы «J1» (как Eu10).
Санчес, Хуан Дж.; Халленберг, Шарлотта; Берстинг, Клаус; Эрнандес, Алексис; Горлин, Р. Дж. (2005). «Высокие частоты линий Y-хромосомы, характеризующиеся E3b1, DYS19-11, DYS392-12 у сомалийских мужчин» . Европейский журнал генетики человека . 13 (7): 856–66. doi : 10.1038/sj.ejhg.5201390 . PMID 15756297 .
Сенгупта С., Животовский Л.А., Кинг Р. и соавт. (февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределения y-хромосомы высокого разрешения в Индии идентифицируют как местную, так и экзогенную экспансию и обнаруживают незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии» . Являюсь. Дж. Хам. Жене . 78 (2): 202–21. дои : 10.1086/499411 . ПМС 1380230 . PMID 16400607 .
Филогенетические заметки
^ ISOGG Y-ДНК Гаплогруппа J и ее субклады - 2016 г. Архивировано 18 августа 2017 г. в Wayback Machine (2 февраля 2016 г.).
^ В этой таблице показаны исторические названия J-M304 (он же J-P209 и J-12f2.1) в опубликованной рецензируемой литературе. Обратите внимание, что в Semino 2000 Eu09 является субкладом Eu10, а в Karafet 2001 24 является субкладом 23 .
YCC 2002/2008 (сокращенно)
J-M304 (он же J-12f2.1 или J-P209)
Джоблинг и Тайлер-Смит, 2000 г.
9
Андерхилл 2000
VI
Молот 2001
Мед
Карафет 2001
23
Семино 2000
ЕС10
Вс 1999 г.
H4
Капелли 2001
Б
YCC 2002 (от руки)
Дж*
YCC 2005 (от руки)
Дж
YCC 2008 (от руки)
Дж
YCC 2010r (от руки)
Дж
^ В этой таблице показаны исторические названия J-M267 и его ранее обнаруженного и названного субклада J-M62 в опубликованной рецензируемой литературе.
YCC 2002/2008 (сокращенно)
J-M267
J-M62
Джоблинг и Тайлер-Смит, 2000 г.
-
9
Андерхилл 2000
-
VI
Молот 2001
-
Мед
Карафет 2001
-
23
Семино 2000
-
ЕС10
Вс 1999 г.
-
H4
Капелли 2001
-
Б
YCC 2002 (от руки)
-
J1
YCC 2005 (от руки)
J1
J1a
YCC 2008 (от руки)
J1
J1a
YCC 2010r (от руки)
J1
J1a
^ В этой таблице показаны исторические названия J-M172 в опубликованной рецензируемой литературе. Обратите внимание, что в Semino 2000 Eu09 является субкладом Eu10, а в Karafet 2001 24 является субкладом 23 .
YCC 2002/2008 (сокращенно)
J-M172
Джоблинг и Тайлер-Смит, 2000 г.
9
Андерхилл 2000
VI
Молот 2001
Мед
Карафет 2001
24
Семино 2000
ЕС9
Вс 1999 г.
H4
Капелли 2001
Б
YCC 2002 (от руки)
J2*
YCC 2005 (от руки)
J2
YCC 2008 (от руки)
J2
YCC 2010r (от руки)
J2
внешняя ссылка
Викискладе есть медиафайлы, связанные с гаплогруппой J Y-ДНК .
Филогенетическое дерево и карты распространения Y-ДНК гаплогруппы J
Гаплогруппа J Y-ДНК и ее субклады из ISOGG 2009
Другой
Ютуб Канал гаплогруппы J2
Распространение гаплогруппы J из National Geographic
Проект ДНК Британских островов
втеФилогенетическое дерево гаплогрупп ДНК Y-хромосомы человека [χ 1] [χ 2]
Эта статья нуждается в обновлении . Пожалуйста, помогите обновить эту статью, чтобы отразить последние события или новую доступную информацию. ( февраль 2021 г. )
" Y-хромосомный Адам "
А00
А0-Т [χ 3]
А0
А1 [х 4]
А1а
A1b
A1b1
БТ
Б
КТ
DE
CF
Д
Е
С
Ф
F1
F2
F3
GHIJK
г
ХАЙК
IJK
ЧАС
ИЖ
К
я
Дж
ЛТ [χ 5]
К2 [х 6]
л
Т
К2а [χ 7]
K2b [χ 8]
К2с
K2d
К2е [χ 9]
К-М2313 [χ 10]
K2b1 [χ 11]
Р [χ 12]
НЕТ
S [χ 13]
М [χ 14]
Р1
Р2
Н
О
Вопрос
р
Y-ДНК по населению
Гаплогруппы Y-ДНК исторических людей
Сноски
^ Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Лармюзо HD (2014). «Видя лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Мутация человека . 35 (2): 187–91. doi : 10.1002/humu.22468 . PMID 24166809 .
^ Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК, 2015 г .. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)
^ Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).
↑ Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.
^ Гаплогруппа LT (L298/P326) также известна как гаплогруппа K1.
↑ В период с 2002 по 2008 год гаплогруппа T-M184 была известна как «гаплогруппа K2». С тех пор это имя было переназначено K-M526 , брату гаплогруппы LT.
↑ Гаплогруппа K2a ( M2308 ) и ее основной субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 г. (Это последовало за публикацией: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL и др. (2016). «Точечные всплески» в мужской демографии человека, выведенной из 1244 последовательностей Y-хромосомы во всем мире» . Nature Genetics . 48 (6): 593–9. doi : 10.1038 /ng.3559 . PMC 4884158. PMID 27111036 . В прошлом другие гаплогруппы, в том числе NO (M214) и K2e, также обозначались именем «K2a».
↑ Гаплогруппа K2b (M1221/P331/PF5911) также известна как гаплогруппа MPS.
↑ Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является родственным субкладом нынешнего K2a).
^ K-M2313*, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является первичной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См.: Позник op. цит. ; YFull YTree v5.08 , 2017, "K-M2335" и; PhyloTree , 2017 г., «Подробности маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)
^ Гаплогруппа K2b1 (P397/P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.
↑ Гаплогруппа P ( P295 ) также известна как K2b2.
↑ Гаплогруппа S по состоянию на 2017 год также известна как K2b1a. (Ранее название гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)
↑ Гаплогруппа M по состоянию на 2017 год также известна как K2b1b. (Ранее название гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)
Категории :
Гаплогруппы Y-ДНК человека
Скрытые категории:
Обратные ссылки шаблона веб-архива
Ошибки отсутствия цели Harv и Sfn
Все статьи с мертвыми внешними ссылками
Статьи с мертвыми внешними ссылками за январь 2018 г.
Статьи с навсегда мертвыми внешними ссылками
CS1 maint: архивная копия как заголовок
Статьи с кратким описанием
Краткое описание соответствует Викиданным
Используйте даты dmy с января 2021 г.
Статьи, требующие дополнительных ссылок с мая 2014 г.
Все статьи, требующие дополнительных ссылок
Статьи в Википедии, требующие уточнения, за июнь 2014 г.
Все статьи с заявлениями без источников
Статьи с утверждениями без источников за июнь 2014 г.
Все статьи с неполным цитированием
Статьи с неполным цитированием за февраль 2020 г.
Статьи будут расширены с января 2013 г.
Все статьи будут расширены
Статьи с использованием небольших окон сообщений
Ссылка на категорию Commons находится в Викиданных.
Статьи Википедии, нуждающиеся в обновлении с февраля 2021 г.