Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Филогения Y-ДНК человека и распределение гаплогрупп. [1]
* (a) Филогенетическое древо . «кйа» означает «тысячу лет назад».
* (b) Географическое распределение каждой гаплогруппы показано цветом.
* (c) Географические обозначения цвета.

В области генетики человека , А человек У-хромосоме ДНК гаплогруппа является гаплогруппа определяется мутациями в не- рекомбинирующих участков ДНК от мужчину-специфической Y - хромосомы ( так называемой Y-ДНК). Многие люди внутри гаплогруппы имеют одинаковое количество коротких тандемных повторов (STR) и типов мутаций, называемых однонуклеотидными полиморфизмами (SNP). [2]

Y-хромосома человека накапливает примерно две мутации на поколение. [3] Гаплогруппы Y-ДНК представляют собой основные ветви филогенетического древа Y-хромосомы, которые имеют сотни или даже тысячи мутаций, уникальных для каждой гаплогруппы.

Самый недавний общий предок Y-хромосомы (Y-MRCA, неофициально известный как Y-хромосомный Адам ) является самым последним общим предком (MRCA), от которого все живущие в настоящее время люди произошли по отцовской линии . По оценкам, Адам с Y-хромосомой жил примерно 236 000 лет назад в Африке. Изучая другие узкие места, большинство евразийских мужчин (людей из популяций за пределами Африки) происходят от человека, жившего 69 000 лет назад. Другие важные узкие места возникли около 50 000 и 5 000 лет назад, и впоследствии происхождение большинства людей евразийского / неафриканского происхождения можно проследить до четырех предков, которые жили 50 000 лет назад. [4] [5] [6] [требуется разъяснение ]

Соглашение об именах [ править ]

Схематическая иллюстрация соглашения об именах гаплогрупп Y-ДНК. Гаплогруппы определяются через мутации (SNP).

Гаплогруппы Y-ДНК определяются наличием ряда маркеров SNP Y-ДНК . Субклады определяются терминальным SNP , самым нижним в филогенетическом дереве Y-хромосомы. [7] [8] Y Хромосома Консорциум (ККЙ) разработала систему именования основных гаплогрупп Y-ДНК с заглавными буквами от А до Т, с дальнейшими субкладами названных с использованием цифр и букв нижнего регистра (YCC от руки номенклатурного ). Сокращенная номенклатура YCC называет гаплогруппы Y-ДНК и их субклады с первой буквой основной гаплогруппы Y-ДНК, за которой следует тире и имя определяющего терминального SNP. [9]

Номенклатура гаплогрупп Y-ДНК со временем меняется, чтобы соответствовать растущему количеству обнаруживаемых и тестируемых SNP и, как следствие, расширению филогенетического дерева Y-хромосомы. Это изменение номенклатуры привело к тому, что в разных источниках используется непоследовательная номенклатура. [2] Это несоответствие и все более громоздкая условная номенклатура побудили перейти к использованию более простой сокращенной номенклатуры. В сентябре 2012 года Family Tree DNA предоставила следующее объяснение своего изменения номенклатуры гаплогрупп Y-ДНК отдельным клиентам на своих страницах результатов Y-ДНК (обратите внимание, что гаплогруппа, упомянутая ниже, относится к конкретному человеку): [10]

Давние клиенты ДНК генеалогического древа видели, как YCC-дерево Homo Sapiens эволюционировало за последние несколько лет по мере открытия новых SNP. Иногда эти новые SNP вызывают существенные изменения в «длинном» объяснении вашей терминальной гаплогруппы. Из-за этой путаницы мы ввели сокращенную версию несколько лет назад, в которой перечислены ветвь дерева и ваш терминальный SNP, то есть J-L147, вместо J1c3d. Таким образом, в ближайшем будущем в Family Tree DNA больше не будет отображаться текущая «рука» на дереве, и мы сосредоточим все наши обсуждения на вашем терминале, определяющем SNP.
Это не меняет науки - это просто обеспечивает более простой и менее запутанный способ общения для всех нас.

- 

Беннетт Гринспен , ДНК генеалогического древа
д-р Майкл Ф. Хаммер, Университет Аризоны

Филогенетическая структура [ править ]

Филогенетическое дерево гаплогрупп Y-ДНК [11]

Основные гаплогруппы Y-ДНК [ править ]

Гаплогруппы A и B [ править ]

Гаплогруппа A - это макрогаплогруппа NRY ( не рекомбинирующая Y ), от которой происходят все современные отцовские гаплогруппы. Он редко встречается в Африке и сосредоточен среди койсанских популяций на юго-западе и нилотских популяций на северо-востоке в долине Нила. BT является субкладом гаплогруппы A, точнее клады A1b (A2-T в Cruciani et al.2011), а именно:

  • Гаплогруппа А
    • Гаплогруппа A00
    • Гаплогруппа A0 (ранее также A1b)
    • Гаплогруппа A1 (также A1a-T)
      • Гаплогруппа A1a (M31)
      • Гаплогруппа A1b (также A2-T; P108, V221)
        • Гаплогруппа A1b1a1 (также A2; M14)
        • Гаплогруппа A1b1b (также A3; M32)
        • Гаплогруппа BT (M91, M42, M94, M139, M299)
          • Гаплогруппа B (M60)
          • Гаплогруппа CT

Гаплогруппа CT (P143) [ править ]

Определяющими мутациями, разделяющими CT (все гаплогруппы, кроме A и B), являются M168 и M294. Место происхождения, вероятно, находится в Африке. Его возраст оценивается примерно в 88 000 лет [12] [13], а в последнее время - примерно в 100 000 [14] или 101 000 лет. [15]

Гаплогруппа C (M130) [ править ]

  • Гаплогруппа C (M130, M216), найденная в Азии , Океании и Северной Америке.
    • Гаплогруппа C1 (F3393 / Z1426)
      • Гаплогруппа C1a (CTS11043)
        • Гаплогруппа C1a1 (M8, M105, M131) с низкой частотой встречается в Японии.
        • Гаплогруппа C1a2 (V20) встречается с низкой частотой в Европе , армянах , Алжире и Непале.
      • Гаплогруппа C1b (F1370, Z16480)
        • Гаплогруппа C1b1 (AM00694 / K281)
          • Гаплогруппа C1b1a (B66 / Z16458)
            • Гаплогруппа C1b1a1 (M356) с низкой частотой обнаруживается в Южной Азии , Юго-Западной Азии и северном Китае.
            • Гаплогруппа C1b1a2 (B65)
              • Гаплогруппа C1b1a2a (B67) найдена среди народа леббо на Борнео, Индонезия.
              • Гаплогруппа C1b1a2b (F725) Встречается у китайцев хань (Гуандун, Хунань и Шэньси), народа дай (Юньнань), народа мурут (Бруней), малайцев (Сингапур) и народа аэта (Филиппины).
            • Гаплогруппа C1b1a3 (Z16582) с низкой частотой обнаруживается в Саудовской Аравии и Ираке.
          • Гаплогруппа C1b1b (B68) найдена среди людей Дусун (Бруней)
        • Гаплогруппа C1b2 (C-Z16582)
        • Гаплогруппа C1b3 (B477 / Z31885)
          • Гаплогруппа C1b3a (M38) найдена в Индонезии , Новой Гвинее , Меланезии , Микронезии и Полинезии.
          • Гаплогруппа C1b3b (M347, P309) Найдено среди коренных народов в Австралии
    • Гаплогруппа C2 (M217, P44) Встречается по всей Евразии и Северной Америке , но особенно среди монголов , казахов , тунгусов , палеосиберий и народов, говорящих на языке на-дене.

Гаплогруппа D (CTS3946) [ править ]

  • Гаплогруппа D (CTS3946)
    • Гаплогруппа D1 (M174) Обнаружена в Японии , Китае (особенно Тибете ), на Андаманских островах.
      • Гаплогруппа D1a (CTS11577)
        • Гаплогруппа D1a1 (Z27276, Z27283, Z29263)
          • Гаплогруппа D1a1a (M15) Найдено в основном в тибетцев , Qiangic народов , Yi и хмонгов-Mien народов
          • Гаплогруппа D1a1b (P99) Встречается в основном у тибетцев , циангов , наси и тюркских народов.
        • Гаплогруппа D1a2 (M55, M57, M64.1, M179, P12, P37.1, P41.1 (M359.1), 12f2.2) В основном встречается в Японии.
        • Гаплогруппа D1a3 (Y34637) Встречается у андаманских народов ( Онге , Джарава )
      • Гаплогруппа D1b (L1366, L1378, M226.2) найдена на острове Мактан , Филиппины.
    • Гаплогруппа D2 (A5580.2) найдена в Нигерии , Саудовской Аравии и Сирии.

Гаплогруппа E (M96) [ править ]

  • Гаплогруппа E (M40, M96), найденная в Африке и некоторых частях Ближнего Востока и Европы.
    • Гаплогруппа E1 (P147)
      • Гаплогруппа E1a (M33, M132) ранее E1
      • Гаплогруппа E1b (P177)
        • Гаплогруппа E1b1 (P2, DYS391p); ранее E3
          • Гаплогруппа E1b1a (V38)
            • Гаплогруппа E1b1a1 (M2) Встречается в Африке, особенно среди населения, говорящего на нигерско-конголезском языке. ; ранее E3a
            • Гаплогруппа E1b1a2 (M329) Обнаружена в Африке, особенно в Эфиопии среди населения, говорящего на омотическом языке. ; ранее E3 *
          • Гаплогруппа E1b1b (M215)
            • Гаплогруппа E1b1b1 (M35). Обнаружена в Африканском Роге , Северной Африке , на Ближнем Востоке и в Европе (особенно в районах около Средиземного моря и Балкан ) ; ранее E3b
    • Гаплогруппа E2 (M75)

Гаплогруппа F (M89) [ править ]

Группы, происходящие от гаплогруппы F, встречаются примерно у 90% населения мира, но почти исключительно за пределами Африки к югу от Сахары.

F xG, H, I, J, K редко встречаются в современных популяциях и достигают пика в Южной Азии , особенно в Шри-Ланке . [11] Он также, кажется, давно присутствует в Юго-Восточной Азии ; Сообщалось о 4–5% в Сулавеси и Лембате . Одно исследование, в котором не проводился всесторонний скрининг других субкладов F-M89 (включая некоторые субклады GHIJK), показало, что индонезийские мужчины с SNP P14 / PF2704 (что эквивалентно M89) составляют 1,8% мужчин в Западном Тиморе , 1,5% Флорес 5,4% Лембата 2,3% Сулавеси и 0,2% Суматра . [16][17] F * (F xF1, F2, F3) был зарегистрирован среди 10% мужчин в Шри-Ланке и Южной Индии , 5% в Пакистане, а также более низкие уровни среди народа таманг (Непал) и в Иране . F1 (P91), F2 (M427) и F3 (M481; ранее F5) очень редки и практически исключительны для регионов / этнических меньшинств в Шри-Ланке, Индии, Непале, Южном Китае , Таиланде , Бирме и Вьетнаме . Однако в таких случаях вероятность ошибочной идентификации считается относительно высокой, и некоторые из них могут принадлежать к неправильно идентифицированным субкладам гаплогруппы GHIJK . [18]

Гаплогруппа G (M201) [ править ]

Гаплогруппа G (M201) возникла около 48000 лет назад, а ее последний общий предок, вероятно, жил 26000 лет назад на Ближнем Востоке. Он распространился на Европу с неолитической революцией .

Встречается во многих этнических группах Евразии; наиболее распространен на Кавказе , в Иране , Анатолии и Леванте . Встречается почти во всех европейских странах, но наиболее распространен в Гагаузии , юго-восточной Румынии , Греции , Италии , Испании , Португалии , Тироле и Богемии с наибольшими концентрациями на некоторых средиземноморских островах; нечасто встречается в Северной Европе . [19] [20]

G-M201 также встречается в небольших количествах в северо-западном Китае и Индии , Бангладеш , Пакистане , Шри-Ланке , Малайзии и Северной Африке .

  • Гаплогруппа G1
  • Гаплогруппа G2
    • Гаплогруппа G2a
      • Гаплогруппа G2a1
      • Гаплогруппа G2a2
      • Гаплогруппа G2a3
        • Гаплогруппа G2a3a
        • Гаплогруппа G2a3b
          • Гаплогруппа G2a3b1
      • Гаплогруппа G2b
      • Гаплогруппа G2c (ранее гаплогруппа G5)
        • Гаплогруппа G2c1

Гаплогруппа H (M69) [ править ]

Гаплогруппа H (M69), вероятно, возникла в Южной и Центральной Азии или Южной Азии примерно 48 000 лет назад, и остается в значительной степени преобладающей там в формах H1 (M69) и H3 (Z5857). Его подклассы также встречаются реже в Иране, Центральной Азии, на Ближнем Востоке и на Аравийском полуострове.

Однако H2 (P96) присутствует в Европе со времен неолита, а H1a1 (M82) распространился на запад в средневековую эпоху с миграцией цыган .

Гаплогруппа I (M170) [ править ]

Гаплогруппа I (M170, M258) встречается в основном в Европе и на Кавказе .

  • Гаплогруппа I1 нордов / северных европидов (M253). Встречается в основном в северной Европе.
  • Гаплогруппа I2 Динариды / динарские европиды (P215) Встречаются в основном на Балканах, в юго-восточной Европе и на Сардинии, за исключением I2B1 (m223), который встречается с умеренной частотой в Западной, Центральной и Северной Европе.

Гаплогруппа J (M304) [ править ]

Гаплогруппа J (M304, S6, S34, S35) встречается в основном на Ближнем Востоке и в Юго-Восточной Европе .

  • Гаплогруппа J * (J-M304 *) редко встречается за пределами острова Сокотра .
    • Гаплогруппа J1 семитидов / бедуинов арабидов (M267) связана с народами Северо-Восточного Кавказа в Дагестане и семитскими языками, говорящими на языках Ближнего Востока, Эфиопии и Северной Африки, а также встречается в Средиземноморской Европе в меньших частотах, как и гаплогруппа T.
    • Гаплогруппа J2 Сирид / Нахрейнидов Арабидов (M172) встречается в основном у семитоязычных народов , Анатолии , Греции , Балкан , Италии , Ирана , Кавказа , Южной Азии и Центральной Азии .

Гаплогруппа K (M9) [ править ]

Гаплогруппа К (M9) распространена по всей Евразии , Океании и среди коренных американцев .

K (xLT, K2a, K2b) - то есть K *, K2c, K2d или K2e - встречается в основном в Меланезии , аборигенах Австралии , Индии , Полинезии и островах Юго-Восточной Азии .

Гаплогруппы L и T (K1) [ править ]

Гаплогруппа L (M20) встречается в Южной Азии, Центральной Азии, Юго-Западной Азии и Средиземноморье.

Гаплогруппа T (M184, M70, М193, M272) находится на высоких уровнях в районе Африканского Рога ( в основном Кушитские -speaking народов), части Южной Азии , на Ближнем Востоке и в Средиземноморье . Т-M184 также найден в существенных меньшинствах Sciaccensi , Stilfser , египтяне , оманцы , сефарды , [21] Ibizans (Eivissencs) и тубы . Он также встречается на низких частотах в других частях Средиземноморья и Южной Азии .

Гаплогруппа K2 (K-M526) [ редактировать ]

Сообщается, что единственные живые самцы, несущие базальную парагруппу K2 *, являются коренными австралийцами . Основные исследования, опубликованные в 2014 и 2015 годах, показывают, что до 27% самцов австралийских аборигенов несут K2 *, в то время как другие несут субклад K2.

Гаплогруппы K2a, K2a1, NO и NO1 [ править ]

Гаплогруппа N [ править ]

Гаплогруппа N (M231) встречается в Северной Евразии, особенно среди носителей уральских языков .

Гаплогруппа N, возможно, возникла в Восточной Азии и распространилась как на север, так и на запад в Сибирь , являясь наиболее распространенной группой, встречающейся у некоторых уральско-говорящих народов .

Гаплогруппа O [ править ]

Гаплогруппа O (M175) наиболее часто встречается в Восточной Азии и Юго-Восточной Азии , с более низкой частотой в южной части Тихого океана , Центральной Азии , Южной Азии и на островах в Индийском океане ( например, Мадагаскар, Коморские Острова).

  • Гаплогруппа O1 (F265 / M1354, CTS2866, F75 / M1297, F429 / M1415, F465 / M1422)
    • Гаплогруппа O1a (M119, CTS31, F589 / Page20, L246, L466) Встречается в восточной, центральной и южной частях материкового Китая , на Тайване и в Юго-Восточной Азии , особенно среди австронезийских и тай-кадайских народов.
    • Гаплогруппа O1b (P31, M268)
      • Гаплогруппа O1b1 (M95) Встречается в Японии , южном Китае, на Тайване, в Юго-Восточной Азии и на Индийском субконтиненте , особенно среди австроазиатских и тай- кадайоязычных народов, малайцев и индонезийцев.
      • Гаплогруппа O1b2 (SRY465, M176) найдена в Японии, Корее , Маньчжурии и Юго-Восточной Азии.
  • Гаплогруппа O2 (M122) Встречается в Восточной Азии, Юго-Восточной Азии и Австронезии, включая Полинезию.

Гаплогруппы K2b1, M & S [ править ]

Примеры базальной парагруппы K2b1 * не идентифицированы. Самцы, несущие субклады K2b1, встречаются в основном среди папуасов , микронезийских народов , коренных австралийцев и полинезийцев .

Его основные субклады - это две основные гаплогруппы:

  • Гаплогруппа S (B254), также известная как K2b1a: обнаружена в высокогорьях Папуа-Новой Гвинеи и;
  • Гаплогруппа M (P256), также известная как K2b1b: обнаружена в Новой Гвинее и Меланезии.

Гаплогруппа P (K2b2) [ править ]

Гаплогруппа P (P295) имеет две основные ветви: P1 (P-M45) и чрезвычайно редкую P2 (P-B253). [22]

P *, P1 * и P2 встречаются вместе только на острове Лусон на Филиппинах . [22] В частности, P * и P1 * значительно чаще встречаются среди представителей народа аэта (или агта) на Лусоне. [23] Хотя в настоящее время P1 * чаще встречается среди живых людей в Восточной Сибири и Центральной Азии , он также обнаруживается в небольших количествах в материковой части Юго-Восточной Азии и Южной Азии . Взятые вместе, эти распределения склонны предполагать, что P * произошел из K2b в Юго-Восточной Азии. [23] [24]

P1 также является родительским узлом двух основных клад:

  • Гаплогруппа Q (Q-M242) и;
  • Гаплогруппа R (R-M207). Они имеют общий маркер M45 в дополнение по крайней мере к 18 другим SNP.

Гаплогруппа Q (MEH2, M242, P36), найденная в Сибири и Америке Гаплогруппа R (M207, M306): найдена в Европе , Западной Азии , Центральной Азии и Южной Азии.

Гаплогруппа Q M242 [ править ]

Q определяется SNP M242. Считается, что он возник в Средней Азии примерно 32 000 лет назад. [25] [26] Субклады гаплогруппы Q с их определяющими мутациями в соответствии с деревом ISOGG 2008 года [27] представлены ниже. ss4 bp, rs41352448, не представлен в дереве ISOGG 2008, потому что это значение для STR. Это низкое значение частоты было обнаружено как новая линия Q (Q5) в индийских популяциях [28].

Дерево ISOGG 2008 года

  • Q (M242)
    • Q *
    • Q1 (P36.2)
      • Q1 *
      • Q1a (MEH2)
        • Q1a *
        • Q1a1 (М120, M265 / N14) Найден с низкой частотой среди бутанцев , [29] Дунгане , Хань китайский , японский , корейцы , монголы , [30] насьте и тибетцы [31] [32]
        • Q1a2 (M25, M143) Встречается с низкой или средней частотой среди некоторых популяций Юго-Западной Азии , Центральной Азии и Сибири.
        • Q1a3 (M346)
          • Q1a3 * Редко встречается в Пакистане , Индии и Тибете.
          • Q1a3a (M3) Типичный для коренных народов Северной и Южной Америки
            • Q1a3a *
            • Q1a3a1 (M19) Найдено среди некоторых коренных народов Южной Америки , таких как Ticuna и вайуу [33]
            • Q1a3a2 (M194)
            • Q1a3a3 (M199, P106, P292)
        • Q1a4 (P48)
        • Q1a5 (P89)
        • Q1a6 (M323) Встречается у значительного меньшинства йеменских евреев.
      • Q1b (M378) Встречается с низкой частотой среди выборок хазарейцев и синдхов.

Гаплогруппа R (M207) [ править ]

Гипотетическое расхождение гаплогруппы R и ее потомков.

Гаплогруппа R определяется SNP M207. Основная часть гаплогруппы R представлена ​​потомком субклада R1 (M173), который, вероятно, возник в евразийских степях . R1 имеет два дочерних субклада: R1a и R1b .

R1a связан с протоиндоиранскими и балто-славянскими народами и в настоящее время встречается в основном в Центральной Азии , Южной Азии и Восточной Европе .

Гаплогруппа R1b является доминирующей гаплогруппой в Западной Европе и также редко встречается среди различных народов Азии и Африки . Его субклад R1b1a2 (M269) представляет собой гаплогруппу, которая наиболее часто встречается среди современных западноевропейских популяций и была связана с итало-кельтскими и германскими народами.

  • Гаплогруппа R1 (M173) Встречается по всей Западной Евразии.
    • Гаплогруппа R1a (M420) найдена в Центральной Азии, Южной Азии, Центральной, Северной и Восточной Европе, на Балканах.
    • Гаплогруппа R1b (M343), найденная в Западной Европе, Западной Азии , Центральной Азии , Северной Африке и северном Камеруне.
  • Гаплогруппа R2 (M124) обнаружена в Южной Азии, на Кавказе, в Центральной Азии и Восточной Европе.

Хронологическое развитие гаплогрупп [ править ]

См. Также [ править ]

  • Гаплогруппы Y-хромосомы в популяциях мира
  • Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Европы
  • Генетическая история Европы
  • Список однонуклеотидных полиморфизмов Y-ДНК
  • Список маркеров Y-STR
  • Гаплогруппы митохондриальной ДНК человека
  • * (гаплогруппа)
  • Молекулярная филогения
  • Генетическая генеалогия
  • Генеалогический ДНК-тест
  • Таблица преобразования для гаплогрупп Y хромосомы

Ссылки [ править ]

  1. ^ Hallast Р, Agdzhoyan А, Балановский О, Сюэ У, Тайлер-Смит С (2020). «Юго-восточноазиатское происхождение современных неафриканских человеческих Y-хромосом» . Hum Genet . DOI : 10.1007 / s00439-020-02204-9 . PMID 32666166 . CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  2. ^ a b «Понимание гаплогрупп: как называются гаплогруппы?» . Семейное древо ДНК. Архивировано из оригинального 21 июня 2012 года . Проверено 31 марта 2013 года .
  3. ^ Долгин, Эли (2009). «Выявлена ​​частота мутаций человека» . Природа . DOI : 10.1038 / новости.2009.864 . Проверено 18 сентября 2017 года . «одна мутация на каждые 30 миллионов пар оснований»
  4. ^ Кармин; и другие. (2015). «Недавнее узкое место в разнообразии Y-хромосомы совпадает с глобальным изменением в культуре» . Геномные исследования . 25 (4): 459–66. DOI : 10.1101 / gr.186684.114 . PMC 4381518 . PMID 25770088 .   "мы датируем самого недавнего общего предка Y-хромосомы (MRCA) в Африке 254 (95% ДИ 192–307) тысяч лет назад и обнаруживаем кластер основных неафриканских гаплогрупп-основателей в узком временном интервале в 47-52 тысячи лет назад, что соответствует с быстрой начальной моделью колонизации Евразии и Океании после узкого места за пределами Африки. В отличие от демографических реконструкций, основанных на мтДНК, мы делаем вывод о втором сильном узком месте в линиях Y-хромосомы, датируемых последними 10 тысячелетиями. Мы предполагаем, что это узкое место вызвано культурными изменениями, влияющими на различия в репродуктивном успехе мужчин ".
  5. ^ Б с д е е г ч я J к л м п о р Q R сек т у V ш х у г аа аЬ ас объявления аи аф ага ах ая а ^ ак ал я в ао ар «YFull YTree» . YПолный . Проверено 15 сентября 2017 года .
  6. ^ {{cite web | title = Что-то странное случилось с мужчинами 7000 лет назад, и мы наконец знаем, почему | url = https://www.sciencealert.com/neolithic-y-chromosome-bottleneck-warring-patrilineal-clans | quote = Около 7000 лет назад - еще в неолите - с генетическим разнообразием человека произошло нечто действительно необычное. В течение следующих 2000 лет, как это было видно в Африке, Европе и Азии, генетическое разнообразие Y-хромосомы рухнуло, как если бы на каждые 17 женщин приходился только один мужчина.
  7. ^ «Понимание результатов: однонуклеотидный полиморфизм Y-ДНК (SNP): что такое гаплогруппа ДНК Y-хромосомы (Y-ДНК)?» . Семейное древо ДНК . Проверено 31 марта 2013 года . Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы (Y-ДНК) являются основными ветвями на генеалогическом дереве отцов человека. Каждая гаплогруппа имеет много ответвлений. Это субклады.
  8. ^ "Руководство пользователя myFTDNA 2.0: Y-ДНК: Что такое страница Y-DNA - Соответствия?" . Семейное древо ДНК . Проверено 31 марта 2013 года . Конечный SNP определяет конечную (конечную) подветвь на дереве Y-ДНК, к которой принадлежит кто-то.
  9. ^ «Понимание результатов: полиморфизм одиночных нуклеотидов (SNP) Y-ДНК: как называются гаплогруппы и их субклады?» . Семейное древо ДНК . Проверено 31 марта 2013 года .
  10. ^ «ДНК генеалогического древа - генетическое тестирование на предмет происхождения, семейной истории и генеалогии» . familytreedna.com .
  11. ^ a b Авторские права 2015 ISOGG. «Ствол дерева гаплогруппы Y-ДНК ISOGG 2015» . isogg.org .
  12. ^ Андерхилл и Кивисилд; Кивисилд, Т (2007). «Использование структуры популяции Y-хромосомы и митохондриальной ДНК в отслеживании миграций человека». Анну. Преподобный Жене . 41 (1): 539–64. DOI : 10.1146 / annurev.genet.41.110306.130407 . PMID 18076332 . 
  13. ^ а б Карафет, ТМ; Мендес, Флорида; Мейлерман, МБ; Андерхилл, Пенсильвания; Зегура, SL; Молоток, MF (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–38. DOI : 10.1101 / gr.7172008 . PMC 2336805 . PMID 18385274 .  
  14. ^ Камин М., Сааг Л., Винсенте М. и др. (Апрель 2015 г.). «Недавнее узкое место в разнообразии Y-хромосомы совпадает с глобальным изменением в культуре» . Геномные исследования . 25 (4): 459–66. DOI : 10.1101 / gr.186684.114 . PMC 4381518 . PMID 25770088 .  
  15. Haber M, Jones AL, Connel BA, Asan, Arciero E, Huanming Y, Thomas MG, Xue Y, Tyler-Smith C (июнь 2019). "Редкая глубоко укоренившаяся африканская гаплогруппа Y-хромосомы D0 и ее последствия для распространения современного человека из Африки" . Генетика . 212 (4): 1421–28. DOI : 10.1534 / genetics.119.302368 . PMC 6707464 . PMID 31196864 .  
  16. ^ a b Кьярони, Жак; Андерхилл, Питер А .; Кавалли-Сфорца, Лука Л. (1 декабря 2009 г.). «Разнообразие Y-хромосомы, человеческое расширение, дрейф и культурная эволюция» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (48): 20174–79. Bibcode : 2009PNAS..10620174C . DOI : 10.1073 / pnas.0910803106 . PMC 2787129 . PMID 19920170 .  
  17. ^ Tumonggor, Meryanne K (2014). «Изоляция, контакты и социальное поведение сформировали генетическое разнообразие в Западном Тиморе» . Журнал генетики человека . 59 (9): 494–503. DOI : 10.1038 / jhg.2014.62 . PMC 4521296 . PMID 25078354 .  
  18. ^ Так было, например, в случае с исходным подкладом F3 (M96), который с тех пор был переименован в гаплогруппу H2 .
  19. ^ Passarino G, GL Cavalleri, Lin А.А., Кавалли-Сфорца Л.Л., Børresen-Дейл Л., Андерхилл П. (2002). «Различные генетические компоненты в норвежской популяции, выявленные с помощью анализа полиморфизмов мтДНК и Y-хромосомы» . Европейский журнал генетики человека . 10 (9): 521–29. DOI : 10.1038 / sj.ejhg.5200834 . PMID 12173029 . 
  20. ^ Карлссон, Андреас О; Валлерстрём, Томас; Гетерстрём, Андерс; Холмлунд, Гунилла (2006). «Разнообразие Y-хромосомы в Швеции - долгосрочная перспектива» . Европейский журнал генетики человека . 14 (8): 963–70. DOI : 10.1038 / sj.ejhg.5201651 . PMID 16724001 . 
  21. ^ Nogueiro, Инес (2009). "Филогеографический анализ отцовских линий в северо-восточных португальских еврейских общинах". Американский журнал физической антропологии . 141 (3): 373–81. DOI : 10.1002 / ajpa.21154 . PMID 19918998 . 
  22. ↑ a b ISOGG, 2016, Y-DNA Haplogroup P and its Subclades - 2016 (20 июня 2016).
  23. ^ a b Тумонггор, Мерианн К; Карафет, Татьяна М; Дауни, Шон; Лансинг, Дж. Стивен; Норквест, Питер; Судойо, Херавати; Хаммер, Майкл Ф; Кокс, Мюррей П. (31 июля 2014 г.). «Изоляция, контакты и социальное поведение сформировали генетическое разнообразие в Западном Тиморе» . Журнал генетики человека . 59 (9): 494–503. DOI : 10.1038 / jhg.2014.62 . PMC 4521296 . PMID 25078354 .  
  24. ^ Татьяна М Карафет; и другие. (2015). «Улучшенное филогенетическое разрешение и быстрая диверсификация гаплогруппы Y-хромосомы K-M526 в Юго-Восточной Азии» . Европейский журнал генетики человека . 23 (3): 369–73. DOI : 10.1038 / ejhg.2014.106 . PMC 4326703 . PMID 24896152 .  
  25. ^ Фагундес, Нельсон-младший; Рикардо Каниц; Роберта Экерт; Ана К.С. Валлс; Маурисио Р. Бого; Франсиско М. Сальцано; Дэвид Гленн Смит; Уилсон А. Сильва; Марко А. Заго; Андреа К. Рибейру-душ-Сантуш; Сидни Э.Б. Сантос; Мария Луиза Петцл-Эрлер; Сандро Л. Бонатто (2008). «Геномика митохондриальной популяции поддерживает единственное докловисное происхождение с прибрежным путем для заселения Америки» (PDF) . Американский журнал генетики человека . 82 (3): 583–92. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2007.11.013 . PMC 2427228 . PMID 18313026 . Архивировано из оригинального (PDF) 25 марта 2009 г.    . Проверено 22 мая 2013 . С момента первых исследований было обнаружено, что сохранившиеся индейские популяции почти исключительно демонстрируют пять «гаплогрупп мтДНК» (A – D и X) 6, отнесенных к автохтонным гаплогруппам A2, B2, C1, D1 и X2a.7 Гаплогруппы A– D встречаются по всему Новому Свету и часто встречаются в Азии, что подтверждает северо-восточное азиатское происхождение этих линий.
  26. ^ Зегура, SL; Карафет, ТМ; Животовский, Л.А.; Молоток, MF (2003). «SNP с высоким разрешением и гаплотипы микросателлитов указывают на недавнее проникновение Y-хромосом коренных американцев в Америку» . Молекулярная биология и эволюция . 21 (1): 164–75. DOI : 10.1093 / molbev / msh009 . PMID 14595095 . 
  27. ^ "Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2010" . Международное общество генетической генеалогии . Проверено 1 июля 2010 года .
  28. ^ Шарма, Сваркар; Рай, Экта; Bhat, Audesh K; Bhanwer, Amarjit S; Bamezaicorresponding, Рамешвар Н.К. (2007). «Новая подгруппа Q5 гаплогруппы Q Y-хромосомы человека в Индии» . BMC Evol Biol . 7 : 232. DOI : 10.1186 / 1471-2148-7-232 . PMC 2258157 . PMID 18021436 .  
  29. ^ Hallast, P .; Batini, C .; Задик, Д .; Maisano Delser, P .; Wetton, JH; Arroyo-Pardo, E .; Cavalleri, GL; De Knijff, P .; Destro Bisol, G .; Дюпюи, Б.М.; Эриксен, HA; Jorde, LB; Король, TE; Larmuseau, MH; Lopez De Munain, A .; Лопес-Парра, AM; Loutradis, A .; Milasin, J .; Novelletto, A .; Pamjav, H .; Sajantila, A .; Schempp, W .; Sears, M .; Толун, А .; Тайлер-Смит, К .; Van Geystelen, A .; Watkins, S .; Винни, Б.; Джоблинг, Массачусетс (2015). «Дерево Y-хромосомы превращается в лист: 13 000 высоконадежных SNP, покрывающих большинство известных кладов» . Молекулярная биология и эволюция . 32 (3): 661–73. DOI : 10.1093 / molbev / msu327 . PMC 4327154 . PMID  25468874 .
  30. ^ Ди Кристофаро, Джули; Пеннарун, Эрван; Мазьер, Стефан; Майрес, Натали М .; Лин, Алиса А .; Темори, Шах Ага; Мецпалу, Майт; Мецпалу, Эне; Витцель, Майкл; Кинг, Рой Дж .; Андерхилл, Питер А .; Виллемс, Ричард; Кьярони, Жак (2013). «Афганский Гиндукуш: там, где сходятся потоки генов Евразийского субконтинента» . PLOS ONE . 8 (10): e76748. Bibcode : 2013PLoSO ... 876748D . DOI : 10.1371 / journal.pone.0076748 . PMC 3799995 . PMID 24204668 .  
  31. ^ Вэнь Б., Ли Х, Лу Д. и др. (Сентябрь 2004 г.). «Генетические данные подтверждают демическое распространение ханьской культуры». Природа . 431 (7006): 302–05. Bibcode : 2004Natur.431..302W . DOI : 10,1038 / природа02878 . PMID 15372031 . 
  32. ^ Уэллс Р.С., Юлдашева Н., Рузибакиев Р. и др. (Август 2001 г.). «Сердце Евразии: континентальный взгляд на разнообразие Y-хромосомы» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (18): 10244–49. Bibcode : 2001PNAS ... 9810244W . DOI : 10.1073 / pnas.171305098 . PMC 56946 . PMID 11526236 .  
  33. ^ Bortolini MC, Salzano FM, Thomas MG и др. (Сентябрь 2003 г.). «Свидетельство Y-хромосомы для различных древних демографических историй в Америке» . Являюсь. J. Hum. Genet . 73 (3): 524–39. DOI : 10.1086 / 377588 . PMC 1180678 . PMID 12900798 .  
  34. ^ Батини, Кьяра; Халласт, Пилле; Задик, Даниил; Дельсер, Пьерпаоло Майзано; Бенаццо, Андреа; Гиротто, Сильвия; Арройо-Пардо, Эдуардо; Cavalleri, Gianpiero L .; Де Книжфф, Питер; Дюпюи, Берит Мюре; Эриксен, Хайди А .; Король, Тури Э .; Де Мунайн, Адольфо Лопес; Лопес-Парра, Ана М .; Лутрадис, Афродита; Миласин, Елена; Новеллетто, Андреа; Памджав, Хорольма; Саджантила, Антти; Толун, Аслыхан; Винни, Брюс; Джоблинг, Марк А. (2015). «Недавнее крупномасштабное расширение европейских родословных, показанное повторным упорядочиванием населения» . Nature Communications . 6 : 7152. Bibcode : 2015NatCo ... 6.7152B . DOI : 10.1038 / ncomms8152 . PMC 4441248 . PMID  25988751 .
  35. ^ Mendez, L .; и другие. (2016). «Дивергенция Y-хромосом неандертальца и современного человека» . Американский журнал генетики человека . 98 (4): 728–34. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2016.02.023 . PMC 4833433 . PMID 27058445 .  
  36. ^ "Отцу всех людей 340 000 лет" .
  37. ^ Камин М., Сааг Л., Винсенте М. и др. (Апрель 2015 г.). «Недавнее узкое место в разнообразии Y-хромосомы совпадает с глобальным изменением в культуре» . Геномные исследования . 25 (4): 459–66. DOI : 10.1101 / gr.186684.114 . PMC 4381518 . PMID 25770088 .  
  38. Haber M, Jones AL, Connel BA, Asan, Arciero E, Huanming Y, Thomas MG, Xue Y, Tyler-Smith C (июнь 2019). "Редкая глубоко укоренившаяся африканская гаплогруппа Y-хромосомы D0 и ее последствия для распространения современного человека из Африки" . Генетика . 212 (4): 1421–28. DOI : 10.1534 / genetics.119.302368 . PMC 6707464 . PMID 31196864 .  
  39. ^ Камин М., Сааг Л., Винсенте М. и др. (Апрель 2015 г.). «Недавнее узкое место в разнообразии Y-хромосомы совпадает с глобальным изменением в культуре» . Геномные исследования . 25 (4): 459–466. DOI : 10.1101 / gr.186684.114 . PMC 4381518 . PMID 25770088 .  
  40. Haber M, Jones AL, Connel BA, Asan, Arciero E, Huanming Y, Thomas MG, Xue Y, Tyler-Smith C (июнь 2019). "Редкая глубоко укоренившаяся африканская гаплогруппа Y-хромосомы D0 и ее последствия для распространения современного человека из Африки" . Генетика . 212 : генетика.302368.2019. DOI : 10.1534 / genetics.119.302368 . PMC 6707464 . PMID 31196864 .  
  41. ^ Семино, Орнелла; Магри, Кьяра; Бенуцци, Джорджия; Лин, Алиса А .; Аль-Захери, Надия; Батталья, Винченца; Макчиони, Лилиана; Triantaphyllidis, Costas; и другие. (2004). "Происхождение, распространение и дифференциация гаплогрупп E и J Y-хромосомы: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в Средиземноморском регионе" . Американский журнал генетики человека . 74 (5): 1023–34. DOI : 10.1086 / 386295 . PMC 1181965 . PMID 15069642 .  
  42. ^ a b c Семино, O; Магри, C; Бенуцци, G; и другие. (Май 2004 г.). «Происхождение, распространение и дифференциация гаплогрупп E и J Y-хромосомы: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в районе Средиземноморья» . Являюсь. J. Hum. Genet . 74 (5): 1023–34. DOI : 10.1086 / 386295 . PMC 1181965 . PMID 15069642 .  
  43. ^ a b c d e f g Тромбетта, Бениамино; д'Атаназио, Евгения; Массаиа, Андреа; Ипполити, Марко; Коппа, Альфредо; Кандилио, Франческа; Коя, Валентина; Руссо, Джанлука; Дюгужон, Жан-Мишель; Мораль, Педро; Акар, Неджат; Селлитто, Даниэле; Валезини, Гвидо; Новеллетто, Андреа; Скоццари, Розария; Кручиани, Фульвио (2015). «Филогеографические уточнения и крупномасштабное генотипирование гаплогруппы y-хромосомы человека e обеспечивают новый взгляд на рассредоточение ранних скотоводов на африканском континенте» . Геномная биология и эволюция . 7 (7): 1940–50. DOI : 10.1093 / GbE / evv118 . PMC 4524485 . PMID  26108492 .
  44. ^ а б Ши, Хун; Ци, Сюэбинь; Чжун, Хуа; Пэн, Йи; Чжан, Сяомин; Ma, Runlin Z .; Су, Бинг (2013). "Генетические свидетельства восточноазиатского происхождения и палеолитической миграции на север Y-хромосомы гаплогруппы N" . PLOS ONE . 8 (6): e66102. Bibcode : 2013PLoSO ... 866102S . DOI : 10.1371 / journal.pone.0066102 . PMC 3688714 . PMID 23840409 .  
  45. ^ Батини, Кьяра; Халласт, Пилле; Задик, Даниил; Дельсер, Пьерпаоло Майзано; Бенаццо, Андреа; Гиротто, Сильвия; Арройо-Пардо, Эдуардо; Cavalleri, Gianpiero L .; Де Книжфф, Питер; Дюпюи, Берит Мюре; Эриксен, Хайди А .; Король, Тури Э .; Де Мунайн, Адольфо Лопес; Лопес-Парра, Ана М .; Лутрадис, Афродита; Миласин, Елена; Новеллетто, Андреа; Памджав, Хорольма; Саджантила, Антти; Толун, Аслыхан; Винни, Брюс; Джоблинг, Марк А. (2015). «Недавнее крупномасштабное расширение европейских родословных, показанное повторным упорядочиванием населения» . Nature Communications . 6 : 7152. Bibcode : 2015NatCo ... 6.7152B . DOI : 10.1038 / ncomms8152 . PMC 4441248 . PMID  25988751 .
  46. ^ a b Рутси, Сиири; и другие. (2004). «Филогеография гаплогруппы I Y-хромосомы выявляет отдельные домены доисторического потока генов в Европе» (PDF) . Американский журнал генетики человека . 75 (1): 128–37. DOI : 10.1086 / 422196 . PMC 1181996 . PMID 15162323 . Архивировано из оригинального (PDF) 19 июня 2009 года . Проверено 4 мая 2016 .   
  47. ^ а б П.А. Андерхилл, Н. М. Майрес, С. Рутси, К. Т. Чоу, А. А. Лин, Р. П. Отиллар, Р. Кинг, Л. А. Животовский, О. Балановский, А. Пшеничнов, К. Х. Ричи, Л. Л. Кавалли-Сфорца, Т. Кивисилд, Р. Виллемс, С. Р. Вудворд, Новые филогенетические отношения для гаплогруппы I Y-хромосомы: переоценка ее филогеографии и предыстории, в П. Мелларс, К. Бойл, О. Бар-Йосеф и К. Стрингер (ред.), Переосмысление эволюции человека (2007), стр. 33–42.
  48. ^ a b Шарма, Сваркар; Рай, Экта; Шарма, Притхвирадж; Йена, Мамата; Сингх, Светлана; Дарвиши, Катаюн; Bhat, Audesh K .; Bhanwer, AJ S .; Тивари, Прамод Кумар; Бамезай, Рамешвар Н. К. (2009). «Индийское происхождение отцовской гаплогруппы R1a1 * подтверждает автохтонное происхождение браминов и кастовой системы» . Журнал генетики человека . 54 (1): 47–55. DOI : 10.1038 / jhg.2008.2 . PMID 19158816 . 
  49. ^ ftДНК
  50. ^ Myres2010
  51. ^ Джонс, Эппи Р .; Гонсалес-Фортес, Глория; Коннелл, Сара; Сиска, Вероника; Эрикссон, Андерс; Мартиниано, Руи; McLaughlin, Russell L .; Гальего Льоренте, Маркос; Кэссиди, Лара М .; Гамба, Кристина; Мешвелиани, Тенгиз; Бар-Йосеф, Офер; Мюллер, Вернер; Белфер-Коэн, Анна; Мацкевич, Зиновий; Джакели, Нино; Хайэм, Томас Ф. Г.; Куррат, Матиас; Лордкипанидзе, Давид; Хофрайтер, Майкл; Маника, Андреа; Пинхаси, Рон; Брэдли, Дэниел Г. (2015). «Верхнепалеолитические геномы раскрывают глубокие корни современных евразийцев» . Nature Communications . 6 : 8912. Bibcode : 2015NatCo ... 6.8912J . DOI : 10.1038 / ncomms9912 . PMC 4660371 . PMID  26567969 .
  52. ^ a b «Мезолит Западно-Евразийская ДНК» . Путешествие предков . Архивировано из оригинала на 2016-04-07 . Проверено 4 мая 2016 .
  53. ^ a b c d e Cruciani (2007), "Отслеживание прошлых движений мужчин и женщин в Северной / Восточной Африке и Западной Евразии: новые ключи к Y-хромосомным гаплогруппам E-M78 и J-M12", Molecular Biology and Evolution , 24 (6 ): 1300-11, DOI : 10,1093 / molbev / msm049 , PMID 17351267 Также см. Дополнительные данные, заархивированные 05.12.2012 на Archive.today.
  54. ^ Эватт, Дэнни (2013-11-01). «Клан Эватт: всемирный исторический обзор фамилии Эватт» .
  55. ^ Sjödin, Пер; Франсуа, Оливье (2011). "Волновые модели распространения гаплогруппы y-хромосомы R1b1b2 в Европе" . PLOS ONE . 6 (6): e21592. Bibcode : 2011PLoSO ... 621592S . DOI : 10.1371 / journal.pone.0021592 . PMC 3123369 . PMID 21720564 .  
  56. ^ a b Андерхилл, Питер А .; Майрес, Натали М .; Рутси, Сиири; Мецпалу, Майт; Животовский, Лев А .; Кинг, Рой Дж .; Лин, Алиса А .; Чоу, Шерил-Эмилиан Т .; Семино, Орнелла; Батталья, Винченца; Кутуев, Ильдус; Ярве, Мари; Чаубей, Гианешвер; Аюб, Касим; Мохьюддин, Аиша; Мехди, С. Касим; Сенгупта, Сангхамитра; Рогаев Евгений И .; Хуснутдинова, Эльза К .; Пшеничнов Андрей; Балановский Олег; Балановская, Елена; Джеран, Нина; Августин, Дубравка Гавас; Балдович, Мариан; Эррера, Рене Дж .; Тангарадж, Кумарасами; Сингх, Виджай; Сингх, Лалджи; и другие. (2010). «Разделение постледникового происхождения европейских и азиатских хромосом у в пределах гаплогруппы R1a» . Европейский журнал генетики человека . 18 (4): 479–84. Дои: 10.1038 / ejhg.2009.194 . PMC  2987245 . PMID  19888303 .
  • ^ 2005 Филогенетическое дерево Y-хромосомы, от FamilyTreeDNA.com
  • ^ Система номенклатуры для дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека,Genome.org

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Мендес, Фернандо; Кран, Томас; Шрак, Бонни; Кран, Астрид-Мария; Вирама, Кришна; Вернер, август; Фомине, Форка Лейпи Мэтью; Брэдман, Нил; Томас, Марк; Карафет, Татьяна М .; Хаммер, Майкл Ф. (7 марта 2013 г.). «Афроамериканская отцовская линия добавляет чрезвычайно древний корень к филогенетическому дереву Y-хромосомы человека» (PDF) . Американский журнал генетики человека . 92 (3): 454–59. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2013.02.002 . PMC  3591855 . PMID  23453668 .
  • "Y-гаплогруппа Филогенетическое дерево" . Март 2013 . Проверено 30 марта 2013 года . (диаграмма, показывающая новые ветви, добавленные к филотереву А в марте 2013 г.)

Внешние ссылки [ править ]

  • Дерево гаплогруппы ISOGG Y-ДНК
  • Семейное древо ДНК Public Haplotree
  • Диаграмма скорости различных STR-мутаций Y-хромосомы
  • Карта Y гаплогрупп
  • Атлас человеческих путешествий , из Генографического проекта , National Geographic
  • Карта Y-гаплогруппы DNA Heritage
  • Видеоурок по выявлению отцовского происхождения с помощью Y-хромосом
  • Предиктор гаплогруппы
  • Семино О., Пассарино Г., Офнер П.Дж. и др. (Ноябрь 2000 г.). «Генетическое наследие палеолита Homo sapiens sapiens у современных европейцев: перспектива Y-хромосомы». Наука . 290 (5494): 1155–59. Bibcode : 2000Sci ... 290.1155S . DOI : 10.1126 / science.290.5494.1155 . PMID  11073453 .В формате PDF Paper, который определяет гаплогруппы "Eu"
  • Проекты гаплогруппы и субклада Y-ДНК
  • Описания, проекты и ссылки гаплогрупп YDNA Керчнера
  • Сравнительная таблица STR-маркеров компании Y-DNA Testing
  • Y-DNA Этнографический и генографический атлас и сборник данных из открытых источников
  • Консорциум Y-хромосомы