Генографический проект


Геногеография , запущенная 13 апреля 2005 года Национальное географического общества , была генетическим антропологическим исследованием (продажи прекращены 31 мая 2019) , который направлен на карту исторических моделей миграции человека путем сбора и анализа ДНК образцов. [1] Текущая фаза проекта - Geno 2.0 Next Generation. [2] После закрытия сайта к проекту присоединились 1 006 542 участника из более чем 140 стран.

Генографический проект

Филогения гаплогрупп митохондриальной ДНК

Начало

Созданный и возглавляемый директором проекта Спенсером Уэллсом в 2005 году, «Генографический проект» является частным некоммерческим сотрудничеством между Национальным географическим обществом и Фондом Уэйтта . Полевые исследователи в одиннадцати региональных центрах по всему миру сначала начали со сбора образцов ДНК у коренного населения. С осени 2015 года проектом руководит Мигель Вилар.

Осенью 2012 года Genographic Project объявил о завершении нового набора генотипов , посвященного генетической антропологии , под названием GenoChip. GenoChip специально разработан для антропологического тестирования и включает в себя SNP из аутосомной ДНК , ДНК X-хромосомы, ДНК Y-хромосомы и митохондриальной ДНК (мтДНК). Дизайн нового чипа стал результатом совместных усилий Wells of National Geographic, Эрана Эльхайка из Johns Hopkins , Family Tree DNA и Illumina . [3]

Осенью 2015 года совместными усилиями Вилара, ведущего ученого-генографа, и Family Tree DNA был разработан новый чип.

Весной 2019 года было объявлено, что проект Geno завершился, но результаты будут до 2020 года. В июле 2020 года сайт был закрыт.

Geno 2.0

Анализ аутосомных примесей, разработанный Уэллсом и Эльхайком, классифицирует людей, оценивая их пропорции геномного происхождения, связанные с девятью наследственными регионами: Восточноазиатский, Средиземноморский, Южноафриканский, Юго-Западный Азиатский, Океанский, Юго-Восточный Азиатский, Североевропейский, Африканский к югу от Сахары и коренной Американец. [4]

В 2016 году в проекте началось использование передового [2] секвенирования ДНК спирали для Geno 2.0 Next Generation, [2] [5] текущего этапа Генографического проекта. По сравнению с предыдущими этапами, на которых использовалось девять региональных филиалов, Geno 2.0 Next Generation анализирует современные коренные народы во всем мире, используя 18 или 22 региональных филиала. [6] Используя набор для сбора ДНК, Helix берет образец слюны у участника, который затем анализируется на предмет геномных идентификаторов, которые предлагают беспрецедентное [2] понимание генетического происхождения человека. [2] Затем данные загружаются в базу данных ДНК генографического проекта. [2]

"> Воспроизвести медиа
Участие общественности в генографическом проекте

С 2005 по 2019 год Genographic привлекал волонтеров (для работы на местах и ​​предоставления образцов ДНК) и проекты в области гражданской науки . В это время Национальное географическое общество продавало некоммерческие наборы для самопроверки представителям широкой общественности, которые хотели участвовать в проекте в качестве «гражданских ученых». Такой охват общественности для участия в исследованиях поощряется такими организациями, как Международное общество генетической генеалогии (ISOGG), которое стремится продвигать выгоды от научных исследований. [7] [8] [9] Это включает поддержку, организацию и распространение личного ДНК (генетического) тестирования.

ISOGG поддерживает участие граждан в генетических исследованиях [10] и считает, что такие добровольцы предоставили ценную информацию и исследования профессиональному научному сообществу. [11]

В своем выступлении перед Генеалогическим обществом Южной Калифорнии в 2013 году Уэллс рассказал о том, как оно поощряет гражданских ученых:

С 2005 года в рамках Генографического проекта использовались новейшие генетические технологии для расширения наших знаний о человеческой истории, а его новаторское использование тестирования ДНК для вовлечения и вовлечения общественности в исследовательские усилия помогло создать новое поколение « гражданских ученых». «Geno 2.0 расширяет возможности гражданской науки, используя силу толпы для открытия новых подробностей истории человеческой популяции. [12]

Вскоре после объявления о проекте в апреле 2005 года Совет коренных народов по биоколониализму (IPCB), базирующийся в Неваде, опубликовал заявление с критикой проекта: представители отметили его связь с противоречивыми вопросами (такими как обеспокоенность некоторых племен тем, что результаты исследования генетической миграции человека могут указывать на то, что коренные американцы не являются коренными жителями Северной Америки), поднятые в рамках проекта по разнообразию генома человека , который проводился под контролем правительства, в отличие от финансируемого из частных источников Генографического проекта. IPCB не рекомендовал участвовать коренным народам. [13] Он также рекомендовал коренным народам бойкотировать IBM, Gateway Computers и National Geographic, которые в то время сотрудничали в рамках Генографического проекта.

В мае 2006 года некоторые представители коренных народов отправились на Постоянный форум Организации Объединенных Наций по вопросам коренных народов (UNPFII), чтобы оспорить участие в генетическом тестировании. Представитель сказал:

<< Генографический проект является эксплуататорским и неэтичным, потому что он будет использовать коренные народы в качестве объектов научного интереса в исследованиях, которые не принесут пользы коренным народам, но подвергнут их значительному риску. Исследователи будут брать образцы крови или других тканей тела для собственного использования в чтобы продвигать свои собственные умозрительные теории истории человечества ». [1]

ЮНПФИ провел расследование целей Генографического проекта и пришел к выводу, что, поскольку проект был «задуман и начат без надлежащих консультаций или без учета рисков для его субъектов, коренных народов, Совет по ответственной генетике заключает, что Представители коренных народов правы, и проект следует немедленно приостановить ». [1]

Примерно в мае 2006 года UNPFII рекомендовал National Geographic и другим спонсорам приостановить проект. [14] [15] Высказывались опасения, что знания, полученные в результате исследования, могут вступить в противоречие с устоявшимися верованиями коренных народов и поставить под угрозу их культуру. Высказывались также опасения, что претензии коренных народов на земельные права и другие ресурсы могут оказаться под угрозой.

По состоянию на декабрь 2006 г., некоторые признанные на федеральном уровне племена в США отказались от участия в исследовании. «Ученые пытаются доказать, что мы такие же, как пилигримы, за исключением того, что пришли сюда несколько тысяч лет назад», - сказал Морис Фокс, председатель Массачусетской комиссии по делам индейцев и член Mashpee Wampanoag . "Почему мы должны давать им это открыто?" [14] Не все народы согласны с его позицией; по состоянию на декабрь 2012 г.к проекту присоединились более 70 000 представителей коренных народов из Северной и Южной Америки, Африки, Азии, Европы и Океании. [6]

  • Генеалогический ДНК-тест
  • Генетическое разнообразие
  • Генетика человека
  • Генетическая изменчивость человека
  • Человеческая миграция
  • Гаплогруппы митохондриальной ДНК человека
  • Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы человека
  • Митохондриальная Ева
  • Y-хромосомный Адам
  • Гаплогруппы Y-хромосомы в популяциях мира
  • Персональная геномика
  • Эволюция человеческих языков

  1. ^ a b c "Архивная копия" . Архивировано из оригинального 16 мая 2008 года . Дата обращения 16 мая 2015 .CS1 maint: заархивированная копия как заголовок ( ссылка )
  2. ^ Б с д е е Гено 2.0 следующего поколения National Geographic . 28 июня, 2018. Проверено 28 июня, 2018.
  3. ^ The GenoChip: новый инструмент для журналов Оксфордской генетической антропологии . 9 мая, 2013. Проверено 28 июня, 2018.
  4. ^ Кто я: Обзор регионов
  5. ^ Helix DNA Sequencing и Geno 2.0 Helix . 26 января 2018 г. Проверено 28 июня 2018 г.
  6. ^ a b Эталонное население нового поколения National Geographic . 23 февраля 2018 г. Проверено 28 июня 2018 г.
  7. ^ Bonney, Р. и LaBranche, M. (2004). «Гражданская наука: вовлечение общественности в исследования», ASTC Dimensions , май / июнь 2004 г., стр. 13.
  8. ^ Baretto, К., Фастовский, Д. и Sheehan, P. (2003). «Модель интеграции общественности в научные исследования», Журнал геолого-геофизического образования , 50 (1). С. 71–75.
  9. Перейти ↑ McCaffrey, RE (2005). «Использование гражданской науки в исследованиях городских птиц», « Городская среда обитания» , 3 (1). С. 70–86.
  10. ^ Король, Тури Э .; Джоблинг, Марк А. (2009). «Что в имени? Y-хромосомы, фамилии и революция в генетической генеалогии». Тенденции в генетике . 25 (8): 351–60. DOI : 10.1016 / j.tig.2009.06.003 . ЛВП : 2381/8106 . PMID  19665817 . Международное общество генетической генеалогии (www.isogg.org) выступает за использование генетики в качестве инструмента для генеалогических исследований и обеспечивает сеть поддержки для специалистов по генетической генеалогии. На нем размещается дерево Y-гаплогруппы ISOGG, которое регулярно обновляется.
  11. ^ Mendex и др., Фернандо (28 февраля 2013 г.). «Афроамериканец по отцовской линии добавляет чрезвычайно древний корень к филогенетическому дереву Y-хромосомы человека» . Американское общество генетики человека. С. 454–459 . Проверено 10 июля 2013 года .
  12. ^ Уэллс, Спенсер (2013). «Генографический проект и рост гражданской науки» . Генеалогическое общество Южной Калифорнии (SCGS). Архивировано из оригинального 10 июля 2013 года . Проверено 10 июля 2013 года .
  13. ^ Гарри, Дебра и Le'a Малия Kanehe. "Генетические исследования: сбор крови для сохранения культуры?" Культурное выживание , 29,4 (зима 2005 г.). По состоянию на 4 февраля 2014 г.
  14. ^ а б Хармон, Эми (10 декабря 2006 г.). «Сборщики ДНК - загвоздка: племена им не доверяют» . Нью-Йорк Таймс .
  15. ^ «ООН рекомендует прекратить генографический проект» . ipcb.

Официальные сайты

  • Официальный сайт Genographic Project в National Geographic
  • Спираль
  • Исследовательские лаборатории Аризоны (ARL)
  • Фонд семьи Вайтт

Новостные статьи

  • «В поисках истоков современного человека» . CNN. 14 апреля 2005 г.
  • « Цель « Генографического проекта »- рассказать нам, откуда мы пришли» . USA Today. 17 апреля 2005 г.
  • "Коренные народы против National Geographic" , Совет коренных народов по биоколониализму, 13 апреля 2005 г.
  • "Tracking the Truth" , журнал DB2 (IBM), информация о роли IBM в проекте. Декабрь 2006 г.
  • Истории генографического успеха
  • «Крестоносцы оставили генетическое наследие» . BBC News . 27 марта 2008 г.
  • "Человеческая линия" почти разделена на две " " . BBC News . 24 апреля 2008 г.

Видео

  • Спенсер Уэллс: «Строим генеалогическое древо всего человечества» на YouTube , на TED , 29 августа 2008 г.