Персональная геномика

Личная геномика или потребительские генетики является филиалом в геномика , связанную с секвенирование , анализом и интерпретацией генома индивидуума. На этапе генотипирования используются различные методы, включая чипы анализа однонуклеотидного полиморфизма (SNP) (обычно 0,02% генома) или частичное или полное секвенирование генома . После того, как генотипы известны, индивидуальные вариации можно сравнить с опубликованной литературой, чтобы определить вероятность проявления признаков, предков и риск заболевания.

Автоматизированные высокопроизводительные секвенаторы увеличили скорость и снизили стоимость секвенирования, что позволяет с 2015 года предлагать потребителям секвенирование всего генома, включая интерпретацию, менее чем за 1000 долларов . Возникающий рынок услуг по секвенированию генома напрямую к потребителю поставил новые вопросы как о медицинской эффективности, так и об этических дилеммах, связанных с широким распространением знаний об индивидуальной генетической информации.

Персонализированная медицина - это медицинский метод, нацеленный на структуры лечения и медицинские решения, основанные на прогнозируемой реакции пациента или риске заболевания. [1] Национальный институт рака или NCI, рука из Национальных институтов здравоохранения , списки пациента гены, белки, и окружающей среды , как первичные факторы проанализированы с целью профилактики, диагностики и лечения заболеваний с помощью персонализированной медицины. [1]

В концепции персонализированной медицины есть различные подкатегории, такие как предиктивная медицина , точная медицина и стратифицированная медицина. Хотя эти термины используются как синонимы для описания этой практики, каждый из них имеет индивидуальные нюансы. Прогнозная медицина описывает область медицины, которая использует информацию, часто полученную с помощью методов личной геномики, как для прогнозирования возможности заболевания, так и для принятия профилактических мер для конкретного человека. [2] Точная медицина - это термин, очень похожий на персонализированную медицину, поскольку он фокусируется на генах пациента, окружающей среде и образе жизни; однако он используется Национальным исследовательским советом, чтобы избежать путаницы или неверных толкований, связанных с более широким термином. Стратифицированная медицина - это версия персонализированной медицины, которая фокусируется на разделении пациентов на подгруппы на основе конкретных ответов на лечение и определении эффективных методов лечения для конкретной группы. [3]

Примеры использования персонализированной медицины включают онкогеномику и фармакогеномику . Онкогеномика - это область исследований, сфокусированная на характеристике генов, связанных с раком. В случае рака конкретная информация об опухоли используется для создания индивидуального плана диагностики и лечения. [4] Фармакогеномика - это изучение того, как геном человека влияет на его реакцию на лекарства. [5] Эта область относительно новая, но быстро развивается, отчасти из-за увеличения финансирования исследовательской сети фармакогеномики NIH. С 2001 г. количество исследовательских работ в PubMed, связанных с поисковыми запросами « фармакогеномика» и « фармакогенетика», увеличилось почти на 550% . [6] Это поле позволяет исследователям лучше понять, как генетические различия повлияют на реакцию организма на лекарство, и сообщить, какое лекарство наиболее подходит для пациента. Эти планы лечения смогут предотвратить или, по крайней мере, свести к минимуму побочные реакции на лекарства, которые являются «значительной причиной госпитализаций и смертей в Соединенных Штатах». В целом исследователи считают, что фармакогеномика позволит врачам лучше адаптировать медицину к потребностям конкретного пациента. [5] По состоянию на ноябрь 2016 г. FDA одобрило 204 препарата с информацией о фармакогенетике в маркировке. Эти ярлыки могут описывать, среди прочего, инструкции по дозировке, специфичные для генотипа, и риск нежелательных явлений. [7]

Риск заболевания может быть рассчитан на основе генетических маркеров и полногеномных ассоциативных исследований общих медицинских состояний, которые являются многофакторными и включают в оценку компоненты окружающей среды. Заболевания, которые являются редкими по отдельности (менее 200 000 человек в США), тем не менее, коллективно распространены (затрагивают примерно 8-10% населения США [8] ). Более 2500 из этих болезней (в том числе несколько более распространенных) имеют прогностическую генетику с достаточно высоким клиническим воздействием, поэтому их рекомендуют в качестве медицинских генетических тестов, доступных для отдельных генов (и при полном секвенировании генома), и ежегодно появляются около 200 новых генетических заболеваний. . [9]

Trend in sequencing costs
Типичная стоимость секвенирования генома размером с человека в логарифмической шкале. Обратите внимание на резкую тенденцию быстрее, чем закон Мура, начиная с января 2008 года, когда секвенирование после Сэнгера стало доступным в центрах секвенирования. [10]

Стоимость секвенирования генома человека быстро снижается из-за постоянного развития новых, более быстрых и дешевых технологий секвенирования ДНК, таких как « секвенирование ДНК следующего поколения ».

Национальный институт исследования генома человека, входящий в состав Национальных институтов здравоохранения США , сообщил, что стоимость секвенирования всего генома размером с человека снизилась с примерно 14 миллионов долларов в 2006 году до менее 1500 долларов к концу 2015 года [11].

В диплоидном геноме человека 6 миллиардов пар оснований . Статистический анализ показывает, что для получения покрытия обоих аллелей в 90% генома человека из 25 пар оснований с помощью дробового секвенирования требуется охват примерно в десять раз. [12] Это означает, что в общей сложности необходимо секвенировать 60 миллиардов пар оснований. Applied Biosystems SOLiD , Illumina или Helicos [13] секвенирование машина может последовательно от 2 до 10 миллиардов пар оснований в каждой $ 8000 до $ 18000 перспективе. Стоимость также должна учитывать расходы на персонал, затраты на обработку данных, юридические, коммуникационные и другие расходы. Один из способов оценить это - использовать коммерческие предложения. Первое такое полное диплоидное секвенирование генома (6 миллиардов пар оснований, по 3 миллиарда от каждого родителя) было проведено Knome, и их цена упала с 350 000 долларов в 2008 году до 99 000 долларов в 2009 году. [14] [15] Это позволяет исследовать в 3000 раз больше оснований генома. чем генотипирование на основе чипов SNP , идентифицирующее как новые, так и известные варианты последовательностей, некоторые из которых имеют отношение к личному здоровью или происхождению . [16] В июне 2009 года Illumina объявила о запуске своей собственной услуги по полному секвенированию генома с 30-кратной глубиной за 48 000 долларов за геном. [17] В 2010 году они снизили цену до 19 500 долларов. [18]

В 2009 году компания Complete Genomics of Mountain View объявила, что с июня 2009 года она предоставит полное секвенирование генома за 5000 долларов [19]. Это будет доступно только учреждениям, но не отдельным лицам. [20] Ожидается, что в ближайшие несколько лет цены будут снижаться и дальше за счет экономии на масштабе и усиления конкуренции. [21] [22] По состоянию на 2014 год Gentle предлагала почти полное секвенирование экзома менее чем за 2000 долларов, включая личные консультации и результаты. [23] По состоянию на конец 2018 года было почти полностью секвенировано более миллиона геномов человека всего за 200 долларов на человека [24] и даже при определенных обстоятельствах сверхзащищенные личные геномы по 0 долларов каждый. [25] В этих двух случаях фактическая стоимость снижается, поскольку данные могут быть монетизированы для исследователей.

Снижение стоимости в целом геномного картирования позволило генеалогические сайты , чтобы предложить его в качестве сервиса, [26] в той степени , что один может представить свою геном для толпы источников научных усилий , таких как OpenSNP [27] или DNA.land в Нью - Йорке Центр генома , как образцы гражданской науки . [28] Семья Корпас, возглавляемая ученым Мануэлем Корпасом , разработала проект Corpasome, [29] и воодушевленная низкими ценами на секвенирование генома, стала первым примером краудсорсингового анализа личных геномов, проводимого гражданскими науками . [30]

Открытие клиник геномной медицины в крупных больницах США подняло вопросы о том, расширяют ли эти услуги существующее неравенство в системе здравоохранения США, в том числе со стороны таких практиков, как Роберт С. Грин , директор клиники профилактической геномики в Бригаме и женской больнице . [31] [32]

Генетическая дискриминация - это различение на основе информации, полученной из генома человека. Законы о генетической недискриминации были приняты в некоторых штатах США [33], а на федеральном уровне - Законом о недискриминации генетической информации (GINA). Законодательство GINA предотвращает дискриминацию со стороны медицинских страховых компаний и работодателей, но не распространяется на страхование жизни или страхование на случай длительного ухода. Принятие Закона о доступном медицинском обслуживании в 2010 году усилило защиту GINA, запретив медицинским страховым компаниям отказывать в страховом покрытии из-за «ранее существовавших условий» пациента и лишив страховщиков возможности корректировать страховые взносы на основе определенных факторов, таких как генетические заболевания. [34] Учитывая этические опасения по поводу предсимптоматического генетического тестирования несовершеннолетних, [35] [36] [37] [38] вполне вероятно, что персональная геномика сначала будет применена к взрослым, которые могут дать согласие на такое тестирование, хотя секвенирование генома уже оказывается полезным для детей, если присутствуют какие-либо симптомы. [39]

Есть также опасения относительно исследований генома человека в развивающихся странах. Инструменты для проведения полногеномного анализа обычно используются в странах с высоким уровнем доходов, что требует партнерства между развитыми и развивающимися странами для изучения пациентов, страдающих определенными заболеваниями. Соответствующие инструменты для совместного доступа к собранным данным не одинаково доступны в странах с низкими доходами, и без установленного стандарта для этого типа исследований опасения по поводу справедливости по отношению к местным исследователям остаются нерешенными. [40]

Генетическая конфиденциальность

В Соединенных Штатах биомедицинские исследования с участием людей в качестве субъектов регулируются базовым этическим стандартом, известным как Общее правило , которое направлено на защиту конфиденциальности субъекта, требуя удаления «идентификаторов», таких как имя или адрес, из собранных данных. [41] Однако в отчете Президентской комиссии по изучению биоэтических проблем за 2012 год говорится, что «то, что составляет« идентифицируемые »и« деидентифицируемые »данные, является непостоянным и что развивающиеся технологии и растущая доступность данных могут позволить де- идентифицированные данные для повторной идентификации ". [41] Фактически, исследование уже показало, что «возможно установить личность участника исследования путем перекрестной ссылки на данные исследования о нем и его последовательности ДНК… [с] генетической генеалогией и базами данных общедоступных источников». [42] Это привело к призыву к политикам разработать последовательные руководящие принципы и передовые методы обеспечения доступности и использования индивидуальных геномных данных, собранных исследователями. [43]

Также существуют разногласия относительно опасений компаний, тестирующих индивидуальную ДНК. Существуют такие проблемы, как «утечка» информации, право на неприкосновенность частной жизни и ответственность компании, чтобы этого не произошло. Правила регулирования четко не изложены. Что еще не определено, так это то, кто на законных основаниях владеет информацией о геноме: компания или лицо, чей геном был прочитан. Были опубликованы примеры использования персональной информации о геноме. [44] Дополнительные проблемы конфиденциальности, связанные, например, с генетической дискриминацией , потерей анонимности и психологическим воздействием, все чаще указываются академическим сообществом [44], а также правительственными учреждениями. [41]

Дополнительные проблемы возникают из-за компромисса между общественной пользой от обмена исследованиями и возможностью утечки данных и повторной идентификации. Проект « Персональный геном» (начатый в 2005 г.) - один из немногих, которые сделали общедоступными как последовательности генома, так и соответствующие медицинские фенотипы. [45] [46]

Персонализированная утилита для генома

Полное секвенирование генома открывает большие перспективы в мире здравоохранения с точки зрения возможности точного и персонализированного лечения. Такое использование генетической информации для выбора подходящих лекарств известно как фармакогеномика. Эта технология может позволить лечить индивидуума и его определенные генетические предрасположенности (например, индивидуальную химиотерапию). Одним из наиболее эффективных и действенных способов использования персональной информации о геноме является предотвращение сотен серьезных генетических нарушений, связанных с одним геном, которые угрожают около 5% новорожденных (с затратами до 20 миллионов долларов) [47], например, устранение болезни Тея Сакса. через Дор Йешорим . Другой набор из 59 генов, проверенный Американским колледжем медицинской генетики и геномики (ACMG-59), считается действенным у взрослых. [48]

В то же время полное секвенирование генома может выявить настолько редкие полиморфизмы и / или незначительные изменения последовательности, что выводы об их влиянии являются сложными, что усиливает необходимость сосредоточиться на надежных и действенных аллелях в контексте клинической помощи. Чешский медицинский генетик Ева Махачкова пишет: «В некоторых случаях трудно определить, является ли обнаруженный вариант последовательности причинной мутацией или нейтральной (полиморфной) вариацией, не влияющей на фенотип. Интерпретация редких вариантов последовательности неизвестного значения, обнаруженных при заболевании -вызывающие гены становятся все более важной проблемой ». [49] Фактически, исследователи из проекта Консорциума агрегации экзомов (ExAC) подсчитали, что в среднем человек несет 54 генетические мутации, которые ранее считались патогенными, то есть имеющие 100% пенетрантность, но без каких-либо явных негативных проявлений для здоровья. [50]

Как и в случае с другими новыми технологиями, врачи могут заказать геномные тесты, для которых некоторые не имеют должной подготовки для интерпретации результатов. Многие не знают, как SNP реагируют друг на друга. Это приводит к тому, что клиент получает потенциально вводящие в заблуждение и вызывающие беспокойство результаты, которые могут вызвать нагрузку на уже перегруженную систему здравоохранения. Теоретически это может заставить человека принимать необразованные решения, такие как выбор нездорового образа жизни и изменения в планировании семьи. Отрицательные результаты, которые потенциально могут быть неточными, теоретически снижают качество жизни и психическое здоровье человека (например, усиление депрессии и обширного беспокойства).

Прямая к потребителю генетика

"> Воспроизвести медиа
Использование микрочипов для генотипирования. В видео показан процесс извлечения генотипов из образца слюны человека с помощью микроматриц, как это делается в большинстве крупных генетических компаний, напрямую занимающихся потребителями.

Есть также три потенциальных проблемы, связанные с достоверностью персональных наборов генома. Первый вопрос - это валидность теста. Обработка ошибок образца увеличивает вероятность ошибок, которые могут повлиять на результаты теста и интерпретацию. Второй влияет на клиническую валидность, что может повлиять на способность теста выявлять или прогнозировать связанные нарушения. Третья проблема - это клиническая применимость персональных наборов генома и связанные с ними риски, а также преимущества их внедрения в клиническую практику. [51]

Людей нужно научить интерпретировать свои результаты и что они должны рационально извлекать из этого опыта. Обеспокоенность по поводу того, что клиенты неправильно интерпретируют информацию о состоянии здоровья, стала одной из причин закрытия в 2013 г. FDA службы анализа состояния здоровья 23 & Me. [52] Не только средний человек должен быть обучен измерениям своей собственной геномной последовательности, но и профессионалы, в том числе врачи и научные журналисты, должны получить знания, необходимые для информирования и просвещения своих пациентов и общественности. . [53] [54] [55] Примеры таких усилий включают Проект личного генетического образования (pgEd), сотрудничество Смитсоновского института с NHGRI , а также проекты MedSeq, BabySeq и MilSeq Genomes to People, инициативу Гарвардской медицинской школы и Бригама. и Женская больница .

Основное использование личной геномики за пределами области здоровья - это анализ предков (см. Генетическая генеалогия ), включая информацию об эволюционном происхождении, такую ​​как содержание неандертальцев. [56]

Научно-фантастический фильм 1997 года GATTACA представляет общество ближайшего будущего, в котором личная геномика доступна каждому, и исследует ее влияние на общество. «Идеальная ДНК» [57] - это роман, в котором доктор Мануэль Корпас использует собственный опыт и знания как ученого-геномиста, чтобы начать исследование некоторых из этих чрезвычайно сложных вопросов.

В 2018 году полиция арестовала Джозефа Джеймса Динджело главным подозреваемым в Голден Стэйт Киллер или East Area Rapist [58] и Уильям Earl Талботта II , как главный подозреваемый в убийстве Джей Кук и Таня Ван Cuylenborg в 1987 году [59] Эти аресты были основаны на личной геномике, загруженной в базу данных с открытым исходным кодом GEDmatch , что позволило следователям сравнить ДНК, извлеченную с места преступления, с ДНК, загруженной в базу данных родственниками подозреваемого. [60] [58] В декабре 2018 года FamilyTreeDNA изменила условия обслуживания, чтобы правоохранительные органы могли использовать свои услуги для выявления подозреваемых в «насильственных преступлениях» или для опознания останков жертв. Компания подтвердила, что работает с ФБР по крайней мере по нескольким делам, а это означает, что GEDmatch больше не единственная, кто это делает. [61] С тех пор почти 50 подозреваемых в нападении, изнасиловании или убийстве были арестованы с использованием того же метода. [62]

Персональная геномика также позволила исследователям идентифицировать ранее неизвестные тела с помощью GEDmatch ( Девушка из оленьей кожи , [63] Лайл Стевик [64] и Джозеф Ньютон Чендлер III ). [65]

  • Сравнение услуг по секвенированию ДНК
  • Геном человека  - Полный набор последовательностей нуклеиновых кислот для человека
  • Human Genome Project  - Исследовательская программа по секвенированию генома человека
  • Однонуклеотидный полиморфизм  - одиночное нуклеотидное положение в геномной ДНК, в котором существуют различные альтернативные последовательности.
  • Популяционная геномика
  • Секвенирование всего генома  - определение почти всей последовательности ДНК генома организма за один раз.
  • Биоинформатика  - вычислительный анализ больших и сложных наборов биологических данных.
  • Геномика  - дисциплина в генетике
  • Персонализированная медицина
  • Системная биология  - Вычислительное и математическое моделирование сложных биологических систем.
  • Технологии транскриптомики
  • Омикс
  • Группы населения в биомедицине
  • Геномное консультирование
  • Личная медицина
  • Шифрование ДНК
  • Выборочное генетическое и геномное тестирование

  1. ^ a b «Словарь терминов по раку NCI» . Национальный институт рака . 2 февраля 2011 . Проверено 5 декабря +2016 .
  2. ^ «Прогнозная медицина - Последние исследования и новости | Природа» . www.nature.com . Проверено 5 декабря +2016 .
  3. ^ MRC, Медицинский исследовательский совет (3 марта 2016 г.). «Стратифицированная медицина» . www.mrc.ac.uk . Проверено 5 декабря +2016 .
  4. ^ Штраусберг, Роберт Л .; Симпсон, Эндрю JG; Старый, Ллойд Дж .; Риггинс, Грегори Дж. (27 мая 2004 г.). «Онкогеномика и разработка новых методов лечения рака». Природа . 429 (6990): 469–474. Bibcode : 2004Natur.429..469S . DOI : 10,1038 / природа02627 . PMID  15164073 . S2CID  37628107 .
  5. ^ а б Справка, Genetics Home. «Что такое фармакогеномика?» . Домашний справочник по генетике . Проверено 5 декабря +2016 .
  6. ^ Джонсон, Джули А. (5 декабря 2016 г.). «Фармакогенетика в клинической практике: как далеко мы продвинулись и куда идем?» . Фармакогеномика . 14 (7): 835–843. DOI : 10,2217 / pgs.13.52 . PMC  3697735 . PMID  23651030 .
  7. ^ Исследования, Центр оценки лекарственных средств и. «Геномика - таблица фармакогеномных биомаркеров в маркировке лекарств» . www.fda.gov . Проверено 5 декабря +2016 .
  8. ^ "Управление редких заболеваний NIH" .
  9. ^ «Генетические тесты» .
  10. ^ Веттерстранд, Крис (21 мая 2012 г.). «Стоимость секвенирования ДНК: данные крупномасштабной программы секвенирования генома NHGRI» . Программа крупномасштабного секвенирования генома . Национальный институт исследования генома человека . Проверено 24 мая 2012 года .
  11. ^ «Стоимость секвенирования генома человека» . Национальный институт исследования генома человека (NHGRI) . Проверено 5 декабря +2016 .
  12. ^ Уилер, Дэвид А; Шринивасан, Майтрейан; Эгхольм, Майкл; Шен, Юйфэн; Чен, Лэй; Макгуайр, Эми; Он, Вен; Чен И-Цзюй; Махиджани, Винод; Рот, Г. Томас; Гомеш, Ксавьер; Тартаро, Кэрри; Ниази, Фахим; Turcotte, Cynthia L; Ирзик, Жерар П.; Лупски, Джеймс Р.; Чиналт, Крейг; Сун, Син-чжи; Лю, Юэ; Юань, Е; Назарет, Линн; Цинь, Сян; Музны, Донна М; Маргулис, Марсель; Вайншток, Джордж М; Гиббс, Ричард А; Ротберг, Джонатан М (2008). "JDW-genome-supp-mat-march-proof.doc" (PDF) . Природа . 452 (7189): 872–876. Bibcode : 2008Natur.452..872W . DOI : 10,1038 / природа06884 . PMID  18421352 . S2CID  4429736 . Проверено 19 октября 2011 года .
  13. ^ «Настоящее секвенирование одной молекулы (tSMS): Helicos BioSciences» . Helicosbio.com. Архивировано из оригинала 4 октября 2011 года . Проверено 19 октября 2011 года .
  14. ^ «Knome снижает цену полного генома с 350 000 до 99 000 долларов» . Генетический генеалог. 11 апреля 2009 г.
  15. ^ Каров, Юлия (19 мая 2009 г.). «Knome добавляет секвенирование экзома, начинает предлагать услуги исследователям» . GenomeWeb . Проверено 24 февраля 2010 года .
  16. ^ Хармон, Кэтрин (28 июня 2010 г.). «Секвенирование генома для всех нас» . Scientific American . Проверено 13 августа 2010 года .
  17. ^ «Индивидуальное секвенирование генома - Illumina, Inc.» . Everygenome.com. Архивировано из оригинального 19 октября 2011 года . Проверено 19 октября 2011 года .
  18. ^ "Illumina снижает стоимость секвенирования личного генома на 60% | GPlus.com" . Glgroup.com. 4 июня 2010 . Проверено 19 октября 2011 года .
  19. ^ Каров, Джулия. «Complete Genomics предложит 5000 долларов США в качестве услуги бизнеса во втором квартале 2009 года | Последовательность | Секвенирование» . GenomeWeb . Проверено 19 октября 2011 года .
  20. ^ Лауэрман, Джон (5 февраля 2009 г.). «Полная геномика снижает стоимость геномной последовательности до 5000 долларов» . Блумберг . Проверено 19 октября 2011 года .
  21. ^ «MSN | Outlook, Office, Skype, Bing, последние новости и последние видео» . Архивировано из оригинального 25 августа 2009 года . Проверено 11 июня 2009 года .
  22. ^ «Illumina запускает услугу персонального секвенирования генома за 48 000 долларов: Genetic Future» . Scienceblogs.com. Архивировано из оригинала на 6 июня 2011 года . Проверено 19 октября 2011 года .
  23. ^ { http://www.healthcarejournallr.com/the-journal/contents-index/features/563-what-a-tangled-web-we-weave.html} [ постоянная мертвая ссылка ]
  24. ^ Меган Молтени (19 ноября 2018 г.). «Теперь вы можете секвенировать весь свой геном всего за 200 долларов» . Проводной .
  25. ^ Шэрон Бегли (15 ноября 2018 г.). «Предлагая бесплатное секвенирование ДНК, Nebula Genomics открывается для бизнеса. Но есть небольшая загвоздка» . Стат .
  26. ^ Каплан, Сара (17 апреля 2016 г.). «Как ваши 20 000 генов определяют так много совершенно разных черт? Они многозадачны» . Вашингтон Пост . Проверено 27 августа 2016 года .
  27. ^ Грешак, Бастиан (2014). «openSNP - краудсорсинговый веб-ресурс для личной геномики» . PLOS ONE . 9 (3): e89204. Bibcode : 2014PLoSO ... 989204G . DOI : 10.1371 / journal.pone.0089204 . PMC  3960092 . PMID  24647222 .
  28. ^ Циммер, Карл (25 июля 2016 г.). «Игра геномов, серия 13: ответы и вопросы» . СТАТ . Проверено 27 августа 2016 года .
  29. ^ Корпас, Мануэль (2013). «Краудсорсинг Корпасомы» . Исходный код для биологии и медицины . 8 (1): 13. DOI : 10,1186 / 1751-0473-8-13 . PMC  3706263 . PMID  23799911 .
  30. ^ Corpas M, Valdivia-Granda W, Torres N, Greshake B, Coletta A, Knaus A, Harrison AP, Cariaso M, Moran F, Nielsen F, Swan D, Weiss Solis DY, Krawitz P, Schacherer F, Schols P, Yang H , Борри П., Глусман Г., Робинсон П.Н. (ноябрь 2015 г.). «Краудсорсинговый геномный анализ семейного квартета прямо к потребителю» . BMC Genomics . 16 (910): 910. DOI : 10,1186 / s12864-015-1973-7 . PMC  4636840 . PMID  26547235 .
  31. ^ https://genomes2people.medium.com/is-preventive-genomics-elitist-af70d51f83f3
  32. ^ https://www.statnews.com/2019/08/16/top-us-medical-centers-roll-out-dna-sequencing-clinics-for-healthy-and-often-wealthy-clients/
  33. ^ "Законы государства о борьбе с дискриминацией в области генетики и медицинского страхования" .
  34. ^ «Генетическая дискриминация» . Национальный институт исследования генома человека (NHGRI) . Проверено 5 декабря +2016 .
  35. ^ McCabe LL; McCabe ER (июнь 2001 г.). «Постгеномная медицина. Пресимптоматическое тестирование для прогноза и профилактики». Clin Perinatol . 28 (2): 425–34. DOI : 10.1016 / S0095-5108 (05) 70094-4 . PMID  11499063 .
  36. ^ Нельсон Р.М.; Botkjin JR; Кодиш Э.Д .; и другие. (Июнь 2001 г.). «Этические вопросы генетического тестирования в педиатрии» . Педиатрия . 107 (6): 1451–55. DOI : 10.1542 / peds.107.6.1451 . PMID  11389275 .
  37. ^ Borry P; Fryns JP; Schotsmans P; Dierickx K (февраль 2006 г.). «Тестирование несущей способности несовершеннолетних: систематический обзор руководящих принципов и документов с изложением позиции» . Евро. J. Hum. Genet . 14 (2): 133–8. DOI : 10.1038 / sj.ejhg.5201509 . PMID  16267502 .
  38. ^ Borry P; Stultiens L; Nys H; Cassiman JJ; и другие. (Ноябрь 2006 г.). «Пресимптоматическое и прогностическое генетическое тестирование несовершеннолетних: систематический обзор руководящих принципов и документов с изложением позиции» . Clin. Genet . 70 (5): 374–81. DOI : 10.1111 / j.1399-0004.2006.00692.x . PMID  17026616 . S2CID  7066285 .
  39. ^ Марк Джонсон и Кэтлин Галлахер (27 февраля 2011 г.). «Один на миллиард. Случай Ника Волкера может быть передовым фронтом волны, распространяющейся по генетической медицине» . Милуоки Журнал Страж.
  40. ^ де Фриз, Янтина; Бык, Сьюзен Дж; Думбо, Огобара; Ибрагим, Мунтасер; Мерсеро-Пуйялон, Одиллия; Квятковски, Доминик; Паркер, Майкл (18 марта 2011 г.). «Этические вопросы исследований в области геномики человека в развивающихся странах» . BMC Medical Ethics . 12 : 5. DOI : 10,1186 / 1472-6939-12-5 . PMC  3076260 . PMID  21418562 .
  41. ^ а б в «Конфиденциальность и прогресс в секвенировании всего генома» . Президентская комиссия по изучению вопросов биоэтики. Архивировано из оригинального 22 ноября 2016 года . Проверено 30 ноября +2016 .
  42. ^ Отметьте Хайден, Эрика (2013). «В генетических базах данных обнаружена лазейка в конфиденциальности» . Природа . DOI : 10.1038 / nature.2013.12237 . S2CID  211729032 .
  43. ^ Гутманн, Эми; Вагнер, Джеймс У. (1 мая 2013 г.). «Нашла свою ДНК в Интернете: примирение конфиденциальности и прогресса». Отчет Центра Гастингса . 43 (3): 15–18. DOI : 10.1002 / hast.162 . PMID  23650063 .
  44. ^ а б Де Кристофаро, Эмилиано (17 октября 2012 г.). «Секвенирование всего генома: мечта об инновациях или кошмар конфиденциальности?». arXiv : 1210.4820 [ cs.CR ].
  45. ^ Мао Кью, Сиотлос С., Чжан Р.Ю., Болл депутат, Чин Р., Карневали П., Баруа Н., Нгуен С., Агарвал М.Р., Клегг Т., Коннелли А., Вандевеге В., Заранек А.В., Эстеп П.В., Церковный генеральный директор, Дрманак Р., Петерс Б.А. (2016). «Последовательности всего генома и экспериментально фазированные гаплотипы более 100 личных геномов» . Gigascience . 5 (1): 42. DOI : 10,1186 / s13742-016-0148-г . PMC  5057367 . PMID  27724973 .CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  46. ^ Цай Б., Ли Б., Кига Н., Тусберг Дж., Бергквист Т., Чен Й., Никнафс Н., Картер Х., Токхайм К., Белева-Гатри В., Доувиль С., Бхаттачарья Р., Йео ХТГ, Фан Дж., Сенгупта С., Ким Д., Клайн М., Тернер Т., Дикханс М., Зауча Дж., Пал Л., Цао Ц, Ю Ц, Инь И, Карраро М., Джолло М., Феррари С., Леонарди Е., Тосатто СЦЭ, Бобе Дж., Болл М, Хоскинс Р., Репо С. , Черч Г., Бреннер С., Моулт Дж., Гоф Дж., Станке М., Карчин Р., Муни С.Д. (2016). «Сопоставление фенотипов с целыми геномами: уроки, извлеченные из трех итераций проблем сообщества проекта личного генома» . Мутация человека . 38 (9): 1266–1276. DOI : 10.1002 / humu.23265 . PMC  5645203 . PMID  28544481 .CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  47. ^ Рэнди Шор (4 мая 2014 г.). «Секвенирование генома: дорогой способ сэкономить» . Ванкувер Сан .
  48. ^ «ACMG обновляет список генов вторичных результатов» . GenomeWeb . 17 ноября 2016 г.
  49. ^ Machácková, E. (1 марта 2003 г.). «Болезненные мутации против нейтрального полиморфизма: использование биоинформатики и ДНК-диагностики». Casopis Lekaru Ceskych . 142 (3): 150–153. PMID  12756842 .
  50. ^ Отметьте Хайден, Эрика (2016). «Переосмыслить связь между генами и болезнью: база данных ExAC показала, что многие мутации, считающиеся вредными, являются доброкачественными» . Природа . 538 (7624): 140. DOI : 10.1038 / 538140a . PMID  27734882 .
  51. ^ Хантер, Дэвид Дж .; Хури, Муин Дж .; Дражен, Джеффри М. (10 января 2008 г.). «Выпустить геном из бутылки - исполним ли мы наше желание?». Медицинский журнал Новой Англии . 358 (2): 105–107. DOI : 10.1056 / NEJMp0708162 . PMID  18184955 .
  52. ^ Copeland, CS (май – июнь 2014 г.). "Что за запутанная паутина мы плетем" (PDF) . Журнал здравоохранения Литл-Рока .
  53. ^ Лунсхоф, Жантин; Мардис Элейн [Получено с http://www.future-science-group.com/_img/pics/Mardis_Forward.pdf [ постоянная мертвая ссылка ] «Навигеника - как это работает»]. Журнал "Медицина будущего". Проверено 30 марта 2012 г. /
  54. ^ Робертс, Дж. Скотт; Gornick, Michele C. et al. [Получено с http://www.genomes2people.org/wp-content/uploads/2017/01/Roberts-et-al-PGen-PHG-2017.pdf «Прямая к потребителю генетическая Тестирование: мотивация пользователей, принятие решений и предполагаемая полезность результатов »]. Геномика общественного здравоохранения. Проверено 20 февраля 2017 г. /
  55. ^ Корпус, Мануэль (6 января 2012 г.). «Семейный опыт личной геномики». Журнал генетического консультирования . 21 (3): 368–391. DOI : 10.1007 / s10897-011-9473-7 . PMID  22223063 . S2CID  10845045 .
  56. ^ Copeland, CS (март – апрель 2014 г.). «Свобода личности, общественная безопасность и сложные границы личной геномики» (PDF) . Журнал здравоохранения Нового Орлеана .
  57. ^ Мануэль Корпас (2016). Совершенная ДНК . Кембридж: DNAdigest. ISBN 978-1539783725.
  58. ^ а б Аранго, Тим; Гольдман, Адам; Фуллер, Томас (27 апреля 2018 г.). «Поймать убийцу: фальшивый профиль на участке ДНК и нетронутый образец» . Нью-Йорк Таймс .
  59. ^ Чжан, Сара (19 мая 2018 г.). «Грядущая волна убийств, раскрытых генеалогией» . Атлантика . Проверено 22 июня 2018 .
  60. ^ "Что означает арест убийцы из Голден Стэйт для генетической конфиденциальности?" . СТАТ . 26 апреля 2018.
  61. ^ Хааг, Мэтью (4 февраля 2019 г.). «FamilyTreeDNA допускает обмен генетическими данными с ФБР» The New York Times . ISSN  0362-4331 . Проверено 11 февраля 2019 .
  62. ^ Бала, Нила (18 марта 2019 г.). «Подозреваемые в уголовных преступлениях тоже заслуживают генетической конфиденциальности» . Журнал Slate .
  63. ^ « „ Buck кожи Girl“Дело перерыв Успех проекта строительства нового ДНК Doe» . Судебно-медицинский журнал . 16 апреля 2018 . Проверено 22 июня 2018 .
  64. ^ "Идентификаторы проекта ДНК Доу 2001 Самоубийство в мотеле, Использование генеалогии" . Судебно-медицинский журнал . 9 мая 2018 . Проверено 22 июня 2018 .
  65. ^ Канилья, Джон (21 июня 2018 г.). «Власти раскрывают холодное дело героя войны, который скрывался за личностью мертвого мальчика» . cleveland.com . Проверено 22 июня 2018 .

  • Дадли и Карчевски (2013). Изучение личной геномики . Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0199644490. Архивировано из оригинала на 1 декабря 2012 года.
  • Sweet K; Михаэлис Р. (май 2011 г.). Руководство занятого врача по генетике, геномике и персонализированной медицине (1-е изд.). Springer Scientific Press. ISBN 978-94-007-1147-1.
  • Кадвалладр, Кэрол (8 июня 2013 г.). «Что случилось, когда я секвенировал свой геном» . Хранитель . Проверено 10 июля 2013 года .
  • Мануэль Корпас (2016). Совершенная ДНК . Независимая издательская платформа CreateSpace. ISBN 978-1539783725. ASIN  1539783723 .