Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено из гаплогруппы J-P209 (Y-ДНК) )
Перейти к навигации Перейти к поиску
Эта статья о гаплогруппе Y-ДНК человека. Для гаплогруппы мтДНК человека см. Гаплогруппа J (мтДНК) .

Гаплогруппа J-M304
Гаплогруппа J (Y-ДНК) .PNG
Возможное время происхождения42 900 лет назад [1]
Возраст коалесценции31 600 лет назад [2]
Возможное место происхожденияЗападная Азия [3]
ПредокIJ
ПотомкиJ-M172 , J-M267
Определение мутацийM304 / Страница16 / PF4609, 12f2.1
Самые высокие частотыИнгушский , чеченский

Гаплогруппа J-M304 , также известная как J , [Филогенетика 1] представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы человека . Считается, что он появился в Западной Азии . [3] Оттуда клады распространились во время неолита , прежде всего в Северную Африку , Африканский Рог , Сокотру , Кавказ , Европу , Западную Азию , Центральную Азию , Южную Азию и Юго-Восточную Азию .

Гаплогруппа J-M304 делится на два основных субклада (ветви), J-M267 и J-M172 .

Истоки [ править ]

Гаплогруппа J-M304, как полагают, отделилась от гаплогруппы I-M170 примерно 43000 лет назад в Западной Азии [4], поскольку обе линии являются субкладами гаплогруппы IJ . Гаплогруппа IJ и гаплогруппа K происходят от гаплогруппы IJK , и только на этом уровне классификации гаплогруппа IJK соединяется с гаплогруппой G-M201 и гаплогруппой H как непосредственными потомками гаплогруппы F-M89.. J-M304 определяется генетическим маркером M304 или эквивалентным маркером 12f2.1. Основные нынешние подгруппы J-M267 и J-M172, которые теперь составляют между собой почти все потомки гаплогруппы, как полагают, возникли очень рано, по крайней мере, 10 000 лет назад. Тем не менее, сообщалось, что Y-хромосомы F-M89 * и IJ-M429 * наблюдались на иранском плато (Grugni et al. 2012).

С другой стороны, может показаться, что различные эпизоды движения населения повлияли на Юго-Восточную Европу, а также роль Балкан как давнего коридора в Европу с Ближнего Востока демонстрируется филогенетическим объединением Hgs I. и J за счет основной мутации M429. Это доказательство общей родословной предполагает, что предковый Hgs IJ-M429 *, вероятно, попал в Европу через балканские пути незадолго до LGM . Затем они впоследствии разделились на Hg J и Hg I на Ближнем Востоке и в Европе по типичной дизъюнктивной филогеографической схеме. Такой географический зал [ требуется пояснение ] склонен сталкиваться с дополнительными последовательными генными потоками, включая садоводческих поселенцев. Более того, объединение гаплогрупп IJK создает эволюционную дистанцию ​​от делегатов F – H, а также поддерживает вывод о том, что и IJ-M429, и KT-M9 возникли ближе к Ближнему Востоку, чем к Центральной или Восточной Азии. [ необходима цитата ]

Гаплогруппа J также была обнаружена среди двух древнеегипетских мумий, раскопанных на археологическом участке Абусир-эль-Мелек в Среднем Египте, которые датируются периодом между поздним Новым царством и римской эрой . [5]

Распространение [ править ]

Гаплогруппа J-M304 находится в наибольшей концентрации на Аравийском полуострове . За пределами этого региона гаплогруппа J-M304 имеет значительное присутствие в других частях Ближнего Востока, а также в Северной Африке , на Африканском Роге и на Кавказе . Он также умеренно встречается в Южной Европе , особенно в центральной и южной Италии, на Мальте, Греции и Албании. Субклад J-M410 в основном распространен в Анатолии , Греции и южной Италии. Кроме того, J-M304 наблюдается в Центральной и Южной Азии , особенно в форме его субклада J-M172. J-12f2 и J-P19 также встречаются средиГереро (8%). [6]

Страна / регионОтбор пробNJ-M267J-M172Итого ДжИзучать
АлжирОран10222,54.927,4Робино 2008
АлбанияТирана3020,0Bosch 2006 г.
Албания5523,64Батталья 2008
БоснияСербы81 год9.9Батталья 2008
КавказЧеченский33020,956,777,6Балановский 2011
КавказИнгуш1432,888,891,6Балановский 2011
КитайУйгурский50034,034,0Шоу 2010
КитайУзбекский23030,434,7Шоу 2010
КитайТаджикский31 год016.116.1Шоу 2010
Кипр1649,612,922,5Эль-Сибай 2009 [7]
Египет12419,87,627,4Эль-Сибай 2009
ГрецияКрит / Ираклион1041.944,246,1Мартинес 2007
ГрецияКрит1433.535 год38,5Эль-Сибай 2009
Греция1541.918,120Эль-Сибай 2009
ИндияСунниты и шииты Северной Индии1123243,275,2Эль-Сибай 2009
Иран923.22528,2Эль-Сибай 2009
ИракАраб , арамеи , ассирийцы , мандеи11733,125,158,2Эль-Сибай 2009
ИзраильАкко (арабы)10139,218,657,8Эль-Сибай 2009
Италия69922022Капелли 2007
ИталияЦентральный Марке595.135,640,7Капелли 2007
ИталияЗападная Калабрия573.535,138,6Капелли 2007
ИталияСицилия2125.222,627,8Эль-Сибай 2009
ИталияСардиния81 год4.99.914,8Эль-Сибай 2009
Иордания27335,514,650,1Эль-Сибай 2009
КосовоАлбанцы11416,67Перичич 2005
Кувейт4233,39,542,8Эль-Сибай 2009
Ливан9511729,446,4Эль-Сибай 2009
Мальта907,821,128,9Эль-Сибай 2009
Марокко31610,21.2Эль-Сибай 2009
МароккоЖители Италии5119,6019,6Онофри 2008
ПортугалияПортугалия3034.36.911.2Эль-Сибай 2009
КатарКатар7258,38,366,6Эль-Сибай 2009
СербияБелград1138Перичич 2005
Сербия1795,6Мирабал 2010
ИспанияКадис283,614,317,9Эль-Сибай 2009
ИспанияКантабрия702,92,95,8Эль-Сибай 2009
ИспанияКастилия21 год09,59,5Эль-Сибай 2009
ИспанияКордова27014,714,7Эль-Сибай 2009
ИспанияГалиция195,305,3Эль-Сибай 2009
ИспанияУэльва22013,713,7Эль-Сибай 2009
ИспанияИбица5403,73,7Эль-Сибай 2009
ИспанияЛеон601,756,7Эль-Сибай 2009
ИспанияМалага26015.415.4Эль-Сибай 2009
ИспанияМайорка621.689,7Эль-Сибай 2009
ИспанияСевилья1553.27,811Эль-Сибай 2009
ИспанияВаленсия31 год2,75.58,2Эль-Сибай 2009
СирияАрабский , арамейский , ассирийский55433,620,854,4Эль-Сибай 2009
Тунис62088Эль-Сибай 2009
Тунис5234,63.838,4Онофри 2008
ТунисСусс22025,98,234,1Фадлауи-Зид 2015
ТунисТунис14832,43,435,8Арреди 2004
индюк5239.124,233,3Эль-Сибай 2009
ОАЭ16434,710,345Эль-Сибай 2009
Йемен6272,59,682,1Эль-Сибай 2009

Распределение субкладов [ править ]

J-M304 * [ править ]

Парагруппа J-M304 * [Филогенетика 2] включает в себя все J-M304, за исключением J-M267, J-M172 и их субкладов. J-M304 * редко встречается за пределами острова Сокотра, принадлежащего Йемену, где он встречается чрезвычайно часто - 71,4%. [8] Гаплогруппа J-M304 * также с меньшей частотой обнаруживалась в Омане ( Giacomo 2004 ) , евреях-ашкенази , [9] Саудовской Аравии ( Abu-Amero 2009 ) , Греции ( Giacomo 2004 ) , Чешской Республике ( Giacomo 2004 и Лука 2007 ), уйгуры [10] и несколько тюркских народов . [11] ( Cinnioglu 2004 и Varzari 2006 ).

YFull [12] и FTDNA [13] , однако, не смогли найти людей J * нигде в мире, хотя есть 2 человека J2-Y130506 и 1 человек J1 из Сокотры.

Ниже приводится краткое изложение большинства исследований, специально протестированных на J-M267 и J-M172, с указанием его распространения в Европе, Северной Африке, на Ближнем Востоке и в Центральной Азии.

J-M267 [ править ]

Основная статья: Гаплогруппа J-M267

Гаплогруппа J-M267 [Филогенетика 3], определяемая SNP M267, в настоящее время наиболее часто встречается на Аравийском полуострове: Йемен (до 76%), [14] Саудовская Аравия (до 64%) ( Alshamali 2009 ) , Катар (58 %), [15] и Дагестан (до 56%). [16] J-M267 обычно встречается среди арабских бедуинов (62%), [17] евреев ашкенази (20%) ( Semino 2004 ) , Алжира (до 35%) ( Semino 2004 ) , Ирака (28%) ( Semino 2004 ) , Тунис (до 31%) [18], Сирия (до 30%), Египет (до 20%) ( Луис, 2004 г. ) и Синайский полуостров . В некоторой степени частота гаплогруппы J-M267 падает на границах арабских / семитоязычных территорий с в основном неарабоязычными / семитоязычными территориями, такими как Турция (9%), Иран (5%), индийские мусульмане-сунниты ( 2,3%) и шииты Северной Индии (11%) ( Eaaswarkhanth 2009). Некоторые приведенные выше цифры, как правило, являются большими, полученными в некоторых исследованиях, в то время как меньшие цифры, полученные в других исследованиях, опускаются. Это также очень часто встречается среди евреев , особенно среди представителей линии Коханим (46%) ( Hammer 2009 ) .

ISOGG заявляет, что J-M267 возник на Ближнем Востоке . Он встречается в некоторых частях Ближнего Востока , Анатолии и Северной Африки , с гораздо более редким распространением на южном Средиземноморском фланге Европы и в Эфиопии .

Но не все исследования сходятся во мнении о происхождении. Левант был предложен , но исследование 2010 пришло к выводу о том , что гаплогруппа имела более северное происхождение, возможно , Анатолия .

Происхождение субклада J-P58, вероятно, происходит из более северных популяций, а затем распространяется на юг, на Аравийский полуостров . Высокая дисперсия Y-STR для J-P58 в этнических группах в Турции , а также в северных регионах Сирии и Ирака подтверждает вывод о происхождении J-P58 из соседней восточной Анатолии . Более того, сетевой анализ гаплотипов J-P58 показывает, что некоторые популяции с низким разнообразием, такие как бедуины из Израиля , Катара , Судана и Объединенных Арабских Эмиратов, плотно сгруппированы около высокочастотных гаплотипов. Это предполагает, что эффекты основателя с расширением звездной вспышки в Аравийской пустыне ( Chiaroni 2010 ) .

J-M172 [ править ]

Основная статья: Гаплогруппа J-M172

Гаплогруппа J-M172 [Филогенетика 4] обнаружена в самых высоких концентрациях на Кавказе и в Плодородном полумесяце / Ираке и встречается по всему Средиземноморью (включая Итальянский , Балканский , Анатолийский и Пиренейский полуострова и Северную Африку ) ( Giacomo 2003 ) .

Самая высокая когда-либо зарегистрированная концентрация J-M172 составляла 72% в Северо-Восточной Грузии ( Насидзе 2004 ) . Другие высокие отчеты включают 32% ингушей ( Насидзе 2004 ) , киприотов 30-37% (Capelli 2005), ливанцев 30% (Wells et al. 2001), ассирийцев , мандеев и арабов- иракцев 29,7% (Sanchez et al. 2005) [ полный текст цитируется ] , сирийцы и сирийцы 22,5%, курды 24% -28%, пуштуны 20-30%, [19] иранцы 23% ( Абурто 2006 ), евреи-ашкенази 24%, палестинские арабы 16,8% -25%, евреи-сефарды 29% [20] и мусульмане-шииты из Северной Индии 18%, чеченцы 26%, балкарцы 24%, ягнобы 32%, армяне 21-24%, и азербайджанцы 24% -48%.

В Южной Азии было обнаружено, что J2-M172 значительно выше среди дравидийских каст (19%), чем среди индоевропейских каст (11%). J2-M172 и J-M410 встречаются 21% среди дравидийских средних каст, за ними следуют высшие касты - 18,6% и низшие - 14%. ( Sengupta 2006 ) [21] Субклады M172, такие как M67 и M92, не были обнаружены ни в индийских, ни в пакистанских образцах, что также может указывать на частичное общее происхождение ( Sengupta 2006 ) [21]

Согласно генетическому исследованию, проведенному в Китае Shou et al., J2-M172 обнаруживается с высокой частотой среди уйгуров (17/50 = 34%) и узбеков (7/23 = 30,4%), умеренная частота среди памирцев (5/31 = 16,1%), и низкая частота среди югуров (2/32 = 6,3%) и монгуоров (1/50 = 2,0%). Авторы также обнаружили J-M304 (xJ2-M172) с низкой частотой среди русских (1/19 = 5,3%), узбеков (1/23 = 4,3%), людей сибэ (1/32 = 3,1%), дунсянов ( 1/35 = 2,9%) и казахи (1/41 = 2,4%) в Северо-Западном Китае . [22]

Филогенетика [ править ]

В филогенетике Y-хромосомы субклады являются ветвями гаплогрупп. Эти субклады также определяются однонуклеотидными полиморфизмами (SNP) или уникальными полиморфизмами событий (UEP).

Филогенетическая история [ править ]

Основная статья: Таблица преобразования для гаплогрупп Y-хромосомы

До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем именования Филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знакового Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

YCC 2002/2008 (стенография)(α)(β)(γ)(δ)(е)(ζ)(η)YCC 2002 (от руки)YCC 2005 (от руки)YCC 2008 (от руки)YCC 2010r (от руки)ISOGG 2006ISOGG 2007ISOGG 2008ISOGG 2009ISOGG 2010ISOGG 2011ISOGG 2012
J-12f2a9VIMed23Eu10H4BJ *JJJ------J
J-M629VIMed23Eu10H4BJ1J1aJ1aJ1a------Частный
J-M1729VIMed24Eu9H4BJ2 *J2J2J2------J2
J-M479VIMed24Eu9H4BJ2aJ2aJ2a1J2a4a------J2a1a
J-M689VIMed24Eu9H4BJ2bJ2bJ2a3J2a4c------J2a1c
J-M1379VIMed24Eu9H4BJ2cJ2cJ2a4J2a4h2a1------J2a1h2a1a
J-M1589VIMed24Eu9H4BJ2dJ2dJ2a5J2a4h1------J2a1h1
J-M129VIMed24Eu9H4BJ2e *J2eJ2bJ2b------J2b
J-M1029VIMed24Eu9H4BJ2e1 *J2e1J2bJ2b------J2b
J-M999VIMed24Eu9H4BJ2e1aJ2e1aJ2b2aJ2b2a------Частный
J-M679VIMed24Eu9H4BJ2f *J2fJ2a2J2a4b------J2a1b
J-M929VIMed24Eu9H4BJ2f1J2f1J2a2aJ2a4b1------J2a1b1
J-M1639VIMed24Eu9H4BJ2f2J2f2J2a2bJ2a4b2------Частный

Публикации исследований [ править ]

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании дерева YCC.

  • α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
  • β Андерхилл 2000
  • γ Hammer 2001
  • δ Карафет 2001
  • ε Семино 2000
  • ζ вс 1999
  • η Капелли 2001

Обсуждение [ править ]

Филогенетические деревья [ править ]

Есть несколько подтвержденных и предложенных филогенетических деревьев, доступных для гаплогруппы J-M304. Научно принятый - это консорциум Y-хромосомы (YCC), опубликованный в Karafet 2008 и впоследствии обновленный. Черновик дерева, который показывает развивающуюся науку, предоставлен Томасом Краном из Центра геномных исследований в Хьюстоне, штат Техас . Международное общество генетической генеалогии (ISOGG) также предоставляет любительское дерево.

Черновик дерева Центра геномных исследований [ править ]

Это Томас Кран из Черновика предложенного дерева для гаплогруппы J-P209 Центра геномных исследований ( Krahn & FTDNA 2013 ) . Для краткости показаны только первые три уровня субкладов.

  • J-M304 12f2a, 12f2.1, M304, P209, L60, L134
    • M267, L255, L321, L765, L814, L827, L1030
      • M62
      • M365.1
      • L136, L572, L620
        • M390
        • P56
        • P58, L815, L828
        • L256
      • Z1828, Z1829, Z1832, Z1833, Z1834, Z1836, Z1839, Z1840, Z1841, Z1843, Z1844
        • Z1842
        • L972
    • M172, L228
      • M410, L152, L212, L505, L532, L559
        • M289
        • L26, L27, L927
        • L581
      • М12, М102, М221, М314, L282
        • M205
        • M241

Дерево Консорциума Y-хромосомы [ править ]

Это официальное научное дерево, созданное Консорциумом Y-хромосомы (YCC). Последнее крупное обновление было в 2008 году ( Карафет 2008 ) . Последующие обновления производились ежеквартально и раз в два года. Текущая версия является переработкой обновления 2010 года. [23]

См. Также [ править ]

Генетика [ править ]

  • Генетическая история Ближнего Востока
  • Генетическая история Европы
  • Генетика и археогенетика Южной Азии
  • Таблица преобразования для гаплогрупп Y хромосомы
  • Генетическая генеалогия
  • Гаплогруппа
  • Гаплотип
  • Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека
  • Молекулярная филогения
  • Парагруппа
  • Субклад
  • Y-хромосома Аарон
  • Гаплогруппы Y-хромосомы в популяциях мира
  • Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Европы
  • Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Южной Азии
  • Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Восточной и Юго-Восточной Азии
  • Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Ближнего Востока
  • Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Северной Африки
  • Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Кавказа
  • Гаплогруппы Y-ДНК по этнической группе

Субклады Y-ДНК J [ править ]

  • J-P58
  • J-M304
  • J-M172
  • J-M267
  • J2-L24
  • J2-L192
  • J2-L271

Ссылки [ править ]

  1. ^ "J YTree" . Архивировано 23 мая 2018 года . Проверено 8 апреля 2018 года .
  2. ^ "J YTree" . Архивировано 23 мая 2018 года . Проверено 8 апреля 2018 года .
  3. ↑ a b Y-DNA Haplogroup J Архивировано 18 августа 2017 года в Wayback Machine , ISOGG, 2015
  4. ^ "J YTree" . Архивировано 23 мая 2018 года . Проверено 8 апреля 2018 года .
  5. ^ Schuenemann, Верена J .; и другие. (2017). «Геномы древних египетских мумий предполагают увеличение числа африканских предков к югу от Сахары в постримские периоды» . Nature Communications . 8 : 15694. Bibcode : 2017NatCo ... 815694S . DOI : 10.1038 / ncomms15694 . PMC 5459999 . PMID 28556824 .  
  6. ^ Вуд, Элизабет Т .; и другие. (2005). «Контрастные модели вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: свидетельства предвзятых по полу демографических процессов» (PDF) . Европейский журнал генетики человека . 13 (7): 867–876. DOI : 10.1038 / sj.ejhg.5201408 . PMID 15856073 . S2CID 20279122 . Архивировано (PDF) из оригинала 24 сентября 2016 года . Проверено 24 сентября 2016 года .   
  7. ^ Эль-Сибай 2009 сообщил о результатах нескольких исследований: Ди Джакомо 2003 , Аль-Захери 2003 , Флорес 2004 , Чинниоглу 2004 , Капелли 2005 , Гонсалвес 2005 , Заллуа 2008 , Каденас 2008
  8. ^ Cerny 2008 : J-12f2 (xM267, M172) (45/63) Черны Виктору; и другие. (2009). «За пределами Аравии - поселение на острове Сокотра, выявленное генетическим разнообразием митохондрий и Y-хромосомы» (PDF) . Американский журнал физической антропологии . 138 (4): 439–447. DOI : 10.1002 / ajpa.20960 . PMID 19012329 . Архивировано из оригинального (PDF) 6 октября 2016 года . Проверено 12 июня +2016 .  
  9. ^ Шен 2004 : Гаплогруппа J-M304 (xM267, M172) в 1/20 евреев ашкенази.
  10. ↑ Zhong et al (2011), Mol Biol Evol, 1 января 2011 г., т. 28 нет. 1 717-727. Архивировано 23 августа 2011 г. в Wayback Machine , см. Таблицу [ постоянная мертвая ссылка ] .
  11. ^ Юнусбаи 2006 : статы для комбинированных дагестанских этносов см Дагестанской статьи для деталей. Даргинцы (91%), аварцы (67%), чамалины (67%), лезгины (58%), табассарцы (49%), андийцы (37%), ассирийцы (29%), багвалины (21,4%))
  12. ^ "J YTree" . Архивировано 23 мая 2018 года . Проверено 8 апреля 2018 года .
  13. ^ "Архивная копия" . Архивировано 12 февраля 2020 года . Проверено 28 сентября 2019 .CS1 maint: archived copy as title (link)
  14. ^
    • Альшамали 2009 : 81% (84/104)
    • Малуф 2008 : 70% (28/40)
    • Кадены 2008 : 45/62 = 72,6% J-M267
  15. ^ Кадены 2008 : 42/72 = 58,3% J-M267
  16. ^ Юнусбаев 2006 : Dargwas (91%), аварцы (67%), Chamalins (67%), лезгины (58%), Tabassarans (49%), Andis (37%), ассирийцы (29%), Bagvalins (21,4% )) статистика объединённых дагестанских этносов см.статью о Дагестане
  17. ^ Nebel 2001 : 21/32
  18. ^ 31% основан на комбинированных данных
    • Семино 2004 : 30%
    • Arredi 2004 : 32%
  19. ^ Хабер, Марк; Platt, Daniel E .; Ашрафиан Бонаб, Мазиар; Юханна, Соня С .; Сориа-Эрнанц, Дэвид Ф .; Мартинес-Крус, Бегонья; Дуайхи, Бушра; Гассиб-Саббаг, Мишелла; Рафатпанах, Хошанг; Ганбари, Мохсен; Кит, Джон; Балановский, Олег; Уэллс, Р. Спенсер; Комас, Дэвид; Тайлер-Смит, Крис; Заллуа, Пьер А. (2012). «Этнические группы Афганистана разделяют наследие Y-хромосомы, структурированное историческими событиями» . PLOS ONE . 7 (3): e34288. Bibcode : 2012PLoSO ... 734288H . DOI : 10.1371 / journal.pone.0034288 . PMC 3314501 . PMID 22470552 .  
  20. ^ «Архивная копия» (PDF) . Архивировано 31 января 2017 года (PDF) . Дата обращения 11 мая 2020 . CS1 maint: archived copy as title (link)
  21. ^ а б Сенгупта, S; Животовский, Л.А.; King, R; и другие. (Февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределений Y-хромосомы высокого разрешения в Индии позволяют идентифицировать как местные, так и экзогенные экспансии и выявить незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии» . Являюсь. J. Hum. Genet . 78 (2): 202–21. DOI : 10.1086 / 499411 . PMC 1380230 . PMID 16400607 .  
  22. ↑ Shou et al (2010), Распределение Y-хромосомы среди популяций в Северо-Западном Китае указывает на значительный вклад скотоводов из Центральной Азии и меньшее влияние западных евразийцев. Архивировано 2 апреля 2015 г. в Wayback Machine , Journal of Human Genetics (2010) 55, 314– 322; DOI: 10.1038 / jhg.2010.30; опубликовано в Интернете 23 апреля 2010 г., таблица 2. Распределение гаплогрупп и разнообразие Y-хромосомы в 14 популяциях на северо-западе. Архивировано 14 января 2015 г. в Wayback Machine.
  23. ^ "Y-ДНК Haplotree" . Архивировано 27 января 2013 года . Проверено 3 января 2013 года . Family Tree DNA использует дерево Y-хромосомы Консорциума и размещает его на своем веб-сайте.

Цитированные работы [ править ]

Журналы

  • Консорциум Y-хромосомы "YCC" (2002). "Система номенклатуры дерева бинарных гаплогрупп Y-хромосомы человека" . Геномные исследования . 12 (2): 339–48. DOI : 10.1101 / gr.217602 . PMC  155271 . PMID  11827954 .
  • Абу-Амеро, Халед К.; Хеллани, Али; Гонсалес, Ана М; Ларруга, Хосе М; Кабрера, Висенте М; Андерхилл, Питер А (2009). «Саудовское разнообразие Y-хромосомы и его связь с соседними регионами» . BMC Genetics . 10 : 59. DOI : 10.1186 / 1471-2156-10-59 . PMC  2759955 . PMID  19772609 .
  • Альшамали, Фарида; Перейра, Луиза; Будоул, Брюс; Poloni, Estella S .; Куррат, Матиас (2009). «Структура местного населения на Аравийском полуострове, выявленная разнообразием Y-STR» . Человеческая наследственность . 68 (1): 45–54. DOI : 10.1159 / 000210448 . PMID  19339785 .
  • Кьярони, Жак; Кинг, Рой Дж; Майрес, Натали М; Хенн, Бренна М; Дюкурно, Аксель; Митчелл, Майкл Дж; Boetsch, Gilles; Шейха, Исса; и другие. (2009). «Появление гаплогруппы J1e Y-хромосомы среди арабоязычного населения» . Европейский журнал генетики человека . 18 (3): 348–53. DOI : 10.1038 / ejhg.2009.166 . PMC  2987219 . PMID  19826455 .
  • Кьярони, Жак; Кинг, Рой Дж; Майрес, Натали М; Хенн, Бренна М; Дюкурно, Аксель; Митчелл, Майкл Дж; Boetsch, Gilles; Шейха, Исса; и другие. (2010). «Появление гаплогруппы J1e Y-хромосомы среди арабоязычного населения» . Европейский журнал генетики человека . 18 (3): 348–53. DOI : 10.1038 / ejhg.2009.166 . PMC  2987219 . PMID  19826455 .
  • Чинниоглу, Дженгиз; Кинг, Рой; Кивисилд, Тоомас; Калфоглу, Эрси; Атасой, Севиль; Cavalleri, Gianpiero L .; Лилли, Анита С .; Roseman, Charles C .; и другие. (2004). «Раскопки гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии». Генетика человека . 114 (2): 127–48. DOI : 10.1007 / s00439-003-1031-4 . PMID  14586639 . S2CID  10763736 .
  • Ди Джакомо, Ф .; Luca, F .; Anagnou, N .; Ciavarella, G .; Корбо, РМ; Cresta, M .; Cucci, F .; Di Stasi, L .; и другие. (2003). «Клинические паттерны человеческого Y-хромосомного разнообразия в континентальной Италии и Греции во власти дрейфа и эффектов основателя». Молекулярная филогенетика и эволюция . 28 (3): 387–95. DOI : 10.1016 / S1055-7903 (03) 00016-2 . PMID  12927125 .
  • Ди Джакомо, Ф .; Luca, F .; Попа, LO; Akar, N .; Anagnou, N .; Banyko, J .; Brdicka, R .; Barbujani, G .; и другие. (2004). «Y-хромосомная гаплогруппа J как признак постнеолитической колонизации Европы». Генетика человека . 115 (5): 357–71. DOI : 10.1007 / s00439-004-1168-9 . PMID  15322918 . S2CID  18482536 .
  • Хаммер, Майкл Ф .; Бехар, Дорон М .; Карафет, Татьяна М .; Mendez, Fernando L .; Hallmark, Брайан; Эрез, Тамар; Животовский, Лев А .; Россет, Сахарон; Скорецкий, Карл (2009). «Расширенные гаплотипы Y-хромосомы разрешают множественные и уникальные линии еврейского священства» . Генетика человека . 126 (5): 707–17. DOI : 10.1007 / s00439-009-0727-5 . PMC  2771134 . PMID  19669163 .
  • Джоблинг, Марк А .; Тайлер-Смит, Крис (2000). «Новое использование новых гаплотипов». Тенденции в генетике . 16 (8): 356–62. DOI : 10.1016 / S0168-9525 (00) 02057-6 . PMID  10904265 .
  • Карафет, ТМ; Мендес, Флорида; Мейлерман, МБ; Андерхилл, Пенсильвания; Зегура, SL; Молоток, MF (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–8. DOI : 10.1101 / gr.7172008 . PMC  2336805 . PMID  18385274 .
  • Luca, F .; Ди Джакомо, Ф .; Benincasa, T .; Попа, LO; Banyko, J .; Крамарова, А .; Malaspina, P .; Novelletto, A .; Brdicka, R. (2007). «Вариация Y-хромосомы в Чехии». Американский журнал физической антропологии . 132 (1): 132–9. DOI : 10.1002 / ajpa.20500 . ЛВП : 2108/35058 . PMID  17078035 .
  • Луис, Дж; Роулд, D; Регейро, М; Caeiro, B; Cinnioglu, C; Roseman, C; Андерхилл, П; Cavallisforza, L; Эррера, Р. (2004). «Левант против Африканского Рога: свидетельства двунаправленных коридоров миграции людей» . Американский журнал генетики человека . 74 (3): 532–44. DOI : 10.1086 / 382286 . PMC  1182266 . PMID  14973781 .
  • Мирабал С., Варлен Т., Гайден Т. и др. (Июль 2010 г.). «Короткие тандемные повторы Y-хромосомы человека: история аккультурации и миграции как механизмов распространения сельского хозяйства на Балканском полуострове». Американский журнал физической антропологии . 142 (3): 380–390. DOI : 10.1002 / ajpa.21235 . PMID  20091845 .
  • Насидзе, И .; Линг, EYS; Quinque, D .; Dupanloup, I .; Cordaux, R .; Рычков, С .; Наумова, О .; Жукова, О .; и другие. (2004). «Митохондриальная ДНК и вариация Y-хромосомы на Кавказе» . Анналы генетики человека . 68 (3): 205–21. DOI : 10.1046 / j.1529-8817.2004.00092.x . PMID  15180701 . S2CID  27204150 .
  • Перичич М., Лаук Л.Б., Кларич И.М. и др. (Октябрь 2005 г.). «Филогенетический анализ с высоким разрешением в юго-восточной Европе отслеживает основные эпизоды отцовского потока генов среди славянского населения» . Мол. Биол. Evol . 22 (10): 1964–75. DOI : 10.1093 / molbev / msi185 . PMID  15944443 .
  • Шен, Пейдун; Лави, Тал; Кивисилд, Тоомас; Чоу, Вивиан; Сенгун, Дениз; Гефель, Дов; Шпирер, Иссак; Вульф, Эйлон; и другие. (2004). «Реконструкция отцовства и материнства самаритян и других израильских популяций на основе Y-хромосомы и вариации последовательности митохондриальной ДНК». Мутация человека . 24 (3): 248–60. DOI : 10.1002 / humu.20077 . PMID  15300852 . S2CID  1571356 .

Диссертация и диссертации

  • Варзари, Александр (2006). История популяции Днестровско-Карпатских гор: доказательства внедрения Alu и полиморфизма Y-хромосомы (PDF) (Диссертация). Мюнхен, Университет. OCLC  180859661 .

Блоги

  • Диенекес (2009). «Ближневосточные и южно-сахарские родословные в индийских мусульманских популяциях» .

Списки рассылки

  • Абурто, Альфред А (2006). «Гаплогруппа Y в Иране» (Список рассылки). Архивировано из оригинального 13 октября 2012 года . Проверено 3 января 2013 года .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • yJdb: гаплотипы базы данных Y-гаплогруппы J гаплогруппы J.
  • [1]
  • Субклады гаплогруппы J в Международном обществе генетической генеалогии
  • Nebel et al. 2001, см. Модальные гаплотипы "J1" (как Eu10)
  • Санчес, Хуан Дж; Халленберг, Шарлотта; Борстинг, Клаус; Эрнандес, Алексис; Горлин, Р.Дж. (2005). «Высокие частоты клонов Y-хромосомы, характеризующиеся E3b1, DYS19-11, DYS392-12 у сомалийских мужчин» . Европейский журнал генетики человека . 13 (7): 856–66. DOI : 10.1038 / sj.ejhg.5201390 . PMID  15756297 .
  • Сенгупта С., Животовский Л.А., Кинг Р. и др. (Февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределений Y-хромосомы высокого разрешения в Индии позволяют идентифицировать как местные, так и экзогенные экспансии и выявить незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии» . Являюсь. J. Hum. Genet . 78 (2): 202–21. DOI : 10.1086 / 499411 . PMC  1380230 . PMID  16400607 .

Филогенетические заметки [ править ]

  1. ^ ISOGG Y-DNA Haplogroup J and its Subclades - 2016 Архивировано 18 августа 2017 года в Wayback Machine (2 февраля 2016 года).
  2. ^ В этой таблице показаны исторические названия J-M304 (также известный как J-P209 и J-12f2.1) в опубликованной рецензируемой литературе. Обратите внимание, что в Semino 2000 Eu09 является субкладом Eu10, а в Karafet 2001 24 - субкладом 23 .
    YCC 2002/2008 (стенография)J-M304
    (он же J-12f2.1 или J-P209)
    Джоблинг и Тайлер-Смит 20009
    Андерхилл 2000VI
    Молот 2001Med
    Карафет 200123
    Семино 2000Eu10
    Вс 1999H4
    Капелли 2001B
    YCC 2002 (от руки)J *
    YCC 2005 (от руки)J
    YCC 2008 (от руки)J
    YCC 2010r (от руки)J
  3. ^ В этой таблице показаны исторические названия J-M267 и его ранее обнаруженного и названного субклада J-M62 в опубликованной рецензируемой литературе.
    YCC 2002/2008 (стенография)J-M267J-M62
    Джоблинг и Тайлер-Смит 2000-9
    Андерхилл 2000-VI
    Молот 2001-Med
    Карафет 2001-23
    Семино 2000-Eu10
    Вс 1999-H4
    Капелли 2001-B
    YCC 2002 (от руки)-J1
    YCC 2005 (от руки)J1J1a
    YCC 2008 (от руки)J1J1a
    YCC 2010r (от руки)J1J1a
  4. ^ В этой таблице показаны исторические названия J-M172 в опубликованной рецензируемой литературе. Обратите внимание, что в Semino 2000 Eu09 является субкладом Eu10, а в Karafet 2001 24 - субкладом 23 .
    YCC 2002/2008 (стенография)J-M172
    Джоблинг и Тайлер-Смит 20009
    Андерхилл 2000VI
    Молот 2001Med
    Карафет 200124
    Семино 2000Eu9
    Вс 1999H4
    Капелли 2001B
    YCC 2002 (от руки)J2 *
    YCC 2005 (от руки)J2
    YCC 2008 (от руки)J2
    YCC 2010r (от руки)J2

Внешние ссылки [ править ]

Филогенетическое дерево и карты распространения гаплогруппы J Y-ДНК [ править ]

  • Y-ДНК гаплогруппа J и ее субклады из ISOGG 2009

Другое [ править ]

  • Youtube Haplogroup J2 Channel
  • Распространение гаплогруппы J от National Geographic
  • Проект ДНК Британских островов
Филогенетическое дерево гаплогрупп ДНК Y-хромосомы человека [χ 1] [χ 2] Эта статья нуждается в обновлении . Обновите эту статью, чтобы отразить недавние события или новую доступную информацию. ( Февраль 2021 г. )
« Y-хромосомный Адам »
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я  J    LT  [χ 5]      K2  [χ 6]
L    Т   K2a  [χ 7]       K2b  [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313  [χ 10]    K2b1  [χ 11]П  [χ 12]
НЕТ  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
NОQр
Y-ДНК по населению Y-ДНК гаплогруппы исторических людей Сноски  ^ Ван печь М, Ван Geystelen А, Кайзер М, Decorte R, Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Мутация человека . 35 (2): 187–91. DOI : 10.1002 / humu.22468 . PMID 24166809 .  ^ Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Y-DNA Haplogroup Tree 2015 . (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.) ^ Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4). ^ Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4. ^ Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1. ^ В период2002 по 2008 год, Гаплогруппа T-M184 был известен как «гаплогруппы К2». С тех пор это имя было присвоено K-M526 , брату Haplogroup LT. ^ Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году. (Это последовало за публикацией: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL, et al. (2016) ». в мужской демографии человека выведен из последовательностей по всему миру 1244 Y-хромосома» . Nature Genetics . 48 (6): 593-9. DOI : 10.1038 / ng.3559 . ПМК 4884158 . PMID 27111036 .   В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a». ^ Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы. ^ Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешнего K2a). ^ K-M2313 *, у которого еще нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Poznik op. соч. ; YFull YTree v5.08 , 2017, «K-M2335» и; PhyloTree , 2017, «Подробная информация о маркерах Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.) ^ Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру. ^ Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2. ^ Гаплогруппа S, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.) ^ Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)