Гаплогруппа M-P256

Гаплогруппа M-P256

Возможное время происхождения	32000-47000 лет назад ( Scheinfeldt 2006 )
Возможное место происхождения	Wallacea (восточная Индонезия) или Новая Гвинея ^[1]
Предок	K2b1
Определение мутаций	P256

Гаплогруппа M , также известная как M-P256 и гаплогруппа K2b1b (ранее K2b1d), представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы . M-P256 является потомком гаплогруппы гаплогруппы K2b1 и, как полагают, впервые появилась между 32 000 и 47 000 лет назад ( Scheinfeldt 2006 ) .

M-P256 является наиболее часто встречающейся гаплогруппой Y-хромосомы в Западном Папуа и Западной Папуа-Новой Гвинее ( Kayser 2003 ) . Он также встречается в соседних частях Меланезии , Индонезии и среди коренных австралийцев .

Он и гаплогруппа S (B254) являются единственными первичными субкладами K2b1 , также известными как гаплогруппа MS.

Филогенетическая структура [ править ]

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогрупп основано главным образом на деревьях, опубликованных ISOGG в 2016 г. ( ISOGG 2016 ) и YCC в 2008 г. ( Karafet 2008 )

M * (P256)
- M1 (M4, M5 / P73, M106, M186, M189, M296, P35)
  - M1a (P34_1, P34_2, P34_3, P34_4, P34_5)
    - M1a1 (P51)
    - M1a2 (P94)
  - M1b (P87)
    - M1b1 (M104_1 / P22_1, M104_2 / P22_2)
      - M1b1a (M16)
      - M1b1b (M83)
- M2 (M353, M387)
  - M2a (M177 / SRY9138)
- M3 (P117, P118)

Распространение [ править ]

M * (M-P256 *) [ редактировать ]

Парагруппа M-P256 * редко встречается в Новой Гвинее (6,3%) и Флоресе (2,5%). ^[1]

M1 (M-M4) [ править ]

Гаплогруппа M-M4
Возможное время происхождения	8 200 [3 800–20 600] лет назад ( Kayser 2003 )
Возможное место происхождения	Юго-Восточная Азия - Меланезия ^{[ необходима ссылка ]}
Предок	M-P256
Определение мутаций	M4, M5 / P73, M106, M186, M189, M296, P35 ^{[ необходима ссылка ]}

Часто встречается в Новой Гвинее и Меланезии , с умеренным распространением в соседних частях Индонезии , Микронезии и Полинезии .

Уна 100% ( Kayser 2003 )
Кетенгбан 100% ( Кайзер 2003 )
Авю 100% ( Kayser 2003 )
Citak 86% ( Kayser 2003 )
Асмат 75% ( Kayser 2003 )
Западное Папуа
- низменности / побережье 77,5% ( Kayser 2003 )
- нагорье 74,5% ( Kayser 2003 )
Комбай / Коровай 46% ( Kayser 2003 )
Папуа - Новая Гвинея
- побережье 29% ( Kayser 2003 )
- нагорье 35,5% ( Kayser 2003 )
Толай (Новая Британия) 31% ( Kayser 2003 )
Тробрианские острова 30% ( Kayser 2003 )
Малуку (Молуккские острова) 21% ( Kayser 2003 )
Жители островов Торресова пролива (Австралия): до 2,0%, т. Е. 0,9% выборок, когда 45% от общего числа считались «некоренными» ( Nagle 2015 ).

Крайний географический выброс был, по-видимому, выявлен в исследовании 2012 года, в котором сообщалось о хазарейском человеке из Мазари-Шарифа , Афганистан, с M1 среди выборки из 60 мужчин из Мазари-Шарифа ( Haber 2012 ) . У хазарейца был SNP M186 (который, как полагают, эквивалентен M4).

Старые имена (YCC 2002/2008)	М-М4
Джоблинг и Тайлер-Смит 2000	24
Андерхилл 2000	VIII
Молот 2001	1U
Карафет 2001	37
Семино 2000	Eu16
Вс 1999	H17
Капелли 2001	E
YCC 2002 (от руки)	М *
YCC 2005 (от руки)	M
YCC 2008 (от руки)	M1
YCC 2010r (от руки)	M1

M1a (M-P34) [ править ]

M1a (M-P34) - наиболее часто встречающаяся гаплогруппа ДНК Y-хромосомы в Западной Новой Гвинее . Он также встречается с умеренной частотой в соседних частях Индонезии ( Малуку , Нуса-Тенггара ) и по всей Папуа-Новой Гвинее , включая прибрежные острова ( Karafet 2005 и Kayser 2008 ).

Старые имена (YCC 2002/2008)	M-P34
Джоблинг и Тайлер-Смит 2000	24
Андерхилл 2000	VIII
Молот 2001	1U
Карафет 2001	37
Семино 2000	Eu16
Вс 1999	H17
Капелли 2001	E
YCC 2002 (от руки)	M1
YCC 2005 (от руки)	M1
YCC 2008 (от руки)	M1a
YCC 2010r (от руки)	M1a

M1b (M-P87) [ редактировать ]

M1b M-P87 (xM104 / P22) был обнаружен примерно в 18% (20/109) пула образцов из Новой Ирландии , примерно в 12% (5/43) образца Лавонгаи из Нью-Ганновера , примерно в 5% (19/395) пул образцов из Новой Англии (и, в частности, в примерно 24% (15/63) из Baining из Восточной Новой Британии ), в одном Saposa человека из северной Бугенвиль , а в другом человеке , из северное побережье Папуа-Новой Гвинеи ( Scheinfeldt 2006 ) .

Субклад M1b1 (M104_1 / P22_1, M104_2 / P22_2) часто встречается в популяциях архипелага Бисмарка и острова Бугенвиль , с умеренным распространением в Новой Гвинее , Фиджи , Тонге , Восточной Футуне и Самоа . ( Kayser 2008 и Scheinfeldt 2006 ).

Старые имена (YCC 2002/2008)	M-P22
Джоблинг и Тайлер-Смит 2000	24
Андерхилл 2000	VIII
Молот 2001	1U
Карафет 2001	38
Семино 2000	Eu16
Вс 1999	H17
Капелли 2001	E
YCC 2002 (от руки)	M2 *
YCC 2005 (от руки)	M2a
YCC 2008 (от руки)	M1b1
YCC 2010r (от руки)	M1b1

M2 (M-M353) [ редактировать ]

С низкой частотой встречается на Фиджи и в Восточной Футуне ( Kayser 2006 ) .

Субклад M2a (M-M177 также известный как M-SRY9138) обнаружен у одной особи Nasioi с восточного побережья Бугенвиля и у одной особи из провинции Малаита на Соломоновых островах ( Cox 2006 ) .

Исторические названия M-SRY9138 (также известного как M-M177) из рецензируемой литературы.

Старые имена (YCC 2002/2008)	K-SRY9138 / M-SRY9138 AKA M-M177
Джоблинг и Тайлер-Смит 2000	23
Андерхилл 2000	VIII
Молот 2001	1E
Карафет 2001	25
Семино 2000	Eu16
Вс 1999	H5
Капелли 2001	F
YCC 2002 (от руки)	K1
YCC 2005 (от руки)	K1
YCC 2008 (от руки)	M2a
YCC 2010r (от руки)	M2a

M3 (M-P117) [ редактировать ]

M3 (P117, P118) часто встречается в популяциях Новой Британии , а также иногда наблюдается на севере Бугенвиля , Фиджи и Восточной Футуне ( Kayser 2008 и Scheinfeldt 2006 ).

Предыдущая филогенетическая история [ править ]

До 2002 г. в академической литературе было по крайней мере семь систем именования Филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знакового Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

YCC 2002/2008 (стенография)	(α)	(β)	(γ)	(δ)	(е)	(ζ)	(η)	YCC 2002 (от руки)	YCC 2005 (от руки)	YCC 2008 (от руки)	YCC 2010r (от руки)	ISOGG 2006	ISOGG 2007	ISOGG 2008	ISOGG 2009	ISOGG 2010	ISOGG 2011	ISOGG 2012
M4	24	VIII	1U	37	Eu16	H17	E	М *	M	M1	M1	-	-	-	-	-	-	-
M-P34	24	VIII	1U	37	Eu16	H17	E	M1	M1	M1a	M1a	-	-	-	-	-	-	-
M-P22 / M-M104	24	VIII	1U	38	Eu16	H17	E	M2 *	M2a	M1b1	M1b1	-	-	-	-	-	-	-
М-М16	24	VIII	1U	39	Eu16	H17	E	M2a	M2a1	M1b1a	M1b1a	-	-	-	-	-	-	-
M-M83	24	VIII	1U	38	Eu16	H17	E	M2b	M2a2	M1b1b	M1b1b	-	-	-	-	-	-	-
K-SRY9138 / M-SRY9138	23	VIII	1E	25	Eu16	H5	F	K1	K1	M2a	M2a	-	-	-	-	-	-	-

Источники

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании Дерева YCC.

α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
β Андерхилл 2000
γ Hammer 2001
δ Карафет 2001
ε Семино 2000
ζ вс 1999
η Капелли 2001

Бумага Karafet в 2008 внесен ряд изменений, по сравнению с предыдущим 2006 ISOGG дерево . До открытия маркера P256 текущая подгруппа M-M4 (определяемая маркером M4) ранее представляла всю гаплогруппу M-P256; и подгруппы , М2 и М3 были ранее классифицированы как подгруппы K1 и K7 родителя Гаплогруппа K . ^{[ необходима цитата ]}

Ссылки [ править ]

Сноски [ править ]

^ a b Татьяна М. Карафет, Брайан Холлмарк, Мюррей П. Кокс, Херавати Судойо, Шон Дауни, Дж. Стивен Лансинг и Майкл Ф. Хаммер, «Основное деление Восток-Запад лежит в основе стратификации Y-хромосомы в Индонезии», Molecular Biological Evolution , (2010), т. 27, нет. 8. С. 1833-1844.

Процитированные работы [ править ]

Cox, Murray P .; Миразон Лар, Марта (2006). «Разнообразие Y-хромосомы обратно пропорционально языковой принадлежности в парных австронезийских и папуасоязычных сообществах Соломоновых островов». Американский журнал биологии человека . 18 (1): 35–50. DOI : 10.1002 / ajhb.20459 . PMID 16378340 . S2CID 4824401 .
Габер, Марк; Platt, Daniel E .; Ашрафиан Бонаб, Мазиар; Юханна, Соня С .; Сориа-Эрнанц, Дэвид Ф .; Мартинес-Крус, Бегонья; Дуайхи, Бушра; Гассиб-Саббаг, Мишелла; Рафатпанах, Хошанг (2012). Кайзер, Манфред (ред.). «Этнические группы Афганистана разделяют наследие Y-хромосомы, структурированное историческими событиями» . PLOS ONE . 7 (3): e34288. Bibcode : 2012PLoSO ... 734288H . DOI : 10.1371 / journal.pone.0034288 . PMC 3314501 . PMID 22470552 .
Карафет, Татьяна М .; Lansing, JS; Редд, Алан Дж .; Уоткинс, Джозеф С .; Сурата, СПК; Артхавигуна, Вашингтон; Майер, Лаура; Бамшад, Майкл; Джорд, Линн Б. (2005). «Балийская перспектива Y-хромосомы на заселение Индонезии: генетический вклад от донеолитических охотников-собирателей, австронезийских фермеров и индийских торговцев» (PDF) . Биология человека . 77 (1): 93–114. DOI : 10,1353 / hub.2005.0030 . hdl : 1808/13586 . PMID 16114819 . S2CID 7953854 .
Карафет, ТМ; Мендес, Флорида; Мейлерман, МБ; Андерхилл, Пенсильвания; Зегура, SL; Молоток, MF (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–8. DOI : 10.1101 / gr.7172008 . PMC 2336805 . PMID 18385274 .
Кайзер, Манфред; Брауэр, Силке; Вайс, Гюнтер; Schiefenhövel, Wulf; Андерхилл, Питер; Шен, Пейдун; Офнер, Питер; Томмазео-Понцетта, Мила; Стоункинг, Марк (2003). «Уменьшенная Y-хромосома, но не митохондриальная ДНК, разнообразие в человеческих популяциях из Западной Новой Гвинеи» . Американский журнал генетики человека . 72 (2): 281–302. DOI : 10.1086 / 346065 . PMC 379223 . PMID 12532283 .
Kayser, M .; Брауэр, S; Cordaux, R; Касто, А; Лао, О; Животовский, Л.А.; Мойз-Фори, К; Рутледж, РБ; Schiefenhoevel, W. (2006). «Меланезийское и азиатское происхождение полинезийцев: мтДНК и градиенты Y-хромосомы через Тихий океан» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (11): 2234–44. DOI : 10.1093 / molbev / msl093 . PMID 16923821 .
Kayser, M .; Choi, Y .; Ван Овен, М .; Мона, С .; Брауэр, С .; Трент, RJ; Suarkia, D .; Schiefenhovel, W .; Стоункинг, М. (2008). «Влияние австронезийской экспансии: данные по мтДНК и разнообразию Y-хромосомы на Адмиралтейских островах в Меланезии» . Молекулярная биология и эволюция . 25 (7): 1362–74. DOI : 10.1093 / molbev / msn078 . PMID 18390477 .
Scheinfeldt, L .; Friedlaender, F; Фридлендер, Дж; Латам, К; Коки, G; Карафет, Т; Молоток, М; Лоренц, Дж (2006). «Неожиданное изменение хромосомы NRY в Меланезии на Северном острове» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (8): 1628–41. DOI : 10.1093 / molbev / msl028 . PMID 16754639 .
Nagle, N .; и другие. (2015). «Древность и разнообразие аборигенных австралийских Y-хромосом». Американский журнал физической антропологии . 159 (3): 367–81. DOI : 10.1002 / ajpa.22886 . PMID 26515539 .

Внешние ссылки [ править ]

Распространение гаплогруппы M от National Geographic

См. Также [ править ]

Викискладе есть медиафайлы, связанные с гаплогруппой M Y-ДНК .

Генетическая генеалогия
Гаплогруппа
Гаплотип
Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека
Молекулярная филогения
Парагруппа
Субклад
Гаплогруппы Y-хромосомы в популяциях мира
Гаплогруппы Y-ДНК по этнической группе
Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Восточной и Юго-Восточной Азии

Филогенетическое дерево гаплогрупп ДНК Y-хромосомы человека [χ 1] [χ 2] Эта статья нуждается в обновлении . Обновите эту статью, чтобы отразить недавние события или новую доступную информацию. ( Февраль 2021 г. )

	« Y-хромосомный Адам »
		A00	A0-T ^{[χ 3]}
			A0	A1 ^{[χ 4]}
				A1a	A1b
					A1b1	BT
						B	CT
							DE				CF
						D	E		C	F
												F1	F2		F3	GHIJK
																	грамм	HIJK
																		IJK	ЧАС
											IJ	K
								я	J	LT ^{[χ 5]}	K2 ^{[χ 6]}
													L	Т		K2a ^{[χ 7]}	K2b ^{[χ 8]}	K2c	K2d	K2e ^{[χ 9]}
																K-M2313 ^{[χ 10]}		K2b1 ^{[χ 11]}	П ^{[χ 12]}
																НЕТ		S ^{[χ 13]}	M ^{[χ 14]}		P1	P2
															N	О			Q	р

Y-ДНК по населению Y-ДНК гаплогруппы исторических людей Сноски ^ Ван печь М, Ван Geystelen А, Кайзер М, Decorte R, Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Мутация человека . 35 (2): 187–91. DOI : 10.1002 / humu.22468 . PMID 24166809 . ^ Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015 . (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.) ^ Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4). ^ Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4. ^ Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1. ^ В период2002 по 2008 год, Гаплогруппа T-M184 был известен как «гаплогруппы К2». Это имя с тех пор было присвоено K-M526 , брату Haplogroup LT. ^ Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году. (Это последовало за публикацией: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL, et al. (2016) ». в мужской демографии человека выведен из последовательностей по всему миру одна тысячи двести сорок четыре Y-хромосома» . Nature Genetics . 48 (6): 593-9. DOI : 10.1038 / ng.3559 . ПМК 4884158 . PMID 27111036 . В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a». ^ Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы. ^ Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «Гаплогруппа X» и «K2a» (но является родственным субкладом нынешнего K2a). ^ K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Poznik op. соч. ; YFull YTree v5.08 , 2017, «K-M2335» и; PhyloTree , 2017, «Подробная информация о маркерах Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.) ^ Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру. ^ Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2. ^ Гаплогруппа S, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1a. (Ранее название Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.) ^ Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее название Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

[karafet_2010-1] Татьяна М. Карафет, Брайан Холлмарк, Мюррей П. Кокс, Херавати Судойо, Шон Дауни, Дж. Стивен Лансинг и Майкл Ф. Хаммер, «Основное деление Восток-Запад лежит в основе стратификации Y-хромосомы в Индонезии», Molecular Biological Evolution , (2010), т. 27, нет. 8. С. 1833-1844.

[1]