Гистоноподобный белок, структурирующий нуклеоид

Семейство гистонов H-NS

структура раствора домена олигомеризации бактериального белка h-ns, структурирующего хроматин

Идентификаторы

Условное обозначение

Histone_HNS

Pfam

PF00816

ИнтерПро

IPR001801

SCOP2

1hns / SCOPe / SUPFAM

Доступные белковые структуры:
Pfam	структуры / ECOD
PDB	RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsum	краткое изложение структуры

В молекулярной биологии, то гистон-подобный нуклеоиды-структурированию (Н-NS) , белок принадлежит к семейству из бактериальных белков , которые играют роль в формировании нуклеоидов структуры и влиять на экспрессию генов в определенных условиях. ^[1] Белок имеет гомолог, который кодируется многими большими конъюгативными плазмидами. ^[2]

Механизм [ править ]

Основная функция H-NS - влиять на топологию ДНК. Считается, что H-NS достигает этого, образуя комплексы с самим собой и связываясь с различными участками ДНК, объединяя их. ^[3]^[4] Другая важная роль H-NS заключается в выключении экспрессии генов. H-NS регулирует экспрессию генов путем связывания с ДНК, богатой AT, что является общим признаком промоторов и горизонтально приобретенных генов. ^[5] Ослабление подавления H-NS может быть достигнуто путем связывания другого белка или путем изменения топологии ДНК, которое может происходить, например, из-за изменений температуры и осмолярности. ^[3]

H-NS также может взаимодействовать с другими белками и влиять на их функцию, например, он может взаимодействовать с моторным белком жгутика FliG для повышения его активности. ^[6]

Ссылки [ править ]

^ Синдо Н, Иваки Т, Ieda Р, Kurumizaka Н, Ueguchi С, Mizuno T, Морикава S, Накамура Н, Н Кубонива (февраль 1995 г.). «Структура раствора ДНК-связывающего домена нуклеоид-ассоциированного белка, H-NS, из Escherichia coli» . FEBS Lett . 360 (2): 125–31. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (95) 00079-O . PMID 7875316 . S2CID 44479751 .
^ Beloin, C .; Deighan, P .; Дойл, М .; Дорман, CJ (2003-10-01). «Штамм 2457T Shigella flexneri 2a экспрессирует трех членов семейства H-NS-подобных белков: характеристика белка Sfh». Молекулярная генетика и геномика: MGG . 270 (1): 66–77. DOI : 10.1007 / s00438-003-0897-0 . ISSN 1617-4615 . PMID 12898223 . S2CID 305597 .
^ a b Дорман, Чарльз Дж. (май 2004 г.). «H-NS: универсальный регулятор динамического генома». Обзоры природы микробиологии . 2 (5): 391–400. DOI : 10.1038 / nrmicro883 . PMID 15100692 . S2CID 7772634 .
^ Дама, RT; Wyman, C; Гусен, Н. (15 сентября 2000 г.). «Опосредованное H-NS уплотнение ДНК, визуализированное с помощью атомно-силовой микроскопии» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (18): 3504–10. DOI : 10.1093 / NAR / 28.18.3504 . PMC 110753 . PMID 10982869 .
^ Луккини, Саша; Роули, Гэри; Голдберг, Мартин Д .; Херд, Дуглас; Харрисон, Маркус; Хинтон, Джей CD (2006). «H-NS опосредует подавление латерально приобретенных генов у бактерий» . PLOS Патогены . 2 (8): e81. DOI : 10.1371 / journal.ppat.0020081 . PMC 1550270 . PMID 16933988 .
^ Донато, Джина М .; Кавула, Томас Х. (11 сентября 1998 г.). «Усиленное связывание измененного белка H-NS с белком ротора жгутиков FliG вызывает повышенную скорость вращения жгутика и повышенную подвижность жгутиков» . Журнал биологической химии . 273 (37): 24030–24036. DOI : 10.1074 / jbc.273.37.24030 . PMID 9727020 .

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR001801

Эта статья о белках незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid7875316-1] Синдо Н, Иваки Т, Ieda Р, Kurumizaka Н, Ueguchi С, Mizuno T, Морикава S, Накамура Н, Н Кубонива (февраль 1995 г.). «Структура раствора ДНК-связывающего домена нуклеоид-ассоциированного белка, H-NS, из Escherichia coli» . FEBS Lett . 360 (2): 125–31. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (95) 00079-O . PMID 7875316 . S2CID 44479751 .

[2] Beloin, C .; Deighan, P .; Дойл, М .; Дорман, CJ (2003-10-01). «Штамм 2457T Shigella flexneri 2a экспрессирует трех членов семейства H-NS-подобных белков: характеристика белка Sfh». Молекулярная генетика и геномика: MGG . 270 (1): 66–77. DOI : 10.1007 / s00438-003-0897-0 . ISSN 1617-4615 . PMID 12898223 . S2CID 305597 .

[Dorman2004-3] Дорман, Чарльз Дж. (май 2004 г.). «H-NS: универсальный регулятор динамического генома». Обзоры природы микробиологии . 2 (5): 391–400. DOI : 10.1038 / nrmicro883 . PMID 15100692 . S2CID 7772634 .

[4] Дама, RT; Wyman, C; Гусен, Н. (15 сентября 2000 г.). «Опосредованное H-NS уплотнение ДНК, визуализированное с помощью атомно-силовой микроскопии» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (18): 3504–10. DOI : 10.1093 / NAR / 28.18.3504 . PMC 110753 . PMID 10982869 .

[Lucchini2006-5] Луккини, Саша; Роули, Гэри; Голдберг, Мартин Д .; Херд, Дуглас; Харрисон, Маркус; Хинтон, Джей CD (2006). «H-NS опосредует подавление латерально приобретенных генов у бактерий» . PLOS Патогены . 2 (8): e81. DOI : 10.1371 / journal.ppat.0020081 . PMC 1550270 . PMID 16933988 .

[6] Донато, Джина М .; Кавула, Томас Х. (11 сентября 1998 г.). «Усиленное связывание измененного белка H-NS с белком ротора жгутиков FliG вызывает повышенную скорость вращения жгутика и повышенную подвижность жгутиков» . Журнал биологической химии . 273 (37): 24030–24036. DOI : 10.1074 / jbc.273.37.24030 . PMID 9727020 .

[1]