Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с Inoviridae )
Перейти к навигации Перейти к поиску

электронная микрофотография затененного нитчатого бактериофага (иновируса)
Inoviridae
M13B.svg
Представление о нитчатом фаге M13.
Синий: белок пальто pIII
Коричневый: белок пальто pVI
Красный: белок пальто
pVII Лимонно- зеленый: белок пальто pVIII
Фуксия: Coat Proteín pIX
Фиолетовый: одноцепочечная ДНК
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство :Моноднавирия
Королевство:Loebvirae
Тип:Hofneiviricota
Учебный класс:Faserviricetes
Заказ:Tubulavirales
Семья:Inoviridae
Роды

См. Текст

Нитчатый бактериофаг - это семейство вирусов ( Inoviridae ), заражающих бактерии . Фаги названы в честь их нитевидной формы, червеобразной цепи (длинной, тонкой и гибкой, напоминающей длину приготовленных спагетти), диаметром около 6 нм и длиной около 1000-2000 нм. [1] [2] [3] [4] [5]Оболочка вириона включает пять типов вирусного белка, которые локализуются во время сборки фага на внутренней мембране бактерий-хозяев и добавляются к формирующемуся вириону по мере его выхода через мембрану. Простота этого семейства делает его привлекательной модельной системой для изучения фундаментальных аспектов молекулярной биологии, а также доказало свою полезность в качестве инструмента в иммунологии и нанотехнологиях.

Характеристики [ править ]

Собранные основные субъединицы белка оболочки в нитчатом бактериофаге Ff (fd, f1, M13) (род Inovirus ) в разобранном виде.

Нитчатые бактериофаги - одни из самых простых известных живых организмов, у них гораздо меньше генов, чем у классических хвостатых бактериофагов, изученных группой фагов . Семейство включает 29 определенных видов, разделенных на 23 рода. [6] [7] Однако анализ наборов геномных и метагеномных данных с использованием подхода машинного обучения привел к обнаружению 10 295 иновирусоподобных последовательностей почти во всех типах бактерий практически во всех экосистемах, что указывает на то, что эта группа вирусов гораздо более разнообразна и разнообразна. более широко, чем предполагалось изначально. [5]

Три нитчатых бактериофага, fd, f1 и M13, были выделены и охарактеризованы тремя разными исследовательскими группами в начале 1960-х годов, но они настолько похожи, что иногда их объединяют под общим названием «Ff», которое включает в себя род Inovirus, признанный Международным сообществом. Комитет по таксономии вирусов (ICTV). [8] [9] Молекулярная структура нитчатого фага Ff была определена с использованием ряда физических методов, особенно дифракции рентгеновских лучей на волокнах , [2] [10] и дополнительно уточнена с помощью твердотельного ЯМР и криоэлектронной микроскопии . [2] [11]Одноцепочечная ДНК фага Ff проходит по центральному ядру фага и защищена цилиндрической белковой оболочкой, построенной из тысяч идентичных α-спиральных субъединиц основного белка оболочки, кодируемых геном фага 8. Белок гена 8 вставлен в плазматическая мембрана как ранний этап сборки фага. [2]Некоторые штаммы фага имеют «лидерную последовательность» на белке гена 8, чтобы способствовать встраиванию в мембрану, но другим, по-видимому, не требуется лидерная последовательность. Два конца фага закрыты несколькими копиями белков, которые важны для инфицирования бактерий-хозяев, а также для сборки формирующихся фаговых частиц. Эти белки являются продуктами фаговых генов 3 и 6 на одном конце фага и фаговых генов 7 и 9 на другом конце. Исследования дифракции волокон идентифицировали два структурных класса фагов, различающихся деталями расположения белка гена 8. Класс I, включая штаммы fd, f1, M13 рода Inovirus, а также If1 ( вирус Escherichia If1 вида ICTV , род Infulavirus ) [12]и IKe (IKe вируса Salmonella вида ICTV , род Lineavirus ) [13] имеет ось вращения, относящуюся к белкам оболочки гена 8, тогда как класс II, включающий штаммы Pf1 ( вируса Pf1 Pseudomonas вида ICTV из рода Primolicivirus ), [14] Pf3 (Pf3 вируса Pseudomonas вида ICTV из рода Tertilicivirus ), [15] Pf4 и PH75 (из предложенного NCBI вида Thermus фаг PH75 , incertae sedis внутри Inoviridae ), [16]эта ось вращения заменяется осью спирали. Это техническое различие мало влияет на общую структуру фага, но объем независимых дифракционных данных больше для класса симметрии II, чем для класса I. Это помогло определить структуру фага Pf1 класса II [17] и, соответственно, Структура I класса. [10]

ДНК, выделенная из фага fd (рода Inovirus ), является одноцепочечной и топологически представляет собой круг. То есть одиночная цепь ДНК простирается от одного конца фаговой частицы до другого, а затем снова возвращается, чтобы замкнуть круг, хотя две цепи не спарены по основанию. Предполагалось, что эта топология распространяется на все другие нитчатые фаги, но это не относится к фагу Pf4, для которого ДНК в фаге является одноцепочечной, но топологически линейной, а не кольцевой. [11] Во время сборки фага fd ДНК фага сначала упаковывается в линейный внутриклеточный нуклеопротеиновый комплекс с множеством копий белка репликации / сборки гена 5 фага. Затем белок гена 5 замещается белком оболочки гена 8, когда формирующийся фаг экструдируется через плазматическую мембрану бактерии, не убивая бактериального хозяина. [18] [19] [2] [20] Этот белок также связывается с высоким сродством с G-квадруплексными структурами (хотя они не присутствуют в ДНК фага) и с аналогичными шпильчатыми структурами в ДНК фага. [21]

Белок p1 фага Ff (т.е. род Inovirus ), который необходим для сборки фага на мембране, имеет гидрофобный домен, охватывающий мембрану, с N-концевой частью в цитоплазме и C-концевой частью в периплазме (обратное ориентации белка оболочки гена 8). К цитоплазматической стороне трансмембранного домена примыкает последовательность из 13 остатков p1, имеющая набор основных остатков, близко совпадающий с образцом основных остатков около C-конца p8, но инвертированный по отношению к последовательности. Этот механизм сборки делает этот фаг ценной системой для изучения трансмембранных белков . [2] [22] [4] Ген 1, кодирующий АТФазу, [23]представляет собой консервативный маркерный ген, который (наряду с тремя дополнительными генетическими характеристиками) использовался для автоматического обнаружения последовательностей иновирусов. [5]

Жизненный цикл [ править ]

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Проникновение в хозяйскую клетку достигается за счет адсорбции, опосредованной пилусом, в хозяйскую клетку. Репликация следует модели катящегося круга оцДНК. Транскрипция с использованием ДНК-шаблона - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина путем вирусной экструзии. [24] Сборка вируса происходит на внутренней мембране (в случае грамотрицательных бактерий) посредством встроенного в мембрану комплекса моторных белков. [24] Этот мультимерный сборочный комплекс, кодируемый геном 1 (часто называемый ZOT, zonula occludens toxin), представляет собой АТФазу, содержащую функциональные и важные мотивы Walker A и Walker B [23]которые, как считается, опосредуют гидролиз АТФ, обеспечивая энергию для сборки фаговой нити. Нитчатый фаг Cf1t из Xanthomonas campestris (из предложенного NCBI вида Xanthomonas фаг Cf1t , incertae sedis в составе Inoviridae , вероятно, неправильно написан как Cflt) [25], как было показано в 1987 году, интегрируется в геном бактерии-хозяина, и с тех пор такие умеренные нитчатые фаги стали сообщалось, многие из которых были вовлечены в патогенез. [1]

Таксономия [ править ]

Различают следующие роды: [7]

  • Аффертхолерамвирус
  • Бифиливирус
  • Капистривирус
  • Кориовирус
  • Фибровирус
  • Хабенивирус
  • Инфулавирус
  • Иновирус
  • Lineavirus
  • Пархипатевирус
  • Примолицивирус
  • Псекадовирус
  • Restivirus
  • Saetivirus
  • Скутикавирус
  • Стаминивирус
  • Субеминивирус
  • Тертилицивирус
  • Томиксвирус
  • Версовирус
  • Vicialiavirus
  • Вилловирус
  • Ксиливирус

Филогенетические деревья и клады все чаще используются для изучения таксономии [26] Inoviridae. [1] [3] [5] [27]

На основе metagenomical данных, семейство было предложено разделить на новые семьи Amplinoviridae , Protoinoviridae , Photinoviridae , Vespertilinoviridae , Densinoviridae и Paulinoviridae , все в порядке Tubulavirales , конечно. [28]

Известные участники [ править ]

  • фаги рода Inovirus или Ff [8] [9] - они инфицируют Escherichia coli, несущую F-эписому .
  • вид Escherichia virus M13
  • Бактериофаг M13
  • f1 фаг
  • вид Нитчатый бактериофаг fd (предложение)
  • фаг fd
  • род Affertcholeramvirus [29]
  • виды Vibrio virus CTXphi
  • Вибриофаг CTXphi (также известный как бактериофаг CTXφ)
  • род Infulavirus ) [12]
  • вид Escherichia virus If1
  • If1 фаг
  • род Lineavirus [13]
  • виды вируса сальмонеллы IKe
  • IKe фаг
  • род Primolicivirus ) [14]
  • вид Pseudomonas virus Pf1
  • Фаг Pf1
  • род Tertilicivirus ) [15]
  • вид Pseudomonas virus Pf3 - бактериофаги, поражающие синегнойную палочку.
  • Фаг Pf3

Другие известные предлагаемые виды:

  • вид Thermus phage PH75 [16]
  • Фаг PH75
  • вид Xanthomonas phage Cf1t (вероятно, неправильно написан как Cflt) [25]
  • Cf1t фаг

История [ править ]

Нитевидная частица, видимая на электронных микрофотографиях, изначально была неправильно интерпретирована как загрязняющая бактериальные пилусы , но ультразвуковая деградация, которая разрывает гибкие волокна примерно наполовину [30], инактивировала инфекционность, как и предполагалось для морфологии нитчатых бактериофагов. [31] Три нитчатых бактериофага, fd, f1 и M13, были выделены и охарактеризованы тремя различными исследовательскими группами в начале 1960-х годов. Поскольку эти три фага различаются менее чем на 2 процента по своим последовательностям ДНК, что соответствует изменениям только в нескольких десятках кодонов во всем геноме, для многих целей они могут считаться идентичными. [32]Дальнейшая независимая характеристика в последующие полвека была сформирована интересами этих исследовательских групп и их последователей. [2]

Нитчатые фаги, в отличие от большинства других фагов, непрерывно экструдируются через бактериальную мембрану, не убивая хозяина. [20] Генетические исследования M13 с использованием условно летальных мутантов, инициированные Дэвидом Праттом и его коллегами, привели к описанию функций фаговых генов. [33] [34] Примечательно, что белковый продукт гена 5, который необходим для синтеза одноцепочечной ДНК потомства, производится в больших количествах в инфицированных бактериях, [35] [36] [37] и связывается с зарождающаяся ДНК с образованием линейного внутриклеточного комплекса. [18] (Простая нумерация генов с использованием арабских цифр 1,2,3,4 ..., введенная группой Пратта, иногда заменяется практикой использования римских цифр I, II, III, IV ... но номера генов, определяемые две системы одинаковы).

Более длинная (или более короткая) ДНК может быть включена в фаг fd, поскольку во время сборки может быть добавлено больше (или меньше) белковых субъединиц, что требуется для защиты ДНК, что делает фаг удобным для генетических исследований. [38] [39] На длину фага также влияет положительный заряд на длину на внутренней поверхности капсида фага. [40] Геном fd был одним из первых полных геномов, которые были секвенированы. [41]

Таксономия нитчатых бактериофагов была определена Андре Львоффом и Полем Турнье как семейство Inophagoviridae, род I. inophagovirus, вид Inophagovirus bacterii (Inos = волокно или нить по-гречески), с типовым видом фага fd (Hoffmann-Berling). [42] [43] «Фаговирус» является тавтологическим , и название семейства было изменено на Inoviridae, а типовой род - на Inovirus . Эта номенклатура сохранялась в течение многих десятилетий, хотя определение fd как типовых видов было заменено, поскольку M13 стал более широко использоваться для генетических манипуляций [44] [45] и для исследований p8 в мембранно-миметических средах. [2]Количество известных нитчатых бактериофагов многократно увеличилось за счет использования подхода машинного обучения, и было предложено, чтобы «бывшее семейство Inoviridae было переклассифицировано в порядок, предварительно разделив его на 6 семейств-кандидатов и 212 подсемейств-кандидатов». [5] Фаги Fd, f1, М13 и другие родственные фаги часто упоминаются в качестве членов группы Ff фагов, для F специфического (они заражают кишечную палочку , несущие F-эписому ) F ilamentous фагов, используя концепцию общеупотребительного имени . [46]

Нитевидный бактериофаг, сконструированный для отображения иммуногенных пептидов, полезен в иммунологии и более широких биологических приложениях. [47] [48] [49] [50] Джордж Смит и Грег Винтер использовали f1 и fd в своей работе по фаговой индикации, за которую они были удостоены доли Нобелевской премии по химии 2018 года. Ангела Белчер и ее коллеги использовали для создания и использования многих производных M13 для широкого круга целей, особенно в материаловедении . [50] [51] [52] [53] Нитчатый бактериофаг может способствовать толерантности к антибиотикам, образуя жидкокристаллические домены [54] вокруг бактериальных клеток.[55] [11]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c Hay ID, Литгоу Т. (июнь 2019 г.). «Нитчатые фаги: мастера экономики совместного использования микробов» . EMBO Reports . 20 (6): e47427. DOI : 10.15252 / embr.201847427 . PMC  6549030 . PMID  30952693 .
  2. ^ a b c d e f g h Straus SK, Bo HE (2018). Белла Дж. Р., Харрис Д. (ред.). "Белки и сборка нитчатых бактериофагов". Субклеточная биохимия . Springer Singapore. 88 : 261–279. DOI : 10.1007 / 978-981-10-8456-0_12 . ISBN 978-981-10-8455-3. PMID  29900501 .
  3. ^ a b Май-Прохнов А., Хуэй Дж. Г., Кьеллеберг С., Раконжак Дж., Макдугалд Д., Райс С. А. (июль 2015 г.). «Большие вещи в маленьких упаковках: генетика нитчатых фагов и влияние на приспособленность их хозяина» . FEMS Microbiology Reviews . 39 (4): 465–87. DOI : 10.1093 / femsre / fuu007 . PMID 25670735 . 
  4. ^ a b Rakonjac J, Russel M, Khanum S, Brooke SJ, Rajič M (2017). Лим Т.С. (ред.). «Нитчатый фаг: структура и биология». Успехи экспериментальной медицины и биологии . Издательство Springer International. 1053 : 1–20. DOI : 10.1007 / 978-3-319-72077-7_1 . ISBN 978-3-319-72076-0. PMID  29549632 .
  5. ^ a b c d e Roux S, Krupovic M, Daly RA, Borges AL, Nayfach S, Schulz F, et al. (Ноябрь 2019 г.). «Выявлено, что скрытые иновирусы распространены среди бактерий и архей в биомах Земли» . Природная микробиология . 4 (11): 1895–1906. DOI : 10.1038 / s41564-019-0510-х . PMC 6813254 . PMID 31332386 .  
  6. ^ «Вирусная зона» . ExPASy . Проверено 15 июня 2015 года .
  7. ^ а б ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.» . Дата обращения 4 июля 2020 .
  8. ^ a b NCBI: Иновирус (род)
  9. ^ a b ICTV: История таксономии ICTV: Иновирус . 2019 EC 51, Берлин, Германия, июль 2019 года; Ратификация по электронной почте март 2020 г. (MSL # 35).
  10. ^ a b Марвин Д.А., Хейл Р.Д., Неф С, Хелмер-Читтерих М. (январь 1994 г.). «Молекулярные модели и структурные сравнения нативных и мутантных нитчатых бактериофагов I класса Ff (fd, f1, M13), If1 и IKe». Журнал молекулярной биологии . 235 (1): 260–86. DOI : 10.1016 / s0022-2836 (05) 80032-4 . PMID 8289247 . 
  11. ^ a b c Тарафдер А.К., фон Кюгельген А., Меллул А.Дж., Шульце Ю., Аартс Д.Г., Бхарат Т.А. (март 2020 г.). «Жидкокристаллические капли фага образуют окклюзионные оболочки, которые инкапсулируют и защищают инфекционные палочковидные бактерии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 117 (9): 4724–4731. DOI : 10.1073 / pnas.1917726117 . PMC 7060675 . PMID 32071243 .  
  12. ^ a b NCBI: Infulavirus (род)
  13. ^ a b NCBI: Lineavirus (род)
  14. ^ a b NCBI: Primolicivirus (род)
  15. ^ a b NCBI: Tertilicivirus (род)
  16. ^ a b NCBI: Thermus фаг PH75 (виды)
  17. ↑ Марвин Д.А., Брайан Р.К., Неф C (январь 1987 г.). «Иновирус Pf1. Распределение электронной плотности, рассчитанное с помощью алгоритма максимальной энтропии на основе данных дифракции нативного волокна с разрешением 3 A и данных однократного изоморфного замещения с разрешением 5 A». Журнал молекулярной биологии . 193 (2): 315–43. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (87) 90222-1 . PMID 3599076 . 
  18. ^ a b Pratt D, Laws P, Griffith J (февраль 1974 г.). «Комплекс одноцепочечной ДНК бактериофага М13 и белка гена 5». Журнал молекулярной биологии . 82 (4): 425–39. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (74) 90239-3 . PMID 4594145 . 
  19. ↑ Gray CW (июль 1989 г.). «Трехмерная структура комплексов одноцепочечных ДНК-связывающих белков с ДНК. Белки IKe и fd gene 5 образуют левые спирали с одноцепочечной ДНК». Журнал молекулярной биологии . 208 (1): 57–64. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (89) 90087-9 . PMID 2671388 . 
  20. ^ a b Hoffmann Berling H, Maze R (март 1964 г.). «Высвобождение специфических мужских бактериофагов из выживших бактерий-хозяев». Вирусология . 22 (3): 305–13. DOI : 10.1016 / 0042-6822 (64) 90021-2 . PMID 14127828 . 
  21. ^ Wen JD, Серый DM (март 2004). «Одноцепочечный ДНК-связывающий белок гена 5 Ff собирается на нуклеотидах, ограниченных шпилькой ДНК». Биохимия . 43 (9): 2622–34. DOI : 10.1021 / bi030177g . PMID 14992600 . 
  22. ^ Рапоза, депутат; Вебстер Р.Л. (1995). «Продукты гена I и перекрывающегося в рамке гена XI необходимы для сборки нитчатого фага». J. Molec Biol . 248 (3): 627–638. DOI : 10.1006 / jmbi.1995.0247 . PMID 7752229 . 
  23. ^ а б Ло, Белинда; Хаазе, Максимилиан; Мюллер, Лукас; Кун, Андреас; Лептин, Себастьян (9 апреля 2017 г.). «Трансмембранный белок морфогенеза gp1 нитчатых фагов содержит мотивы Walker A и Walker B, необходимые для сборки фагов» . Вирусы . 9 (4): 73. DOI : 10,3390 / v9040073 . PMC 5408679 . PMID 28397779 .  
  24. ^ а б Ло, Белинда; Кун, Андреас; Лептин, Себастьян (май 2019 г.). «Захватывающая биология фагового дисплея: сборка нитчатых фагов» . Молекулярная микробиология . 111 (5): 1132–1138. DOI : 10.1111 / mmi.14187 . PMID 30556628 . 
  25. ^ a b NCBI: фаг Xanthomonas Cf1t (виды)
  26. ^ Исполнительный комитет Международного комитета по таксономии вирусов (май 2020 г.). «Новая область таксономии вирусов: разделение виросферы на 15 иерархических рангов» . Природная микробиология . 5 (5): 668–674. DOI : 10.1038 / s41564-020-0709-х . PMC 7186216 . PMID 32341570 .  
  27. ^ Kazlauskas D, Varsani А, Кунин Е.В., Krupovic М (июль 2019). «Множественное происхождение прокариотических и эукариотических одноцепочечных ДНК-вирусов из бактериальных и архейных плазмид» . Nature Communications . 10 (1): 3425. Bibcode : 2019NatCo..10.3425K . DOI : 10.1038 / s41467-019-11433-0 . PMC 6668415 . PMID 31366885 .  
  28. ^ Саймон Ру, Март Крупович, Ребекка А. Дейли, Адэр Л. Борхес, Стивен Найфах, Фредерик Шульц, Эмили А. Элоэ-Фадрош и др. : Выявлено, что скрытые иновирусы распространены среди бактерий и архей в биомах Земли . В: Nature Microbiology, 22 июля 2019 г., doi: 10.1038 / s41564-019-0510-x
  29. ^ NCBI: Affertcholeramvirus (род)
  30. ^ Freifelder D, Дэвисон PF (май 1962). «Исследования звуковой деградации дезоксирибонуклеиновой кислоты» . Биофизический журнал . 2 (3): 235–47. Bibcode : 1962BpJ ..... 2..235F . DOI : 10.1016 / S0006-3495 (62) 86852-0 . PMC 1366369 . PMID 13894963 .  
  31. Перейти ↑ Marvin DA, Hoffmann-Berling H (1963). «Физико-химические свойства двух новых малых бактериофагов». Природа . 197 (4866): 517–518. Bibcode : 1963Natur.197..517M . DOI : 10.1038 / 197517b0 . S2CID 4224468 . 
  32. ^ Мораг O, G Абрамов, Goldbourt A (декабрь 2011). «Сходства и различия внутри членов семейства Ff вирусов нитчатых бактериофагов». Журнал физической химии B . 115 (51): 15370–9. DOI : 10.1021 / jp2079742 . PMID 22085310 . 
  33. ^ Пратт Д, Tzagoloff Н, Эрдал WS (ноябрь 1966). «Условные летальные мутанты малого нитчатого колифага M13. I. Изоляция, комплементация, уничтожение клеток, время действия цистрона». Вирусология . 30 (3): 397–410. DOI : 10.1016 / 0042-6822 (66) 90118-8 . PMID 5921643 . 
  34. ^ Пратт Д, Tzagoloff Н, Бодойн J (сентябрь 1969). «Условно летальные мутанты небольшого нитчатого колифага M13. II. Два гена белков оболочки». Вирусология . 39 (1): 42–53. DOI : 10.1016 / 0042-6822 (69) 90346-8 . PMID 5807970 . 
  35. ^ Pratt D, Эрдал WS (октябрь 1968). «Генетический контроль синтеза ДНК бактериофага М13». Журнал молекулярной биологии . 37 (1): 181–200. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (68) 90082-X . PMID 4939035 . 
  36. ^ Генри TJ, Пратт D (март 1969). «Белки бактериофага М13» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 62 (3): 800–7. Bibcode : 1969PNAS ... 62..800H . DOI : 10.1073 / pnas.62.3.800 . PMC 223669 . PMID 5257006 .  
  37. Перейти ↑ Alberts B, Frey L, Delius H (июль 1972 г.). «Выделение и характеристика белка гена 5 вирусов нитчатых бактерий». Журнал молекулярной биологии . 68 (1): 139–52. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (72) 90269-0 . PMID 4115107 . 
  38. ^ Herrmann R, Нойгебауер K, Zentgraf H, Schaller H (февраль 1978). «Транспозиция последовательности ДНК, определяющей устойчивость к канамицину, в одноцепочечный геном бактериофага fd». Молекулярная и общая генетика . 159 (2): 171–8. DOI : 10.1007 / bf00270890 . PMID 345091 . S2CID 22923713 .  
  39. ^ Саттар, Садия; Беннетт, Николас Дж .; Вен, Уэсли X .; Guthrie, Jenness M .; Блэквелл, Лен Ф .; Конвей, Джеймс Ф .; Раконяц, Ясна (2015). «Ff-nano, короткие функционализированные наностержни, полученные из нитчатого бактериофага Ff (f1, fd или M13)» . Границы микробиологии . 6 : 316. DOI : 10,3389 / fmicb.2015.00316 . ISSN 1664-302X . PMC 4403547 . PMID 25941520 .   
  40. Перейти ↑ Greenwood J, Hunter GJ, Perham RN (январь 1991). «Регулирование длины нитчатых бактериофагов путем модификации электростатических взаимодействий между белком оболочки и ДНК». Журнал молекулярной биологии . 217 (2): 223–7. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (91) 90534-й . PMID 1992159 . 
  41. ^ Beck E, Sommer R, Auerswald EA, Kurz C, Zink B, Osterburg G и др. (Декабрь 1978 г.). «Нуклеотидная последовательность ДНК бактериофага fd» . Исследования нуклеиновых кислот . 5 (12): 4495–503. DOI : 10.1093 / NAR / 5.12.4495 . PMC 342768 . PMID 745987 .  
  42. ^ Lwoff А, Р Турнье (1966). «Классификация вирусов». Ежегодный обзор микробиологии . 20 (1): 45–74. DOI : 10.1146 / annurev.mi.20.100166.000401 . PMID 5330240 . 
  43. ^ Matthews RE (1982). «Классификация и номенклатура вирусов. Четвертый доклад Международного комитета по таксономии вирусов» . Интервирология . 17 (1–3): 1–199. DOI : 10.1159 / 000149278 . PMID 6811498 . 
  44. ^ Мессинг, Иоахим (1991). «Клонирование в фаге M13 или как использовать биологию в лучшем виде» . Джин . 100 : 3–12. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (91) 90344-B . ISSN 0378-1119 . PMID 2055478 .  
  45. ^ Мессинг, Иоахим (1996). «Клонирование одноцепочечной ДНК». Молекулярная биотехнология . 5 (1): 39–47. DOI : 10.1007 / BF02762411 . PMID 8853015 . S2CID 33495106 .  
  46. ^ Gibbs AJ, Харрисон BD, Ватсон DH, Wildy P (январь 1966). «Что в названии вируса?». Природа . 209 (5022): 450–4. Bibcode : 1966Natur.209..450G . DOI : 10.1038 / 209450a0 . PMID 5919575 . S2CID 4288812 .  
  47. ^ Смит GP (июнь 1985). «Нитевидный слитый фаг: новые векторы экспрессии, которые отображают клонированные антигены на поверхности вириона». Наука . 228 (4705): 1315–7. Bibcode : 1985Sci ... 228.1315S . DOI : 10.1126 / science.4001944 . PMID 4001944 . 
  48. ↑ Prisco A, De Berardinis P (24 апреля 2012 г.). «Нитчатый бактериофаг fd как система доставки антигена в вакцинации» . Международный журнал молекулярных наук . 13 (4): 5179–94. DOI : 10.3390 / ijms13045179 . PMC 3344273 . PMID 22606037 .  
  49. ^ Sioud M (апрель 2019). «Библиотеки фаговых дисплеев: от связующих веществ до адресной доставки лекарств и терапии для человека». Молекулярная биотехнология . 61 (4): 286–303. DOI : 10.1007 / s12033-019-00156-8 . PMID 30729435 . S2CID 73434013 .  
  50. ^ а б Генри К.А., Арбаби-Гахруди М, Скотт Дж. К. (2015). «Помимо фагового дисплея: нетрадиционные применения нитчатого бактериофага в качестве носителя вакцины, терапевтического биологического средства и основы для биоконъюгации» . Границы микробиологии . 6 : 755. DOI : 10,3389 / fmicb.2015.00755 . PMC 4523942 . PMID 26300850 .  
  51. ^ Casey JP, Барберо RJ, Heldman N, Белчер AM (ноябрь 2014). «Универсальная активность ферментов de novo в капсидных белках из библиотеки сконструированных бактериофагов M13». Журнал Американского химического общества . 136 (47): 16508–14. DOI : 10.1021 / ja506346f . PMID 25343220 . 
  52. ^ О Д, Ци Дж, Хан Би, Чжан Джи, Карни Т.Дж., Омура Дж и др. (Август 2014 г.). «M13 вирус-направленный синтез наноструктурированных оксидов металлов для литий-кислородных аккумуляторов». Нано-буквы . 14 (8): 4837–45. Bibcode : 2014NanoL..14.4837O . DOI : 10.1021 / nl502078m . PMID 25058851 . 
  53. ^ Dorval Courchesne NM, Klug MT, Huang KJ, Weidman MC, Cantú VJ, Chen PY и др. (Июнь 2015 г.). «Создание многофункциональных нанопористых композитов на основе вирусов для тонкопленочных солнечных элементов: вклад морфологии и оптики в генерацию фототока». Журнал физической химии C . 119 (25): 13987–4000. DOI : 10.1021 / acs.jpcc.5b00295 . hdl : 1721,1 / 102981 . ISSN 1932-7447 . 
  54. ^ Dogic Z (30 июня 2016). "Нитевидные фаги как модельная система в физике мягкого вещества" . Границы микробиологии . 7 : 1013. DOI : 10,3389 / fmicb.2016.01013 . PMC 4927585 . PMID 27446051 .  
  55. ^ Secor PR, Дженнингс Л.К., Майклз Л.А., Свири Дж. М., Сингх П. К., Parks WC, Bollyky PL (декабрь 2015 г.). «Матрица биопленки Pseudomonas aeruginosa в жидкий кристалл» . Микробная клетка . 3 (1): 49–52. DOI : 10.15698 / mic2016.01.475 . PMC 5354590 . PMID 28357315 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Вирусная зона : Inoviridae
  • ICTV
  • EcoliWiki
  • Microbewiki
  • ViralZone : Inoviridae