Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Изохоризмат-синтаза
Изохоризмат Synthase.png
Мультяшный вид Ishochorismate Synthase (2 подразделения)
Идентификаторы
ЕС нет.5.4.4.2
№ CAS37318-53-9
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
BRENDABRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
Структуры PDB RCSB PDB PDBe PDBsum
Поиск
ЧВКстатьи
PubMedстатьи
NCBIбелки

Изохоризматсинтаза ( номер EC 5.4.4.2 ) представляет собой фермент изомеразу, который катализирует первый этап биосинтеза витамина К 2 (менахинона) в Escherichia coli . [1]

Реакция [ править ]

Изохоризматсинтаза принадлежит к семейству ферментов изомераз. Более конкретно, ее классифицируют как внутримолекулярную трансферазу, поскольку она переносит гидроксигруппу хоризмата между атомами углерода. [2]

Изохоризмат-синтаза катализирует необратимое превращение хоризмата в изохоризмат :

Изохоризмат Синтаза Rxn.png

Изохоризматсинтаза наиболее активна при 37 ° C и pH от 7,5 до 8. Для нее требуется Mg 2+ в качестве кофактора в концентрации от 100 мкМ до 1 мМ. [1] Ингибиторы изохоризматсинтазы включают:

  • (4 R , 5 R ) -4-гидрокси-5- (1-карбоксивинилокси) циклогекс-1-енкарбоксилат
  • (4 R , 5 R ) -4-гидрокси-5-карбоксиметокси-циклогекс-1-енкарбоксилат
  • (4 R , 5 R ) -5- (2-карбоксиаллилокси) -4-гидроксициклогекс-1-енкарбоксилат
  • (4 R , 5 R , 6 S ) -6-аммонио-5 - [(1-карбоксилатэтенил) окси] -4-гидроксициклогекс-1-ен-1-карбоксилат
  • (4 R , 5 R , 7 R ) -5- (1-карбоксиэтокси) -4-гидроксициклогекс-1-енкарбоксилат
  • (4 R , 5 R , 7 S ) -5- (1-карбоксиэтокси) -4-гидроксициклогекс-1-енкарбоксилат
  • (4 R , 5 S , 6 S ) -4-аммонио-5 - [(1-карбоксилатэтенил) окси] -6-гидроксициклогекс-1-ен-1-карбоксилат
  • (4 R , 5 S , 6 S ) -5 - [(1-карбоксилатэтенил) окси] -4,6-дигидроксициклогекс-1-ен-1-карбоксилат [3]
  • Cu 2+
  • Hg 2+
  • K +
  • Mg 2+ в концентрациях более 1 мМ
  • N- этилмалеимид

Номенклатура [ править ]

Систематическое название данного фермента isochorismate hydroxymutase, а общее название isochorismate синтазы. Другие названия этого фермента включают:

  • Изохоризмат мутаза
  • Менахинон-специфическая изохоризматсинтаза
  • MenF

Пути [ править ]

MenF - это ген, который кодирует изохоризматсинтазу, обнаруженную в пути менахинона у Escherichia coli , не следует принимать за ген entC, который кодирует изохоризматсинтазу, обнаруженную в пути энтеробактина у Escherichia coli . [1] Этот фермент катализирует первый этап биосинтеза салициловой кислоты у синегнойной палочки . [4] Изохоризматсинтаза имеет несколько других гомологов, обнаруженных у других организмов. Это включает:

Гены ферментов / названия ферментовОрганизмы
ICS
  • Arabidopsis thaliana
  • Цианидий кальдарий
  • Глицин макс
  • Nicotiana benthamiana
  • Populus fremontil
  • Populus angustifolia
  • Populus tremuloides
ICS1
  • Arabidopsis thaliana
Продукт гена ICS1
  • Arabidopsis thaliana
  • Цианидий кальдарий
ICS2
  • Arabidopsis thaliana
Изохоризмат-синтаза
  • Arabidopsis thaliana
  • Цианидий кальдарий
  • Глицин макс
Изохоризмат-синтаза 1
  • Arapidopsis thaliana
МБТЛ
  • Микобактерии туберкулеза
ПЧА
  • Синегнойная палочка

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c Дарувала Р., Бхаттачарья Д.К., Квон О, Меганатан Р. (май 1997 г.). «Биосинтез менахинона (витамина К2): сверхэкспрессия, очистка и характеристика новой изохоризматсинтазы из Escherichia coli» . Журнал бактериологии . 179 (10): 3133–8. DOI : 10.1128 / jb.179.10.3133-3138.1997 . PMC  179089 . PMID  9150206 .
  2. ^ "EC 5.4.4.2" . IUBMB . Проверено 30 ноября 2014 года .
  3. ^ Payne RJ, Буллок Е.М., Тоскано М.М., Джонс М.А., Kerbarh O, Abell C (июнь 2009). «Синтез и оценка аналогов 2,5-дигидрохоризмата как ингибиторов ферментов, утилизирующих хоризмат» . Органическая и биомолекулярная химия . 7 (11): 2421–9. DOI : 10.1039 / B901694E . PMID 19462053 . 
  4. ^ Гейл (9 мая 2003). «Изохоризмат-синтаза (PchA), первый и ограничивающий скорость фермент в биосинтезе салицилата синегнойной палочки» . Журнал биологической химии .