Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Доступен ряд сетевых нейробиологических баз данных, которые предоставляют информацию об экспрессии генов , нейронах , макроскопической структуре мозга, а также неврологических или психических расстройствах. Некоторые базы данных содержат описательные и числовые данные, некоторые - о функциях мозга, другие предлагают доступ к «необработанным» данным визуализации, таким как посмертные срезы мозга или изображения 3D MRI и fMRI . Некоторые фокусируются на человеческом мозге, другие - на нечеловеческом.

По мере роста количества баз данных, которые стремятся распространять информацию о структуре, развитии и функциях мозга, растет потребность в сопоставлении самих этих ресурсов. В результате в настоящее время существуют базы данных нейробиологических баз данных, некоторые из которых насчитывают более 3000 записей. [1]

Базы данных неврологии [ править ]

Базы данных неврологии [ править ]

Агрегаторы статей по неврологии [ править ]

Канал по неврологии на RightRelevance. [38]

См. Также [ править ]

  • Нейроинформатика
  • Будапешт Справочный Коннектом

Ссылки [ править ]

  1. ^ "Количество записей, использующих поисковый запрос" база данных " " . neuinfo.org . НИФ . Дата обращения 25 января 2015 .
  2. ^ Lein ES, Hawrylycz MJ, Ao N, Ayres M, Bensinger A, Bernard A и др. (Январь 2007 г.). «Полногеномный атлас экспрессии генов в мозге взрослой мыши». Природа . 445 (7124): 168–76. Bibcode : 2007Natur.445..168L . DOI : 10,1038 / природа05453 . PMID 17151600 . S2CID 4421492 .  
  3. ^ Джек CR, Бернштейн MA, Фокс NC, Томпсон P, Александр G, Харви D и др. (Апрель 2008 г.). «Инициатива по нейровизуализации болезни Альцгеймера (ADNI): методы МРТ» . Журнал магнитно-резонансной томографии . 27 (4): 685–91. DOI : 10.1002 / jmri.21049 . PMC 2544629 . PMID 18302232 .  
  4. ^ Амунц К, Лепаж С, Borgeat л, Mohlberg Н, Dickscheid Т, Руссо М.Е., и др. (Июнь 2013). «BigBrain: 3D-модель человеческого мозга сверхвысокого разрешения» . Наука . 340 (6139): 1472–5. Bibcode : 2013Sci ... 340.1472A . DOI : 10.1126 / science.1235381 . PMID 23788795 . S2CID 14122170 .  
  5. ^ Кемптона MJ, Геддес JR, Эттингер U, Williams SC, Grasby PM (сентябрь 2008). «Мета-анализ, база данных и мета-регрессия 98 исследований структурной визуализации при биполярном расстройстве» . Архив общей психиатрии . 65 (9): 1017–32. DOI : 10,1001 / archpsyc.65.9.1017 . PMID 18762588 . 
  6. ^ Сераг А., Альджабар П., Болл Г., Конселл С.Дж., Бордман Дж. П., Резерфорд М. А. и др. (Февраль 2012 г.). «Построение последовательного пространственно-временного атласа высокого разрешения развивающегося мозга с использованием адаптивной ядерной регрессии». NeuroImage . 59 (3): 2255–65. DOI : 10.1016 / j.neuroimage.2011.09.062 . PMID 21985910 . S2CID 9747334 .  
  7. ^ Szalkai В, Kerepesi С, Варга В, Grolmusz V (февраль 2017 г.). «Параметризуемые консенсусные коннектомы из проекта Human Connectome: Будапештский эталонный сервер Connectome v3.0» . Когнитивная нейродинамика . 11 (1): 113–116. arXiv : 1602.04776 . DOI : 10.1007 / s11571-016-9407-Z . PMC 5264751 . PMID 28174617 .  
  8. Перейти ↑ Laird AR, Lancaster JL, Fox PT (2005). «BrainMap: социальная эволюция базы данных картирования человеческого мозга» (PDF) . Нейроинформатика . 3 (1): 65–78. DOI : 10.1385 / NI: 3: 1: 065 . PMID 15897617 .  
  9. ^ Микула S, Trotts I, Stone JM, Jones EG (март 2007). «Картирование мозга с высоким разрешением и виртуальная микроскопия с помощью Интернета» . NeuroImage . 35 (1): 9–15. DOI : 10.1016 / j.neuroimage.2006.11.053 . PMC 1890021 . PMID 17229579 .  
  10. ^ Okano Н, Sasaki Е, Yamamori Т, Iriki А, Shimogori Т, Yamaguchi Y, Касаи К, Мияваки А (ноябрь 2016). "Мозг / РАЗУМЫ: Японский национальный проект мозга для мартышек нейробиологии" . Нейрон . 92 (3): 582–590. DOI : 10.1016 / j.neuron.2016.10.018 . PMID 27809998 . 
  11. Перейти ↑ Nielsen, FA (2003). База данных Brede: небольшая база данных для функциональной нейровизуализации NeuroImage 19 (2), представленная на 9-й Международной конференции по функциональному картированию человеческого мозга, 19-22 июня 2003 г., Нью-Йорк, штат Нью-Йорк.
  12. ^ Пападопулос Орфанос D, Мишель В, Шварц У, Р Пинель, Морено А, Ле Бьян D, Frouin V (январь 2017 г.). «База данных Brainomics / Localizer» . NeuroImage . 144 (Pt B): 309–314. DOI : 10.1016 / j.neuroimage.2015.09.052 . PMID 26455807 . S2CID 13004274 .  
  13. ^ Тышка JM, Pauli WM (ноябрь 2016). «Выделение in vivo подразделений амигдалоидного комплекса человека в групповом шаблоне с высоким разрешением» . Картирование человеческого мозга . 37 (11): 3979–3998. DOI : 10.1002 / hbm.23289 . PMC 5087325 . PMID 27354150 .  
  14. ^ Кларк К., Вендт Б., Смит К., Фрейманн Дж., Кирби Дж., Коппель П. и др. (Декабрь 2013). «Архив визуализации рака (TCIA): поддержка и управление хранилищем общедоступной информации» . Журнал цифровой обработки изображений . 26 (6): 1045–57. DOI : 10.1007 / s10278-013-9622-7 . PMC 3824915 . PMID 23884657 .  
  15. ^ Сато А, Секине У, Сарута С, Nishibe Н, Н Морита, Сато Y, Sadakata Т, Шинода У, Т Кодзима, Фуруичи Т (октябрь 2008 г.). «База данных транскриптомов развития мозжечка (CDT-DB): профилирование пространственно-временной экспрессии генов во время постнатального развития мозжечка мыши». Нейронные сети . 21 (8): 1056–69. DOI : 10.1016 / j.neunet.2008.05.004 . PMID 18603407 . 
  16. Van Horn JD, Grethe JS, Kostelec P, Woodward JB, Aslam JA, Rus D, Rockmore D, Gazzaniga MS (2001) Центр данных функциональной магнитно-резонансной томографии (fMRIDC): проблемы и преимущества крупномасштабной базы данных нейровизуализации изучает Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 29 августа; 356 (1412): 1323-39
  17. ^ «Гиппокампом» . hippocampome.org . Проверено 10 августа +2016 .
  18. ^ Wheeler DW, White CM, CL Rees, Комендантов А.О., Гамильтон DJ, Асколи GA (сентябрь 2015). «Hippocampome.org: база знаний о типах нейронов в гиппокампе грызунов» . eLife . 4 : e09960. DOI : 10.7554 / eLife.09960 . PMC 4629441 . PMID 26402459 .  
  19. ^ Амунц K, Zilles K (декабрь 2015). «Архитектоническое картирование человеческого мозга за пределами Бродмана» . Нейрон . 88 (6): 1086–1107. DOI : 10.1016 / j.neuron.2015.12.001 . PMID 26687219 . 
  20. ^ Zilles K, Амунц K (февраль 2010). «Столетие карты Бродмана - зачатие и судьба». Обзоры природы. Неврология . 11 (2): 139–45. DOI : 10.1038 / nrn2776 . PMID 20046193 . S2CID 5278040 .  
  21. ^ "Домашняя страница Атласа Кимата" . Киматский атлас . Кембриджский университет . Проверено 11 декабря 2015 .
  22. ^ Кемптона МДж, Сальвадор Z, Munafò М.Р., Джеддес JR, Симмонс А, Frangou С, и др. (Июль 2011 г.). «Структурные нейровизуализационные исследования при большом депрессивном расстройстве. Мета-анализ и сравнение с биполярным расстройством» . Архив общей психиатрии . 68 (7): 675–90. DOI : 10.1001 / archgenpsychiatry.2011.60 . PMID 21727252 . см. также базу данных МРТ на сайте www.depressiondatabase.org
  23. ^ Shimogori Т, Эйбы А, Перейти Y, Hashikawa Т, Kishi Н, Кикучи СС, Kita Y, Ниие К, Nishibe Н, Okuno М, Saga К, Sakurai М, Сато М, Сэридзав Т, Сузуки S, Такахаш Е, Танака M, Tatsumoto S, Toki M, UM, Wang Y, Windak KJ, Yamagishi H, Yamashita K, Yoda T, Yoshida AC, Yoshida C, Yoshimoto T., Okano H (март 2018). «Цифровой генный атлас мозга новорожденных обыкновенных мартышек». Neurosci Res . 128 : 1–13. DOI : 10.1016 / j.neures.2017.10.009 . PMID 29111135 . S2CID 3735944 .  
  24. Rosen GD, Williams AG, Capra JA, Connolly MT, Cruz B, Lu L, Airey DC, Kulkarni K, Williams RW (2000) The Mouse Brain Library @ www.mbl.org. Международная конференция по геному мышей, 14: 166. www.mbl.org.
  25. ^ Трипати, Шриджой; Геркин, Ричард. «НейроЭлектро» . www.neuroelectro.org . Проверено 10 августа +2016 .
  26. ^ Асколи Г.А., Донохью DE, Halavi M (август 2007). «NeuroMorpho.Org: центральный ресурс по морфологии нейронов» . Журнал неврологии . 27 (35): 9247–51. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.2055-07.2007 . PMC 6673130 . PMID 17728438 .  
  27. ^ Мирский JS, Надкарни PM, MD Хили, Миллер PL, Shepherd GM (июль 1998). «Инструменты базы данных для интеграции и поиска данных о свойствах мембран, коррелирующих с морфологией нейронов». Журнал методов неврологии . 82 (1): 105–21. DOI : 10.1016 / S0165-0270 (98) 00049-1 . PMID 10223520 . S2CID 12871618 .  
  28. ^ Маркус DS, Ван TH, Паркер J, Чернански JG, Моррис JC, Бакнер RL (сентябрь 2007). «Серия исследований изображений открытого доступа (OASIS): данные поперечного сечения МРТ у пожилых людей молодого, среднего возраста, недемольных и слабоумных пожилых людей» . Журнал когнитивной неврологии . 19 (9): 1498–507. DOI : 10.1162 / jocn.2007.19.9.1498 . PMID 17714011 . S2CID 10840552 .  
  29. ^ Poldrack RA, Барш DM, Mitchell JP, Вейджер ТД, Вагнер А.Д., Девлин JT, Кумба C, Koyejo O, Milham MP (июль 2013). «К открытому обмену данными ФМРТ на основе задач: проект OpenfMRI» . Границы нейроинформатики . 7 (12): 12. DOI : 10,3389 / fninf.2013.00012 . PMC 3703526 . PMID 23847528 .  
  30. ^ Niso G, Роджерс С, Moreau JT, Чен Л.Я., Маджар С, Дас С, и др. (Январь 2016 г.). "OMEGA: Открытый архив MEG". NeuroImage . 124 (Pt B): 1182–7. DOI : 10.1016 / j.neuroimage.2015.04.028 . PMID 25896932 . 
  31. ^ Labus JS, Naliboff В, Килпэтрик л, Лю С, Аш-McNalley С, дос Сантос ИК, и др. (Январь 2016 г.). «Сеть визуализации боли и интероцепции (PAIN): мультимодальное, многоузловое хранилище изображений мозга для хронических соматических и висцеральных болевых расстройств» . NeuroImage . 124 (Pt B): 1232–7. DOI : 10.1016 / j.neuroimage.2015.04.018 . PMC 4627849 . PMID 25902408 .  
  32. Перейти ↑ Conrad MS, Sutton BP, Dilger RN, Johnson RW (сентябрь 2014 г.). "Усредненная коллекция мозга новорожденного поросенка (Sus scrofa) на основе трехмерной магнитно-резонансной томографии in vivo" . PLOS ONE . 9 (9): e107650. Bibcode : 2014PLoSO ... 9j7650C . DOI : 10.1371 / journal.pone.0107650 . PMC 4177841 . PMID 25254955 .  
  33. ^ Ван Л., Альперт К.И., Калхун В.Д., Кобиа Д.Д., Кеатор Д.Б., Кинг М.Д. и др. (Январь 2016 г.). «SchizConnect: медиация баз данных нейровизуализации по шизофрении и родственным расстройствам для крупномасштабной интеграции» . NeuroImage . 124 (Pt B): 1155–67. DOI : 10.1016 / j.neuroimage.2015.06.065 . PMC 4651768 . PMID 26142271 .  
  34. Obeid I, Picone J (13 мая 2016 г.). "Корпус данных ЭЭГ больницы Темплского университета" . Границы неврологии . 10 : 196. DOI : 10,3389 / fnins.2016.00196 . PMC 4865520 . PMID 27242402 .  
  35. ^ Lüsebrink Р, Sciarra А, Мэттерн Н, Якупов R, Спек O (март 2017 г.). «1-взвешенный набор данных МРТ всего мозга человека in vivo со сверхвысоким изотропным разрешением 250 мкм» . Научные данные . +4 (170032): 170032. Bibcode : 2017NatSD ... 470032L . DOI : 10.1038 / sdata.2017.32 . PMC 5349250 . PMID 28291265 .  
  36. ^ Горголевского КДж, Varoquaux G, G Ривера, Шварц Y, Гоши С.С., Maumet М, Николс ТЕ, Poldrack Р.А., Полина Дж, Яркони Т, Маргулис DS (октябрь 2014). «NeuroVault.org: Интернет-хранилище для сбора и обмена статистическими картами человеческого мозга без обновления». bioRxiv 10.1101 / 010348 . 
  37. ^ Гарднер Д., Акил Х, Асколи Г.А., Боуден Д.М., Жук В., Донохью Д.Э. и др. (Сентябрь 2008 г.). «Информационная структура нейробиологии: среда данных и знаний для нейробиологии» . Нейроинформатика . 6 (3): 149–60. DOI : 10.1007 / s12021-008-9024-Z . PMC 2661130 . PMID 18946742 .  
  38. ^ «Правильная релевантность: неврология» . www.rightrelevance.com . Правильная актуальность . Проверено 10 августа +2016 .