Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
BrainMaps
BrainMaps treewidget.jpg
Содержание
ОписаниеИнтерактивный масштабируемый цифровой атлас мозга высокого разрешения
Типы данных
захвачены		Нейроанатомия , Гистология
Организмывключает: человека, обезьяну, кошку, мышь, опоссум, золотую рыбку, утконоса, собаку, сову, курицу, крысу и т. д.
Доступ
Интернет сайтhttp://brainmaps.org/
Разное
ЛицензияАвторские права на все наборы данных изображений принадлежат их соответствующим владельцам, если не указано иное, кампусу UC Regents Davis . [1]
Ниссля окрашивали , Chlorocebus aethiops мозг в BrainMaps.org.
а : выбор из нескольких сотен корональных разрезов .
b : показан определенный корональный разрез.
c : увеличение островковой области коры .
d : дальнейшее увеличение островковой коры. Видны нейроны, окрашенные по Нисслю . Доступ к этому фрагменту можно получить по этой ссылке. [1]

BrainMaps - это финансируемый Национальным институтом здравоохранения интерактивный цифровой атлас мозга с высоким разрешением и виртуальным микроскопом с возможностью масштабирования, который основан на более чем 140 миллионов мегапикселей (140 терабайт) сканированных изображений серийных срезов мозга как приматов, так и не приматов и интегрирован с высокоскоростная база данных для запросов и извлечения данных о структуре и функциях мозга через Интернет.

В настоящее время представлены полные наборы данных атласа мозга по 16 видам; некоторые из них: Macaca mulatta , Chlorocebus aethiops , Felis silvestris catus , Mus musculus , Rattus norvegicus и Tyto alba .

С 2005 по 2011 год главным исследователем проекта был нейробиолог из Калифорнийского университета в Дэвисе Тед Джонс , после чего роль взял на себя У. Мартин Усри.

Описание [ править ]

BrainMaps использует форматы изображений с разным разрешением для представления массивных изображений мозга и интерфейс пользователя dHTML / Javascript для навигации по изображениям, что аналогично тому, как Google Maps работает с геопространственными данными.

BrainMaps - одна из самых крупных онлайн-баз данных по нейробиологии и репозиториев изображений, в которой представлен самый высокий из когда-либо созданных атлас мозга. [2] [3]

Расширения интерактивной трехмерной визуализации были разработаны с помощью настольных приложений на основе OpenGL . [4] Бесплатные инструменты анализа изображений позволяют конечным пользователям анализировать онлайн-изображения на субнейронном уровне. BrainMaps использовался как в исследованиях [5] [6], так и в дидактических целях.

Дополнительные изображения [ править ]

  • Массивные изображения мозга форматируются как пирамиды изображений с разным разрешением, что обеспечивает быструю навигацию путем загрузки небольших фрагментов изображения вместо всего изображения.

  • Наборы данных как функция видов на BrainMaps.

См. Также [ править ]

  • Список баз данных неврологии
  • Проект человеческого мозга
  • NeuroNames
  • Мышиный мозг

Ссылки [ править ]

  1. ^ Условия использования , BrainMaps.org Дата доступа: 11февраля 2014 г.
  2. ^ Микула, S; Рыси I; Stone JM; Джонс EG (2007). «Картирование мозга высокого разрешения и виртуальная микроскопия с подключением к Интернету» . NeuroImage . 35 (1): 9–15. DOI : 10.1016 / j.neuroimage.2006.11.053 . PMC  1890021 . PMID  17229579 .
  3. ^ Микула, S; Stone JM; Джонс EG (2008). "BrainMaps.org - Интерактивные цифровые атласы мозга высокого разрешения и виртуальная микроскопия" . Мозги умы СМИ . 3 : bmm1426. PMC 2614326 . PMID 19129928 .  
  4. ^ Троттс, я; Mikula S; Джонс EG (2007). «Интерактивная визуализация стопок изображений с разным разрешением в 3D» . NeuroImage . 35 (3): 1038–43. DOI : 10.1016 / j.neuroimage.2007.01.013 . PMC 2492583 . PMID 17336095 .  
  5. ^ Микула, S; Менеджер по связям с общественностью; Джонс EG (2007). «Таламус монотремы: цито- и миелоархитектура и химическая нейроанатомия» . Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci . 363 (1502): 2415–40. DOI : 10.1098 / rstb.2007.2133 . PMC 2606803 . PMID 17553780 .  
  6. ^ Микула, S; Пэрриш СК; Триммер JS; Джонс EG (2009). «Полная трехмерная визуализация стриосом приматов с помощью иммуноокрашивания KChIP1» . J Comp Neurol . 514 (5): 507–17. DOI : 10.1002 / cne.22051 . PMC 2737266 . PMID 19350670 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • BrainMaps.org
  • BrainMaps, опубликованные в журнале Science Magazine
  • Изображения BrainMaps, представленные в статье журнала Discover «10 неразгаданных тайн мозга»
  • Публикации, связанные с BrainMaps