Лютеовирусный кэп-независимый элемент трансляции
| Лютеовирусный кэп-независимый элемент трансляции (BTE) | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности BTE | |
| Идентификаторы | |
| Условное обозначение | BTE |
| Рфам | RF00434 |
| Другие данные | |
| тип РНК | Цис-reg |
| Домен (ы) | Вирусы |
| ТАК | SO:0000233 |
| Структуры PDB | PDBe |
Кэп-независимый трансляционный элемент (BTE) , подобный вирусу желтой карликовости ячменя , представляет собой элемент РНК, обнаруженный в 3'-UTR некоторых лютеовирусов . Этот элемент обеспечивает трансляцию геномной РНК и субгеномной РНК1 (sgRNA1). [1]
BTE имеют консенсусную последовательность GGAUCCUGGGAAACAGG, встроенную в серии из трех-шести петель-стеблей, исходящих из центральной втулки.
Было обнаружено, что BTE связывается с eIF4G и слабо с eIF4E (белками, участвующими в инициации трансляции). [2] BTE позволяет инициировать трансляцию мРНК без кэпа 7 мГ (необходимого для трансляции в большинстве эукариотических мРНК). Существуют и другие формы кэп-независимых элементов трансляции (CITE) (в основном, в вирусах растений из родов лютеовирусов, некровирусов, диантовирусов и умбравирусов вирусов растений , но также и в некоторых мРНК хозяина; в частности, многие мРНК теплового шока не имеют кэпа 7 мГ, но все же переведено). Общая цель BTE и других CITE состоит в том, чтобы получить рибосому .чтобы начать трансляцию без крышки 7mG. В случае BTE он «обманывает» eIF4F (eIF4E, eIF4G являются частями eIF4F), чтобы «сообщить» рибосоме о наличии кепки 7 мГ.
Рекомендации
- ↑ Миллер В.А., Ван З., Тредер К. (декабрь 2007 г.). «Удивительное разнообразие кэп-независимых элементов трансляции в 3'-нетранслируемых областях растительных вирусных РНК» . Труды биохимического общества . 35 (часть 6): 1629–1633. DOI : 10.1042/ BST0351629 . ПМС 3081161 . PMID 18031280 .
- ^ Тредер К., Кнеллер Э.Л., Аллен Э.М., Ван З., Браунинг К.С., Миллер В.А. (январь 2008 г.). «3'-кэп-независимый элемент трансляции вируса желтой карликовости ячменя связывает eIF4F через субъединицу eIF4G, чтобы инициировать трансляцию» . РНК . 14 (1): 134–47. doi : 10.1261/rna.777308 . ПМК 2151041 . PMID 18025255 .
Внешние ссылки
- Страница элемента трансляции, независимого от крышки лютеовируса (BTE) в Rfam
- Цис-регуляторные элементы РНК
- Заготовки по молекулярной и клеточной биологии
