Майкл Грибсков - профессор биологических и компьютерных наук в Университете Пердью . В 1979 году Грибсков окончил Орегонский государственный университет со степенью бакалавра наук с отличием в области биохимии и биофизики. Позже, в 1985 году, он получил степень доктора философии по молекулярной биологии в Университете Висконсин-Мэдисон . [1]
Он служил в качестве президента Международного общества по вычислительной биологии , [2] и его факультета страниц гласит , что он является председателем белка информационных ресурсов научно надзора и Консультативного совета, и на редколлегий журналов биоинформатики , Журнал вычислительной Биология и химия , а также журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии . [1]
Год | Позиция |
---|---|
1979 г. | Бакалавр с отличием в области биохимии и биофизики Государственный университет Орегона |
1979–1984 | Грант NIH на преддипломную подготовку университет Висконсин-Мэдисон |
1985 г. | Кандидат наук. в Университете молекулярной биологии Висконсин-Мэдисон |
1985–1987 | Постдокторантура Американского онкологического общества Калифорнийский университет в Лос-Анджелесе |
1988–1992 | Научный сотрудник Национального института рака - FCRDC |
1992 г. | Штатный научный сотрудник Суперкомпьютерного центра Сан-Диего |
1993–1996 | Старший научный сотрудник Суперкомпьютерного центра Сан-Диего |
1993–1999 | Адъюнкт-профессор биологии Калифорнийского университета, Сан-Диего |
1994–1997 | Структурные запросы главного исследователя к базам данных нуклеиновых кислот |
1999–2003 гг. | Адъюнкт-профессор биологии Калифорнийского университета, Сан-Диего |
2004 – настоящее время | Профессор биологии и информатики Университета Пердью |
Анализ профиля [ править ]
Грибсков вместе с Дэвидом Айзенбергом и Эндрю Маклахланом представил метод анализа профиля в 1987 году; это метод обнаружения отдаленно родственных белков путем сравнения последовательностей. Профиль представляет собой оценочную матрицу для конкретной позиции , и он создается из группы последовательностей, предварительно выровненных (зонд). Сходство любой другой последовательности (цели) (одной или нескольких) с зондом можно проверить путем сравнения цели с файлом с помощью динамического программирования.. Этот алгоритм состоит из двух шагов. Первым шагом является создание профиля с помощью программного обеспечения PROFWARE, которое использует существующее выравнивание (зонд) на основе сходства последовательностей или соответствующей трехмерной структуры для создания профиля. Второй шаг - это сравнение профиля с базой данных последовательностей или отдельной последовательности. На этом этапе на основе сгенерированного профиля целевая последовательность или группа последовательностей могут быть выровнены с помощью PROFINAL, при выравнивании используется динамическое программирование. [3]
Ссылки [ править ]
- ^ a b Профиль факультета Университета Пердью. Архивировано 03 декабря 2011 г. в Wayback Machine.
- ^ История ISCB
- ^ Грибсков, М; Маклахлан, AD; Айзенберг, Д. (июль 1987 г.). «Профильный анализ: обнаружение отдаленно родственных белков» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 84 (13): 4355–8. DOI : 10.1073 / pnas.84.13.4355 . PMC 305087 . PMID 3474607 .
Предшественник Филиппа Борна | Президент Международного общества вычислительной биологии с 2003 по 2007 гг. | Преемник Буркхард Рост |