Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Михаил Грибсков (слева) на конференции ISMB в 2012 году.

Майкл Грибсков - профессор биологических и компьютерных наук в Университете Пердью . В 1979 году Грибсков окончил Орегонский государственный университет со степенью бакалавра наук с отличием в области биохимии и биофизики. Позже, в 1985 году, он получил степень доктора философии по молекулярной биологии в Университете Висконсин-Мэдисон . [1]

Он служил в качестве президента Международного общества по вычислительной биологии , [2] и его факультета страниц гласит , что он является председателем белка информационных ресурсов научно надзора и Консультативного совета, и на редколлегий журналов биоинформатики , Журнал вычислительной Биология и химия , а также журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии . [1]

Анализ профиля [ править ]

Грибсков вместе с Дэвидом Айзенбергом и Эндрю Маклахланом представил метод анализа профиля в 1987 году; это метод обнаружения отдаленно родственных белков путем сравнения последовательностей. Профиль представляет собой оценочную матрицу для конкретной позиции , и он создается из группы последовательностей, предварительно выровненных (зонд). Сходство любой другой последовательности (цели) (одной или нескольких) с зондом можно проверить путем сравнения цели с файлом с помощью динамического программирования.. Этот алгоритм состоит из двух шагов. Первым шагом является создание профиля с помощью программного обеспечения PROFWARE, которое использует существующее выравнивание (зонд) на основе сходства последовательностей или соответствующей трехмерной структуры для создания профиля. Второй шаг - это сравнение профиля с базой данных последовательностей или отдельной последовательности. На этом этапе на основе сгенерированного профиля целевая последовательность или группа последовательностей могут быть выровнены с помощью PROFINAL, при выравнивании используется динамическое программирование. [3]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b Профиль факультета Университета Пердью. Архивировано 03 декабря 2011 г. в Wayback Machine.
  2. ^ История ISCB
  3. ^ Грибсков, М; Маклахлан, AD; Айзенберг, Д. (июль 1987 г.). «Профильный анализ: обнаружение отдаленно родственных белков» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 84 (13): 4355–8. DOI : 10.1073 / pnas.84.13.4355 . PMC  305087 . PMID  3474607 .