| Nocardiaceae | |
|---|---|
 | |
| Колонии Nocardia asteroides | |
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Класс: | |
| Заказ: | |
| Подотряд: | |
| Семья: | Nocardiaceae Гаррити и др. 2001 г. |
| Роды | |
Nocardia | |
Nocardiaceae являются семья из аэробных , без привередливый, высокая G + C , грамположительных актиномицетов , которые обычно встречаются в почве и воде. [1] Члены этого семейства были изолированы от антарктических почв. [2] Nocardiaceae представляют коккобациллы, нитчатые или, реже, фрагментированные и палисадные формы [3], а нитчатые виды растут по морфологическому образцу ветвления, подобному гифам грибов . [4]
Геномика [ править ]
Nocardiaceae образуют монофилетическую кладу внутри Corynebacteriales как в 16S рРНК, так и в филогенетических деревьях на основе белков. [5] [6] Был идентифицирован ряд консервативных сигнатурных инделей и консервативных сигнатурных белков, которые уникально обнаружены у родов Nocardia и Rhodococcus , что подтверждает тесную взаимосвязь между этими двумя родами. [6] Недавние предложения были сделаны на основе сигнатурных нуклеотидов 16S рРНК и хемотаксономических маркеров, чтобы добавить роды Gordonia , Skermania , Williamsia , Millisia и Smaragdicoccus.к семейству Nocardiaceae. [5] [7] Однако не было обнаружено никаких консервативных инделей сигнатур или белков, которые обычно являются общими для Nocardia , Rhodococcus и Gordonia , полностью секвенированных членов предлагаемой ревизии Nocardiaceae. [6]
Патогенная способность [ править ]
Некоторые виды колонизируют животных, а представители родов Nocardia и Rhodococcus могут вызывать инфекцию у людей и домашнего скота. [8] Многие представители этого семейства интегрируют миколиновые кислоты в свою клеточную стенку , и в результате Nocardia spp. могут быть ошибочно приняты за микобактерии при просмотре под микроскопом после кислотостойкого окрашивания. [9]
Воздействие на окружающую среду [ править ]
Вспенивание сточных вод [ править ]
Виды Nocardia часто ответственны за накопление пены, которая возникает в активном иле во время очистки сточных вод . [4] [10] [11] [12] Биологическое вспенивание может быть проблематичным для процесса очистки воды, и накопление пены сокращается за счет добавления поверхностно-активных веществ в сточные воды. [13] [14]
Биовосстановление углеводородов [ править ]
Почва Nocardiaceae может разлагать углеводороды (например, нефтяные дистилляты) и была предложена в качестве агентов биоремедиации для разливов окружающей среды. [15]
Изменения номенклатуры [ править ]
В 1980-х годах все виды Nocardiaceae, отнесенные к роду Micropolyspora, были переведены в роды Nocardia или Nonomuraea в семействе Streptosporangiaceae или Saccharopolyspora в семействе Pseudonocardiaceae . [16] Это фактически положило конец официальному статусу этого рода, но название сохраняется в более старых исследовательских статьях.
Ссылки [ править ]
- ^ Stackebrandt Е., Рейни, FA и NL Уорд-Рейни. 1997. Предложение по новой иерархической системе классификации, Actinobacteria classis nov . Int. J. Syst. Bacteriol., 1997, 47 : 479-491. Архивировано 15 мая 2011 года на Wayback Machine.
- ^ Aislabie, J. Экосистема процессы в Антарктике свободных ото льда ландшафтов . «Бактерии, разлагающие углеводороды, в загрязненных нефтью почвах возле базы Скотт, Антарктида». Стр. 257.
- ^ Кулич, SM и WA Pasculle. Окончательный диагноз - пневмония, внутригрудный лимфаденит и сепсис, вторичные по отношению к Rhodococcus equi . Медицинский факультет Питтсбургского университета. Проверено 20 октября 2007 года.
- ^ a b Биттон, Г. Микробиология сточных вод . «Пенная микробиология». стр. 229 .
- ^ a b Ludwig, W .; Euzéby, J .; Schumann, P .; Буссе, HJR; Трухильо, Мэн; Kämpfer, P .; Уитмен, ВБ (2012). «Дорожная карта филума актинобактерий». Bergey's Manual® по систематической бактериологии . п. 1. DOI : 10.1007 / 978-0-387-68233-4_1 . ISBN 978-0-387-95043-3.
- ^ a b c Gao, B .; Гупта, RS (2012). «Филогенетическая основа и молекулярные сигнатуры для основных кладов филума актинобактерий» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 76 (1): 66–112. DOI : 10.1128 / MMBR.05011-11 . PMC 3294427 . PMID 22390973 .
- ^ Zhi, X. -Y .; Li, W. -J .; Штакебрандт, Э. (2009). «Обновление структуры и определения на основе последовательности гена 16S рРНК высших рангов класса Actinobacteria, с предложением двух новых подотрядов и четырех новых семейств и исправленных описаний существующих высших таксонов» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 59 (3): 589–608. DOI : 10.1099 / ijs.0.65780-0 . PMID 19244447 .
- ^ Кастеллани, А. и А. Дж. Чалмерс. 1919. Руководство по тропической медицине , 3-е изд., Williams Wood and Co., New York, p. 1040.
- ^ Нокардия: серьезное заболевание для коров . Презентационные изображения с сайта: aids-images.ch. Проверено 20 октября 2007 года.
- ^ Blackall, LL, Tandoi, В. Дженкинс, Д. 1991. Непрерывные исследования культуры с Nocardia amarae из активного ила и их последствия для вспенивания контроля Nocardia. Архивировано 20 мая 2011 года на Wayback Machine Res. J. Water Pollution Cont. Кормили. 63 : 44-50.
- Перейти ↑ Pitt, P., and D. Jenkins. 1990. Причины и борьба с Nocardia в активном иле. Архивировано 20 мая 2011 г. на Wayback Machine . Res. J. Water Pollution Cont. Кормили. 62 : 143-150.
- ^ Blackall, LL 1994. Микроорганизмы активного ила и биопленки процессов в архив 2011-05-20 в Wayback Machine . Water Sci. Technol. 29 : 35-44.
- ^ Шао, Ю.Дж., Старр, М., Капорис, К., Ким, HS, Дженкинс, Д. 1997. Добавление полимера как решение проблемы вспенивания Nocardia . Вода Enviro. Res., 69 : 25-27.
- ^ Хо, К.Ф., Дженкинс, Д. 1991 Влияние поверхностно-активных веществ на пенообразование Nocardia в активном иле. Архивировано 20 мая2011 г. на Wayback Machine . Water Sci. Tech. 23 : 879-887.
- ^ Aislabie J., Маклеод, М., и Р. Фрейзер. Возможность биодеградации углеводородов в почве в зависимости от Росса в Антарктиде . Прил. Microbiol. Biotechnol. 49 : 210-214.
- ^ Запись Micropolyspora в LPSN ; Euzéby, JP (1997). «Список названий бактерий со статусом в номенклатуре: папка, доступная в Интернете» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 47 (2): 590–2. DOI : 10.1099 / 00207713-47-2-590 . PMID 9103655 .
