РНК и тРНК обычно имеют сложную двумерную структуру. Рут Нусинов поняла, что существует простой способ раскрыть структуру РНК и тРНК. Методика заключается в создании круга. Каждая база пронумерована. Если оснований "n", то числа от 1 до n. Каждое число представлено в виде точки на круге, последовательно от 1 до n. Для оснований, которые связаны вместе (например, 2 и 48, линия проводится между 2 и 48. Полученный график Нуссинова легко выявит вторичные структуры, такие как структуры клеверного листа в РНК или тРНК (наличие «цветков»). нарисованные хорды пересекаются, это соответствует псевдоузламв структуре тРНК. Псевдоузлы подразумевают изгибы в структуре РНК или тРНК (РНК или тРНК на самом деле не являются плоскими ). Линии (например, связи между цветами) объясняют трехмерное складывание (третичное складывание). К сожалению, это сложно визуализировать, поэтому лучше увидеть объяснение с помощью диаграмм. [1]
Пространственная геометрия РНК может объяснить заболевания из медицинской генетики : в частности, при складывании и скручивания становится трудность для рибосомальной обработки .
Ссылки [ править ]
- ^ "Emergent Computing: Emphasizing Bioinformatics", Мэтью Саймон, Springer, 2005, стр. 314-329
