Информационная система по биоразнообразию океанов ( OBIS ), ранее Ocean Биогеографической информационная система , представляет собой веб-точка доступа к информации о распределении и численности живых видов в океане . Он был разработан как компонент управления информацией десятилетней переписи морской флоры и фауны.(CoML) (2001-2010), но не ограничивается данными, полученными из CoML, и направлен на обеспечение комплексного обзора всех данных о морском биоразнообразии, которые могут быть предоставлены ему в открытом доступе соответствующими хранителями данных. Согласно информации на его веб-сайте по состоянию на июль 2018 года, ОБИС «является глобальным центром обмена данными и информацией с открытым доступом по морскому биоразнообразию для науки, сохранения и устойчивого развития». На сайте ОБИС перечислены 8 конкретных целей, главная из которых состоит в том, чтобы «предоставить [] самую большую в мире базу научных знаний о разнообразии, распространении и численности всех морских организмов в интегрированном и стандартизированном формате». [1]
Тип сайта | Интернет-система данных и информации |
---|---|
Доступно в | английский |
URL | www.obis.org |
Коммерческий | нет |
Регистрация | не требуется |
Запущен | Март 2002 г. |
Текущее состояние | активный |
История и текущий статус
Первоначальные идеи для ОБИС были разработаны на совещании CoML по бентической (донной) океанской жизни в октябре 1997 года. Рекомендации этого семинара привели к созданию веб-сайта ( http://marine.rutgers.edu/OBIS ) в Рутгерсе в 1998 году для продемонстрировать исходную концепцию ОБИС. [2] Первый международный семинар ОБИС был проведен 3-4 ноября 1999 г. в Вашингтоне, округ Колумбия, в результате чего был определен объем проекта и установлены контакты с потенциальными партнерами, а избранные материалы были опубликованы в специальном выпуске журнала « Океанография » [3]. в рамках которой основатель OBIS д-р Дж. Ф. Грассл сформулировал видение OBIS как «онлайнового всемирного атласа для доступа, моделирования и картирования морских биологических данных в многомерном географическом контексте». [4] В мае 2000 года правительственные агентства США в рамках Национальной программы океанографического партнерства вместе с Фондом Альфреда П. Слоана профинансировали восемь исследовательских проектов для инициирования ОБИС. В мае 2001 года Национальный научный фонд США профинансировал Университет Рутгерса разработку глобального портала для ОБИС. Также в 2001 г. был сформирован Международный комитет ОБИС, первое заседание которого состоялось в августе 2001 г. [5]
Производственная версия портала OBIS была запущена в Университете Рутгерса в 2002 году как веб-сайт http://www.iobis.org , обслуживающий 430 000 записей данных с привязкой к видам из 8 партнерских баз данных, включая записи о рыбах из FishBase , головоногих из CephBase , кораллы из биогеоинформатики гексакоралов , моллюски из базы данных индо-тихоокеанских моллюсков и многое другое. [6] К маю 2006 года портал ОБИС смог получить доступ к 9,5 миллионам записей о 59 000 видов из 112 баз данных [7], а к декабрю 2010 года (по завершении переписи морской флоры и фауны) предоставил доступ к 27,7 миллионам записей, представляющих 167 000 названия таксонов. [8] По состоянию на июль 2018 года на веб-сайте ОБИС указано, что система обеспечивает доступ к более чем 45 миллионам наблюдений почти за 120 000 морских видов (сокращение числа названий является результатом разрешения синонимов, т. Е. Сокращения таксонов, зарегистрированных под несколькими названиями. к единому общепринятому названию) на основе взносов 500 организаций из 56 стран. [9]
В 2009 г. ОБИС был принят как проект в рамках программы Международного обмена океанографическими данными и информацией (МООД) Межправительственной океанографической комиссии (МОК) ЮНЕСКО, а в 2011 г. с прекращением финансирования секретариата и портала в Рутгерсе со стороны Фонда Слоуна. , предложение о размещении Морским институтом Фландрии (VLIZ) в Остенде , Бельгия, было принято в качестве долгосрочного хоста для системы, а также секретариат ОБИС был переведен из Университета Рутгерса в Проектный офис МОК для МООД в Остенде, откуда ОБИС находится в настоящее время поддерживается и ведется доработка без изменения веб-адреса. Таким образом, теперь ОБИС находится в Остенде, в том же здании, где находится ВЛИЗ. VLIZ поддерживает две таксономические базы данных, Всемирный регистр морских видов и IRMNG , Временный регистр морских и неморских родов , обе из которых используются в таксономических решениях, используемых для управления отображением информации о видах в OBIS, а также обеспечивают таксономическую иерархию с помощью по какому содержимому OBIS можно перемещаться. ОБИС в настоящее время находится под руководством МООД при поддержке руководящей группы, Руководящей группы МООД по ОБИС (SG-OBIS); Оперативная деятельность направляется Исполнительным комитетом ОБИС (ОБИС-ЕС) при поддержке 6 рабочих групп ОБИС. Секретариат ОБИС, расположенный в офисе проекта ЮНЕСКО / МОК для МООД в Остенде (Бельгия), включает менеджера проекта ОБИС и менеджера данных и, помимо обслуживания системы ОБИС, также обеспечивает обучение и техническую помощь поставщикам данных, направляет новые данные. стандарты и технические разработки, а также поощряет международное сотрудничество для повышения групповых преимуществ сети. [10]
Данные, доступные через OBIS, охватывают все группы организмов, которые имеют какое-либо отношение к морским или устьевым местообитаниям, включая береговые линии и атмосферу над океаном, таких как морские позвоночные (рыбы, морские млекопитающие, черепахи, морские птицы и т. Д.); морские беспозвоночные (включая зоопланктон ); морские бактерии ; и морские растения (например, фитопланктон, водоросли, мангровые заросли).
ОБИС портал
По мере развития доступных веб-технологий портал ОБИС прошел ряд итераций с момента его создания в 2002 году. Первоначально система извлекала удаленные данные в режиме реального времени в ответ на запрос пользователя и использовала KGS Mapper для визуализации результатов. В 2004 году были введены централизованное индексирование и кеширование метаданных, что привело к более быстрым и надежным результатам, а к параметрам визуализации данных был добавлен преобразователь c-squares . [11] В 2010 году впервые была представлена полноценная веб- система на основе ГИС вместе с новой версией веб-сайта, которая привела к значительно более подробному и гибкому представлению результатов поиска, а также к ряду новых параметров поиска. [12] В апреле 2018 года было объявлено о финансировании разработки новой версии OBIS «2.0» с улучшенными возможностями., [13] и выпущена 29 января 2019 года. [14] URL-адрес веб-сайта изменен с iobis.org на obis. орг.
Региональные узлы ОБИС
За период с 2004 г. по настоящее время также была создана международная сеть региональных узлов OBIS , которые облегчают подключение источников данных в их регионе к главной сети данных OBIS, а также все чаще предоставляют специализированные услуги или просмотр данных OBIS пользователям в их конкретный регион.
- Организаторы Бельгийской платформы биоразнообразия, Брюссель, и Морского института Фландрии , Остенде. Под управлением Бруно Даниса
- Организатор: Centro Nacional Patagonico - (CENPAT) - CONICET. Под управлением Мирты Льюис
- Организатор - Организация научных и промышленных исследований Содружества - океаны и атмосфера. Под управлением Дэйва Уоттса
- Канада
- Организаторы - Центр морского биоразнообразия и Бедфордский институт океанографии. Под управлением Боба Брантона
- Китай
- Организатор - Институт океанологии. Управляется Сунь Сяося
- Европа
- Организатор Vlaams Instituut voor de Zee . Управляется Уордом Аппельтансом
- Индийский океан
- Организаторы - Национальная химическая лаборатория и Национальный институт океанографии. Под управлением Бабы Инголе
- Япония
- Организатор Национального института экологических исследований. Под управлением Джунко Шимура
- Новая Зеландия / юго-западная часть Тихого океана
- Организатор - Национальный институт водных и атмосферных исследований. Под управлением Дона Робертсона
- К югу от Сахары
- Размещено Южноафриканским центром данных по океанографии. Под управлением Мартена Грундлинга
- Филиппины
- Организатор - Центр биоразнообразия АСЕАН. Под управлением Кристиана Эллорана
- Тропический и субтропический восток южной части Тихого океана
- Организатор - Университет Консепсьона. Под управлением Рубена Эскрибандо
- Тропический и субтропический Западная Южная Атлантика
- Организаторы: Университет Сан-Паулу (USP) и Справочный центр экологической информации (CRIA. Управляется Фабио Ланг Да Силвера)
- Соединенные Штаты Америки
- Размещено Геологической службой США (USGS). Под управлением Марка Форнуолла
Смотрите также
- Перепись морской жизни
- Всемирный регистр морских видов (WoRMS)
Избранные публикации об ОБИС
- Грассл, Дж. Ф. и Стокс, К. И., 1999. Глобальная океаническая биогеографическая информационная система (ОБИС) для переписи морской жизни. Океанография 12 (3), стр. 12-14.
- Грассл, Дж. Ф. 2000. Биогеографическая информационная система океана (ОБИС): он-лайн всемирный атлас для доступа, моделирования и картирования морских биологических данных в многомерном географическом контексте. Океанография 13 (3), стр. 5-7.
- Чжан Ю. и Грассл Дж. Ф. 2003. Портал океанской биогеографической информационной системы. Oceanologica Acta 25 (5), стр. 193–197.
- Марк Дж. Костелло, Дж. Фредерик Грассл, Юньцин Чжан, Карен Стокс и Эдвард Ванден Берг, 2005. Где есть что и что где? Онлайн-картографирование морских видов. Информационный бюллетень MarBEF . Весна 2005 г., стр. 20–22.
- Вуд Дж. Б., Чжан, П. Я., Костелло, М. Дж. И Грассл, Дж. Ф. 2006. Введение в ОБИС, www.iobis.org. В: Милославич П. и Кляйн Э. (ред.), Карибское морское биоразнообразие: известное и неизвестное. DEStech Publications Inc., Ланкастер, Пенсильвания, США, стр. 253–254.
- Костелло MJ, Stocks K., Zhang Y., Grassle JF, Fautin DG 2007. О системе океанской биогеографической информации. Получено с http://hdl.handle.net/2292/5236
- Эдвард Ванден Берге, Карен И. Стокс и Дж. Фредерик Грассл. 2010. Интеграция данных: Биогеографическая информационная система океана. Глава 17 (стр. 333-353) в Аласдер Д. Макинтайр (ред.): Жизнь в Мировом океане. Глава Blackwell Publishing Ltd. также доступна по адресу http://www.comlmaps.org/mcintyre/ch17/data-integration-the-ocean-biogeographic-information-system .
- Ванден Берге Э., Халпин П., Ланг да Силвейра Ф., Стокс К. и Грассл Ф. 2010. Интеграция биологических данных в системы наблюдения за океаном: будущая роль ОБИС. В Hall J, Harrison DE, and Stammer D. (eds) Proceedings of OceanObs'09: Устойчивые наблюдения за океаном и информация для общества (том 2). Париж, Публикация Европейского космического агентства № WPP-306.
- Костелло MJ, Vanhoorne B., Appeltans W. 2015. Продвижение сохранения биоразнообразия с помощью таксономии, публикации данных и совместной инфраструктуры. Биология сохранения 29 (4), 1094–1099.
Рекомендации
- ^ Веб-сайт ОБИС (посещение 18 июля 2018 г.)
- ^ Грассл, Дж. Ф. и Стокс, К. И., 1999. «Глобальная океаническая биогеографическая информационная система (ОБИС) для переписи морской жизни». Океанография 12 (3): 12-14.
- ^ Океанография Том 13, вып. 3 ноября 2000 г. Специальный выпуск: Океанская биогеографическая информационная система.
- ^ Грассл, Дж. Ф. 2000. «Биогеографическая информационная система океана (ОБИС): он-лайн всемирный атлас для доступа, моделирования и картирования морских биологических данных в многомерном географическом контексте». Океанография 13 (3): 5-7.
- ↑ Zhang, Y. and Grassle, JF 2003. «Портал океанской биогеографической информационной системы». Oceanologica Acta 25 (5): 193-197.
- ^ "www.iobis.org: архивная версия, 20 марта 2002 г." . Архивировано 20 марта 2002 года . Проверено 20 марта 2002 года .
- ^ «www.iobis.org: архивная версия, 2 мая 2006 г.» . Архивировано 2 мая 2006 года . Проверено 2 мая 2006 года .
- ^ www.obis.org: архивная версия, 13 декабря 2010 г.
- ^ Об ОБИС: архивная версия, 5 июля 2018 г.
- ^ Об ОБИС: Управление
- ^ Тони Рис и Фиби Чжан, 2007. «Развитие концепций в архитектуре и функциональности OBIS, океанской биогеографической информационной системы». в Vanden Berghe, E. et al. (ред.) Proceedings of Ocean Biodiversity Informatics: международная конференция по управлению данными морского биоразнообразия, Гамбург, Германия, 29 ноября - 1 декабря 2004 г. Отчет семинара МОК, 202, Специальная публикация 37 VLIZ: стр. 167-176.
- ^ Эй Фудзиока и др. , 2012. «Развитие глобальных исследований морской биогеографии с помощью программного обеспечения ГИС с открытым исходным кодом и облачных вычислений». Транзакции в ГИС 16 (2): 143–160.
- ^ «МОК инвестирует в OBIS2.0, крупную модернизацию платформы OBIS» ,
- ^ "Выпущен ОБИС 2.0" ,
Внешние ссылки
ОБИС Международный портал
- Международный портал ОБИС
Региональные узлы ОБИС
- AfrOBIS: африканский узел OBIS к югу от Сахары
- EurOBIS: европейский узел OBIS
- Индобис: узел OBIS в Индийском океане
- ОБИС Австралия: австралийский региональный узел ОБИС
- ОБИС Китай: китайский региональный узел ОБИС
- OBIS Юго-западная часть Тихого океана: региональный узел Юго-западной части Тихого океана OBIS
- СКАР-МарБИН: Информационная сеть по морскому биоразнообразию Антарктики
- SEAOBIS: узел OBIS в Юго-Восточной Азии
- ОБИС в США: региональный узел ОБИС в США
- ОБИС Канада: канадский региональный узел ОБИС
Тематические узлы
- OBIS-SEAMAP (Информационная система по биоразнообразию океана - пространственный экологический анализ популяций мегапозвоночных)
Родительский проект
- Домашняя страница Census of Marine Life
История
- Оригинальный прототип портала ОБИС (около 2000 г.)
- Из архивов: Эволюция портала ОБИС с 2002 г. по настоящее время.