OpenEpi - это бесплатная веб-программа с открытым исходным кодом, не зависящая от операционной системы, для использования в эпидемиологии , биостатистике , общественном здравоохранении и медицине , предоставляющая ряд эпидемиологических и статистических инструментов для получения сводных данных. [1] [2] [3] [4] [5] [6] [7] [8] [9] [10] [11] » OpenEpi был разработан на JavaScript и HTML и может работать в современных веб-браузерах.. Программу можно запустить с веб-сайта OpenEpi или загрузить и запустить без подключения к Интернету. Исходный код и документация можно загрузить и бесплатно использовать для других исследователей. OpenEpi получил рецензию как в СМИ, так и в исследовательских журналах. [12] [13] [14] [15] [16]
Разработчики) | А.Г. Дин, К.М. Салливан, М.М. Соэ |
---|---|
Стабильный выпуск | 3.03 / 22 сентября 2014 г . |
Операционная система | Кроссплатформенность |
Платформа | HTML , JavaScript |
Тип | Веб-приложение , Статистический анализ |
Лицензия | Лицензия MIT |
Веб-сайт | www |
Разработчики OpenEpi обладают обширным опытом разработки и тестирования Epi Info , программы, разработанной Центрами по контролю и профилактике заболеваний (CDC) и широко используемой во всем мире для ввода и анализа данных. OpenEpi был разработан для выполнения анализа, обнаруженного в DOS- версии модулей Epi Info StatCalc и EpiTable, для улучшения типов анализа, предоставляемых этими модулями, и для предоставления ряда инструментов и расчетов, которые в настоящее время недоступны в Epi Info. Это первый шаг к полностью основанному на сети набору эпидемиологических программных средств. OpenEpi можно рассматривать как важного помощника для Epi Info и других программ, таких как SAS , PSPP , SPSS , Stata , SYSTAT , Minitab , Epidata и R (см. Язык программирования R ). Еще одна функционально похожая программа для Windows - Winpepi . См. Также список статистических пакетов и сравнение статистических пакетов . И OpenEpi, и Epi Info были разработаны с целью предоставления инструментов для регионов мира с низким и умеренным уровнем ресурсов. Начальное развитие OpenEpi была поддержана грантом Фонда Билла и Мелинды Гейтс в университете Эмори . [17]
Типы вычислений, которые в настоящее время выполняются OpenEpi, включают:
- Различные доверительные интервалы для пропорций, показателей, стандартизованного коэффициента смертности , среднего , медианы , процентилей
- Необработанные и стратифицированные таблицы 2x2 для данных подсчета и скорости
- Соответствующий анализ случай-контроль
- Тест на тренд с данными подсчета
- Независимый t-критерий и односторонний дисперсионный анализ
- Диагностические и скрининговые тесты с кривыми рабочих характеристик приемника (ROC)
- Размер выборки для пропорций, перекрестных обследований, несравненного случая-контроля , когортных , рандомизированных контролируемых испытаний и сравнения двух средних значений.
- Расчет мощности для пропорций (несопоставленные случай-контроль , перекрестные , когортные, рандомизированные контролируемые испытания ) и для сравнения двух средних
- Генератор случайных чисел
Для эпидемиологов и других исследователей в области здравоохранения OpenEpi выполняет ряд вычислений на основе таблиц, которых нет в большинстве эпидемиологических и статистических пакетов. Например, для одной таблицы 2x2, помимо результатов, представленных в других программах, OpenEpi предоставляет оценки для:
- Этиологическая или предотвращенная доля в популяции и подверженных воздействию с доверительными интервалами, основанными на данных о риске, вероятности или частоте
- Кросс-продукт и MLE отношение шансов оценка
- Точные p-значения среднего p и доверительные границы для отношения шансов
- Расчет соотношений ставок и разностей ставок с помощью доверительных интервалов и статистических тестов.
Для стратифицированных таблиц 2x2 с данными подсчета OpenEpi предоставляет:
- Mantel-Haenszel (MH) и прецизионные оценки отношения рисков и отношения шансов
- Разница рисков, скорректированная на основе точности
- Тесты для взаимодействия для соотношения риска , отношение шансов , и разница рисков
- Четыре различных метода доверительного интервала для отношения шансов.
Как и в случае с Epi Info, в стратифицированном анализе предоставляются как грубые, так и скорректированные оценки, чтобы можно было сделать оценку искажения . С данными о скорости OpenEpi предоставляет скорректированные коэффициенты скорости и различия в скорости, а также тесты на взаимодействие . Наконец, с данными подсчета OpenEpi также выполняет тест на наличие тренда как для грубых, так и для стратифицированных данных.
Помимо использования для анализа данных исследователями в области здравоохранения, OpenEpi использовался в качестве учебного инструмента для обучения эпидемиологии студентов: Университета Эмори, Университета Массачусетса, Университета Мичигана, Университета Миннесоты, Колледжа Морхауса, Университета Колумбии, Университета штата Нью-Йорк. Висконсин, Государственный университет Сан-Хосе, Университет медицины и стоматологии Нью-Джерси, Университет Вашингтона и др. Сюда входят курсы на базе кампуса и дистанционное обучение. Поскольку OpenEpi прост в использовании, не требует опыта программирования и может работать в Интернете, студенты могут использовать программу и сосредоточиться на интерпретации результатов. Пользователи могут запускать программу на английском, французском, испанском, португальском или итальянском языках.
Комментарии и предложения по улучшению приветствуются, разработчики отвечают на запросы пользователей. Разработчики побуждают других разрабатывать модули, которые можно добавить в OpenEpi, и предоставлять инструменты разработчика на веб-сайте. Планируемое будущее развитие включает улучшения существующих модулей, разработку новых модулей, перевод на другие языки и добавление возможности вырезать и вставлять данные и / или читать файлы данных.
Смотрите также
- Веб-моделирование
- Бесплатное статистическое программное обеспечение
Рекомендации
- Перейти ↑ Sullivan KM, Dean A, Soe MM (2009). «OpenEpi - эпидемиологический и статистический веб-калькулятор для общественного здравоохранения». Отчеты об общественном здравоохранении (124): 471–474. PMID 19445426 .
- ^ Салливан К .; Абрамсон Дж. (Июль 2008 г.). «Обновление бесплатного эпидемиологического ПО». Монитор эпидемиологии . 29 (7): 3–4.
- ^ Салливан, К. (Весна – Лето 2008 г.). "В центре внимания факультета". Эпи Авангард .
- ^ Салливан, К.М. (декабрь 2007 г.). «OpenEpi теперь доступен на английском, французском, итальянском и испанском языках». Монитор эпидемиологии . 28 (14).
- ^ Салливан К.М., Дин А., Соэ М.М. (май 2007 г.). «OpenEpi версии 2». Монитор эпидемиологии . 28 (5): 1, 9–10.
- ^ Салливан, К.М. (апрель 2007 г.). «Обзор бесплатного аналитического программного обеспечения для эпидемиологов». Монитор эпидемиологии . 28 (4).
- ^ Салливан, К.М. (весна 2007 г.). «OpenEpi - веб-калькулятор». Эпи Авангард .
- ^ Салливан К., Дин А., Соэ М.М. (июнь 2006 г.). «OpenEpi: обновление». Монитор эпидемиологии . 27 (6): 4.
- ^ Салливан К.М., Дин А.Г., Мир Р. (апрель 2004 г.). «OpenEpi: новые совместные усилия в области эпидемиологических вычислений». Монитор эпидемиологии . 25 (4): 3, 7, 9.
- ^ Салливан К.М., Дин А.Г., Мир Р. (11–14 июня 2003 г.). OpenEpi: новые совместные усилия в области эпидемиологических вычислений . 36-е ежегодное собрание Общества эпидемиологических исследований. Атланта, Джорджия , США.
- ^ Дин А.Г., Салливан К.М., Мир Р. (1–4 октября 2003 г.). Инициатива Open Epi: программное обеспечение веб-браузера с открытым исходным кодом для общественного здравоохранения . Ежегодное научное собрание Международной эпидемиологической ассоциации. Толедо, Испания : Европейская эпидемиологическая федерация.
- ^ OpenEpi онлайн «Технологии, здоровье и развитие
- ^ Отличные бесплатные инструменты для обучения статистике | Образование IT | ZDNet.com
- ^ Антох, Дж. (2008). «Среда для статистических вычислений». Обзор компьютерных наук . 2 (2): 113–122. DOI : 10.1016 / j.cosrev.2008.05.002 .
- ^ Абрамсон Дж. Х., Абрамсон Ж. Х. (2008). 6-е (ред.). Методы исследования в общественной медицине: опросы, эпидемиологические исследования, оценка программ, клинические испытания . Джон Вили и сыновья.
- ^ Сингх, С. (2009). «Обзор бесплатных программ для ввода и анализа эпиданных» . Индийский журнал общественной медицины (34): 76–7. PMC 2763648 .
- ^ «Архивная копия» (PDF) . Архивировано из оригинального (PDF) 20 сентября 2009 года . Проверено 22 сентября 2009 .CS1 maint: заархивированная копия как заголовок ( ссылка )
Внешние ссылки
- Официальный веб-сайт