парамиксовирусы
Paramyxoviridae (от греческого para- «рядом с» и myxa « слизь ») — семейство РНК-вирусов с отрицательной цепью порядка Mononegavirales . [1] [2] Позвоночные животные служат естественными хозяевами. [3] Заболевания, связанные с этим семейством, включают корь , эпидемический паротит и инфекции дыхательных путей . [4] Семейство включает четыре подсемейства, 17 родов и 78 видов, три рода из которых не относятся к подсемействам. [5]
Вирионы покрыты оболочкой и могут быть сферическими или плеоморфными и способны продуцировать нитевидные вирионы. Диаметр составляет около 150 нм. Геномы линейны, имеют длину около 15 т.п.н. [6] [1] Белки слияния и белки прикрепления появляются в виде шипов на поверхности вириона. Белки матрикса внутри оболочки стабилизируют структуру вируса. Нуклеокапсидное ядро состоит из геномной РНК, нуклеокапсидных белков, фосфопротеинов и полимеразных белков.
Геном представляет собой несегментированную РНК с отрицательным смыслом, длиной 15–19 тысяч пар оснований и содержит от 6 до 10 генов . К экстрацистронным (некодирующим) областям относятся:
Каждый ген содержит сигналы начала/остановки транскрипции в начале и конце, которые транскрибируются как часть гена.
Последовательность генов в геноме сохраняется во всем семействе из-за явления, известного как полярность транскрипции (см. Mononegavirales ), при котором гены, расположенные ближе всего к 3'-концу генома, транскрибируются в большем количестве, чем гены ближе к 5'-концу. Это результат структуры генома. После того, как каждый ген транскрибирован, РНК-зависимая РНК-полимераза делает паузу, чтобы высвободить новую мРНК, когда она встречает межгенную последовательность. Когда РНК-полимераза останавливается, существует вероятность, что она диссоциирует от РНК-генома. Если он диссоциирует, он должен повторно войти в геном в лидерной последовательности, а не продолжать транскрибировать длину генома. В результате чем дальше вниз по течению от лидерной последовательности находятся гены, тем меньше они будут транскрибироваться РНК-полимеразой.
Доказательства модели с одним промотором были подтверждены, когда вирусы подвергались воздействию УФ-света. УФ-излучение может вызвать димеризацию РНК, что препятствует транскрипции РНК-полимеразой. Если вирусный геном соответствует модели с несколькими промоторами, уровень ингибирования транскрипции должен коррелировать с длиной гена РНК. Однако лучше всего геном описывается моделью с одним промотором. Когда геном парамиксовируса подвергался воздействию УФ-света, уровень ингибирования транскрипции был пропорционален расстоянию от лидерной последовательности. То есть, чем дальше ген от лидерной последовательности, тем больше вероятность того, что димеризация РНК ингибирует РНК-полимеразу.
