Mononegavirales | |
---|---|
Вирус везикулярного стоматита (VSV) вириона и Mononegavirales геномы | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Негарнавирикота |
Учебный класс: | Monjiviricetes |
Заказ: | Mononegavirales |
Семьи | |
Mononegavirales - это отряд РНК-вирусов с отрицательной цепью, которые имеют несегментированные геномы. Некоторые общие члены порядка являются вирус Эбола , респираторно - синцитиальный вирус человеческого , вирус кори , вирус эпидемического паротита , вирус Nipah , и вирус бешенства . Все эти вирусы вызывают серьезные заболевания у людей. Многие другие важные патогены нечеловеческих животных и растений также входят в эту группу. Заказ включаетсебя одиннадцать вирусов семейства: Artoviridae , Bornaviridae , Filoviridae , Lispiviridae, Mymonaviridae , Nyamiviridae , Paramyxoviridae , Pneumoviridae , Rhabdoviridae , Sunviridae и Xinmoviridae . [1]
Использование термина [ править ]
Порядок Mononegavirales (объявленный: / ˌ м ɒ п ə ˌ п ɛ ɡ ə V я г ɑː л ɪ г / ПН -ə- NEG -ə-vee- РВП -liz ) [примечание 1] [2] [3] это вирусологический таксон, который был создан в 1991 году [4] [5] и изменен в 1995, [6] 1997, [7] 2000, [8] 2005, [9] 2011, [2] 2016, [10]2017, [11] и 2018. [1] Имя Mononegavirales происходит от древнегреческого прилагательное μóνος Монос (ссылаясь на monopartite и одноцепочечных геномах большинства mononegaviruses), то латинский глагол negare (ссылаясь на отрицательной полярности этих геномы) и таксономический суффикс -virales (обозначающий вирусный порядок). [3]
Критерии включения в заказ [ править ]
Вирус входит в отряд Mononegavirales, если [2] [3]
- его геном представляет собой линейную, обычно (но не всегда) несегментированную, одноцепочечную, неинфекционную РНК отрицательной полярности; имеет обратные комплементарные 3 'и 5' концы; и не связан ковалентно с белком ;
- его геном имеет характерный порядок генов: 3'-UTR - гены основного белка - гены белка оболочки - ген РНК-зависимой РНК-полимеразы - 5'-UTR (3'-NPMGL-5 ') (есть, однако, некоторые исключения);
- он продуцирует 5-10 различных мРНК из своего генома посредством полярной последовательной транскрипции с одного промотора, расположенного на 3'-конце генома; мРНК имеют 5'-кэп и полиаденилированы ;
- он реплицируется путем синтеза полных антигеномов;
- он образует инфекционные спиральные рибонуклеокапсиды в качестве матриц для синтеза мРНК, антигеномов и геномов;
- он кодирует РНК-зависимую РНК-полимеразу (RdRp, L), которая очень гомологична таковым других мононегавирусов; и / или
- он обычно (но не всегда) производит вирионы с оболочкой с молекулярной массой 300–1000 × 10 6 ; S 20W из 550-> 1,045; и плавучесть в CsCl 1,18–1,22 г / см 3 .
Жизненный цикл [ править ]
Жизненный цикл мононегавируса начинается с прикрепления вириона к специфическим рецепторам на клеточной поверхности , за которым следует слияние оболочки вириона с клеточными мембранами и сопутствующее высвобождение нуклеокапсида вируса в цитозоль . Вирус RdRp частично uncoats нуклеокапсид и переписывает на гены в положительный многожильном мРНК , которые затем переведены на структурные и неструктурные белки. [9]
Мононегавирус RdRps связывается с единственным промотором, расположенным на 3'-конце генома. Транскрипция либо завершается после гена, либо продолжается до следующего гена ниже по течению. Это означает, что гены, расположенные близко к 3'-концу генома, транскрибируются в наибольшем количестве, тогда как гены ближе к 5'-концу транскрибируются с наименьшей вероятностью. Таким образом, порядок генов является простой, но эффективной формой регуляции транскрипции. Самый распространенный белок - это нуклеопротеин , концентрация которого в клетке определяет, когда RdRp переключается с транскрипции гена на репликацию генома. [9]
Репликация приводит к появлению полноразмерных антигеномов с положительной цепью, которые, в свою очередь, транскрибируются в копии генома потомства вируса с отрицательной цепью. Недавно синтезированные структурные белки и геномы самоорганизуются и накапливаются внутри клеточной мембраны . Вирионы отпочковываются от клетки, получая свои оболочки от клеточной мембраны, из которой они отпочковываются. Затем зрелые частицы потомства заражают другие клетки, чтобы повторить цикл. [9]
Палеовирология [ править ]
История мононегавирусов насчитывает несколько десятков миллионов лет. « Окаменелости » мононегавируса были обнаружены в форме генов мононегавируса или фрагментов генов, интегрированных в геномы млекопитающих . Например, «окаменелости» гена борнавируса были обнаружены в геномах летучих мышей , рыб , даманов , сумчатых , приматов , грызунов , жвачных животных и слонов . [12] [13] [14] [15] [16] «Окаменелости» гена филовируса были обнаружены в геномах летучих мышей, грызунов, землероек ,тенреки и сумчатые . [13] [14] [17] [18] «Ископаемые остатки» вируса Midway были обнаружены в геноме рыбок данио . [13] Наконец, «окаменелости» рабдовируса были обнаружены в геномах ракообразных, комаров , клещей и растений . [19] [14] [20] [21]
Таксономия [ править ]
Орден насчитывает одиннадцать семейств, которые включают множество родов, состоящих из множества различных видов:
- Artoviridae
- Bornaviridae
- Filoviridae
- Lispiviridae
- Mymonaviridae
- Nyamiviridae
- Paramyxoviridae
- Пневмовирусы
- Rhabdoviridae
- Sunviridae
- Xinmoviridae
Таблица порядка, показывающая все семейства, роды, виды и их вирусы: [1]
Семья | Род | Разновидность | Вирус (аббревиатура) |
Bornaviridae | Карбовирус | Карбовирус Квинсленда * | вирус питона ковра джунглей (JCPV) |
Юго-западный карбовирус | вирус юго-западного коврового питона (SWCPV) | ||
Ортоборнавирус | Ортоборнавирус Elapid 1 | Вирус подвязочной змеи Ловериджа 1 (LGSV-1) | |
Ортоборнавирус млекопитающего 1 * | Вирус болезни Борна 1 (BoDV-1) | ||
Вирус болезни Борна 2 (BoDV-2) | |||
Ортоборнавирус млекопитающих 2 | борнавирус пестрой белки 1 (VSBV-1) | ||
Ортоборнавирус Passeriform 1 | канареечный борнавирус 1 (CnBV-1) | ||
канареечный борнавирус 2 (CnBV-2) | |||
канареечный борнавирус 3 (CnBV-3)) | |||
Ортоборнавирус Passeriform 2 | эстрильдовый зяблик - борнавирус 1 (EsBV-1) | ||
Ортоборнавирус Psittaciform 1 | попугай борнавирус 1 (PaBV-1) | ||
попугай борнавирус 2 (PaBV-2) | |||
попугай борнавирус 3 (PaBV-3) | |||
попугай борнавирус 4 (PaBV-4) | |||
попугай борнавирус 7 (PaBV-7) | |||
Ортоборнавирус Psittaciform 2 | попугай борнавирус 5 (PaBV-5) | ||
Ортоборнавирус Waterbird 1 | борнавирус водных птиц 1 (ABBV-1) | ||
борнавирус 2 водных птиц (ABBV-2) | |||
Filoviridae | Cuevavirus | Lloviu cuevavirus * | Вирус Lloviu (LLOV) |
Дианловирус | Вирус Менгла (MLAV) | ||
Эболавирус | Bundibugyo ebolavirus | Bundibugyo вирус (BDBV) | |
Рестон эболавирус | Вирус Рестона (RESTV) | ||
Суданский эболавирус | Суданский вирус (SUDV) | ||
Эболавирус Тайского леса | Вирус леса Тай (TAFV) | ||
Заирский эболавирус * | Вирус Эбола (EBOV) | ||
Марбургвирус | Марбургский марбургвирус * | Вирус Марбург (MARV) | |
Вирус Равн (RAVV) | |||
Mymonaviridae | Склеротимонавирус | Склеротиния склеротимонавирус * | Sclerotinia sclerotiorum вирус 1 с отрицательной цепью РНК (SsNSRV-1) |
Nyamiviridae | Ньявирус | Midway nyavirus | Вирус Midway (MIDWV) |
Ньяманини ньявирус * | Вирус Няманини (NYMV) | ||
Ньявирус Сьерра-Невады | Вирус Сьерра-Невады (SNVV) | ||
Перопувирус | Pteromalus puparum peropuvirus * | Pteromalus puparum РНК вируса 1 с отрицательной цепью (PpNSRV-1) | |
Социвирус | Социвирус нематоды соевых бобов * | вирус 1 цисты нематоды сои (SbCNV-1) | |
Paramyxoviridae | Аквапарамиксовирус | Аквапарамиксовирус лосося * | Парамиксовирус атлантического лосося (AsaPV) |
Авулавирус | Птичий авулавирус 1 * | птичий парамиксовирус 1 (APMV-1) | |
Птичий авулавирус 2 | птичий парамиксовирус 2 (APMV-2) | ||
Птичий авулавирус 3 | птичий парамиксовирус 3 (APMV-3) | ||
Птичий авулавирус 4 | птичий парамиксовирус 4 (APMV-4) | ||
Птичий авулавирус 5 | птичий парамиксовирус 5 (APMV-5) | ||
Птичий авулавирус 6 | птичий парамиксовирус 6 (APMV-6) | ||
Птичий авулавирус 7 | птичий парамиксовирус 7 (APMV-7) | ||
Птичий авулавирус 8 | птичий парамиксовирус 8 (APMV-8) | ||
Птичий авулавирус 9 | птичий парамиксовирус 9 (APMV-9) | ||
Птичий авулавирус 10 | птичий парамиксовирус 10 (APMV-10) | ||
Птичий авулавирус 11 | птичий парамиксовирус 11 (APMV-11) | ||
Птичий авулавирус 12 | птичий парамиксовирус 12 (APMV-12) | ||
Птичий авулавирус 13 | птичий парамиксовирус 13 (APMV-13) | ||
Птичий авулавирус 14 | птичий парамиксовирус 14 (APMV-14) | ||
Птичий авулавирус 15 | птичий парамиксовирус 15 (APMV-15) | ||
Птичий авулавирус 16 | птичий парамиксовирус 16 (APMV-16) | ||
Птичий авулавирус 17 | Вирус антарктического пингвина А (APV-A) | ||
Птичий авулавирус 18 | Вирус антарктического пингвина B (APV-B)) | ||
Птичий авулавирус 19 | Вирус антарктического пингвина C (APV-C) | ||
Ферлавирус | Рептильный ферлавирус * | Вирус Фер-де-Ланса (FDLV) | |
Генипавирус | Кедровый генипавирус | Кедровый вирус (CedV) | |
Ганский летучая мышь henipavirus | Вирус Кумаси (KV) | ||
Hendra henipavirus * | Вирус Хендры (HeV) | ||
Mojiang henipavirus | Вирус Mòjiāng (MojV) | ||
Нипах генипавирус | Вирус Нипах (NiV) | ||
Морбилливирус | Морбилливирус собак | вирус чумы собак (CDV) | |
Морбилливирус китообразных | морбилливирус китообразных (CeMV) | ||
Кошачий морбилливирус | морбилливирус кошек (FeMV) | ||
Морбилливирус кори * | вирус кори (МэВ) | ||
Морбилливирус мелких жвачных | вирус чумы мелких жвачных животных (PPRV) | ||
Фокиновый морбилливирус | вирус чумки фосин (PDV) | ||
Морбилливирус чумы крупного рогатого скота | вирус чумы крупного рогатого скота (RPV) | ||
Респировирус | Респираторный вирус крупного рогатого скота 3 | вирус парагриппа крупного рогатого скота 3 (BPIV-3) | |
Человеческий респираторный вирус 1 | вирус парагриппа человека 1 (HPIV-1) | ||
Человеческий респираторный вирус 3 | вирус парагриппа 3 человека (HPIV-3) | ||
Респираторный вирус мыши * | Вирус Сендай (SeV) | ||
Респираторный вирус свиньи 1 | вирус парагриппа 1 свиней (PPIV-1) | ||
Рубулавирус | Achimota rubulavirus 1 | Вирус ачимота 1 (AchPV-1) | |
Achimota rubulavirus 2 | Вирус ачимота 2 (AchPV-2) | ||
Свинка летучая мышь свинка рубулавирус | вирус паротита летучих мышей (BMV) | ||
Рубулавирус собак | вирус парагриппа 5 (PIV-5) | ||
Рубулавирус человека 2 | вирус парагриппа 2 человека (HPIV-2) | ||
Рубулавирус человека 4 | вирус парагриппа человека 4a (HPIV-4a) | ||
вирус парагриппа человека 4b (HPIV-4b) | |||
Мапуэра rubulavirus | Вирус Мапуэра (MapV) | ||
Рубулавирус Menangle | Вирус Менангле (MenPV) | ||
Свинка рубулавирус * | вирус паротита (MuV) | ||
Свиной рубулавирус | Вирус Ла Пьедад Мичоакан Мексика (LPMV) | ||
Обезьяний рубулавирус | обезьяний вирус 41 (SV-41) | ||
Sosuga rubulavirus | Вирус Сосуга | ||
Тевиот рубулавирус | Вирус Тевиот (TevPV) | ||
Tioman rubulavirus | Вирус тиомана (TioPV) | ||
Tuhoko rubulavirus 1 | Вирус Тухоко 1 (ThkPV-1) | ||
Tuhoko rubulavirus 2 | Вирус Тухоко 2 (ThkPV-2) | ||
Tuhoko rubulavirus 3 | Вирус Тухоко 3 (ThkPV-3) | ||
Пневмовирусы | Метапневмовирус | Птичий метапневмовирус * | Птичий метапневмовирус (AMPV) |
Метапневмовирус человека | метапневмовирус человека (HMPV) | ||
Ортопневмовирус | Ортопневмовирус крупного рогатого скота | респираторно-синцитиальный вирус крупного рогатого скота (BRSV) | |
Ортопневмовирус человека * | респираторно-синцитиальный вирус человека A2 (HRSV-A2) | ||
респираторно-синцитиальный вирус человека B1 (HRSV-B1) | |||
Ортопневмовирус мышей | вирус мышиной пневмонии (MPV) | ||
Rhabdoviridae | Альмендравирус | Arboretum almendravirus | Вирус Arboretum (ABTV) |
Бальза альмендравирус | Вирус бальзы (BALV) | ||
Кут-Бэй альмендравирус | Вирус Кут-Бэй (CBV) | ||
Пуэрто-Альмендрас альмендравирус * | Вирус Пуэрто Альмендрас (PTAMV) | ||
Рио-Чико альмендравирус | Вирус Рио-Чико (RCHV) | ||
Куриовирус | Куриовирус Курионополиса * | Вирус Курионополиса (CURV) | |
Ирири куриовирус | Вирус Ирири (IRIRV) | ||
Куриовирус Itacaiunas | Вирус Itacaiunas (ITAV) | ||
Куриовирус Рошамбо | Вирус Рошамбо (RBUV) | ||
Циторабдовирус | Карликовый цитохабдовирус люцерны | вирус карликовости люцерны (ADV) | |
Циторабдовирус желто-полосатой мозаики ячменя | вирус желтой полосатой мозаики ячменя (BYSMV) | ||
Брокколи некротическая желтизна циторабдовирус | вирус некротической желтизны брокколи (BNYV) | ||
Циторабдовирус, ассоциированный с болезнью Colocasia bobone | Вирус, ассоциированный с болезнью Colocasia bobone (CBDaV) | ||
Циторабдовирус полосатости листьев Festuca | вирус полосатости листьев festuca (FLSV) | ||
Салатный некротический желтый цитохабдовирус * | вирус некротической желтизны салата (LNYV) | ||
Салат желтый крапчатый циторхабдовирус | вирус желтой крапчатости салата (LYMoV) | ||
Циторабдовирус мозаики северных злаков | вирус северной мозаики злаков (NCMV) | ||
Sonchus cytorhabdovirus | вирус сонха (SonV) | ||
Циторабдовирус клубники морщинистый | вирус морщинки клубники (SCV) | ||
Циторабдовирус американской полосатой мозаики пшеницы | вирус американской полосатой мозаики пшеницы (WASMV) | ||
Дихорхавирус | Кофейный дихорхавирус кольцевой пятнистости | вирус кольцевой пятнистости кофе (CoRSV) | |
Орхидея пятнистая дихорхавирус * | вирус орхидейной пятнистости (OFV) | ||
Эфемеровирус | Эфемеровирус реки Аделаида | Вирус реки Аделаида (АРВ) | |
Эфемеровирус Берримы | Вирус Берримы (BRMV) | ||
Эфемеровирус бычьей чумы * | вирус эфемерной лихорадки крупного рогатого скота (BEFV) | ||
Эфемеровирус Кимберли | Вирус Кимберли (KIMV) | ||
Вирус Малакал (MALV) | |||
Эфемеровирус кулпинях | Вирус Кулпинья (KOOLV) | ||
Котонканский эфемеровирус | вирус котонкан (КОТВ) | ||
Ободхян эфемеровирус | Вирус Ободхян (OBOV) | ||
Ята эфемеровирус | Вирус Ята (YATV) | ||
Хапавирус | Гапавирус Фландрии | Вирус Фландрии (FLAV) | |
Гапавирус Hart Park | Вирус Харта Парка (ВПЧ) | ||
Гапавирус Grey Lodge | Вирус Серой Ложи (GLOV) | ||
Хапавирус Джоджакака | Вирус Джоинджакака (JOIV) | ||
Гапавирус La Joya | Вирус Ла Хойя (LJV) | ||
Камесский гапавирус | Вирус Камезе (КАМВ) | ||
Гапавирус Ланджиа | Вирус Ланджиа (LANV = LJAV) | ||
Гапавирус Манитобы | Вирус Манитобы (MANV = MNTBV) | ||
Марко гапавирус | Вирус Марко (MCOV) | ||
Гапавирус Mosqueiro | Вирус Москейро (MQOV) | ||
Моссуриловый гапавирус | Моссурил вирус (MOSV) | ||
Нгаинганский гапавирус | Вирус Нгаинган (NGAV) | ||
Гапавирус реки Орд | Вирус реки Орд (ORV) | ||
Гапавирус Пэрри-Крик | Вирус Парри Крик (PCV) | ||
Гапавирус Вонгабеля '*' | Вирус Вонгабеля (WONV) | ||
Ледантевирус | Барур ледантевирус | Вирус Барура (BARV) | |
Ледантевирус Фикирини | Вирус Фикирини (FKRV) | ||
Ледантевирус Фукуока | Вирус Фукуока (FUKV) | ||
Каньявара ледантевирус | Вирус Каньявара (KYAV) | ||
Ледантевирус Кернского каньона | Вирус каньона Керн (KCV) | ||
Keuraliba ledantevirus | Вирус Кералиба (KEUV) | ||
Коленте ледантевирус | Вирус Коленте (KOLEV) | ||
Кумаси ледантевирус | Кумаси рабдовирус (KRV) | ||
Le Dantec ledantevirus * | Вирус Le Dantec (LDV) | ||
Гора Элгон летучая мышь ledantevirus | Вирус летучих мышей Mount Elgon (MEBV) | ||
Nkolbisson ledantevirus | Вирус Нколбиссона (НКОВ) | ||
Нисимуро ледантевирус | Вирус Нисимуро (NISV) | ||
Ледантевирус Оита | Вирус Оита (OITAV) | ||
Ухань ледантевирус | Вирус мух-вшей 5 (WLFV-5) | ||
Yongjia ledantevirus | Вирус клеща Yǒngjiā 2 (YTV-2) | ||
Лиссавирус | Араванский лиссавирус | Вирус Араван (ARAV) | |
Лиссавирус австралийских летучих мышей | Австралийский лиссавирус летучих мышей (ABLV) | ||
Лиссавирус летучих мышей Бокело | Лиссавирус летучих мышей Бокело (BBLV) | ||
Лиссавирус Duvenhage | Вирус Дювенхаге (DUVV) | ||
Европейская летучая мышь 1 лиссавирус | Европейский лиссавирус летучих мышей 1 (EBLV-1) | ||
Европейская летучая мышь 2 лиссавирус | Европейский лиссавирус летучих мышей 2 (EBLV-2) | ||
Ганнорува лиссавирус летучих мышей | Лиссавирус летучих мышей Ганнорува (GBLV) | ||
Икома лиссавирус | Икома лиссавирус (IKOV) | ||
Иркутский лиссавирус | Вирус Иркут (IRKV) | ||
Худжандский лиссавирус | Худжандский вирус (KHUV) | ||
Лагосский лиссавирус летучих мышей | Вирус летучих мышей Лагоса (LBV) | ||
Лиссавирус летучих мышей Lleida | Вирус летучих мышей Lleida (LLEBV) | ||
Мокола лиссавирус | Вирус мокола (MOKV) | ||
Лиссавирус бешенства * | вирус бешенства (RABV) | ||
Лиссавирус летучих мышей Шимони | Вирус летучих мышей Шимони (SHIBV) | ||
Лиссавирус западно-кавказских летучих мышей | Вирус западно-кавказских летучих мышей (WCBV) | ||
Новирхабдовирус | Hirame novirhabdovirus | рабдовирус хираме (HIRV) | |
Рыбный новирхабдовирус | вирус вирусной геморрагической септицемии (VHSV) | ||
Новирхабдовирус лососевых рыб * | вирус инфекционного гемопоэтического некроза (IHNV) | ||
Змееголов novirhabdovirus | рабдовирус змееголова (SHRV) | ||
Нуклеорабдовирус | Дурман желтый нуклеорхабдовирус | вирус желтой жилки дурмана (DYVV) | |
Баклажан пестрый карликовый нуклеорхабдовирус | вирус пятнистой карликовости баклажанов (EMDV) | ||
Нуклеорабдовирус мелкополосной кукурузы | вирус мелкой полосы кукурузы (MSFV) | ||
Кукуруза иранская мозаика нуклеорхабдовирус | вирус иранской мозаики кукурузы (MIMV) | ||
Нуклеорабдовирус кукурузной мозаики | вирус мозаики кукурузы (MMV) | ||
Нуклеорабдовирус желтого карлика картофеля * | вирус желтой карликовости картофеля (PYDV) | ||
Рисовый желтый трюк нуклеорхабдовирус | вирус рисового желтого каскадного роста (RYSV) | ||
вирус транзиторного пожелтения риса (RTYV) | |||
Sonchus yellow net nucleorhabdovirus | вирус желтой сети сонха (SYNV) | ||
Нуклеорхабдовирус осотистых желтых жил | вирус желтой жилки свиноматки (SYVV) | ||
Нуклеорхабдовирус хлороза вен таро | вирус хлороза вен таро (TaVCV) | ||
Перхабдовирус | Ангуиллидный перхабдовирус | вирус угря Европейский X (EVEX) | |
Перхабдовирус окуня * | рабдовирус окуня (PRV) | ||
Перхабдовирус морской форели | рабдовирус озерной форели (LTRV) | ||
Сигмавирус | Сигмавирус Drosophila affinis | Сигмавирус Drosophila affinis (DAffSV) | |
Drosophila ananassae sigmavirus | Сигмавирус Drosophila ananassae (DAnaSV) | ||
Сигмавирус Drosophila immigrans | Сигмавирус Drosophila immigrans (DImmSV) | ||
Сигмавирус Drosophila melanogaster * | Сигмавирус Drosophila melanogaster (DMelSV) | ||
Сигмавирус Drosophila obscura | Сигмавирус Drosophila obscura (DObsSV) | ||
Сигмавирус Drosophila tristis | Сигмавирус Drosophila tristis (DTriSV) | ||
Muscina stabulans sigmavirus | Сигмавирус Muscina stabulans (MStaSV) | ||
Спрививирус | Спрививирус карпа * | весенняя виремия вируса карпа (SVCV) | |
Sprivivirus мальков щуки | рабдовирус белого амура (GrCRV) | ||
рабдовирус мальков щуки (PFRV) | |||
рабдовирус линя (TenRV) | |||
Шрипувирус | Альмпивар шрипувирус | Вирус Альмпивар (ALMV) | |
Шрипувирус чако | Вирус чако (CHOV) | ||
Ниахский шрипувирус * | Вирус Ниаха (NIAV) | ||
Сена Мадурейра шрипувирус | Вирус Сена Мадурейра (SMV) | ||
Шрипур шрипувирус | Вирус Шрипура (SRIV) | ||
Тибровирус | Тибровирус Нижнего Конго | Вирус Нижнего Конго (BASV) | |
Тибровирус Беатрис Хилл | Вирус Беатрис Хилл (BHV) | ||
Тибровирус прибрежных равнин | Вирус прибрежных равнин (CPV) | ||
Экпома 1 тибровирус | Вирус Экпомы 1 (EKV-1) | ||
Экпома 2 тибровирус | Вирус Экпомы 2 (EKV-2) | ||
Тибровирус Sweetwater Branch | Вирус Sweetwater Branch (SWBV) | ||
Тиброгарган тибровирус * | Вирус Bivens Arm (BAV) | ||
Вирус тиброгаргана (TIBV) | |||
Тупавирус | Даремский тупавирус * | Вирус Дарем (DURV) | |
Кламат тупавирус * | Вирус Кламат (KLAV) | ||
Тупайя тупавирус | вирус тупайи (TUPV) | ||
Варикозавирус | Варикозавирус, связанный с большими венами салата * | вирус, связанный с крупными венами салата (LBVaV) | |
Везикуловирус | Везикуловирус алагоа | везикулярный стоматит вирус алагоаса (VSAV) | |
Везикуловирус американских летучих мышей | Везикуловирус американских летучих мышей (ABVV) | ||
Карахас везикуловирус | Вирус Карахаса (CJSV) | ||
Везикуловирус чандипуры | Вирус чандипуры (CHPV) | ||
Кокальный везикуловирус | Кокальный вирус (COCV) | ||
Везикуловирус Индианы * | вирус везикулярного стоматита Индианы (VSIV) | ||
Исфаханский везикуловирус | Вирус Исфахана (ISFV) | ||
Юрона везикуловирус | Вирус Юрона (JURV) | ||
Везикуловирус весны Мальпа | Вирус весны Мальпа (MSPV) | ||
Мараба везикуловирус | Вирус мараба (MARAV) | ||
Морретон везикуловирус | Вирус Морретона (MORV) | ||
Везикуловирус Нью-Джерси | вирус везикулярного стоматита Нью-Джерси (VSNJV) | ||
Везикуловирус перинета | Вирус перинета (PERV) | ||
Пири везикуловирус | Вирус Пири (PIRYV) | ||
Ради везикуловирус | Ради-вирус (RADV) | ||
Юг Богдановац везикуловирус | Вирус Юг Богдановац (YBV) | ||
Не назначен | Вирус Муссы | Вирус Муссы (MOUV) | |
Sunviridae | Sunshinevirus | Reptile sunshinevirus 1 * | Вирус солнечного побережья (SunCV) |
Не назначен | Анфевирус | Синьчэн антивирус * | Вирус комаров Xīnchéng (XcMV) |
Не назначен | Арливирус | Лиши арливирус * | Вирус паука Лиши 2 (LsSV-2) |
Не назначен | Chengtivirus | Tacheng chengtivirus * | Вирус клеща Точенг 6 (TcTV-6) |
Не назначен | Круставирус | Вэньчжоу корюставирус * | Вирус краба Венжлю 1 (WzCV-1) |
Не назначен | Вастривирус | Sanxia wastrivirus * | Вирус водного страйдера Sānxiá 4 (SxWSV-4) |
Легенда таблицы: «*» обозначает типовой вид.
Примечания [ править ]
- ^ В соответствии с правилами наименования таксонов, установленными Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV) , название Mononegavirales всегда должно быть написано с заглавной буквы, выделено курсивом и никогда не сокращается. Имена физических членов ордена («мононегавирусы» или «мононегавирады») пишутся строчными буквами, не выделяются курсивом и используются без артиклей.
Ссылки [ править ]
- ^ a b c Амарасинге Г.К., Арешига Себальос Н.Г., Баньярд А.С., Basler CF, Bavari S, Беннетт А.Дж. и др. (Апрель 2018). «Таксономия отряда Mononegavirales: обновление 2018 г.» . Архив вирусологии . 163 (8): 2283–2294. DOI : 10.1007 / s00705-018-3814-х . PMC 6076851 . PMID 29637429 .
- ^ a b c Истон А., Прингл CR (2011). «Орден Мононегавиралес». В King AM, Адамс MJ, Carstens EB, Lefkowitz EJ (ред.). Таксономия вирусов - девятый доклад Международного комитета по таксономии вирусов . Лондон, Великобритания: Elsevier / Academic Press. стр. 653 -657. ISBN 978-0-12-384684-6.
- ^ a b c Кун Дж. Х., Беккер С., Эбихара Х., Гейсберт Т. В., Джонсон К. М., Каваока Ю. и др. (Декабрь 2010 г.). «Предложение по пересмотренной таксономии семейства Filoviridae: классификация, названия таксонов и вирусов, а также аббревиатуры вирусов» . Архив вирусологии . 155 (12): 2083–103. DOI : 10.1007 / s00705-010-0814-х . PMC 3074192 . PMID 21046175 .
- Перейти ↑ Pringle, CR (1991). «Орден Мононегавиралес». Архив вирусологии . 117 (1–2): 137–40. DOI : 10.1007 / BF01310499 . PMID 2006902 . S2CID 312908 .
- ^ Прингл CR (1991). «Орден Мононегавиралес». В Francki RI, Fauquet CM, Knudson DK, Brown F (eds.). Классификация и номенклатура вирусов - Пятый доклад Международного комитета по таксономии вирусов. Дополнение к архивам вирусологии, т. 2 . Вена, Австрия: Springer. С. 239–41. ISBN 978-0-387-82286-0.
- Перейти ↑ Bishop DH, Pringle CR (1995). «Орден Мононегавиралес». В Murphy FA, Fauquet CM, Bishop DH, Ghabrial SA, Jarvis AW, Martelli GP, Mayo MA, Summers DM (ред.). Таксономия вирусов - шестой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Дополнение к архивам вирусологии . 10 . Вена, Австрия: Springer. С. 265–267. ISBN 978-3-211-82594-5.
- ^ Прингль CR (1997). «Заказ Mononegavirales - текущий статус». Архив вирусологии . 142 (11): 2321–6. PMID 9672597 .
- ^ Прингль CR (2000). «Орден Мононегавиралес». В van Regenmortel MK, Fauquet CM, Bishop DH, Carstens EB, Estes MK, Lemon SM, Maniloff J, Mayo MA, McGeoch DJ, Pringle CR, Wickner RB (ред.). Таксономия вирусов - седьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Academic Press. С. 525–530. ISBN 978-0-12-370200-5.
- ^ а б в г Прингл CR (2005). «Орден Мононегавиралес». В Fauquet CM, Mayo M, Maniloff J, Desselberger U, Ball LA (ред.). Таксономия вирусов - восьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Elsevier / Academic Press. С. 609–614. ISBN 978-0-12-370200-5.
- ^ Афонсу CL, Amarasinghe ГК, Banyai К, Bao Y, Basler CF, Bavari С, и др. (Август 2016 г.). «Таксономия отряда Mononegavirales: обновление 2016 г.» . Архив вирусологии . 161 (8): 2351–60. DOI : 10.1007 / s00705-016-2880-1 . PMC 4947412 . PMID 27216929 .
- ^ Amarasinghe ГК, Bao Y, Basler CF, Bavari S, Пиво М, Bejerman Н, и др. (Август 2017 г.). «Таксономия отряда Mononegavirales: обновление 2017 г.» . Архив вирусологии . 162 (8): 2493–2504. DOI : 10.1007 / s00705-017-3311-7 . PMC 5831667 . PMID 28389807 .
- ↑ Horie M, Honda T, Suzuki Y, Kobayashi Y, Daito T, Oshida T, Ikuta K, Jern P, Gojobori T, Coffin JM, Tomonaga K (январь 2010 г.). «Эндогенные неретровирусные вирусные элементы РНК в геномах млекопитающих» . Природа . 463 (7277): 84–7. Bibcode : 2010Natur.463 ... 84H . DOI : 10,1038 / природа08695 . PMC 2818285 . PMID 20054395 .
- ^ a b c Белый В.А., Левин А.Ю., Скалка А.М. (июль 2010 г.). Бухмайер MJ (ред.). «Неожиданное наследование: множественные интеграции последовательностей древнего борнавируса и эболавируса / марбургвируса в геномах позвоночных» . PLOS Патогены . 6 (7): e1001030. DOI : 10.1371 / journal.ppat.1001030 . PMC 2912400 . PMID 20686665 .
- ^ a b c Кацуракис А., Гиффорд Р.Дж. (ноябрь 2010 г.). Малик HS (ред.). «Эндогенные вирусные элементы в геномах животных» . PLOS Genetics . 6 (11): e1001191. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1001191 . PMC 2987831 . PMID 21124940 .
- Перейти ↑ Cui J, Wang LF (ноябрь 2015 г.). «Геномный майнинг выявляет глубокие эволюционные отношения между борнавирусами и летучими мышами» . Вирусы . 7 (11): 5792–800. DOI : 10,3390 / v7112906 . PMC 4664979 . PMID 26569285 .
- ↑ Хори М, Томонага К. (апрель 2018). «Палеовирология борнавирусов: что можно узнать из молекулярных окаменелостей борнавирусов». Исследование вирусов . 262 : 2–9. DOI : 10.1016 / j.virusres.2018.04.006 . PMID 29630909 .
- ^ Taylor DJ, Лич RW, Брюнн J (июнь 2010). «Филовирусы древние и интегрированы в геномы млекопитающих» . BMC Evolutionary Biology . 10 : 193. DOI : 10.1186 / 1471-2148-10-193 . PMC 2906475 . PMID 20569424 .
- ^ Taylor DJ, Dittmar K, Баллинджер MJ, Брюнн JA (ноябрь 2011). «Эволюционное поддержание филовирусоподобных генов в геномах летучих мышей» . BMC Evolutionary Biology . 11 : 336. DOI : 10.1186 / 1471-2148-11-336 . PMC 3229293 . PMID 22093762 .
- ^ Metegnier G, Бекинг Т, Chebbi М.А., Жиро я, Moumen В, Schaack S, Cordaux R, Гилберт С (2015). «Сравнительный палеовирологический анализ ракообразных позволяет выявить несколько широко распространенных вирусных групп» . Мобильная ДНК . 6 : 16. DOI : 10,1186 / s13100-015-0047-3 . PMC 4573495 . PMID 26388953 .
- Перейти ↑ Chiba S, Kondo H, Tani A, Saisho D, Sakamoto W, Kanematsu S, Suzuki N (июль 2011 г.). Надь П.Д. (ред.). «Широко распространенная эндогенизация последовательностей генома неретровирусных РНК-вирусов в геномы растений» . PLOS Патогены . 7 (7): e1002146. DOI : 10.1371 / journal.ppat.1002146 . PMC 3136472 . PMID 21779172 .
- ↑ Fort P, Albertini A, Van-Hua A, Berthomieu A, Roche S, Delsuc F, Pasteur N, Capy P, Gaudin Y, Weill M (январь 2012 г.). «Ископаемые рабдовирусные последовательности, интегрированные в геномы членистоногих: онтогенез, эволюция и потенциальная функциональность» . Молекулярная биология и эволюция . 29 (1): 381–90. DOI : 10.1093 / molbev / msr226 . PMID 21917725 .
Внешние ссылки [ править ]
- Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV)