Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Mononegavirales - это отряд РНК-вирусов с отрицательной цепью, которые имеют несегментированные геномы. Некоторые общие члены порядка являются вирус Эбола , респираторно - синцитиальный вирус человеческого , вирус кори , вирус эпидемического паротита , вирус Nipah , и вирус бешенства . Все эти вирусы вызывают серьезные заболевания у людей. Многие другие важные патогены нечеловеческих животных и растений также входят в эту группу. Заказ включаетсебя одиннадцать вирусов семейства: Artoviridae , Bornaviridae , Filoviridae , Lispiviridae, Mymonaviridae , Nyamiviridae , Paramyxoviridae , Pneumoviridae , Rhabdoviridae , Sunviridae и Xinmoviridae . [1]

Использование термина [ править ]

Порядок Mononegavirales (объявленный: / ˌ м ɒ п ə ˌ п ɛ ɡ ə V я г ɑː л ɪ г / ПН -ə- NEG -ə-vee- РВП -liz ) [примечание 1] [2] [3] это вирусологический таксон, который был создан в 1991 году [4] [5] и изменен в 1995, [6] 1997, [7] 2000, [8] 2005, [9] 2011, [2] 2016, [10]2017, [11] и 2018. [1] Имя Mononegavirales происходит от древнегреческого прилагательное μóνος Монос (ссылаясь на monopartite и одноцепочечных геномах большинства mononegaviruses), то латинский глагол negare (ссылаясь на отрицательной полярности этих геномы) и таксономический суффикс -virales (обозначающий вирусный порядок). [3]

Критерии включения в заказ [ править ]

Организация генома и синтез РНК отряда Mononegavirales

Вирус входит в отряд Mononegavirales, если [2] [3]

  • его геном представляет собой линейную, обычно (но не всегда) несегментированную, одноцепочечную, неинфекционную РНК отрицательной полярности; имеет обратные комплементарные 3 'и 5' концы; и не связан ковалентно с белком ;
  • его геном имеет характерный порядок генов: 3'-UTR - гены основного белка - гены белка оболочки - ген РНК-зависимой РНК-полимеразы - 5'-UTR (3'-NPMGL-5 ') (есть, однако, некоторые исключения);
  • он продуцирует 5-10 различных мРНК из своего генома посредством полярной последовательной транскрипции с одного промотора, расположенного на 3'-конце генома; мРНК имеют 5'-кэп и полиаденилированы ;
  • он реплицируется путем синтеза полных антигеномов;
  • он образует инфекционные спиральные рибонуклеокапсиды в качестве матриц для синтеза мРНК, антигеномов и геномов;
  • он кодирует РНК-зависимую РНК-полимеразу (RdRp, L), которая очень гомологична таковым других мононегавирусов; и / или
  • он обычно (но не всегда) производит вирионы с оболочкой с молекулярной массой 300–1000 × 10 6 ; S 20W из 550-> 1,045; и плавучесть в CsCl 1,18–1,22 г / см 3 .

Жизненный цикл [ править ]

Жизненный цикл везикуловирусов

Жизненный цикл мононегавируса начинается с прикрепления вириона к специфическим рецепторам на клеточной поверхности , за которым следует слияние оболочки вириона с клеточными мембранами и сопутствующее высвобождение нуклеокапсида вируса в цитозоль . Вирус RdRp частично uncoats нуклеокапсид и переписывает на гены в положительный многожильном мРНК , которые затем переведены на структурные и неструктурные белки. [9]

Мононегавирус RdRps связывается с единственным промотором, расположенным на 3'-конце генома. Транскрипция либо завершается после гена, либо продолжается до следующего гена ниже по течению. Это означает, что гены, расположенные близко к 3'-концу генома, транскрибируются в наибольшем количестве, тогда как гены ближе к 5'-концу транскрибируются с наименьшей вероятностью. Таким образом, порядок генов является простой, но эффективной формой регуляции транскрипции. Самый распространенный белок - это нуклеопротеин , концентрация которого в клетке определяет, когда RdRp переключается с транскрипции гена на репликацию генома. [9]

Репликация приводит к появлению полноразмерных антигеномов с положительной цепью, которые, в свою очередь, транскрибируются в копии генома потомства вируса с отрицательной цепью. Недавно синтезированные структурные белки и геномы самоорганизуются и накапливаются внутри клеточной мембраны . Вирионы отпочковываются от клетки, получая свои оболочки от клеточной мембраны, из которой они отпочковываются. Затем зрелые частицы потомства заражают другие клетки, чтобы повторить цикл. [9]

Палеовирология [ править ]

История мононегавирусов насчитывает несколько десятков миллионов лет. « Окаменелости » мононегавируса были обнаружены в форме генов мононегавируса или фрагментов генов, интегрированных в геномы млекопитающих . Например, «окаменелости» гена борнавируса были обнаружены в геномах летучих мышей , рыб , даманов , сумчатых , приматов , грызунов , жвачных животных и слонов . [12] [13] [14] [15] [16] «Окаменелости» гена филовируса были обнаружены в геномах летучих мышей, грызунов, землероек ,тенреки и сумчатые . [13] [14] [17] [18] «Ископаемые остатки» вируса Midway были обнаружены в геноме рыбок данио . [13] Наконец, «окаменелости» рабдовируса были обнаружены в геномах ракообразных, комаров , клещей и растений . [19] [14] [20] [21]

Таксономия [ править ]

Филогенетическое дерево Mononegavirales

Орден насчитывает одиннадцать семейств, которые включают множество родов, состоящих из множества различных видов:

  • Artoviridae
  • Bornaviridae
  • Filoviridae
  • Lispiviridae
  • Mymonaviridae
  • Nyamiviridae
  • Paramyxoviridae
  • Пневмовирусы
  • Rhabdoviridae
  • Sunviridae
  • Xinmoviridae


Таблица порядка, показывающая все семейства, роды, виды и их вирусы: [1]

Легенда таблицы: «*» обозначает типовой вид.

Примечания [ править ]

  1. ^ В соответствии с правилами наименования таксонов, установленными Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV) , название Mononegavirales всегда должно быть написано с заглавной буквы, выделено курсивом и никогда не сокращается. Имена физических членов ордена («мононегавирусы» или «мононегавирады») пишутся строчными буквами, не выделяются курсивом и используются без артиклей.

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c Амарасинге Г.К., Арешига Себальос Н.Г., Баньярд А.С., Basler CF, Bavari S, Беннетт А.Дж. и др. (Апрель 2018). «Таксономия отряда Mononegavirales: обновление 2018 г.» . Архив вирусологии . 163 (8): 2283–2294. DOI : 10.1007 / s00705-018-3814-х . PMC  6076851 . PMID  29637429 .
  2. ^ a b c Истон А., Прингл CR (2011). «Орден Мононегавиралес». В King AM, Адамс MJ, Carstens EB, Lefkowitz EJ (ред.). Таксономия вирусов - девятый доклад Международного комитета по таксономии вирусов . Лондон, Великобритания: Elsevier / Academic Press. стр.  653 -657. ISBN 978-0-12-384684-6.
  3. ^ a b c Кун Дж. Х., Беккер С., Эбихара Х., Гейсберт Т. В., Джонсон К. М., Каваока Ю. и др. (Декабрь 2010 г.). «Предложение по пересмотренной таксономии семейства Filoviridae: классификация, названия таксонов и вирусов, а также аббревиатуры вирусов» . Архив вирусологии . 155 (12): 2083–103. DOI : 10.1007 / s00705-010-0814-х . PMC 3074192 . PMID 21046175 .  
  4. Перейти ↑ Pringle, CR (1991). «Орден Мононегавиралес». Архив вирусологии . 117 (1–2): 137–40. DOI : 10.1007 / BF01310499 . PMID 2006902 . S2CID 312908 .  
  5. ^ Прингл CR (1991). «Орден Мононегавиралес». В Francki RI, Fauquet CM, Knudson DK, Brown F (eds.). Классификация и номенклатура вирусов - Пятый доклад Международного комитета по таксономии вирусов. Дополнение к архивам вирусологии, т. 2 . Вена, Австрия: Springer. С. 239–41. ISBN 978-0-387-82286-0.
  6. Перейти ↑ Bishop DH, Pringle CR (1995). «Орден Мононегавиралес». В Murphy FA, ​​Fauquet CM, Bishop DH, Ghabrial SA, Jarvis AW, Martelli GP, Mayo MA, Summers DM (ред.). Таксономия вирусов - шестой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Дополнение к архивам вирусологии . 10 . Вена, Австрия: Springer. С. 265–267. ISBN 978-3-211-82594-5.
  7. ^ Прингль CR (1997). «Заказ Mononegavirales - текущий статус». Архив вирусологии . 142 (11): 2321–6. PMID 9672597 . 
  8. ^ Прингль CR (2000). «Орден Мононегавиралес». В van Regenmortel MK, Fauquet CM, Bishop DH, Carstens EB, Estes MK, Lemon SM, Maniloff J, Mayo MA, McGeoch DJ, Pringle CR, Wickner RB (ред.). Таксономия вирусов - седьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Academic Press. С. 525–530. ISBN 978-0-12-370200-5.
  9. ^ а б в г Прингл CR (2005). «Орден Мононегавиралес». В Fauquet CM, Mayo M, Maniloff J, Desselberger U, Ball LA (ред.). Таксономия вирусов - восьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Elsevier / Academic Press. С. 609–614. ISBN 978-0-12-370200-5.
  10. ^ Афонсу CL, Amarasinghe ГК, Banyai К, Bao Y, Basler CF, Bavari С, и др. (Август 2016 г.). «Таксономия отряда Mononegavirales: обновление 2016 г.» . Архив вирусологии . 161 (8): 2351–60. DOI : 10.1007 / s00705-016-2880-1 . PMC 4947412 . PMID 27216929 .  
  11. ^ Amarasinghe ГК, Bao Y, Basler CF, Bavari S, Пиво М, Bejerman Н, и др. (Август 2017 г.). «Таксономия отряда Mononegavirales: обновление 2017 г.» . Архив вирусологии . 162 (8): 2493–2504. DOI : 10.1007 / s00705-017-3311-7 . PMC 5831667 . PMID 28389807 .  
  12. Horie M, Honda T, Suzuki Y, Kobayashi Y, Daito T, Oshida T, Ikuta K, Jern P, Gojobori T, Coffin JM, Tomonaga K (январь 2010 г.). «Эндогенные неретровирусные вирусные элементы РНК в геномах млекопитающих» . Природа . 463 (7277): 84–7. Bibcode : 2010Natur.463 ... 84H . DOI : 10,1038 / природа08695 . PMC 2818285 . PMID 20054395 .  
  13. ^ a b c Белый В.А., Левин А.Ю., Скалка А.М. (июль 2010 г.). Бухмайер MJ (ред.). «Неожиданное наследование: множественные интеграции последовательностей древнего борнавируса и эболавируса / марбургвируса в геномах позвоночных» . PLOS Патогены . 6 (7): e1001030. DOI : 10.1371 / journal.ppat.1001030 . PMC 2912400 . PMID 20686665 .  
  14. ^ a b c Кацуракис А., Гиффорд Р.Дж. (ноябрь 2010 г.). Малик HS (ред.). «Эндогенные вирусные элементы в геномах животных» . PLOS Genetics . 6 (11): e1001191. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1001191 . PMC 2987831 . PMID 21124940 .  
  15. Перейти ↑ Cui J, Wang LF (ноябрь 2015 г.). «Геномный майнинг выявляет глубокие эволюционные отношения между борнавирусами и летучими мышами» . Вирусы . 7 (11): 5792–800. DOI : 10,3390 / v7112906 . PMC 4664979 . PMID 26569285 .  
  16. Хори М, Томонага К. (апрель 2018). «Палеовирология борнавирусов: что можно узнать из молекулярных окаменелостей борнавирусов». Исследование вирусов . 262 : 2–9. DOI : 10.1016 / j.virusres.2018.04.006 . PMID 29630909 . 
  17. ^ Taylor DJ, Лич RW, Брюнн J (июнь 2010). «Филовирусы древние и интегрированы в геномы млекопитающих» . BMC Evolutionary Biology . 10 : 193. DOI : 10.1186 / 1471-2148-10-193 . PMC 2906475 . PMID 20569424 .  
  18. ^ Taylor DJ, Dittmar K, Баллинджер MJ, Брюнн JA (ноябрь 2011). «Эволюционное поддержание филовирусоподобных генов в геномах летучих мышей» . BMC Evolutionary Biology . 11 : 336. DOI : 10.1186 / 1471-2148-11-336 . PMC 3229293 . PMID 22093762 .  
  19. ^ Metegnier G, Бекинг Т, Chebbi М.А., Жиро я, Moumen В, Schaack S, Cordaux R, Гилберт С (2015). «Сравнительный палеовирологический анализ ракообразных позволяет выявить несколько широко распространенных вирусных групп» . Мобильная ДНК . 6 : 16. DOI : 10,1186 / s13100-015-0047-3 . PMC 4573495 . PMID 26388953 .  
  20. Перейти ↑ Chiba S, Kondo H, Tani A, Saisho D, Sakamoto W, Kanematsu S, Suzuki N (июль 2011 г.). Надь П.Д. (ред.). «Широко распространенная эндогенизация последовательностей генома неретровирусных РНК-вирусов в геномы растений» . PLOS Патогены . 7 (7): e1002146. DOI : 10.1371 / journal.ppat.1002146 . PMC 3136472 . PMID 21779172 .  
  21. Fort P, Albertini A, Van-Hua A, Berthomieu A, Roche S, Delsuc F, Pasteur N, Capy P, Gaudin Y, Weill M (январь 2012 г.). «Ископаемые рабдовирусные последовательности, интегрированные в геномы членистоногих: онтогенез, эволюция и потенциальная функциональность» . Молекулярная биология и эволюция . 29 (1): 381–90. DOI : 10.1093 / molbev / msr226 . PMID 21917725 . 

Внешние ссылки [ править ]

  • Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV)