Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Пегивирус
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство :Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Kitrinoviricota
Класс:Flasuviricetes
Заказ:Амарилловиралес
Семья:Flaviviridae
Род:Пегивирус
Разновидность

Пегивирус A
Пегивирус B
Пегивирус C
Пегивирус D
Пегивирус E
Пегивирус F
Пегивирус G
Пегивирус H
Пегивирус I
Пегивирус J
Пегивирус K
Пегивирус Sifaka

Схематический рисунок вириона пегивируса (поперечный разрез и вид сбоку)

Пегивирус - это одобренное название для рода вирусов с одноцепочечной РНК в семействе Flaviviridae . [1] [2] [3] [4] Имя является производным одно: «П» означает «постоянная» и «г» является ссылкой на гепатит G , бывшее имя C вида.

Геном пегивируса

Таксономия [ править ]

Одиннадцать названных видов относятся к роду Pegivirus . [2] Изоляты, принадлежащие к виду Pegivirus Cявляются монофилетическими и демонстрируют <50% расхождения нуклеотидных (55% аминокислотных) последовательностей между выровненными последовательностями полипротеина друг от друга. Однако все они отличаются более чем на 50% нуклеотидного (> 55% аминокислотного) расхождения от других представителей этого рода. Пегивирусы, отнесенные к этому виду (Pegivirus A), происходят от приматов-хозяев (людей, шимпанзе и нескольких видов обезьян Нового Света). Последовательность U22303 была отнесена к типу данного вида, поскольку это был первый пегивирус, описанный для этого вида. Терминология для описания вирусов с разными хозяевами не была одобрена Международным комитетом по таксономии вирусов; однако вирусы пегивируса А получили название HPgV для пегивируса человека, SPgV для пегивирусов обезьян нового мира и SPgVcpz для обезьяньего вируса шимпанзе. [цитата необходима ]

А второй вид в пределах pegiviruses называется Pegivirus B . В предложение о названии был включен только один вирус - полный геном вируса, обнаруженного у летучих мышей вида Pteropus giganteus . Эта последовательность отличается более чем на 50% нуклеотидной (> 55% аминокислотной) дивергенцией от всех предполагаемых представителей производных от приматов видов Pegivirus C, которые происходят от видов-приматов-хозяев (людей, шимпанзе и нескольких видов обезьян Нового Света). Последовательность GU566734 была определена как член типа этого вида, поскольку это был первый пегивирус, описанный для этого вида. [ необходима цитата ]

Использование технологий глубокого секвенирования позволило идентифицировать дополнительные вирусы, которые отличаются от видов пегивируса В более чем на 50% нуклеотидов (> 55% аминокислот) и пегивируса С у грызунов, лошадей и у разных видов летучих мышей, а также у обезьян Старого Света и количества Количество видов пегивирусов увеличено до одиннадцати. [5]

Пересмотренная таксономия [ править ]

Виды, известные в 2016 году, с тех пор были разделены на 11 видов - Pegivirus A – K. [2] [5]

  • Пегивирус A включает вирус GBV-A
  • Пегивирус B включает вирус GBV-D
  • Пегивирус C включает вирус GBV-C
  • Пегивирус D включает вирус, связанный с болезнью Тейлера.
  • Пегивирус Е включает вирус Пегивирус лошадей.
  • Pegivirus F включает вирус Bat pegivirus.
  • Pegivirus G включает вирус Bat pegivirus.
  • Пегивирус Н включает вирус Пегивирус человека 2
  • Pegivirus I включает вирус Bat pegivirus
  • Пегивирус J включает вирус пегивирус грызунов.
  • Пегивирус К включает вирус свиной пегивирус.

История [ править ]

  • В 1967 году сообщалось , что экспериментальная инокуляция сыворотки 34-летнего хирурга (Джордж Баркер) с острым гепатитом на тамарины привела к гепатиту . [6]
  • В 1995 году два новых члена семейства Flaviviridae (GBV-A и GBV-B) были идентифицированы у тамаринов, у которых развился гепатит после инокуляции 11-м пассажем GB. Позже был обнаружен ряд вариантов GBV-A у пойманных диких обезьян Нового Света.
  • Впоследствии, в 1995 году, был идентифицирован человеческий вирус [GBV-C или вирус гепатита G (HGV)].
  • Более отдаленно родственный вирус (GBV-D) был позже обнаружен у летучих мышей ( Pteropus giganteus ). [7]
  • Род Pegivirus был предложен в 2011 году [3] ГН-В был назначен к роду Hepacivirus , [2] , тогда как ГН-А вместе с ГН-C были отнесены к новому роду Pegivirus . [2]
  • В 2016 году род Pegivirus был разделен на 11 видов - пегивирусы A – K с GBV-C, отнесенные к видам пегивируса C. [5]

Заметки [ править ]

  • Болезнь Тейлера - форма гепатита лошадей - также, по-видимому, вызывается пегивирусом - вирусом, ассоциированным с болезнью Тейлера . [8]
  • Гепегивирус человека 1 или пегивирус человека 2 (HPgV2) - это вирус, выделенный у 2 больных гемофилией, которым повторно переливали кровь, и у двух пациентов, которым переливали кровь. [9] Этот вирус принадлежит к новой кладе пегивирусов.
  • Родственный вирус был изолирован от изящной кошачьей акулы ( Proscyllium habereri ). [10]
  • Пегивирусы человека, по-видимому, связаны с нечеловеческими видами приматов. [11]
  • В 2019 году исследователи описали пегивирус-1 человека как «причину энцефалита человека ( лейкоэнцефалита )»; а также передаются половым путем и от матери ребенку . [12]
  • Другой вирус - пегавирус грызунов - был выделен от белозвратного вудрача ( Neotoma albigula ). [13]
  • Пегивирус (пегивирус лошадей) также был выделен от лошади. [14]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Симмондс, Питер; Бехер, Пол; Бух, Йенс; Гулд, Эрнест А; Мейерс, Грегор; Монат, Том; Муэрхофф, Скотт; Плетнев Александр; Рико-Гессе, Ребекка; Смит, Дональд Б. Стэплтон, Джек Т; Отчет Ictv, Консорциум (2017). «Профиль таксономии вирусов ICTV: Flaviviridae» . Журнал общей вирусологии . 98 (1): 2–3. DOI : 10,1099 / jgv.0.000672 . PMC  5370391 . PMID  28218572 .
  2. ^ a b c d e "Отчет ICTV Flaviviridae" .
  3. ^ а б Стэплтон, Дж. Т; Foung, S; Muerhoff, A. S; Бух, Дж; Симмондс, П. (2010). «Вирусы GB: обзор и предлагаемая классификация GBV-A, GBV-C (HGV) и GBV-D в роде Pegivirus в семействе Flaviviridae» . Журнал общей вирусологии . 92 (2): 233–46. DOI : 10.1099 / vir.0.027490-0 . PMC 3081076 . PMID 21084497 .  
  4. ^ Адамс, M. J; Lefkowitz, E.J; Король, AM Q; Карстенс, Э. Б. (2013). «Недавно согласованные изменения в Международный кодекс классификации и номенклатуры вирусов» . Архив вирусологии . 158 (12): 2633–9. DOI : 10.1007 / s00705-013-1749-9 . PMID 23836393 . 
  5. ^ a b c Смит, Дональд Б.; Бехер, Пол; Бух, Йенс; Гулд, Эрнест А; Мейерс, Грегор; Монат, Томас; Муэрхофф, А. Скотт; Плетнев Александр; Рико-Гессе, Ребекка; Стэплтон, Джек Т; Симмондс, Питер (2016). «Предлагаемое обновление таксономии родов Hepacivirus и Pegivirus в семействе Flaviviridae» . Журнал общей вирусологии . 97 (11): 2894–2907. DOI : 10,1099 / jgv.0.000612 . PMC 5770844 . PMID 27692039 .  
  6. ^ Deinhardt F, Holmes AW, Capps RB, Popper H (1967) Исследования передачи вирусного гепатита человека мартышкам. I. Передача болезни, серийные отхождения и описание поражений печени. J Exp Med 125 (4) 673-688
  7. ^ Эпштейн, Джонатан H; Куан, Феникс-Лан; Бризе, Томас; Стрит, Крейг; Джабадо, Омар; Конлан, Шон; Али Хан, Шахниз; Вердуго, Рассвет; Хоссейн, М. Джахангир; Хатчисон, Стивен К.; Эгхольм, Майкл; Луби, Стивен П.; Дашак, Питер; Липкин, В. Ян (2010). «Идентификация GBV-D, нового GB-подобного флавивируса из плодоядных летучих мышей Старого Света (Pteropus giganteus) в Бангладеш» . PLOS Патогены . 6 (7): e1000972. DOI : 10.1371 / journal.ppat.1000972 . PMC 2895649 . PMID 20617167 .  
  8. ^ Чандриани, S; Skewes-Cox, P; Чжун, Вт; Ganem, D.E; Водолазы, Т.Дж .; Van Blaricum, A.J; Tennant, B.C; Кистлер, А. Л. (2013). «Идентификация ранее не описанного дивергентного вируса от Flaviviridae во время вспышки гепатита лошадиной сыворотки» . Труды Национальной академии наук . 110 (15): E1407–15. Bibcode : 2013PNAS..110E1407C . DOI : 10.1073 / pnas.1219217110 . PMC 3625295 . PMID 23509292 .  
  9. ^ Капур, Амит; Кумар, Арвинд; Симмондс, Питер; Бхува, Нишит; Сингх Чаухан, Локендра; Ли, Бохён; Салл, Амаду Альфа; Джин, Жэжен; Морс, Стивен С; Шаз, Бет; Бурбело, Питер Д.; Липкин, В. Ян (2015). «Виромный анализ реципиентов переливания выявляет новый вирус человека, который имеет общие геномные особенности с гепацивирусами и пегивирусами» . mBio . 6 (5): e01466–15. DOI : 10,1128 / mBio.01466-15 . PMC 4600124 . PMID 26396247 .  
  10. ^ Ши, Ман; Линь, Сиань-Дань; Василакис, Никос; Тиан, Цзюнь-Хуа; Ли, Ци-Сю; Чен, Лян-Цзюнь; Иствуд, Джиллиан; Дяо, Сю-Нянь; Чен, Мин-Хуэй; Чен, Сяо; Цинь, Синь-Чэн; Уайден, Стивен Джи; Вуд, Томас Дж. Теш, Роберт Б; Сюй, Цзяньго; Холмс, Эдвард С ; Чжан, Юн-Чжэнь (2016). «Дивергентные вирусы, обнаруженные у членистоногих и позвоночных, пересматривают эволюционную историю Flaviviridae и родственных вирусов» . Журнал вирусологии . 90 (2): 659–69. DOI : 10,1128 / JVI.02036-15 . PMC 4702705 . PMID 26491167 .  
  11. ^ Тезе, Жюльен; Лоус, София; Паркер, Джо; Pybus, Оливер G (2015). «Эволюционный и филогенетический анализ гепацивирусов и пегивирусов» . Геномная биология и эволюция . 7 (11): 2996–3008. DOI : 10.1093 / GbE / evv202 . PMC 5635594 . PMID 26494702 .  
  12. ^ «Ученые обнаруживают скрытую причину энцефалита» .
  13. ^ Капур, А; Simmonds, P; Шил, Т. К. Н; Hjelle, B; Каллен, Дж. М.; Бурбело, П. Д.; Чаухан, Л. В; Duraisamy, R; Санчес Леон, М; Джайн, К.; Vandegrift, K.J; Калишер, К. Н; Райс, К. М.; Липкин, В. I (2013). «Идентификация гомологов вируса гепатита С и пегивирусов на грызунах» . mBio . 4 (2): e00216–13. DOI : 10,1128 / mBio.00216-13 . PMC 3622934 . PMID 23572554 .  
  14. ^ Капур, А; Simmonds, P; Каллен, Дж. М.; Шил, Т. К. Н; Medina, J. L; Giannitti, F; Nishiuchi, E; Brock, K. V; Бурбело, П. Д.; Райс, К. М.; Липкин, В. I (2013). «Идентификация пегивируса (GB Virus-Like Virus), который заражает лошадей» . Журнал вирусологии . 87 (12): 7185–90. DOI : 10,1128 / JVI.00324-13 . PMC 3676142 . PMID 23596285 .