Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Flaviviridae
Вирусы-10-00597-g001.png
Структура и геном вириона вируса Зика
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство :Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Kitrinoviricota
Учебный класс:Flasuviricetes
Заказ:Амарилловиралес
Семья:Flaviviridae
Роды

Flaviviridae - это семейство оболочечных РНК-вирусов с положительной цепью, которые в основном инфицируют млекопитающих и птиц . [1] В основном они передаются через членистоногих- переносчиков (в основном клещей и комаров ). [2] Семейство получило свое название отвируса желтой лихорадки , типового вируса группы; flavus в переводе с латыни означает «желтый», а желтая лихорадка, в свою очередь, была названа из-за своей склонности вызывать желтуху у жертв. [3] В семействе 89 видов, разделенных на четыре рода. [2]Заболевания, связанные с этой группой, включают: гепатит ( гепацивирусы ), геморрагические синдромы , смертельные заболевания слизистой оболочки ( пестивирусы ), геморрагическая лихорадка , энцефалит и врожденный дефект микроцефалии ( флавивирусы ). [4]

Структура [ править ]

Частицы вируса имеют оболочку сферической формы с геометрией, подобной икосаэдру, которая имеет псевдосимметрию T = 3. Их диаметр составляет около 40–60 нм . [2] [4]

Геном [ править ]

Члены семьи Flaviviridae имеют monopartite, линейные, одноцепочечной РНК геномы положительной полярности, а также от 9,6 до 12,3 т.п.о. пар в общей длины. 5'-концы флавивирусов несут метилированный нуклеотидный кэп, в то время как другие члены этого семейства не кэпированы и кодируют внутренний сайт входа в рибосому.

Геном кодирует один полипротеин с множеством трансмембранных доменов, который расщепляется протеазами хозяина и вирусами на структурные и неструктурные белки. Среди неструктурных белковых продуктов (NS) местоположения и последовательности NS3 и NS5, которые содержат мотивы, необходимые для процессинга полипротеина и репликации РНК, соответственно, относительно хорошо консервативны во всем семействе и могут быть полезны для филогенетического анализа.

Жизненный цикл [ править ]

Жизненный цикл вируса японского энцефалита (JEV)

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Проникновение в хозяйскую клетку достигается прикреплением вирусного белка оболочки Е к рецепторам хозяина, что опосредует клатрин- опосредованный эндоцитоз. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Трансляция происходит по вирусной инициации. Вирус выходит из клетки-хозяина почкованием. Естественными хозяевами служат люди и млекопитающие. Вирус передается через переносчиков (клещей и комаров). [2] [4]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
ГепацивирусЛюдиЭпителий: кожа; эпителий: почка; эпителий: кишечник; эпителий: семенникиКлатрин-опосредованный эндоцитозСекрецияЦитоплазмаЦитоплазмаСекс; кровь
ФлавивирусЛюди; млекопитающие; комары; клещиЭпителий: кожа; эпителий: почка; эпителий: кишечник; эпителий: семенникиКлатрин-опосредованный эндоцитозСекрецияЦитоплазмаЦитоплазмаЗооноз; укус членистоногого
ПегивирусМлекопитающиеНиктоКлатрин-опосредованный эндоцитозСекрецияЦитоплазмаЦитоплазмаНеизвестный
ПестивирусМлекопитающиеНиктоКлатрин-опосредованный эндоцитозСекрецияЦитоплазмаЦитоплазмаПо вертикали: родительский

Таксономия [ править ]

Филогенетическое дерево Flaviviridae с использованием последовательностей белка NS3

В семье четыре рода: [1] [2]

  • Род флавивирусов ( типовой вид желтой лихорадки вирус , другие включают вирус Западного Нила , вирус денге и вирус Зика ).
  • Род Hepacivirus ( типовой вид Hepacivirus C ( вирус гепатита C ), также включает Hepacivirus B (вирус GB B))
  • Род Pegivirus (включает Pegivirus A (GB вирус A), Pegivirus C (GB вирус C) и Pegivirus B (GB вирус D))
  • Род Pestivirus (типовой вид Pestivirus A ( вирус вирусной диареи крупного рогатого скота 1 ), другие включают Pestivirus C ( вирус классической чумы свиней , ранее вирус холеры свиней)). Вирусы этого рода поражают млекопитающих, кроме человека.
Неклассифицированный

Известны и другие флавивирусы, которые еще предстоит классифицировать. К ним относится вирус акулы Wenling.

Jingmenvirus - это группа неклассифицированных вирусов в семействе, которое включает вирус Alongshan, вирус Guaico Culex, вирус клещей Jingmen и вирус клещей Mogiana. Эти вирусы имеют сегментированный геном из 4 или 5 частей. Два из этих сегментов происходят от флавивирусов.

Некоторые вирусы могут быть родственниками флавивирусов, но обладают характеристиками, нетипичными для флавивирусов. К ним относятся цитрусовый Цзинмэнь-подобный вирус, вирус цистовой нематоды сои 5, агент личинки Toxocara canis, вирус крикета Ухань и, возможно, связанный вирус горечавки Кобу-шо.

Клиническое значение [ править ]

Основные заболевания, вызываемые членами семейства Flaviviridae, включают:

  • Лихорадка денге
  • Гепатит С
  • японский энцефалит
  • Кясанурская болезнь леса
  • Энцефалит долины Мюррей
  • Сент-Луисский энцефалит
  • Клещевой энцефалит
  • Энцефалит Западного Нила
  • Желтая лихорадка
  • Лихорадка Зика

Ссылки [ править ]

  1. ^ а б Симмондс, П; Becher, P; Бух, Дж; Gould, E; Мейерс, G; Monath, T; Muerhoff, S; Плетнев, А; Rico-Hesse, R; Смит, Д.; Стэплтон, Дж; Консорциум отчетов ICTV (2017). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Flaviviridae" . Журнал общей вирусологии . 98 (1): 2–3. DOI : 10,1099 / jgv.0.000672 . PMC  5370391 . PMID  28218572 .
  2. ^ a b c d e "Flaviviridae" . Интернет-отчет ICTV .
  3. ^ "Flaviviridae" . Microbe Wiki . Проверено 22 июля 2008 года .
  4. ^ a b c «Вирусная зона» . ExPASy . Дата обращения 15 июня 2015 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Отчет ICTV : Flaviviridae
  • Результаты поиска по базе данных геномов Flaviviridae из Центра ресурсов вирусной биоинформатики
  • Вирусная зона : Flaviviridae
  • Ресурс базы данных и анализа вирусных патогенов (ViPR): Flaviviridae
  • « Flaviviridae » . Браузер таксономии NCBI . 11050.