Семьи FXYD белок представляет собой семейство небольших мембранных белков , которые разделяют 35-аминокислотную последовательность домен подписи, начиная с аминокислотной последовательности PFXYD и содержащий 7 инвариант и 6 высоко консервативных аминокислот. Утвержденная номенклатура генов человека для этого семейства представляет собой FXYD-домен, содержащий регулятор ионного транспорта.
Семейство ATP1G1 / PLM / MAT8 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
Символ | ATP1G1_PLM_MAT8 | |||||||
Pfam | PF02038 | |||||||
ИнтерПро | IPR000272 | |||||||
PROSITE | PS01310 | |||||||
TCDB | 1.A.27 | |||||||
OPM суперсемейство | 62 | |||||||
Белок OPM | 2jo1 | |||||||
Мембранома | 382 | |||||||
|
У млекопитающих он содержит не менее семи членов. [2] Два других члена семейства, которые не являются очевидными ортологами какого-либо идентифицированного белка FXYD млекопитающих, существуют у рыбок данио. Все эти белки имеют общую сигнатурную последовательность из шести консервативных аминокислот, включающих мотив FXYD на NH2-конце, и два глицина и один остаток серина в трансмембранном домене . Белки FXYD широко распространены в тканях млекопитающих с выраженной экспрессией в тканях, которые осуществляют транспорт жидкости и растворенных веществ или которые электрически возбудимы.
Первоначальная функциональная характеристика показала, что белки FXYD действуют как каналы или как модуляторы ионных каналов . Однако исследования показали, что большинство белков FXYD имеют другую специфическую функцию и действуют как тканеспецифичные регуляторные субъединицы Na, K-АТФазы . Каждая из этих вспомогательных субъединиц оказывает различное функциональное воздействие на транспортные характеристики Na, K-АТФазы, которое регулируется в соответствии с конкретными функциональными потребностями ткани, в которой экспрессируется белок FXYD. Белки FXYD, по-видимому, преимущественно связываются с изоферментами Na, K-АТФазы альфа1-бета и влияют на их функцию, делая их функционально комплементарными или дополнительными к сосуществующим изоферментам.
Белки человека, содержащие этот домен
FXYD1 ; FXYD2 ; FXYD3 ; FXYD4 ; FXYD5 ; FXYD6 ; FXYD7 ; FXYD8 ; KCT1 ;
Рекомендации
- ^ Teriete P, Franzin CM, Choi J, Marassi FM (июнь 2007). «Структура Na, K-АТФазы регуляторного белка FXYD1 в мицеллах» . Биохимия . 46 (23): 6774–83. DOI : 10.1021 / bi700391b . PMC 2527028 . PMID 17511473 .
- ^ Crambert G, Geering K (2003). «Белки FXYD: новые тканеспецифические регуляторы повсеместной Na, K-АТФазы». Sci. СТКЕ . 2003 (166): re1. DOI : 10.1126 / stke.2003.166.re1 . PMID 12538882 . S2CID 23110172 .