Это семейство представляет собой элемент внутреннего сайта входа в рибосомы (IRES) пикорнавируса, присутствующий в их 5'-нетранслируемой области. [1] Эти элементы были обнаружены в пикорнавирусах. [2] Они представляют собой цис-действующие последовательности РНК, которые принимают различные трехмерные структуры, задействуют механизм трансляции и часто действуют в сочетании со специфическими РНК-связывающими белками. [2] Элементы IRES обеспечивают независимую от кэпа и концов трансляцию мРНК в клетке-хозяине. Было обнаружено, что аутоантиген La (La) необходим для вируса Коксаки.B3 (CVB3) IRES-опосредованная трансляция, и было высказано предположение, что La может потребоваться для эффективной трансляции вирусной РНК в поджелудочной железе . [3] [4] По вторичной структуре пикорнавирусы IRES подразделяются на четыре основных типа. Тип I включает энтеро- и риновирусы IRES, а тип II, среди прочего, включает кардио- и афтовирусы. Тип III используется для обозначения IRES гепатита А. [2]
Внутренний сайт входа в рибосомы пикорнавируса (IRES) | |
---|---|
Идентификаторы | |
Символ | IRES_Picorna |
Рфам | RF00229 |
Прочие данные | |
Тип РНК | Цис-рег ; IRES |
Домен (ы) | Вирусы |
ИДТИ | ИДТИ: 0043022 |
ТАК | ТАК: 0000243 |
Структуры PDB | PDBe |
Рекомендации
- ^ Фернандес-Miragall, Ольга; Куинто, Соня Лопес де; Мартинес-Салас, Энкарнасьон (февраль 2009 г.). «Актуальность структуры РНК для активности элементов IRES пикорнавируса». Вирусные исследования . 139 (2): 172–182. DOI : 10.1016 / j.virusres.2008.07.009 . PMID 18692097 .
- ^ а б в Мартинес-Салас, Энкарнасьон; Франсиско-Велилья, Росарио; Фернандес-Чаморро, Хавьер; Лозано, Глория; Диас-Толедано, Роза (август 2015 г.). «Элементы IRES пикорнавируса: структура РНК и взаимодействия белков хозяина». Вирусные исследования . 206 : 62–73. DOI : 10.1016 / j.virusres.2015.01.012 . hdl : 10261/140186 . PMID 25617758 .
- ^ Ray PS, Das S (октябрь 2002 г.). «La аутоантиген необходим для внутренней трансляции РНК вируса Коксаки В3, опосредованной сайтом входа в рибосомы» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (20): 4500–4508. DOI : 10.1093 / NAR / gkf583 . PMC 137146 . PMID 12384597 .
- ^ Лю З., Карти С.М., Чунг П., Богунек Л., Уилсон Дж. Э., Макманус Б. М., Ян Д. (декабрь 1999 г.). «Структурный и функциональный анализ 5'-нетранслируемой области РНК вируса Коксаки В3: исследования трансляции и инфекционности in vivo полноразмерных мутантов». Вирусология . 265 (2): 206–217. DOI : 10.1006 / viro.1999.0048 . PMID 10600593 .
Внешние ссылки
- http://rfam.xfam.org/family/RF00229 Сайт внутренней рибосомы пикорнавируса (IRES)
- Страница сайта внутренней рибосомы пикорнавируса (IRES) в Rfam