Polynucleobacter является родом протеобактерий , первоначально установленный Heckmann и Шмидтом (1987) [1] исключительно укрывают облигатные эндосимбионты из инфузорий , принадлежащих к роду Euplotes .
Полинуклеобактерии | |
---|---|
Научная классификация | |
Королевство: | |
Тип: | |
Класс: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | Polynucleobacter Heckmann & Schmidt 1987, исправлено. Hahn et al. 2009 г., поправить. Hahn et al. 2016 г. |
Типовой вид | |
Полинуклеобактерии необходимы | |
Разновидность | |
P. acidiphobus Hahn et al . 2011 |
Недавно было описано несколько новых видов Polynucleobacter , [2] [3] [4] [5] [6] [7] [8] [9] », которые все представляют собой свободноживущие (т.е. не связанные с хозяином) планктонные пресноводные бактерии. Таким образом, род Polynucleobacter в настоящее время включает один вид, содержащий облигатные эндосимбионты инфузорий, и девять видов, представляющих свободноживущие планктонные штаммы. В штаммы типа планктонных видов были выделены из пресноводных систем , расположенных в Армении , Австрии , Китая , Франции , Германии , Норвегии , Уганды , и Соединенных Штатах . В настоящее время род насчитывает 17 видов.
Свободноживущие бактерии Poynucleobacter представляют собой важных членов бактериопланктона в пресноводных системах, таких как озера, пруды и ручьи. [10]
Геномика
Два геномных проекты завершены на П. necessarius штаммов: один проект на облигатно штамма свободноживущего , выделенном из кислого пресноводного пруда, [11] и один проект по облигатным эндосимбионту инфузории Euplotes aediculatus . [12]
Анализ последовательностей генома привел к открытию консервативного мотива РНК .
Рекомендации
- ^ Heckmann, K. и HJ Schmidt (1987) Polynucleobacter needarius gen. nov., sp. nov., облигатно эндосимбиотическая бактерия, обитающая в цитоплазме Euplotes aediculatus . Int. J. Syst. Бактериол. 37: 456-457. (DOI: 10.1099 / 00207713-37-4-456)
- ^ Hahn, MW, E. Lang, U. Brandt, H. Lünsdorf, QL Wu и E. Stackebrandt (2010) Polynucleobacter cosmopolitanus sp. nov., свободноживущие планктонные бактерии, населяющие пресноводные озера и реки. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 60: 166-173. (DOI: 10.1099 / ijs.0.010595-0)
- ^ Хан, МВт, Е. Ланг, У. Брандт и C. Spröer (2011) Polynucleobacter acidiphobus зр. nov., представитель многочисленной группы планктонных пресноводных бактерий. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 61: 788-794. (DOI: 10.1099 / ijs.0.023929-0)
- ^ Хан, MW, Э. Ланг, М. Тарао и У. Брандт (2011) Polynucleobacter rarus sp. nov., свободноживущая планктонная бактерия, выделенная из кислого озера. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 61: 781-787 (DOI: 10.1099 / ijs.0.017350-0)
- ^ Hahn, MW, A. Minasyan, E. Lang, U. Koll, and C. Spröer (2012) Polynucleobacter difficili s sp. nov., планктонная пресноводная бактерия, аффилированная с подклассом B1 рода Polynucleobacter . Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 62: 376-383. (DOI: 10.1099 / ijs.0.031393-0)
- ^ Хан, МВт, Дж Шмидт, А. Питт, SJ Taipale, и E. Ланг (2016) Перераспределение из четырех Polynucleobacter necessarius штаммовкачестве представителей Polynucleobacter asymbioticus гребня. nov., Polynucleobacter duraquae sp. nov., Polynucleobacter yangtzensis sp. ноя и Polynucleobacter sinensis sp. ноябрь, и исправленное описание Polynucleobacter necessarius . Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 66: 2883-2892. (DOI: 10.1099 / ijsem.0.001073)
- ^ Hahn, MW, LR Huymann, U. Koll, J. Schmidt, E. Lang, M. Hoetzinger (2017) Polynucleobacter wuianus sp. nov., свободноживущая пресноводная бактерия, аффилированная с комплексом криптических видов PnecC. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 67: 379-385. (DOI: 10.1099 / ijsem.0.001637)
- ^ Питт А., Шмидт Дж, Ланг Е., Уитмен ВБ, Woyke Т., Хан МВт (2018). Polynucleobacter meluiroseus sp. nov., бактерия, выделенная из озера, расположенного в горах средиземноморского острова Корсика. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 68 : 1975-1985 [1]
- ^ Hoetzinger М., Шмидт Дж, Питт А., Колл У., Ланг Е., Хан МВт (2019) Polynucleobacter paneuropaeus зр. nov., характеризующийся шестью штаммами, изолированными из пресноводных озер, расположенных на 3000 км поперечного сечения с севера на юг по всей Европе. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 69 : 203-213. (DOI: 10.1099 / ijsem.0.003130)
- ^ Jezberová J., J. Jezbera, У. Брандт, Е. С. Линдстром, С. Langenheder и МВт Hahn (2010). Повсеместность Polynucleobacter needarius ssp. asymbioticus в непроточных пресноводных местообитаниях неоднороднойплощади2000 км 2 . Environ. Microbiol. 12: 658-669.
- ^ GOLD CARD: Gc00537 проект Геном: Polynucleobacter necessarius подвид. asymbioticus QLW-P1DMWA-1, GOLD - база данных геномов онлайн
- ^ GOLD CARD: Gc00757 проект Геном: Polynucleobacter necessarius подвид. necessarius STIR1, GOLD - геном OnLine Database
Внешние ссылки
- Polynucleobacter - Браузер таксономии NCBI