Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Протопарвовирус
Электронная микрофотография парвовируса собак
Электронная микрофотография из собачьего парвовируса
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство :Моноднавирия
Королевство:Shotokuvirae
Тип:Cossaviricota
Класс:Quintoviricetes
Заказ:Piccovirales
Семья:Parvoviridae
Подсемейство:Parvovirinae
Род:Протопарвовирус
Типовой вид
Протопарвовирус грызунов 1
Виды [1]

см. текст

Protoparvovirus это название рода вирусов в Parvovirinae подсемейства семейства вирусов Parvoviridae . [2] [3] Позвоночные животные служат естественными хозяевами. В настоящее время в этом роду 13 видов [4], включая типовой вид Протопарвовирус 1 грызунов, для которого типичным вирусом является вирус крошечных мышей (MVM). Этот род также включает парвовирус собак (CPV), который вызывает повреждение желудочно-кишечного тракта у щенков, что приводит к летальному исходу около 80% [5], и парвовирус свиней (PPV), который является основной причиной гибели плода и бесплодия у свиней. [6]Род делится филогенетически на две ветви, одна из которых содержит много членов-основателей семейства, таких как MVM, CPV и PPV, которые были изучены достаточно подробно, а вторая ветвь занята исключительно предсказанными вирусами, кодирующие последовательности которых были недавно идентифицированы в дикой природе, используя подходы к обнаружению вирусов, но чья биология остается малоизученной. Эта вторая ветвь в настоящее время включает два вида, представители которых заражают людей, - протопарвовирус приматов 1 и протопарвовирус приматов 3 . До 2014 года этот род назывался Parvovirus , но его переименовали, чтобы исключить путаницу между представителями этого рода и членами всего семейства Parvoviridae . [7] [8]

Таксономия [ править ]

В настоящее время известно 13 видов, многие из которых содержат несколько названных вирусов, штаммов вирусов, генотипов или серотипов. Применительно к вирусам определение видов несколько необычно. [9] Это просто абстрактная таксономическая концепция, которая объединяет выбранный диапазон генетических вариантов, помогая различать ветви в филогенетической линии, но это не физическая сущность, подобная вирусу, которая может заразить животное или быть изолированной. [10]Если уровень разнообразия, используемый для определения вида, установлен очень низким, многие из них будут фактически содержать один вирус, а вирусу и виду может быть даже дано одно и то же имя, что приведет к путанице между двумя концепциями в литературе и маргинализации филогенетических роль таксона вида. Чтобы противостоять этой проблеме, уровень разнообразия, признанный в настоящее время для видов Parvoviridae, является относительно широким: виды определяются как кластер похожих вирусов, которые кодируют конкретный репликационный белок, обычно называемый NS1, который как минимум на 85% идентичен кодируемому белку. другими представителями вида. [7] [8]

К признанным видам рода Protoparvovirus относятся: [4]

  • Протопарвовирус плотоядных животных (парвовирус каланов)
  • Плотоядный protoparvovirus 1 (который включает ввирусы собачий парвовирус и кошачий парвовирус );
  • Протопарвовирус рукокрылых 1 (мегабат буфавирус 1);
  • Протопарвовирус 1 Eulipotyphla (буфавирус Mpulungu);
  • Протопарвовирус 1 приматов (буфавирусы человека);
  • Протопарвовирус приматов 2 (вирус обезьян Wuharv parvovirus 1);
  • Протопарвовирус приматов 3 (катавирус);
  • Протопарвовирус приматов 4
  • Протопарвовирус 1 грызунов (который включает парвовирус H-1, вирус крыс Килхэма, вирус LuIII, вирус минутных мышей , парвовирус мыши, опухолевый вирус X и минутный вирус крыс);
  • Протопарвовирус грызунов 2 (парвовирус крысы 1)
  • Протопарвовирус грызунов 3 (крысиный буфавирус SY-2015);
  • Протопарвовирус 1 копытных животных ( парвовирус свиньи )
  • Протопарвовирус 2 копытных животных (protoparvovirus Zsana / 2013 / HUN);

Протопарвовирусы, поражающие людей, были впервые обнаружены в 2012 году в фекалиях детей из Буркина-Фасо и названы с использованием сиглумбуфавируса. [11] На сегодняшний день обнаружены три генотипа буфавирусов, циркулирующих в Тунисе, Финляндии [12] и Бутане [13].

Второй вирус этого рода, поражающий людей - кутавирус - первоначально был выделен из фекалий детей, страдающих диареей. [14]

Третий потенциальный протопарвовирус человека - тусавирус 1 - был обнаружен в фекалиях одного человека, но вопрос о том, способен ли он инфицировать людей или был просто проглочен, еще предстоит выяснить. [15]

Структура [ править ]

Вирусы рода Protoparvovirus имеют протеиновые капсиды без оболочки диаметром около 18–26 нм, которые демонстрируют Т = 1 икосаэдрическую симметрию. Геномы представляют собой одноцепочечную линейную ДНК длиной 4-6 т.п.н. с небольшими (100-500b) несовершенными палиндромными последовательностями на каждом конце, которые складываются, образуя отличительные дуплексные теломеры шпильки. [5]

РодСоставСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
ПротопарвовирусИкосаэдрТ = 1Без оболочкиЛинейная оцДНКНет

Считается, что капсид состоит из 60 белков VP ( PDB : 2CAS ), как VP1, так и VP2.

Геномная организация [ править ]

В геноме протопарвовируса есть две ORF. Неструктурная ORF (NS) является «первой» на 5 'стороне, а структурная (VP) - на 3' конце. Геном выражен обширным альтернативным сплайсингом . Это не только позволяет выражать VP, но также дает несколько альтернативно соединенных версий каждой ORF, обычно называемых NS1, NS2 (P, Y, L), VP1 и VP2. [5] Вот несколько примеров аннотированных белков из UniProt:

  • NS1 Минутного вируса мышей (MVM), P03134
  • NS2 МВМ, P0DJZ2
  • VP1 парвовируса собак (CPV), P17455
  • ВП2 КПВ, П61826

Жизненный цикл [ править ]

Репликация вируса является ядерной. Проникновение в клетку-хозяин достигается за счет прикрепления к рецепторам хозяина, которые опосредуют клатрин-опосредованный эндоцитоз. Репликация повторяет модель шпильки. В некоторых комбинациях вирус / клетка-хозяин вирионы потомства могут перемещаться через цитоплазму в везикулах и высвобождаться из родительской клетки-хозяина до гибели клетки, тогда как оставшиеся вирионы высвобождаются после лизиса клетки. В настоящее время известно, что позвоночные животные 6 отрядов служат естественными хозяевами. Пути передачи обычно фекально-оральный и / или респираторный. [5]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
ПротопарвовирусПозвоночныеПеременнаяэндоцитозранний везикулярный экспорт / лизис клетокЯдроЯдрофекально-оральный или респираторный

История [ править ]

Вирус крыс Килхэм, выделенный в 1959 г. [16], был первым идентифицированным представителем этого семейства небольших линейных одноцепочечных ДНК-вирусов.

В последующие годы ряд физически похожих вирусов, в том числе H1, LuIII, миниатюрный вирус мышей и опухолевый вирус X, были извлечены из клеток или тканей при рутинном использовании в исследовательских лабораториях [17], а также парвовирус свиней, PPV, одна из основных причин. репродуктивной недостаточности у свиней, был изолирован от инфицированных свиней. [18] В 1971 году все эти вирусы были признаны частью таксономического рода Parvovirus в Первом отчете недавно созданного Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV) [19]

Во втором отчете ICTV, опубликованном в 1976 году, было установлено семейство Parvoviridae , которое в то время включало три рода, один из которых сохранил название Parvovirus и содержал все вышеупомянутые вирусы плюс вирус панлейкопении кошек (теперь он называется парвовирусом кошек , сокращенно FPV). , которые, как было показано, вызывают эпидемии энтерита, панлейкопении и врожденной мозжечковой атаксии у домашних кошек. В 1978 году появился вирус того же вида, что и FPV, который был способен инфицировать собак (так называемый собачий парвовирус или CPV), который быстро распространился по всему миру, вызывая пандемии тяжелых кишечных и коронарных заболеваний. [20]

Род Parvovirus продолжал накапливать новые вирусы до 2014 года, когда его название было изменено на Protoparvovirus . [7] [8]

Ссылки [ править ]

  1. ^ "Род: Protoparvovirus " (HTML) . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 8 января 2019 . CS1 maint: discouraged parameter (link)
  2. ^ Котмор, SF; Agbandje-McKenna, M; Канути, М; Chiorini, JA; Эйс-Хубингер, А; Хьюз, Дж; Mietzsch, M; Modha, S; Ольястро, М; Пензес, JJ; Пинтель, диджей; Цю, Дж; Содерлунд-Венермо, М; Tattersall, P; Tijssen, P; и Консорциум отчетов ICTV (2019). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Parvoviridae " . Журнал общей вирусологии . 100 (3): 367–368. DOI : 10,1099 / jgv.0.001212 . PMC 6537627 . PMID 30672729 .  
  3. ^ "ICTV 10-й отчет (2018) Parvoviridae " .
  4. ^ a b «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.» . talk.ictvonline.org . Международный комитет по таксономии вирусов . Дата обращения 5 мая 2020 .
  5. ^ a b c d «Вирусная зона» . ExPASy . Проверено 15 июня 2015 года . CS1 maint: discouraged parameter (link)
  6. ^ "ICTV 10-й отчет (2018) Протопарвовирус " .
  7. ^ a b c «Официальная таксономия ICTV: обновления после 8-го отчета» . Официальная таксономия ICTV . Официальная таксономия ICTV . Проверено 11 июня 2014 . CS1 maint: discouraged parameter (link)
  8. ^ a b c Котмор С.Ф., Агбандже-МакКенна М., Чиорини Дж. А., Муха Д. В., Пинтель Д. Д., Цю Дж., Содерлунд-Венермо М., Таттерсолл П., Тейссен П., Гатерер Д., Дэвисон А. Дж.. 2014. Семейство Parvoviridae. Arch. Virol. 159: 1239–47.
  9. ^ Van Regenmortel MHV (2000) Введение в понятие вида в таксономии вирусов. В: Van Regenmortel MHV, Fauquet CM, Bishop DHL, Carstens EB, Estes MK, Lemon SM, McGeogh DJ, Maniloff J, Mayo MA, Pringle CR, Wickner RB. (eds) Таксономия вирусов - седьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Elsevier Academic Press, Лондон.
  10. ^ Van Regenmortel MHV (2003) Вирусы реальны, виды вирусов - это искусственные таксономические конструкции. Arch. Virol. 148: 2481–2488.
  11. ^ Пхан ТГ, Во- Н.П., Bonkoungou И.Я., Капур А, Барро Н, O'Ryan М, Kapusinszky Б, Ван С, Delwart Е. 2012. Острая диарея у детей Западной Африки: различные энтеровирусов и новый парвовирус рода. J Virol. 86: 11024–30
  12. ^ Вяйсянен Е, Kuisma я, Фан Т.Г., Delwart Е, Lappalainen М, Tarkka Е, Хедман К, Сёдерлунд-Венермо М. 2014. Bufavirus в фекалиях больных с гастроэнтеритом, Финляндия. Emerg Infect Dis. 20 (6): 1078–80.
  13. ^ Yahiro Т, Вангчуг S, Тшеринг К, Р Bandhari, Зангм S, Т Дорджи, Тшеринг К, Мацумото Т, Nishizono А, Сёдерлунд-Венермо М, Ахмед К. 2014. Нового человека bufavirus генотип 3 у детей с тяжелой диареей, Бутаном . Emerg Infect Dis. 20 (6): 1037–9.
  14. ^ Phan TG, Dreno B, da Costa AC, Li L, Orlandi P, Deng X, Kapusinszky B, Siqueira J, Knol AC, Halary F, Dantal J, Alexander KA, Pesavento PA, Delwart EA новый протопарвовирус в образцах фекалий человека и кожные Т-клеточные лимфомы (грибовидный микоз). Вирусология 496: 299–305. DOI: 10.1016 / j.virol.2016.06.013
  15. ^ Phan TG, Sdiri-Loulizi K, M Ауни, Амбер-Балай K, P Потье, Дэн X, Delwart E (2014) Новый парвовирус в ребенке с необъяснимой диареей, Тунисом. Emerg Infect Dis 20 (11): 1911–1913. DOI: 10.3201 / eid2011.140428
  16. ^ Kilham, L. и Olivier, LJ 1959. Скрытый вирус крыс, выделенный в культуре ткани. Вирусология 7: 428–37
  17. ^ Таттерсолл, П. 2006. Эволюция таксономии парвовирусов. В кн .: «Парвовирусы». Дж. Керр, С. Ф. Котмор, М. Е. Блум, Р. М. Линден и С. Р. Пэрриш (редакторы), гл. 1. С. 5–4. Ходдер Арнольд, Лондон.
  18. ^ Ren X, Tao Y, Cui J, Suo S, Cong Y, Tijssen P. 2013. Филогения и эволюция парвовируса свиней. Вирусные исследования. 178: 392–397.
  19. ^ "Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV)" .
  20. ^ Hoelzer К, Парриш CR. 2010. Появление парвовирусов хищников. Вет. Res. 41:39.

Внешние ссылки [ править ]

  • Вирусная зона : Протопарвовирус
  • ICTV