Ризария

Ризария Временной диапазон: Неопротерозой - современный Pha. Протерозойский Архейский Had'n

Аммиак теплый ( Foraminifera )
Научная классификация
Домен:	Эукариоты
(без рейтинга):	Потогонные
Клэйд :	ЦАРЬ
Клэйд :	SAR
(без рейтинга):	Ризария Кавальер-Смит , 2002 г.
Phyla
Cercozoa Retaria Фораминиферы Радиолярии

Ризарии являются богатыми видов супергруппы в основном из одноклеточных ^[1] эукариотов . ^[2] За исключением Chlorarachniophyte и трех видов рода Paulinella в типе Cercozoa , все они нефотосинтетические, но многие фораминиферы и радиолярии имеют симбиотические отношения с одноклеточными водорослями. ^[3] Также была описана многоклеточная форма Guttulinopsis vulgaris , клеточная слизистая плесень . ^[4] Эта супергруппа была предложена Кавалье-Смитом в 2002 году. Описывается в основном на основе рДНК.последовательности, они значительно различаются по форме, не имеющие четкие морфологические отличительные символов ( синапоморфий ), но по большей части они амебоиды с нитевидным, Ретикулезом или микротрубочками при поддержке подталкивателей . Многие производят раковины или скелеты, которые могут иметь довольно сложную структуру, и они составляют подавляющее большинство окаменелостей простейших. Почти у всех есть митохондрии с трубчатыми кристами .

Группы [ править ]

Три основные группы ризариев: ^[5]

Cercozoa - различные амебы и жгутиконосцы, обычно с филозовыми ложноножками и обычны в почве.
Фораминиферы - амебоиды с ретикулозными ложноножками, распространены как морской бентос.
Радиолярии - амебоиды с аксонодами , распространены как морской планктон.

Некоторые другие группы могут быть включены в Cercozoa, но некоторые деревья кажутся ближе к Foraminifera. Это Phytomyxea и Ascetosporea , паразиты растений и животных соответственно, а также своеобразная амеба Gromia . Различные группы Rhizaria считаются близкими родственниками, основанными главным образом на генетическом сходстве, и рассматриваются как продолжение Cercozoa. Название Rhizaria для расширенной группы было введено Кавалье-Смитом в 2002 г. ^[6], который также включал центрохелид и Apusozoa .

Другой отряд, который, по-видимому, принадлежит к этому таксону, - это Mikrocytida . ^[7] Это паразиты устриц .

Эволюционные отношения [ править ]

Ризарии являются частью Diaphoretickes (bikont) клайда вместе с архепластидой , Alveolata , Cryptista , Haptista и Halvaria .

Исторически многие ризарии считались животными из-за их подвижности и гетеротрофности . Однако, когда простая дихотомия животных и растений была заменена признанием дополнительных царств, систематики обычно помещали ризариев в царство Протиста . Когда ученые начали изучать эволюционные отношения между эукариотами с использованием молекулярных данных, стало ясно, что царство протистов было парафилетическим . Ризарии, по-видимому, имеют общего предка со Stramenopiles и Alveolates, входящими в состав суперсистемы SAR (Stramenopiles + Alveolates + Rhizaria). ^[8]Ризария была подтверждена молекулярно-филогенетическими исследованиями как монофилетическая группа. ^[9] Биосинтез предшественников 24-изопропилхолестана в различных ризариях ^[10] предполагает важную экологическую роль уже во время эдиакарского периода .

Филогения [ править ]

Филогения, основанная на Bass et al. 2009, ^[11] Howe et al. 2011, ^[12] и Silar 2016. ^[13]

Ризария

Фитомиксея

Вампиреллида

Filosa

Скиомонада

Chlorarachniophyceae

Гранофилоза

Монадофилоза

Метромонада

Cercomonadida

Glissomonadida - Sainourida клады

Вентрифилоза

	Силикофилоза ( Imbricatea )

	Текофилоза

Ретикулозиды

	Gromiidea

	Аскетоспорея

Retaria

Стихолончея

Поликистинея

	Acantharea

	Фораминиферы

Cercozoa

В 2019 году Cercozoa были признаны основной группой Rhizaria, как сестра Retaria. ^[14]

Cercomonas sp. ( Cercozoa : Cercomonadida
Ebria sp. (Cercozoa: Ebridea )
Rhipidodendron sp. (Cercozoa: Spongomonadea )
Euglypha sp. (Cercozoa: Euglyphida )
Феодариане (Cercozoa: Phaeodarea )
Clathrulina elegans (Cercozoa: Granofilosea: Desmothoracida )
Chlorarachnion sp. (Cercozoa: ( Chlorarachniophyta )
Vampyrella sp. (Cercozoa: Vampyrellidae )
Громия (Cercozoa: Gromiidea )
Порошковая парша (Cercozoa: Plasmodiophorida )
Фораминиферы ( Retaria : Foraminifera )
Поликистины (Retaria: Radiolaria )
Акантарии (Retaria: Radiolaria )

Ссылки [ править ]

^ Кристофер Тейлор (2004). «Ризария» . Архивировано из оригинала на 2009-04-20.
^ Николаев С.И., Берни С., Фарни Дж. Ф. и др. (Май 2004 г.). «Закат Heliozoa и рост Rhizaria, новой супергруппы амебоидных эукариот» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 101 (21): 8066–71. DOI : 10.1073 / pnas.0308602101 . PMC 419558 . PMID 15148395 .
^ Гаст, Ребекка Дж .; Кэрон, Дэвид А. (2001-10-01). «Фотосимбиотические ассоциации в планктонных фораминиферах и радиоляриях». Hydrobiologia . 461 (1): 1–7. DOI : 10,1023 / A: 1012710909023 . ISSN 1573-5117 . S2CID 1387879 .
^ Коричневый; и другие. (2012). «Агрегативная многоклеточность независимо развивалась в эукариотической супергруппе Rhizaria» . Текущая биология . 22 (12): 1123–1127. DOI : 10.1016 / j.cub.2012.04.021 . PMID 22608512 .
Перейти ↑ Moreira D, von der Heyden S, Bass D, López-García P, Chao E, Cavalier-Smith T (июль 2007 г.). «Глобальная филогения эукариотов: комбинированные деревья рибосомной ДНК с малыми и большими субъединицами поддерживают монофилию Rhizaria, Retaria и Excavata». Мол. Филогенет. Evol . 44 (1): 255–66. DOI : 10.1016 / j.ympev.2006.11.001 . PMID 17174576 .
Перейти ↑ Cavalier-Smith, Thomas (2002). «Фаготрофное происхождение эукариот и филогенетическая классификация простейших» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 52 (2): 297–354. DOI : 10.1099 / 00207713-52-2-297 . ISSN 1466-5026 . PMID 11931142 . Проверено 8 июня 2007 .
^ Hartikainen, H; Stentiford, GD; Бейтман, KS; Берни, К; Файст, SW; Лонгшоу, М; Окамура, B; Камень, D; Уорд, G; Дерево, C; Басс, D (2014). «Микроцитиды представляют собой широко распространенное и расходящееся излучение паразитов водных беспозвоночных» (PDF) . Curr Biol . 24 (7): 807–12. DOI : 10.1016 / j.cub.2014.02.033 . PMID 24656829 . S2CID 17180719 .
^ Бурки, F; Шалчиан-Тебризи, К; Minge, M; Skjaeveland, A; Николаев, С.И.; Якобсен, KS; Павловский, Дж (2007). Батлер, Джеральдин (ред.). "Филогеномика перетасовывает эукариотические супергруппы" . PLoS ONE . 2 (8): e790–. Bibcode : 2007PLoSO ... 2..790B . DOI : 10.1371 / journal.pone.0000790 . PMC 1949 142 . PMID 17726520 .
^ Бурки, Фабьен; Шалчиан-Тебризи, Камран; Павловский, янв (23 августа 2008 г.). «Филогеномика открывает новую« мегагруппу », включающую большинство фотосинтезирующих эукариот» . Письма биологии . 4 (4): 366–9. DOI : 10.1098 / RSBL.2008.0224 . PMC 2610160 . PMID 18522922 .
^ Халльманн, Кристиан; Штур, Марлен; Кучера, Михал; Зонневельд, Карин; Бобровский, Илья; Bowser, Samuel S .; Павловский, Ян; Деккер, Патрик Де; Новак, Ева СМ (04.03.2019). «Предполагаемые биомаркеры губок в одноклеточных ризариях ставят под сомнение раннее появление животных». Природа, экология и эволюция . 3 (4): 577–581. DOI : 10.1038 / s41559-019-0806-5 . ISSN 2397-334X . PMID 30833757 . S2CID 71148672 .
↑ Bass D, Chao EE, Nikolaev S, et al. (Февраль 2009 г.). "Филогения новой голой филозы и ретикулозы Cercozoa: Granofilosea cl. N. И Proteomyxidea Revised". Протист . 160 (1): 75–109. DOI : 10.1016 / j.protis.2008.07.002 . PMID 18952499 .
^ Хау; и другие. (2011), «Новые культивируемые протисты идентифицируют глубоко разветвленные клады ДНК в окружающей среде Cercozoa: New Genera Tremula, Micrometopion, Minimassisteria, Nudifila, Peregrinia», Protist , 162 (2): 332–372, doi : 10.1016 / j.protis. 2010.10.002 , PMID 21295519
^ Силар, Филипп (2016), «Protistes Eucaryotes: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes» , HAL Archives- ouvertes: 1–462
^ Ирвин, Николас AT; Тихоненков, Денис В .; Хехенбергер, Элизабет; Мыльников, Александр П .; Бурки, Фабьен; Килинг, Патрик Дж. (01.01.2019). «Филогеномика поддерживает монофилию Cercozoa». Молекулярная филогенетика и эволюция . 130 : 416–423. DOI : 10.1016 / j.ympev.2018.09.004 . ISSN 1055-7903 . PMID 30318266 .

Внешние ссылки [ править ]

Молекулярная филогения амебоидных протистов - древо ризарии
Древо жизни эукариоты

[1] Кристофер Тейлор (2004). «Ризария» . Архивировано из оригинала на 2009-04-20.

[pmid15148395-2] Николаев С.И., Берни С., Фарни Дж. Ф. и др. (Май 2004 г.). «Закат Heliozoa и рост Rhizaria, новой супергруппы амебоидных эукариот» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 101 (21): 8066–71. DOI : 10.1073 / pnas.0308602101 . PMC 419558 . PMID 15148395 .

[3] Гаст, Ребекка Дж .; Кэрон, Дэвид А. (2001-10-01). «Фотосимбиотические ассоциации в планктонных фораминиферах и радиоляриях». Hydrobiologia . 461 (1): 1–7. DOI : 10,1023 / A: 1012710909023 . ISSN 1573-5117 . S2CID 1387879 .

[4] Коричневый; и другие. (2012). «Агрегативная многоклеточность независимо развивалась в эукариотической супергруппе Rhizaria» . Текущая биология . 22 (12): 1123–1127. DOI : 10.1016 / j.cub.2012.04.021 . PMID 22608512 .

[pmid17174576-5] Перейти ↑ Moreira D, von der Heyden S, Bass D, López-García P, Chao E, Cavalier-Smith T (июль 2007 г.). «Глобальная филогения эукариотов: комбинированные деревья рибосомной ДНК с малыми и большими субъединицами поддерживают монофилию Rhizaria, Retaria и Excavata». Мол. Филогенет. Evol . 44 (1): 255–66. DOI : 10.1016 / j.ympev.2006.11.001 . PMID 17174576 .

[6] Перейти ↑ Cavalier-Smith, Thomas (2002). «Фаготрофное происхождение эукариот и филогенетическая классификация простейших» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 52 (2): 297–354. DOI : 10.1099 / 00207713-52-2-297 . ISSN 1466-5026 . PMID 11931142 . Проверено 8 июня 2007 .

[Hartikainen2014-7] Hartikainen, H; Stentiford, GD; Бейтман, KS; Берни, К; Файст, SW; Лонгшоу, М; Окамура, B; Камень, D; Уорд, G; Дерево, C; Басс, D (2014). «Микроцитиды представляют собой широко распространенное и расходящееся излучение паразитов водных беспозвоночных» (PDF) . Curr Biol . 24 (7): 807–12. DOI : 10.1016 / j.cub.2014.02.033 . PMID 24656829 . S2CID 17180719 .

[8] Бурки, F; Шалчиан-Тебризи, К; Minge, M; Skjaeveland, A; Николаев, С.И.; Якобсен, KS; Павловский, Дж (2007). Батлер, Джеральдин (ред.). "Филогеномика перетасовывает эукариотические супергруппы" . PLoS ONE . 2 (8): e790–. Bibcode : 2007PLoSO ... 2..790B . DOI : 10.1371 / journal.pone.0000790 . PMC 1949 142 . PMID 17726520 .

[Burki2008-9] Бурки, Фабьен; Шалчиан-Тебризи, Камран; Павловский, янв (23 августа 2008 г.). «Филогеномика открывает новую« мегагруппу », включающую большинство фотосинтезирующих эукариот» . Письма биологии . 4 (4): 366–9. DOI : 10.1098 / RSBL.2008.0224 . PMC 2610160 . PMID 18522922 .

[10] Халльманн, Кристиан; Штур, Марлен; Кучера, Михал; Зонневельд, Карин; Бобровский, Илья; Bowser, Samuel S .; Павловский, Ян; Деккер, Патрик Де; Новак, Ева СМ (04.03.2019). «Предполагаемые биомаркеры губок в одноклеточных ризариях ставят под сомнение раннее появление животных». Природа, экология и эволюция . 3 (4): 577–581. DOI : 10.1038 / s41559-019-0806-5 . ISSN 2397-334X . PMID 30833757 . S2CID 71148672 .

[pmid18952499-11] Bass D, Chao EE, Nikolaev S, et al. (Февраль 2009 г.). "Филогения новой голой филозы и ретикулозы Cercozoa: Granofilosea cl. N. И Proteomyxidea Revised". Протист . 160 (1): 75–109. DOI : 10.1016 / j.protis.2008.07.002 . PMID 18952499 .

[Howe-12] Хау; и другие. (2011), «Новые культивируемые протисты идентифицируют глубоко разветвленные клады ДНК в окружающей среде Cercozoa: New Genera Tremula, Micrometopion, Minimassisteria, Nudifila, Peregrinia», Protist , 162 (2): 332–372, doi : 10.1016 / j.protis. 2010.10.002 , PMID 21295519

[Silar-13] Силар, Филипп (2016), «Protistes Eucaryotes: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes» , HAL Archives- ouvertes: 1–462

[14] Ирвин, Николас AT; Тихоненков, Денис В .; Хехенбергер, Элизабет; Мыльников, Александр П .; Бурки, Фабьен; Килинг, Патрик Дж. (01.01.2019). «Филогеномика поддерживает монофилию Cercozoa». Молекулярная филогенетика и эволюция . 130 : 416–423. DOI : 10.1016 / j.ympev.2018.09.004 . ISSN 1055-7903 . PMID 30318266 .

[1]