Сара Ч.Р. Элгин - американский биохимик и генетик. Она является профессором биологии Виктора Гамбургера в Вашингтонском университете в Сент-Луисе и известна своей работой в области эпигенетики , регуляции генов и гетерохроматина , а также своим вкладом в научное образование .
Сара ЧР Элгин | |
---|---|
Национальность | Американец |
Альма-матер | Колледж Помона , Калифорнийский технологический институт |
Известен | гетерохроматин , естествознание |
Награды |
|
Научная карьера | |
Поля | Биохимия , биофизика , генетика , эпигенетика |
Учреждения | Калифорнийский технологический институт ; Гарвардский университет ; Вашингтонский университет в Сент-Луисе |
Докторант | Джеймс Боннер |
Докторанты | Ли М. Сильвер Кармелла Хейнс |
ранняя жизнь и образование
Сара «Салли» Элгин родилась в Вашингтоне, округ Колумбия. Она выросла в Салеме, штат Орегон. [1] В старшей школе Элгин изучал уровни выпадения осадков в дождевой воде Орегона после испытаний ядерного оружия в Советском Союзе . [2] Она получила степень бакалавра в области химии из колледжа Помона в 1967 году . [3] [1] Находясь в Помоне, она участвовала в летней исследовательской программе в Университете Лидса, посвященной характеристикам стебля зеленой златоглазки Chrysopa vittata. [4] Элгин выполняла свою дипломную работу в лаборатории Джеймса Боннера в Калифорнийском технологическом институте , выделяя и характеризуя негистоновые хромосомные белки из печени крыс. Она получила докторскую степень. в области биохимии в 1972 году. [1] Элгин осталась в Калифорнийском технологическом институте для своих постдокторских исследований , работая в лаборатории Лероя Гуда . Она продолжала выделять и характеризовать негистоновые хромосомные белки, но приступила к изучению дрозофилы .
Академическая карьера и исследования
После ее постдоктора, Elgin поступил на факультет в отделе биохимии и молекулярной биологии в Гарвардском университете , [1] , где ее лаборатории впервые иммунным из политенных хромосом от дрозофилы личиночной слюнной железы [5] и нуклеазы пищеварения анализы. [6] [7]
В 1981 году Элгин поступил на факультет биологии Вашингтонского университета в Сент-Луисе . Ее лаборатория выделила и охарактеризовала гетерохроматиновый белок 1 у дрозофилы [8] (теперь известный как Su (var) 205 или HP1a). Чтобы исследовать среду хроматина, ее лаборатория разработала конструкцию P-элемента с копией гена white , управляемую промотором hsp70 . Когда этот репортерный ген внедряется в гетерохроматиновую среду, глаза мух демонстрируют пестрый фенотип, тогда как когда элемент P вставлен в эухроматин, глаза мух показывают красный фенотип; это явление известно как пестрота с эффектом позиции . Анализы расщепления нуклеаз подтвердили, что фенотипы глаз указывают на хроматиновую среду, окружающую сайт вставки P-элемента. [9] [10] В 2006 году Элгин был назначен первым заслуженным профессором искусств и наук Виктора Гамбургера .
В Вашингтонском университете в районе Сент-Луиса и на национальном уровне Элгин активно занимается научным образованием. В 1989 году она основала программу научных исследований Вашингтонского университета и активно занимается научным образованием в школьном округе Юниверсити-Сити .
В 2002 году Элгин стал профессором HHMI [1] [2] с целью разработать базовую учебную программу для интеграции первичных исследований в области геномики с курсом колледжа под названием Phage Bioinformatics. Кроме того, Элгин сотрудничал с профессорами по всей стране, чтобы улучшить аннотацию последовательностей различных видов дрозофилы , особенно для точечной хромосомы. [11] [12] Этот проект называется Genomics Education Partnership (GEP) , консорциум из 174 колледжей и университетов [3], которые участвуют в проектах по улучшению последовательности и аннотации с целью публикации результатов в основных исследовательских журналах, а также публикация данных об опыте обучения студентов, посещающих исследовательские классы, на основе данных GEP. [13] [14] [15]
Партнерство в области образования в области геномики
В июне 2005 года Элгин провела однодневный вводный семинар в Вашингтонском университете в Сент-Луисе, чтобы показать приглашенным преподавателям, что ее студенты могут делать в аннотации генома. Все 17 преподавателей, участвовавших в программе, подписались под предложением Медицинскому институту Говарда Хьюза (HHMI) о создании Партнерства в области образования в области геномики (GEP). Грант HHMI был профинансирован, и первая группа членов GEP посетила полный учебный семинар в июне 2006 года [16].
Основание GEP было мотивировано необходимостью включить геномику и биоинформатику в учебную программу бакалавриата, а также желанием сделать это, одновременно привлекая студентов к исследованиям в области геномики. Существует потребность в значительных когнитивных усилиях человека для улучшения сборки и аннотирования геномов, чтобы ответить на интересные вопросы о роли структуры генома в поддержании стабильности генома и регуляции экспрессии генов.
GEP был создан с этими основными целями:
- Внедрение биоинформатики в целом и геномики в частности в учебную программу бакалавриата и предоставление студентам исследовательского опыта;
- Установление инклюзивного и открытого партнерства в масштабе, позволяющем решать большие (мегабазовые) проекты, требующие параллельной работы множества студентов-исследователей;
- Моделирование «командной науки», которое требует существенного вклада ведущего исследователя, участвующих преподавателей и студентов, а также опыта коллег в области информатики и секвенирования генома во взаимовыгодном и взаимовыгодном сотрудничестве;
- Публикация результатов в научной литературе с участием всех участвующих преподавателей и студентов в качестве соавторов окончательной публикации;
- Регулярная публикация результатов оценивания в учебной литературе для содействия преподаванию и обучению.
Под руководством Элгина с 2006 по 2017 год GEP вырос до энергичной, совместной и продуктивной группы, состоящей из более чем 100 преданных своему делу преподавателей, и предоставил тысячам студентов возможность участвовать в исследованиях в области геномики. Хотя у GEP теперь новый директор программы, Лаура К. Рид , Элджин по-прежнему активно участвует во многих аспектах партнерства.
Награды и почести
- Национальная академия наук, 2018 [1]
- Премия Брюса Альберта за выдающиеся достижения в области естественнонаучного образования (Американское общество клеточной биологии), 2006 г., совместно с А. Малкольмом Кэмпбеллом [17]
- Премия за выдающийся вклад в образование (Американское общество биохимии и молекулярной биологии), 2007 г. [18]
- Премия Элизабет У. Джонс за выдающиеся достижения в области образования (Американское генетическое общество), 2009 г. [19]
- Американская академия искусств и наук, 2012 [20] [1]
Примечания и ссылки
- ^ a b c d e f "Сара К. Элджин" . Национальная академия наук . Проверено 30 августа 2018 года .
- ^ «Какой наставник оказал наибольшее влияние на вашу карьеру и почему?» .
- ^ «Старр назван в Академию» . Журнал колледжа Помона . Помона Колледж. 24 июня 2020 . Проверено 29 августа 2020 .
- ^ Робертс, SC (1966). «Краткое описание ранних стадий развития Chrysopa vittata (Neuroptera Chrysopidae)». Вестник энтомолога . 17 : 85–89.
- ^ Серебро, LM; Элгин, SC (февраль 1976 г.). «Метод определения распределения хромосомных белков in situ» . Proc Natl Acad Sci USA . 73 (2): 423–427. Полномочный код : 1976PNAS ... 73..423S . DOI : 10.1073 / pnas.73.2.423 . PMC 335921 . PMID 813226 .
- ^ Wu, C; Бингхэм, ПМ; Ливак, KJ; Holmgren, R; Элгин, SCR (апрель 1979 г.). «Структура хроматина конкретных генов: I. Доказательства доменов более высокого порядка определенной последовательности ДНК». Cell . 16 (4): 797–806. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (79) 90095-3 . PMID 455449 . S2CID 10025372 .
- ^ Wu, C; Вонг, YC; Элгин, SCR (апрель 1979 г.). «Структура хроматина конкретных генов: II. Нарушение структуры хроматина во время активности генов». Cell . 16 (4): 807–814. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (79) 90096-5 . PMID 455450 . S2CID 25861704 .
- ^ Джеймс, ТС; Элгин, SCR (ноябрь 1986 г.). «Идентификация негистонового хромосомного белка, связанного с гетерохроматином в Drosophila melanogaster и его гене» . Mol Cell Biol . 6 (11): 3862–3872. DOI : 10,1128 / MCB.6.11.3862 . PMC 367149 . PMID 3099166 .
- ^ Wallrath, LL; Элгин, SCR (1995-05-15). «Пестрота эффекта положения у Drosophila связана с измененной структурой хроматина» . Гены и развитие . 9 (10): 1263–1277. DOI : 10,1101 / gad.9.10.1263 . PMID 7758950 .
- ^ Вс, Флорида; Cuaycong, MH; Элгин, SCR (апрель 2001 г.). «Дальний порядок нуклеосом связан с молчанием генов в перицентрическом гетерохроматине Drosophila melanogaster» . Mol Cell Biol . 21 (8): 2867–2879. DOI : 10.1128 / MCB.21.8.2867-2879.2001 . PMC 86916 . PMID 11283265 .
- ^ Slawson, EE; Шаффер, CD; Мэлоун, компакт-диск; Люнг, Вт; Kellmann, E; Шевчек, РБ; Крейг, Калифорния; Блум, С.М. Bogenpohl, J 2nd; Ди, Дж; Morimoto, ET; Мён, Дж; Nett, AS; Озсолак, Ф; Tittiger, ME; Zeug, A; Пардью, ML; Бюлер, Дж; Мардис, ER; Элгин, СК (20 февраля 2006 г.). «Сравнение последовательностей точечных хромосом из D. melanogaster и D. virilis показывает обогащение последовательностей транспозонов ДНК в гетерохроматических доменах» . Genome Biol . 7 (2): R15. DOI : 10.1186 / GB-2006-7-2-r15 . PMC 1431729 . PMID 16507169 .
- ^ Люнг, Вт; Шаффер, CD; Кордонье, Т; Вонг, Дж; Итано, MS; Slawson Tempel, EE; Kellmann, E; Desruisseau, DM; Каин, C; Карраскильо, Р. Чусак, ТМ; Falkowska, K; Grim, KD; Guan, R; Ханиборн, Дж; Хан, S; Ржу не могу; МакГаха, Р. Планкетт, Дж; Richner, JM; Richt, R; Сабин, Л; Шах, А; Шарма, А; Сингхал, S; Песня, F; Swope, C; Вилен, CB; Бюлер, Дж; Мардис, ER; Элгин, SC (август 2010 г.). «Эволюция отдельного геномного домена у Drosophila: сравнительный анализ точечной хромосомы у Drosophila melanogaster и Drosophila virilis» . Генетика . 185 (4): 1519–1534. DOI : 10.1534 / genetics.110.116129 . PMC 2927774 . PMID 20479145 .
- ↑ Крис Шаффер, Консуэло Альварес, Шерил Бейли, Дарон Барнард, Сатиш Бхалла, Читра Чандрасекаран, Видья Чандрасекаран, Хуэй-Мин Чунг, Дуг Дорер, Чунгуанг Ду, Тодд Экдал, Джефф Поэт, Дональд Фрохлих, Аня Госер, Чарльз Гудман, Чарльз , Лаура Хупс, Дайана Джонсон, Крис Джонс, Мэриан Келер, Нигхат Кокан, Ольга Копп, Гэри Кулек, Джерри Макнил, Роберт Мосс, Дженнифер Мика, Алексис Нагенгаст, Роберт Моррис, Пол Овервоорд, Либби Шуп, Сьюзан Пэрриш, Келли Рид, E Глория Регисфорд, Деннис Реви, Энн Розенвальд, Кен Сэвилл, Стефани Шредер, Мэри Шоу, Кристофер Смит, Мэри Смит, Эрик Спана, Мэри Спратт, Джойс Стэмм, Джефф Томпсон, Мэтью Ваверсик, Барбара Уилсон, Джим Янгблом, Уилсон Люнг, Дэвид. Лопатто, Сара ЧР Элгин. Партнерство в области образования в области геномики: успешная интеграция исследований в лабораторные классы в разнообразной группе вузов, Cell Biology Ed-Life Sci Ed 9 : 35-40 (Spring, 2010).
- ^ Элгин, Сара ЧР; Хаузер, Чарльз; Хольцен, Тереза М .; Джонс, Кристофер; Кляйншмит, Адам; Лезерман, Джудит; Genomics Education Partnership (декабрь 2016 г.). «GEP: Краудсорсинговый анализ больших данных с участием студентов» . Тенденции в генетике . 33 (2): 81–85. DOI : 10.1016 / j.tig.2016.11.004 . ISSN 0168-9525 . PMID 27939750 .
- ^ Лопатто, Дэвид; Розенвальд, Энн Дж .; ДиАнджело, Джастин Р .; Слушайте, Эми Т .; Скерритт, Мэтью; Ваверсик, Мэтью; Аллен, Анна К .; Альварес, Консуэло; Андерсон, Сара; Арриго, Синди; Аршам, Эндрю (2020). «Содействие росту через разочарование: использование исследований геномики в учебном процессе на уровне бакалавриата» . Журнал микробиологии и биологического образования . 21 (1): 40. DOI : 10,1128 / jmbe.v21i1.2005 . ISSN 1935-7877 . PMC 7048401 . PMID 32148609 .
- ^ Lopatto, D .; Alvarez, C .; Barnard, D .; Чандрасекаран, С .; Chung, H.-M .; Du, C .; Eckdahl, T .; Гудман, А.Л .; Hauser, C .; Джонс, CJ; Копп, штат Орегон (31 октября 2008 г.). "Студенческие исследования. Партнерство в области образования в области геномики" . Наука . 322 (5902): 684–685. DOI : 10.1126 / science.1165351 . ISSN 1095-9203 . PMC 2953277 . PMID 18974335 .
- ^ «Премия Брюса Альберта» . Американское общество клеточной биологии . Проверено 30 августа 2018 года .
- ^ «Премия за выдающиеся достижения в области образования» . Американское общество биохимии и молекулярной биологии . Проверено 30 августа 2018 года .
- ^ «Премия Элизабет У. Джонс» . Американское общество генетиков . Проверено 30 августа 2018 года .
- ^ «Члены по теме и году избрания» (PDF) . Американская академия искусств и наук . Проверено 30 августа 2018 года .
Внешние ссылки
- Страница факультета Сары Элгин
- Сайт Elgin Lab
- HHMI профессора Био доктора Элгина
- Домашняя страница Genomics Education Partnership